广东工业大学生物化学第六章核酸课件.ppt
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- 广东工业大学 生物化学 第六 核酸 课件
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1、第六章第六章 核酸核酸P113v 要点:1.核酸的分类、分布2.核酸的生物学功能3.核酸的结构:核酸的基本组成单位-核苷酸;核酸的一级结构;Chargaff法则;DNA双螺旋结构模型、左手螺旋(Z-DNA),DNA的三级结构-超螺旋。RNA的高级结构。RNA的类型,RNA的碱基组成4.核酸的理化性质:水解;酸碱性质;紫外吸收特性;核酸的变性、复性和分子杂交;热变性和Tm值,DNA复性及杂交。5.核酸酶早在1868年,Miescher从细胞核中分离得到一种酸性物质,即现在被称为核酸的物质。1939年,Knapp等第一次用实验方法证实核酸是生命遗传的基础物质。自然界,动物、植物和微生物都含有核酸,
2、细菌也不例外。核酸的发现核酸的发现1 1、脱氧核糖核酸(、脱氧核糖核酸(DNADNA)Deoxyribonucleic Deoxyribonucleic Acid Acid 2 2、核糖核酸(、核糖核酸(RNARNA)Ribonucleic AcidRibonucleic Acidv核酸的两大分类核酸的两大分类P114DNADNA为为双链双链分子,其中大多数是分子,其中大多数是链状结构大分子,也有少部分链状结构大分子,也有少部分呈环状结构。呈环状结构。DNADNA分子含有生物物种的所有遗分子含有生物物种的所有遗传信息,传信息,分子量分子量一般都很一般都很大大。脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNA
3、DNA)RNARNA主要是负责主要是负责DNADNA遗传信息的翻译和表达,遗传信息的翻译和表达,分分子量子量要比要比DNADNA小小得多。得多。RNARNA为为单链单链分子。分子。根据根据RNARNA的功能,可以分为的功能,可以分为mRNAmRNA、tRNAtRNA和和rRNArRNA三种。三种。核糖核酸(核糖核酸(RNARNA)组成核酸组成核酸的核苷酸的核苷酸核苷酸中核苷酸中的碱基的碱基核苷酸中核苷酸中的戊糖的戊糖结构结构DNAdAMPdAMP、dGMPdGMP、dCMPdCMP、dTMPdTMPA A、G G、C C、T T脱氧核糖脱氧核糖双链双链RNAAMPAMP、GMPGMP、CMPC
4、MP、UMPUMPA A、G G、C C、U U核糖核糖单链为主单链为主RNA RNA 与与 DNA DNA 的主要差别的主要差别DNA:真核生物主要分布在细胞核细胞核中,与组蛋白结合,以染色体形式存在;线粒体、叶绿体中有少量DNARNA:主要存在于细胞质细胞质中,细胞核、叶绿体、线粒体中有少量。v核酸的分布核酸的分布v核酸的生物学功能(核酸的生物学功能(P115)DNA是遗传物质的基础遗传物质的基础,控制控制蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成mRNA作为模板指导蛋白质的合成,传递传递DNA的的遗传信息遗传信息tRNA是转运工具转运工具,携带活化的氨基酸到正确位置rRNA是蛋白质合成的场所蛋白质
