酶-生物化学与分子生物学课件.ppt
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- 生物化学 分子生物学 课件
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1、Enzyme第第 三三 章章 酶酶 第第一一节节 酶的催化特点酶的催化特点 第第二二节节 酶的结构与功能酶的结构与功能 第三节第三节 酶促反应动力学酶促反应动力学 第四节第四节 酶的调节酶的调节 第五节第五节 酶与医学的关系酶与医学的关系 第六节第六节 酶的分类与命名酶的分类与命名概述概述(一)酶的概念(一)酶的概念n酶是一类由活细胞产生的,酶是一类由活细胞产生的,对其特异对其特异底物具有高效催化作用的底物具有高效催化作用的蛋白质。蛋白质。n目前将生物催化剂分为两类目前将生物催化剂分为两类:酶酶 和和 非酶生物催化剂(如:核酶)非酶生物催化剂(如:核酶)(二)酶的化学本质(二)酶的化学本质 1
2、 1大多数酶是蛋白质大多数酶是蛋白质19261926年美国年美国SumnerSumner得到了脲酶的结晶,并指出酶是蛋白质。得到了脲酶的结晶,并指出酶是蛋白质。19301930年年NorthropNorthrop等得到了胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋等得到了胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的结晶,并进一步证明了酶是蛋白质。白酶的结晶,并进一步证明了酶是蛋白质。J.B.SumnerJ.B.SumnerJ.H.NorthropJ.H.Northrop 20世纪世纪80年代发现某些年代发现某些RNA有催化活性,甚至有些有催化活性,甚至有些DNA也有催化活性,使酶是蛋白质的传统概念受到很大冲击。也有催化
3、活性,使酶是蛋白质的传统概念受到很大冲击。2 2某些某些RNARNA有催化活性有催化活性 1982年美国年美国T.Cech等人发现四膜虫的等人发现四膜虫的rRNA前体能在完全没前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,即有蛋白质的情况下进行自我加工,即RNA有催化活性。有催化活性。Thomas Cech University of Colorado at Boulder,USA 1983年美国年美国S.Altman等研究等研究RNaseP(由(由20%蛋白质和蛋白质和80%的的RNA组成),发现组成),发现RNaseP中的中的RNA可催化可催化E.coli tRNA的前体加工。的前体加工。S
4、idney Altman Yale University New Haven,CT,USA Cech和和Altman各自独立地发现了各自独立地发现了RNA的催化活性,并的催化活性,并命名这一类酶为命名这一类酶为ribozyme(核酶)。(核酶)。两人因此共同获得了两人因此共同获得了1989年诺贝尔化学奖。年诺贝尔化学奖。3有些有些DNA也有催化活性也有催化活性 1995年年Cuenoud等发现有些等发现有些DNA分子亦具有催化分子亦具有催化活性。活性。第一节第一节 酶的催化特点酶的催化特点The CharacteristicThe Characteristic ofof Enzyme-Cata
5、lyzed Enzyme-Catalyzed ReactionReaction 只能催化热力学上允许的化学反应;只能催化热力学上允许的化学反应;反应前后本身不发生变化;反应前后本身不发生变化;能加快可逆反应的速度,但不改变反应的平衡点;能加快可逆反应的速度,但不改变反应的平衡点;加快反应速度的机制都是降低反应所需的活化能加快反应速度的机制都是降低反应所需的活化能。酶促反应的能力学基础酶促反应的能力学基础化学反应速率的依赖因素:化学反应速率的依赖因素:分子间碰撞频率分子间碰撞频率 有有效碰撞分子的百分数效碰撞分子的百分数几个概念:几个概念:能阈能阈:反应物分子发生化学变化所需最低能量反应物分子发
6、生化学变化所需最低能量 活化分子活化分子:含有高于反应能阈而能起反应的分子含有高于反应能阈而能起反应的分子 活化能活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量底物分子从初态转变到活化态所需的能量供给能量,如加温、光照等供给能量,如加温、光照等降低活化能降低活化能酶的催化特点酶的催化特点高度的催化能力高度的催化能力高度的专一性高度的专一性高度的不稳定性高度的不稳定性可调节性可调节性(一)高度的催化能力(一)高度的催化能力 酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不需要较高的反应温度。例例 :2 2H H2 2O O2 22H2H2 2O+OO+O2 2 1mol H1mol H2 2O O2 2酶
7、能催化酶能催化 5 510106 6 molmol H H2 2O O2 2的分解的分解1 1mol Femol Fe3+3+只能催化只能催化 6 61010-4-4 mol Hmol H2 2O O2 2的分解的分解 酶的催化效率通常比非催化反应高酶的催化效率通常比非催化反应高10108 810102020倍,倍,比一般催化剂高比一般催化剂高10107 710101313倍。倍。酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的活化能。酶比一般催化剂能更有效地降低反应的活化能。酶比一般催化剂能更有效地降低反应的活化能。活化能。活化态活化态例例:2H2O22H
