基因表达与调控下真核基因表达调控一般规律优选专选课件.ppt
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1、基因表达与调控下真核基因表达调控一般规律22023-8-11基因表达与调控下真核基因表达调控一般规律 真核生物(除酵母、藻类和原生动物等单细胞类真核生物(除酵母、藻类和原生动物等单细胞类之外)主要由多细胞组成,每个细胞基因组中蕴之外)主要由多细胞组成,每个细胞基因组中蕴藏的遗传信息量及基因数量都大大高于原核生物藏的遗传信息量及基因数量都大大高于原核生物。人类细胞单倍体基因组有人类细胞单倍体基因组有3109bp,为大肠杆菌,为大肠杆菌总总DNA的的800倍,噬菌体的倍,噬菌体的10万倍左右!万倍左右!真核基因表达调控的最显著特征是能在特定真核基因表达调控的最显著特征是能在特定时间和特定的细胞中激
2、活特定的基因,从而实现时间和特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定预定”的、有序的、不可逆转的分化、发育过的、有序的、不可逆转的分化、发育过程,并使生物的组织和器官在一定的环境条件范程,并使生物的组织和器官在一定的环境条件范围内保持正常功能。围内保持正常功能。真核生物基因调控,根据其性质可分为两大类:真核生物基因调控,根据其性质可分为两大类:第一类是瞬时调控或称可逆性调控,它相当于原核细第一类是瞬时调控或称可逆性调控,它相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应,包括某种底物或激素水胞对环境条件变化所做出的反应,包括某种底物或激素水平升降及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。平升降及细胞周
3、期不同阶段中酶活性和浓度的调节。第二类是发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控第二类是发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。进程。根据基因调控在同一事件中发根据基因调控在同一事件中发生的先后次序又可分为:生的先后次序又可分为:DNA水平调控(水平调控(DNA regulation);转录水平调控转录水平调控(transcriptional regulation););转录后水平调控转录后水平调控(post transcriptional regulation););翻译水平调控翻译水平调控
4、(translational regulation););蛋白质加工水平的调控蛋白质加工水平的调控(regulation of protein maturation)等)等。8.1 真核生物的基因结构与转录活性真核生物的基因结构与转录活性真核生物与原核生物基因表达调控的特点比较:真核生物与原核生物基因表达调控的特点比较:1.1.原核生物无细胞核,真核生物具有核膜包裹着的细原核生物无细胞核,真核生物具有核膜包裹着的细胞核,所以原核基因的转录和翻译通常偶联在一起,而真胞核,所以原核基因的转录和翻译通常偶联在一起,而真核基因的转录是在细胞核中进行,翻译在胞质中进行;核基因的转录是在细胞核中进行,翻译
5、在胞质中进行;2.2.原核的染色质基本上是裸露的原核的染色质基本上是裸露的DNADNA,而真核的染色质,而真核的染色质则是由则是由DNADNA与组蛋白紧密结合形成为核小体;与组蛋白紧密结合形成为核小体;在原核细胞中,染色质的结构对基因的表达没有明显的在原核细胞中,染色质的结构对基因的表达没有明显的调控作用,而在真核中,这种作用是明显的。调控作用,而在真核中,这种作用是明显的。3.3.原核生物的基因数目少,而且都是连续的。而真核原核生物的基因数目少,而且都是连续的。而真核生物的基因数目众多,多数基因组基因都是不连续的,含生物的基因数目众多,多数基因组基因都是不连续的,含有数量不等的内含子以及功能
