第一篇分子生物学基本原理课件.ppt
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- 一篇 分子生物学 基本原理 课件
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1、分子生物学基本原理分子生物学基本原理第一篇第一篇第一章第一章 基基 因因第一节第一节基因的基本概念基因的基本概念及基因的结构特点及基因的结构特点一、核酸是遗传信息的载体一、核酸是遗传信息的载体 DNA的结构:的结构:一级结构一级结构二级结构二级结构三级结构三级结构 DNA上主要携带两类遗传信息:上主要携带两类遗传信息:一类是编码信息一类是编码信息 另一类是调控信息另一类是调控信息 真核细胞的真核细胞的DNA中存在着大量的非编码序列中存在着大量的非编码序列 RNARNA RNA分为三类:分为三类:mRNA;rRNA;tRNA。基因基因(gene):(gene):是核酸分子中贮存遗传信息的遗传单位
2、,是指是核酸分子中贮存遗传信息的遗传单位,是指贮存有功能的蛋白质多肽链或贮存有功能的蛋白质多肽链或RNARNA序列信息及表达这序列信息及表达这些信息所必须的全部核酸序列。些信息所必须的全部核酸序列。按照此说,基因即包括编码序列,也包括它的调按照此说,基因即包括编码序列,也包括它的调控序列及内含子和上、下游的非编码序列。控序列及内含子和上、下游的非编码序列。真核生物和原核生物及多数病毒的基因都以真核生物和原核生物及多数病毒的基因都以DNADNA的形式存在,少数病毒(的形式存在,少数病毒(RNARNA病毒)的基因是以病毒)的基因是以RNARNA的的形式存在形式存在。二、基因的基本概念二、基因的基本
3、概念基因一般特点:基因一般特点:多数生物的基因都是由多数生物的基因都是由DNA组成,而少数组成,而少数病毒的基因是由病毒的基因是由RNA组成。组成。基因的大多数都编码在染色体上,但也有基因的大多数都编码在染色体上,但也有编码在染色体之外的基因。如质粒、线粒编码在染色体之外的基因。如质粒、线粒体、叶绿体等。体、叶绿体等。原核生物的基因是连续编码的,而真核细原核生物的基因是连续编码的,而真核细胞基因是断裂基因。胞基因是断裂基因。在病毒的基因组中存在着重叠基因的现象在病毒的基因组中存在着重叠基因的现象基因组基因组(GenomeGenome)的概念的概念:Genome最早由德国植物遗传学家温克勒最早由
4、德国植物遗传学家温克勒尔于尔于1920年提出,它由年提出,它由gene和和chromosome组合而成。组合而成。基因组是指一个细胞中核酸的全部核苷酸基因组是指一个细胞中核酸的全部核苷酸排列序列,即一个细胞中蕴藏着的全部遗传自排列序列,即一个细胞中蕴藏着的全部遗传自信。信。第二节第二节 结构基因中贮存的遗传信息结构基因中贮存的遗传信息 结构基因中贮存的遗传信息结构基因中贮存的遗传信息 RNA的结构信息的结构信息 蛋白质的结构信息蛋白质的结构信息 RNA的特点:的特点:mRNA:原核与真核的区别:原核与真核的区别 tRNA:rRNA:结构基因与蛋白质信息之间的关系结构基因与蛋白质信息之间的关系
5、遗传密码遗传密码:蛋白质结构的特点:蛋白质结构的特点:遗传密码表遗传密码表第三节第三节结构基因变异及其结构基因变异及其与疾病的关系与疾病的关系 基因突变及发生机制基因突变及发生机制:自发突变与诱变自发突变与诱变 基因突变的类型:基因突变的类型:转换;颠换转换;颠换 基因突变的后果:基因突变的后果:基因突变与疾病的关系:基因突变与疾病的关系:基因突变导致蛋白质功能降低或丧失基因突变导致蛋白质功能降低或丧失 基因突变导致蛋白质活性异常增高基因突变导致蛋白质活性异常增高 基因表达量过高导致某种蛋白质过量基因表达量过高导致某种蛋白质过量 基因突变导致蛋白质产生过少而不能形成基因突变导致蛋白质产生过少而