8、2O+O2 反反 应应活化能活化能非催化反应非催化反应335kJ/mol铂催化反应铂催化反应49.4kJ/molH2O2酶催化酶催化8.36kJ/mol要求底物具有特定的结构。酶的这种要求底物具有特定的结构。酶的这种特 性 称 为 酶 的 专 一 性 或 特 异 性特 性 称 为 酶 的 专 一 性 或 特 异 性。针对底物分子内部的化学键、催化针对底物分子内部的化学键、催化反应的类型、底物分子的立体结构。反应的类型、底物分子的立体结构。*酶的专一性酶的专一性根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,酶的专一性可大致分为以下酶的专一性可大致分为以下3 3种类型
9、:种类型:绝对专一性绝对专一性:只能催化一种物质进行一种化只能催化一种物质进行一种化学反应的性质。(脲酶)学反应的性质。(脲酶)相对专一性相对专一性:催化同一类化合物或同一种化催化同一类化合物或同一种化学键进行化学反应的性质。(胰蛋白酶)学键进行化学反应的性质。(胰蛋白酶)立体异构专一性立体异构专一性:只对立体异构体中的一种只对立体异构体中的一种起催化作用。(淀粉酶)起催化作用。(淀粉酶)CONH2NH2H2O脲脲酶酶CO2 +2NH3CONH2NHCH3H2O脲脲酶酶X(三)高度不稳定性(三)高度不稳定性 酶是蛋白质,而大多蛋白质不稳定,酶是蛋白质,而大多蛋白质不稳定,如:其在强酸或强碱条件
10、下易变性。如:其在强酸或强碱条件下易变性。酶生成与降解量的调节酶生成与降解量的调节 酶活性的调节酶活性的调节 通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包括三方面的调节。其中包括三方面的调节。第二节第二节酶的结构与功能酶的结构与功能The Structure and Function of Enzyme 一、一、酶的分子酶的分子组成组成蛋白质部分蛋白质部分酶蛋白酶蛋白 非蛋白质部分非蛋白质部分辅助因子辅助因子 金属离子金属离子
11、小分子有机化合物小分子有机化合物(全酶全酶)*各部分在催化反应中的作用各部分在催化反应中的作用q酶蛋白酶蛋白决定反应的特异性决定反应的特异性q辅助因子辅助因子决定反应的种类与性质决定反应的种类与性质 金属离子的作用金属离子的作用催化过程中传递电子;催化过程中传递电子;作为连接酶与底物的桥梁,便于酶对底物起作用;作为连接酶与底物的桥梁,便于酶对底物起作用;稳定酶的构象;稳定酶的构象;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。小分子有机化合物的作用小分子有机化合物的作用参与酶的催化反应,在反应中起运输载体的作用,传参与酶的催化反应,在反应中起运输载体的作用,传递电子、
12、质子或其它基团。递电子、质子或其它基团。小分子有机化合物在催化中的作用小分子有机化合物在催化中的作用尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸维生素维生素B12生物素生物素吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)叶酸叶酸NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸,辅酶I)NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶苷酸磷酸,辅酶II)FMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)
13、FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)辅酶辅酶A(CoA)硫辛酸硫辛酸钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类生物素生物素磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛四氢叶酸四氢叶酸氢原子(质子)氢原子(质子)醛基醛基酰基酰基烷基烷基二氧化碳二氧化碳氨基氨基甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基甲炔基、甲酰基等一碳单位等一碳单位所含的维生素所含的维生素名名称称小分子有机化合物小分子有机化合物(辅辅 酶酶 或或 辅辅 基基)转移的基团转移的基团尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维
14、生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸维生素维生素B12生物素生物素吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)叶酸叶酸NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸,辅酶I)NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶苷酸磷酸,辅酶II)FMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)辅酶辅酶A(CoA)硫辛酸硫辛酸钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类生物素生物素磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛四氢叶酸四氢叶酸氢原子(质子)氢原子(质子)醛基醛基酰基酰基烷基
15、烷基二氧化碳二氧化碳氨基氨基甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基甲炔基、甲酰基等一碳单位等一碳单位所含的维生素所含的维生素名名称称小分子有机化合物小分子有机化合物(辅辅 酶酶 或或 辅辅 基基)转移的基团转移的基团 金属酶金属酶(金属离子为酶的一部分)(金属离子为酶的一部分)金属离子与酶结合牢固,提取过程中不易丢失。金属离子与酶结合牢固,提取过程中不易丢失。羧肽酶(羧肽酶(ZnZn2+2+)和黄嘌呤氧化酶()和黄嘌呤氧化酶(MoMo6+6+)。)。金属活化酶(激活酶)金属活化酶(激活酶)金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。紧密。各种激