6、不清的重复序列等;有数量不等的内含子以及功能不清的重复序列等;4.4.真核生物生成的初始转录物需在核中进行一系列的真核生物生成的初始转录物需在核中进行一系列的转录后加工和运输,所以,真核基因的表达有多种转录后转录后加工和运输,所以,真核基因的表达有多种转录后的调控机制,如的调控机制,如5 5-端加帽、端加帽、3 3-端加端加poly(A)poly(A)尾、剪接及尾、剪接及成熟成熟mRNAmRNA由胞核到胞质的运输等;由胞核到胞质的运输等;5.5.原核基因转录多为多顺反子,即参与同一个代谢途原核基因转录多为多顺反子,即参与同一个代谢途径的多个蛋白基因串联在一起,受同一个调控序列的调控径的多个蛋白
7、基因串联在一起,受同一个调控序列的调控;而真核基因转录多为单顺反子。而且一个真核基因通常;而真核基因转录多为单顺反子。而且一个真核基因通常有多个调控序列,必须有多个激活物同时特异地结合上,有多个调控序列,必须有多个激活物同时特异地结合上,才能启动基因的转录;才能启动基因的转录;6.6.在原核基因转录的调控中,既有激活物的调控(正在原核基因转录的调控中,既有激活物的调控(正调控),也有阻遏物的调控(负调控),二者同等重要。调控),也有阻遏物的调控(负调控),二者同等重要。在真核中虽然也有正调控成分和负调控成分,但迄今已知在真核中虽然也有正调控成分和负调控成分,但迄今已知的主要是正调控。的主要是正
8、调控。7.7.真核生物大都为多细胞生物,在个体发育过程中逐真核生物大都为多细胞生物,在个体发育过程中逐步分化形成各种组织和细胞类型。分化是不同基因表达的步分化形成各种组织和细胞类型。分化是不同基因表达的结果。不同类型的细胞,功能不同,基因表达的情况也不结果。不同类型的细胞,功能不同,基因表达的情况也不一样。某些基因仅特异地在某种细胞中表达,称为细胞特一样。某些基因仅特异地在某种细胞中表达,称为细胞特异性或组织特异性表达,因而具有调控这种特异性表达的异性或组织特异性表达,因而具有调控这种特异性表达的机制。机制。8.8.真核生物对外界环境条件变化的反应和原核生物十真核生物对外界环境条件变化的反应和
9、原核生物十分不同。同一群原核生物细胞处在相同的环境条件中,对分不同。同一群原核生物细胞处在相同的环境条件中,对环境条件的变化会作出基本一致的反应;而真核生物常常环境条件的变化会作出基本一致的反应;而真核生物常常只有少部分细胞基因的表达直接受到环境条件变化的影响只有少部分细胞基因的表达直接受到环境条件变化的影响和调控,其他大部分间接或不受影响。和调控,其他大部分间接或不受影响。8.1.1 基因家族基因家族 真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合,被称为基真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合,被称为基因家族(因家族(gene familygene family)。)。定义:真核基因组中来源相
10、同,结构相似,功能相关的一定义:真核基因组中来源相同,结构相似,功能相关的一组基因。可能由某一共同祖先基因组基因。可能由某一共同祖先基因(ancestral gene)(ancestral gene)经重经重复复(duplication)(duplication)和突变产生。和突变产生。特点:家族成员可以分布于不同染色体上;特点:家族成员可以分布于不同染色体上;可集中于一条染色体上,串联排列在一起,形成可集中于一条染色体上,串联排列在一起,形成基因簇基因簇(gene cluster)(gene cluster);有些成员不产生有功能的基因产物,这种基因称有些成员不产生有功能的基因产物,这种基因