6、不能形成正常功能正常功能 第二章第二章 基因组的结构与功能基因组的结构与功能第二节第二节 原核生物基因组原核生物基因组一、原核生物基因组结一、原核生物基因组结构与功能的特点构与功能的特点基因组为一个环状双链基因组为一个环状双链DNA分子:分子:原核生物的原核生物的DNA与一个大的支架蛋白与一个大的支架蛋白结合形成一个复合结构,结合形成一个复合结构,习惯上仍称为习惯上仍称为染色体染色体。细。细菌细胞没有细胞核,但它菌细胞没有细胞核,但它的染色体的染色体DNA在细胞中形在细胞中形成一个致密的区域,称为成一个致密的区域,称为类核类核(nucleoid)。基因组中只有一个复制起始点。基因组中只有一个复
7、制起始点。具有操纵子的结构:具有操纵子的结构:操纵子操纵子(operon):指数个功能上相关联的结构基因串指数个功能上相关联的结构基因串联在一起,构成一个信息区,它共用一个上游的调控区和下联在一起,构成一个信息区,它共用一个上游的调控区和下游的终止信号,上游的调控区包括游的终止信号,上游的调控区包括启动子启动子(promoter)和操纵和操纵基因基因(operator)在转录时将几个相联的结构基因一同转录成在转录时将几个相联的结构基因一同转录成RNA,形成的,形成的RNA也为也为多顺反子多顺反子。编码顺序不会重叠编码顺序不会重叠结构基因的序列是连续编码的,不存在内含子,结构基因的序列是连续编码
8、的,不存在内含子,转录后不需剪切。转录后不需剪切。编码区在基因组中占的比例(约编码区在基因组中占的比例(约50%)多于真核)多于真核细胞,但小于病毒基因组。非编码区主要是一些细胞,但小于病毒基因组。非编码区主要是一些调控序列。调控序列。重复序列少:原核细胞的结构基因多为单拷贝,重复序列少:原核细胞的结构基因多为单拷贝,但编码但编码rRNA的基因往往是多拷贝的。的基因往往是多拷贝的。存在编码同功酶的基因。存在编码同功酶的基因。细菌基因组存在着可移动的细菌基因组存在着可移动的DNA序列,包括插入序列,包括插入序列和转座子。序列和转座子。含有多种功能的识别区域,如复制起始区、复制含有多种功能的识别区
9、域,如复制起始区、复制终止区、转录起动区和终止区等。终止区、转录起动区和终止区等。大肠杆菌染色体基因组的结构和功能大肠杆菌染色体基因组的结构和功能 大肠杆菌染色体基因组是研究最清楚的基因大肠杆菌染色体基因组是研究最清楚的基因组。估计大肠杆菌基因组含有组。估计大肠杆菌基因组含有3500个基因个基因,已被定,已被定位的有位的有900个左右个左右。在这。在这900个基因中,有个基因中,有260个个基因已查明具有操纵子结构,定位于基因已查明具有操纵子结构,定位于75个操纵子个操纵子中。中。在已知的基因中在已知的基因中8的序列具有调控作用。大肠杆菌的序列具有调控作用。大肠杆菌染色体基因组中已知的基因多是
10、编码一些酶类的基因,染色体基因组中已知的基因多是编码一些酶类的基因,如氨基酸、嘌呤、嘧啶、脂肪酸和维生素合成代谢的如氨基酸、嘌呤、嘧啶、脂肪酸和维生素合成代谢的一些酶类的基因,以及大多数碳、氮化合物分解代谢一些酶类的基因,以及大多数碳、氮化合物分解代谢的酶类的基因。的酶类的基因。另外,核糖体大、小亚基中另外,核糖体大、小亚基中50多种蛋白质多种蛋白质的的基因也已经鉴定了。基因也已经鉴定了。二、质粒二、质粒质粒的一般特性:质粒的一般特性:1.质粒是存在于细菌细胞中独立于染色体之外的自主质粒是存在于细菌细胞中独立于染色体之外的自主复制的遗传成分。绝大多数的质粒都是由环形双链复制的遗传成分。绝大多数