5、合成的场所。核酸核酸核苷酸核苷酸磷酸磷酸核苷核苷戊糖戊糖碱基碱基组成核酸的基本元素:组成核酸的基本元素:C、H、O、N、P,其中其中P含含量稳定(量稳定(9%-10%)v核酸的基本组成单位核酸的基本组成单位:核苷酸核苷酸v核酸的组成:核酸的组成:戊糖、磷酸、含氮碱基戊糖、磷酸、含氮碱基第二节第二节 核酸的组成核酸的组成成分成分P118DNA与RNA的组成比较 组成类别碱基戊糖磷酸嘧啶嘌呤RNA胞嘧啶尿嘧啶尿嘧啶腺嘌呤鸟嘌呤-D-核糖核糖磷酸DNA胸腺嘧啶胸腺嘧啶-D-2-脱脱氧核糖氧核糖 磷酸磷酸 核糖核糖 核酸核酸核苷酸核苷酸戊糖戊糖 核苷核苷 脱氧核糖脱氧核糖 嘌呤碱嘌呤碱 含氮碱含氮碱
6、嘧啶碱嘧啶碱 核酸的水解产物:核酸的水解产物:v核酸的基本结构单位是核酸的基本结构单位是核苷酸核苷酸,核苷酸由,核苷酸由碱基、戊糖和磷酸碱基、戊糖和磷酸组成组成-D-D-核糖核糖 -D-2-D-2-脱氧核糖脱氧核糖戊糖:戊糖:P118P118尿嘧啶尿嘧啶 胞嘧啶胞嘧啶 胸腺嘧啶胸腺嘧啶嘧啶嘧啶UCTAG腺嘌呤腺嘌呤 鸟嘌呤鸟嘌呤嘌呤嘌呤核苷核苷是由是由戊糖与含氮碱基戊糖与含氮碱基经脱水缩合而生成的化经脱水缩合而生成的化合物。合物。v核苷的糖与碱基之间以核苷的糖与碱基之间以糖苷键糖苷键相连接,这些糖苷相连接,这些糖苷键都是键都是-型型。在大多数情况下,核苷是由核糖或脱氧核糖的在大多数情况下,核苷
7、是由核糖或脱氧核糖的-C1-C1-羟基与嘧啶碱羟基与嘧啶碱N1N1或嘌呤碱或嘌呤碱N9N9进行缩合,故生进行缩合,故生成的化学键称为成的化学键称为,N N糖苷键糖苷键核苷脱氧核糖核苷脱氧核糖核苷核糖核苷核糖核苷核苷的分类核糖核糖+碱基碱基脱氧核糖脱氧核糖+碱基碱基核苷的命名腺嘌呤核糖腺嘌呤核苷腺嘌呤核苷(简称腺苷)(简称腺苷)v核糖核苷的命名:某碱基核苷某碱基核苷 简称:某苷某苷腺嘌呤脱氧核糖腺嘌呤脱氧核苷腺嘌呤脱氧核苷(简称脱氧腺苷)(简称脱氧腺苷)v脱氧核苷的命名:某碱基脱氧核苷某碱基脱氧核苷 简称:脱氧某苷脱氧某苷 腺苷腺苷(AR)脱氧胞苷脱氧胞苷(dCR)1,N9-糖苷键糖苷键 1,N
8、1-糖苷键糖苷键11N9N1碱碱基基糖糖l“稀有核苷稀有核苷”是由是由“稀有碱基稀有碱基”所生成的核苷。所生成的核苷。假尿苷(假尿苷()1,C5-糖苷键糖苷键1C5尿苷尿苷 核苷酸是由核苷酸是由核苷与磷酸核苷与磷酸经脱水缩合后经脱水缩合后生成的磷酸酯。生成的磷酸酯。核苷酸核苷酸P124核糖核苷酸核糖核苷酸脱氧核糖核苷酸脱氧核糖核苷酸核苷酸核苷酸腺嘌呤核苷酸磷酸磷酸戊糖戊糖碱基碱基核核苷苷磷酸与核糖的磷酸与核糖的羟羟基缩合成基缩合成酯酯时,由于核糖核时,由于核糖核苷苷的核的核糖糖上有三个游离上有三个游离羟羟基,故能生成基,故能生成三种三种核糖核糖核核苷苷酸的异构体,即酸的异构体,即2-2-核苷酸
9、、核苷酸、3-3-核苷酸核苷酸和和5-5-核苷酸;最常见者为核苷酸;最常见者为5-5-核苷酸核苷酸而脱氧核而脱氧核苷苷的脱氧核的脱氧核糖糖上仅有两个游离上仅有两个游离羟羟基,基,故只能生成故只能生成两种两种脱氧核脱氧核糖糖核核苷苷酸的异构体,即酸的异构体,即3-3-核苷酸和核苷酸和5-5-核苷酸核苷酸组成RNA的核苷酸 组成RNA的核苷酸主要有四种:1.腺嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸(腺苷酸腺苷酸)AMP2.鸟嘌呤核苷酸鸟嘌呤核苷酸(鸟苷酸鸟苷酸)GMP3.胞嘧啶核苷酸胞嘧啶核苷酸(胞苷酸胞苷酸)CMP4.尿嘧啶核苷酸尿嘧啶核苷酸(尿苷酸尿苷酸)UMP 组成DNA的核苷酸主要有四种:1.腺嘌呤脱氧核