11、称为假基因为假基因(Pseudogene)(Pseudogene)。1 1、简单多基因家族、简单多基因家族 特点:特点:家族成员串联排列在一起家族成员串联排列在一起 组成一个转录单位组成一个转录单位 代表代表:rRNA基因家族基因家族 (重复单元重复单元28S、18S、5.8s-rRNA)脊椎动物中脊椎动物中rRNArRNA基因家族主要成员的分布与成熟过程分析基因家族主要成员的分布与成熟过程分析。2 2、复杂多基因家族、复杂多基因家族 特点:相关基因家族排列在一起,之间有间隔序列,分别特点:相关基因家族排列在一起,之间有间隔序列,分别 作为独立的转录单位。作为独立的转录单位。代表代表:组蛋白基
12、因家族。组蛋白基因家族。间隔区间隔区3 3、发育相关复杂基因家族、发育相关复杂基因家族 特点:分布在不同的染色体上特点:分布在不同的染色体上;独立的转录单位独立的转录单位;基因顺序与表达顺序相关。基因顺序与表达顺序相关。代表代表:珠蛋白基因家族。珠蛋白基因家族。图8-7 人细胞中和-珠蛋白基因簇结构示意图8.1.2 染色质的结构对基因表达的调控染色质的结构对基因表达的调控 真核基因组真核基因组DNADNA与组蛋白结合成核小体,再进一步形成更高与组蛋白结合成核小体,再进一步形成更高级的染色质结构,染色质中级的染色质结构,染色质中DNADNA和组蛋白的结构状态影响和组蛋白的结构状态影响转录。转录。
13、细胞分裂时染色体的大部分到间期时松开分散在核内,细胞分裂时染色体的大部分到间期时松开分散在核内,称为常染色质称为常染色质(euchromatin)(euchromatin),松散的染色质中的基因可,松散的染色质中的基因可以转录。染色体中的某些区段到分裂期后保持紧凑折叠的以转录。染色体中的某些区段到分裂期后保持紧凑折叠的结构,在间期核中可以看到其浓集的斑块,称为异染色质结构,在间期核中可以看到其浓集的斑块,称为异染色质(heterochromatin)(heterochromatin),其中未见有基因转录。,其中未见有基因转录。在常染色质中表达的基因如移到异染色质则不表达;即紧在常染色质中表达的
14、基因如移到异染色质则不表达;即紧密的染色质结构阻止基因表达。密的染色质结构阻止基因表达。异染色质化可能是关闭基因活性的一种途径。异染色质化可能是关闭基因活性的一种途径。常染色质(活性染色质)结构上的特点:常染色质(活性染色质)结构上的特点:具有具有DNaseI超敏感位点超敏感位点 具有基因座控制区具有基因座控制区 具有核基质结合区(具有核基质结合区(MAR序列)序列)DNase的敏感性和基因表达的敏感性和基因表达 含有转录活性基因的染色质区域对含有转录活性基因的染色质区域对DNase降解的敏感降解的敏感性要比无转录活性区域高得多性要比无转录活性区域高得多(超敏感位点超敏感位点)。这是由于此。这
15、是由于此区域染色质的区域染色质的DNA蛋白质结构变得松散,蛋白质结构变得松散,DNase易于接易于接触到触到DNA之故。之故。组蛋白的作用组蛋白的作用 组蛋白是带正电荷的碱性蛋白质,可与组蛋白是带正电荷的碱性蛋白质,可与DNA链上链上带负电荷的磷酸基相结合,从而封闭了带负电荷的磷酸基相结合,从而封闭了DNA分子分子,妨碍基因转录。活跃转录的染色质区段中,妨碍基因转录。活跃转录的染色质区段中H1水水平降低。平降低。转录活跃的区域也转录活跃的区域也常缺乏核小体的结常缺乏核小体的结构,并且对核酸酶构,并且对核酸酶敏感度增加。敏感度增加。特异的转录因子可特异的转录因子可消除组蛋白的阻遏消除组蛋白的阻遏
16、作用,使基因转录作用,使基因转录。组蛋白组蛋白H3H3和和H4H4的的N N端端2020个氨基酸通过甲基化、乙酰化和磷个氨基酸通过甲基化、乙酰化和磷酸化作用会改变组蛋白与酸化作用会改变组蛋白与DNADNA间的亲和力,为其它蛋白和间的亲和力,为其它蛋白和转录因子等的结合提供了机会。转录因子等的结合提供了机会。组蛋白组蛋白H3H3和和H4H4的乙酰化与活性染色质有关,而甲基化与非的乙酰化与活性染色质有关,而甲基化与非活性染色质有关。活性染色质有关。8.1.3 8.1.3 真核生物真核生物DNADNA水平上的基因表达调控水平上的基因表达调控 DNA水平的调控是真核生物发育调控的一种形式水平的调控是真