16、酶和核酸酶(各种激酶和核酸酶(MgMg2+2+)。)。辅助因子分类辅助因子分类(按其(按其与酶蛋白结合的紧密程度与酶蛋白结合的紧密程度)辅酶辅酶:与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松,可用疏松,可用透析或超滤的透析或超滤的 方法除去。方法除去。辅基辅基:与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,不能用紧密,不能用透析或超滤的透析或超滤的方法除去方法除去。酶分子上结合底物并催化底物转变成产酶分子上结合底物并催化底物转变成产物的部位。物的部位。酶的必需基团在空间结构上彼此靠近,酶的必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,其能与底物组成具有特定空间结构的区域,其能与底物特异结合并将底物转化为产物。这一
17、区域称特异结合并将底物转化为产物。这一区域称为酶的活性中心或活性部位。为酶的活性中心或活性部位。二二 酶的活性中心酶的活性中心(active center)(active center):活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团(催化底物转变成产物)(催化底物转变成产物)位于活性中心以外,维持酶活性位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象。中心应有的空间构象。底底 物物 活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 活性中心活性中心 溶菌酶的溶菌酶的活性中心活性中心*谷氨酸谷氨酸35和天和天冬氨酸冬氨酸52是催化是催化基团;
18、基团;*色氨酸色氨酸62和和63、天冬氨酸天冬氨酸101和和色氨酸色氨酸108是结是结合基团;合基团;*AF为底物多为底物多糖链的糖基,位糖链的糖基,位于酶的活性中心于酶的活性中心形成的裂隙中。形成的裂隙中。一些酶活性中心的氨基酸残基一些酶活性中心的氨基酸残基 酶酶 残基总数残基总数 活性中心残基活性中心残基牛胰核糖核酸酶牛胰核糖核酸酶 124 His12,His119,Lys41溶菌酶溶菌酶 129 Asp52,Glu35牛胰凝乳蛋白酶牛胰凝乳蛋白酶 245 His57,Asp102,Ser195牛胰蛋白酶牛胰蛋白酶 238 His46,Asp90,Ser183木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶 212
19、Cys25,His159 弹性蛋白酶弹性蛋白酶 240 His45,Asp93,Ser188枯草杆菌蛋白酶枯草杆菌蛋白酶 275 His46,Ser221碳酸酐酶碳酸酐酶 258 His93-Zn-His95,His117酶的不同形式酶的不同形式 单体酶:由单一肽链组成的具有完全催化活性的酶。单体酶:由单一肽链组成的具有完全催化活性的酶。寡聚酶:由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成寡聚酶:由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。的酶。多酶复合体:由几种不同功能的酶彼此聚合形成的复多酶复合体:由几种不同功能的酶彼此聚合形成的复合物。合物。多功能酶:一些多酶体系在进化过程中由于基因的融多功能
20、酶:一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。称为多功能酶。第三节第三节酶促反应动力学酶促反应动力学Kinetics of Enzyme-Catalyzed ReactionKinetics of Enzyme-Catalyzed Reaction 概念概念酶促反应动力学:研究酶促反应速度及酶促反应动力学:研究酶促反应速度及其影响因素。其影响因素。反应速度:用单位时间内底物减少的量反应速度:用单位时间内底物减少的量或产物增加的量来表示,常用初速度来或产物增加的量来表示,常用初速度来衡量。衡量。影
21、响酶促反应速度的因素:影响酶促反应速度的因素:底物浓度底物浓度S酶浓度酶浓度E反应温度反应温度pH 值值抑制剂抑制剂激活剂激活剂1、中间产物学说:、中间产物学说:E+S ES E+P k1 k2k3米氏方程的提出米氏方程的提出 一、底物浓度对反应速度的影响一、底物浓度对反应速度的影响SEE-S复合物复合物abcabcES酶的诱导契合酶的诱导契合反应速度与底物浓度成正比;反反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。应为一级反应。当底物浓度较低时当底物浓度较低时随着底物浓度的增高随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速;反应反应速度不再成正比例加速;反应为混合级反应。为混合级反应。当底物浓度高达
22、一定程度当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度;反应速度不再增加,达最大速度;反应为零级反应反应为零级反应v 在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应速度的影响呈速度的影响呈矩形双曲线关系矩形双曲线关系。19131913年年Michaelis和和Menten推导了米氏方程推导了米氏方程 SKSVvmmax 米米氏氏方方程程的的推推导导 121kkkESSESSEt令令:Kmkkk121将将(4)代入代入(3),则,则:SKSVvmmax1kES 1kES2kEP ESEt SESES生成速度生成速度:SESEkvt11,ES分解速度分解速度:ES
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