10、苷酸腺嘌呤脱氧核苷酸(脱氧腺苷酸脱氧腺苷酸)dAMP2.鸟嘌呤脱氧核苷酸鸟嘌呤脱氧核苷酸(脱氧鸟苷酸脱氧鸟苷酸)dGMP3.胞嘧啶脱氧核苷酸胞嘧啶脱氧核苷酸(脱氧胞苷酸脱氧胞苷酸)dCMP4.胸腺嘧啶脱氧核苷酸胸腺嘧啶脱氧核苷酸(脱氧尿苷酸脱氧尿苷酸)dTMP组成DNA的核苷酸 多聚核苷酸是通过核苷酸的多聚核苷酸是通过核苷酸的5-5-磷酸基磷酸基与另一分子核苷酸的与另一分子核苷酸的C C3 3-OH-OH形成形成磷酸二磷酸二酯键酯键相连而成的链状聚合物。相连而成的链状聚合物。由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为DNADNA链;链;由核糖核苷酸聚合而成的则称为由核糖核苷酸
11、聚合而成的则称为RNARNA链。链。多聚核苷酸多聚核苷酸在讨论有关核酸问题时,一般只关心其中碱在讨论有关核酸问题时,一般只关心其中碱基的种类和顺序,所以上式可以进一步简化基的种类和顺序,所以上式可以进一步简化为:为:5PAPCPGPCPTPGPTPA 3 或 5 ACGCTGTA 3PP5335PP53P53ACGT多磷酸核苷酸P126 5-5-核苷酸又可按其在核苷酸又可按其在55位缩合的磷酸基位缩合的磷酸基的多少,分为一磷酸核苷(核苷酸)、二磷的多少,分为一磷酸核苷(核苷酸)、二磷酸核苷和三磷酸核苷。酸核苷和三磷酸核苷。AMP:一磷酸腺苷ADP:二磷酸腺苷ATP:三磷酸腺苷 ATP是生物体内
12、分布最广和最重要的一是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。种核苷酸衍生物。O-POO-NNNNNH2OHHOHHOHHOCH2O-POO-O-POO-三磷酸腺苷(ATP)ATPATP的性质的性质ATP ATP 分子的最显著特点是含有两个分子的最显著特点是含有两个高能磷酸高能磷酸键键。ATP ATP 水解释放出来的能量用于推动生物水解释放出来的能量用于推动生物体内各种需能的生化反应。体内各种需能的生化反应。ATP ATP 是生物体内最重要的能量转换中间体。是生物体内最重要的能量转换中间体。ATP ATP 也是一种很好的磷酰化剂。也是一种很好的磷酰化剂。脱氧脱氧碱基碱基磷酸基数目磷酸基数目
13、磷酸磷酸dA(腺嘌呤)腺嘌呤)M(一)一)PG(鸟嘌呤)鸟嘌呤)D(二)二)T(胸腺嘧胸腺嘧啶)啶)T(三)三)C(胞嘧啶)胞嘧啶)U(尿嘧啶)尿嘧啶)核苷酸核苷酸的有关的有关缩写符号(缩写符号(补)补)常见核苷酸及符号一磷酸一磷酸二磷酸二磷酸三磷酸三磷酸腺苷腺苷AMPADPATP鸟苷鸟苷GMPGDPGTP胞苷胞苷CMPCDPCTP尿苷尿苷UMPUDPUTP脱氧胸苷脱氧胸苷dTMPdTDPdTTP多磷酸核苷的生物功能1.四种三磷酸核苷(ATP、GTP、CTP、UTP)是合成RNA的重要原料2.四种三磷酸脱氧核苷(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)是合成DNA的重要原料。3.ATP在生物体
14、内化学能的储存和利用中起着重要的作用4.ATP、GTP、CTP、UTP在多种物质的合成中提供所需的能量。环一磷酸腺苷环一磷酸腺苷 环一磷酸鸟苷环一磷酸鸟苷(信息传递和信息放大作用)(信息传递和信息放大作用)5.环核苷酸的分子结构环核苷酸的分子结构 RNARNA通常以单链形式存在,但也可形成通常以单链形式存在,但也可形成局局部的双螺旋部的双螺旋结构。结构。RNARNA分子的种类较多,分子大小变化较大,分子的种类较多,分子大小变化较大,功能多样化。功能多样化。主要的主要的RNARNA种类有种类有rRNArRNA、mRNAmRNA、tRNAtRNA、tRNAtRNA是分子最小,但含有是分子最小,但含