17、核生物发育调控的一种形式,包括基因丢失、扩增、重排和移位等。,包括基因丢失、扩增、重排和移位等。1.基因丢失基因丢失(chromosome diminution)有的生物个体发育早期在体细胞中要丢失部分染色体,有的生物个体发育早期在体细胞中要丢失部分染色体,而在生殖细胞中保持全部的基因组。马蛔虫(而在生殖细胞中保持全部的基因组。马蛔虫(Parascaris equoorum)。)。动物极动物极植物极植物极 小麦瘿蚊(小麦瘿蚊(Mayetiole destructor)受精卵的细胞核分)受精卵的细胞核分裂,而受精卵不分裂,形成合胞体(裂,而受精卵不分裂,形成合胞体(syncytium)。当核)。
18、当核第第3次分裂后,有两核移向卵后端的一个特殊区域,叫做次分裂后,有两核移向卵后端的一个特殊区域,叫做极细胞质,在极细胞质中的核保持了全套的染色体(极细胞质,在极细胞质中的核保持了全套的染色体(2n=40),将来分化为生殖细胞。而在一般的细胞质中,染),将来分化为生殖细胞。而在一般的细胞质中,染色丢失了色丢失了32条,只保留条,只保留8条,将来分化为体细胞。条,将来分化为体细胞。小麦瘿蚊(小麦瘿蚊(Mayetiole destructor):):2n=40。极细胞区:极细胞区:2n=402n=8 动物克隆表明高等生动物克隆表明高等生物细胞核未发生基因物细胞核未发生基因丢失。丢失。2、基因扩增、
19、基因扩增 基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性大量增加基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性大量增加的现象。它使细胞在短期内产生大量的基因产物的现象。它使细胞在短期内产生大量的基因产物以满足生长发育的需要,是基因活性调控的一种以满足生长发育的需要,是基因活性调控的一种方式。方式。非洲爪蟾的卵母细胞中原有非洲爪蟾的卵母细胞中原有rRNArRNA基因(基因(rDNArDNA)约)约500500个拷个拷贝,在减数分裂粗线期,基因开始迅速复制,到双线期拷贝,在减数分裂粗线期,基因开始迅速复制,到双线期拷贝数约为贝数约为200200万个,扩增近万个,扩增近40004000倍,可用于合成倍,可用于合成10101
20、212个核个核糖体。糖体。rDNArDNA是采用滚环式复制方式在核仁区进行的扩增,扩增产生的新是采用滚环式复制方式在核仁区进行的扩增,扩增产生的新rDNArDNA不纳入线不纳入线形染色体中,而是一环状小形染色体中,而是一环状小DNADNA分子方式存在。每个环状分子方式存在。每个环状DNADNA分子中有分子中有2 24 4个,甚个,甚至至1616个个rRNArRNA基因。基因。果蝇的不切离的多次复制使基因扩增,果蝇的不切离的多次复制使基因扩增,DNADNA不切离的不切离的多次扩增形成复制泡的网状结构多次扩增形成复制泡的网状结构 3、基因重排、基因重排 将一个基因从远离启动子的地方移到较近的位点将
21、一个基因从远离启动子的地方移到较近的位点从而启动转录,被称为基因重排。从而启动转录,被称为基因重排。例:免疫球蛋白的产生、例:免疫球蛋白的产生、种类、结构和多样性。种类、结构和多样性。B淋巴细胞的分化过程:淋巴细胞的分化过程:骨髓干细胞骨髓干细胞前前B淋巴细胞淋巴细胞未成熟未成熟B淋巴细胞淋巴细胞成熟成熟B淋巴细胞淋巴细胞外周外周B淋巴细胞淋巴细胞抗体抗体骨髓骨髓(基因发生重排基因发生重排)外周血外周血不同不同Ig家族的家族的V、D、J、C基因片段数基因片段数 V D J C 人人 小鼠小鼠 人人 小鼠小鼠 人人 小鼠小鼠 人人 小鼠小鼠L 6 4L 1000 30 12 4 4 9 8家族家
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