15、有稀有碱基最多稀有碱基最多的的RNARNA,其稀有碱基的含量可多达,其稀有碱基的含量可多达20%20%。tRNAtRNA是单链核酸,但其分子中的某些局是单链核酸,但其分子中的某些局部也可形成双螺旋结构。部也可形成双螺旋结构。RNA的多核苷酸链可以在某些部分弯曲拆叠,形成双螺旋区,此即RNA的二级结构v tRNAtRNA的二级结构由于局部双螺旋的形成而的二级结构由于局部双螺旋的形成而呈现呈现“三叶草三叶草”形,故称为形,故称为 “三叶草三叶草”结构结构。v tRNAtRNA的的“三叶草三叶草”形结构包括:形结构包括:氨基酸臂、氨基酸臂、DHUDHU环环、反密码、反密码环环、可变、可变环环和和TC
16、TC环环五五部分。部分。氨基酸臂氨基酸臂可变环可变环DHU环环反密码环反密码环TC环环(1)(1)氨基酸接受区氨基酸接受区(2)(2)反密码区反密码区与与(3)(3)二氢尿嘧啶区二氢尿嘧啶区(4)(4)T T C C区区(5)(5)可变区可变区v氨基酸臂氨基酸臂:三叶草型结构的“叶柄”,由7个碱基对组成的螺旋区与3末端上CCA相连接的部分组成,它是结合氨基酸的部位。v二氢尿嘧啶环(二氢尿嘧啶环(DHUDHU环)环):含有两个二氧尿嘧啶vTCTC环:环:含有胸苷(T)假尿苷()胞苷(C)序列v反密码环反密码环:其顶端的三个核苷酸残基组成三联反密码子,可识别mRNA分子上氨基酸的三联密码子,在蛋白
17、质生物合成中起着重要的翻译作用。v附加叉(额外环、可变环)附加叉(额外环、可变环):不同的tRNA,其附加叉核苷酸残基数目差异较大,故又称其为可变环。tRNA的二级结构在空间伸展,形成倒倒“L”型型的三维空间立体结构即tRNA的三级结构。在倒L型的一端为反密码环,另一端为氨基酸臂,拐角处则为DHU环和TC环n在在tRNAtRNA二级结构中未二级结构中未配对的某些并不互补配对的某些并不互补的碱基参与了三级结的碱基参与了三级结构中特殊的氢键作用,构中特殊的氢键作用,tRNAtRNA链中的核糖链中的核糖-磷磷酸骨架与某些碱基甚酸骨架与某些碱基甚至其他的骨架之间也至其他的骨架之间也能产生作用。能产生作
18、用。mRNAmRNA可形成局部双螺旋结构的二级结构。可形成局部双螺旋结构的二级结构。mRNAmRNA在真核生物中的初级产物称为在真核生物中的初级产物称为HnRNAHnRNA。v大多数真核成熟的大多数真核成熟的mRNAmRNA分子具有典型的分子具有典型的5-5-端端的的7-7-甲基鸟苷三磷酸甲基鸟苷三磷酸帽子帽子结构和结构和3-3-端端的的多聚腺苷酸多聚腺苷酸(polyApolyA)尾巴尾巴结构。结构。5-cap的功能的功能(1)防止防止mRNA被核酸酶降解。被核酸酶降解。(2)为为mRNA翻译活性所必需。翻译活性所必需。(3)与蛋白质合成的正确起始有关。与蛋白质合成的正确起始有关。polyA的
19、功能的功能(1)保护保护mRNA,免受核酸外切酶的作用。,免受核酸外切酶的作用。(2)与翻译有关,没有与翻译有关,没有polyA翻译活性降低。翻译活性降低。(3)与与mRNA从细胞核转移到细胞质有关。从细胞核转移到细胞质有关。v mRNAmRNA分子中带有遗传密码,其功能分子中带有遗传密码,其功能是为蛋白质的合成是为蛋白质的合成提供模板提供模板。v mRNAmRNA分子中每三个相邻的核苷酸组分子中每三个相邻的核苷酸组成一组,在蛋白质翻译合成时代表一成一组,在蛋白质翻译合成时代表一个特定的氨基酸,这种核苷酸三联体个特定的氨基酸,这种核苷酸三联体称为称为 遗传密码遗传密码l rRNArRNA是细胞
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