11、的质粒都是由环形双链DNA组成,极少发现线性质粒和组成,极少发现线性质粒和RNA成分的质粒。质成分的质粒。质粒的大小差别很大,小的质粒分子量约为粒的大小差别很大,小的质粒分子量约为106,仅编码,仅编码2-3个蛋白质,而最大的分子可比它大个蛋白质,而最大的分子可比它大100倍。倍。2.质粒与宿主菌是寄生的关系,质粒离开细菌不能独质粒与宿主菌是寄生的关系,质粒离开细菌不能独立的复制和生存,而细菌离开质粒仍能正常生存。立的复制和生存,而细菌离开质粒仍能正常生存。3.质粒的存在可以赋予细菌新的遗传特性,这包括抗质粒的存在可以赋予细菌新的遗传特性,这包括抗性特征、代谢特征、修饰宿主生活方式的因子等,其
12、性特征、代谢特征、修饰宿主生活方式的因子等,其中对抗菌素的抗性是质粒最重要的特性。中对抗菌素的抗性是质粒最重要的特性。质粒的遗传控制质粒的遗传控制 质粒带有自己的复制调控系统,可有效的控制质粒带有自己的复制调控系统,可有效的控制质粒在宿主细胞中的拷贝数量。质粒在宿主细胞中的拷贝数量。质粒还有自己精确的分配拷贝到子细胞中的能质粒还有自己精确的分配拷贝到子细胞中的能力。力。质粒还有控制宿主细胞有丝分裂的能力,以便质粒还有控制宿主细胞有丝分裂的能力,以便确保每个子代细胞中稳定的质粒数目。确保每个子代细胞中稳定的质粒数目。高拷贝质粒在细菌中常形成多聚体的形式,在高拷贝质粒在细菌中常形成多聚体的形式,在
13、细菌分裂时,这种多聚体又拆散成单体,控制这一细菌分裂时,这种多聚体又拆散成单体,控制这一过程的诸多因子构成了位点特异重组系统。过程的诸多因子构成了位点特异重组系统。质粒的不相容性:质粒的不相容性:质粒的类型质粒的类型1.结合型质粒、可移动型质粒和自传递型质粒结合型质粒、可移动型质粒和自传递型质粒2.严谨型质粒和松驰型质粒严谨型质粒和松驰型质粒3.窄宿主型质粒和广宿主型质粒窄宿主型质粒和广宿主型质粒一、真核生物染色质一、真核生物染色质DNA的高级结构的高级结构 DNA高级结构中的蛋白质高级结构中的蛋白质组蛋白组蛋白与与非组蛋白非组蛋白第二节第二节 真核生物基因组真核生物基因组 DNA与蛋白质的结
14、与蛋白质的结合与染色体的组装合与染色体的组装 基因组大,编码蛋白质多,一般编码蛋白都基因组大,编码蛋白质多,一般编码蛋白都超过超过1万个以上。在万个以上。在DNA复制时,有多个复复制时,有多个复制起始点。制起始点。真核生物的结构基因都是单顺反子。真核生物的结构基因都是单顺反子。真核生物的基因组中含有大量的重复序列真核生物的基因组中含有大量的重复序列(45%)。真核生物的基因组中存在大量的非编码区。真核生物的基因组中存在大量的非编码区。二、真核生物核基因组结构和功能特点二、真核生物核基因组结构和功能特点 真核基因为断裂基因,在它的结构基真核基因为断裂基因,在它的结构基因中含有外显子和内含子。因中
15、含有外显子和内含子。真核生物的基因组中存在着各种基因真核生物的基因组中存在着各种基因家族。家族。真核生物基因组中也存在移动基因。真核生物基因组中也存在移动基因。基因组中结构基因所占区域远小于非基因组中结构基因所占区域远小于非编码区。编码区。三、真核生物基因组的结构三、真核生物基因组的结构结构基因结构基因 断裂基因断裂基因(split gene):真核生物的结构基:真核生物的结构基因是不连续的编码氨基酸的序列被非编码因是不连续的编码氨基酸的序列被非编码序列所打断,因此被称为断裂基因。序列所打断,因此被称为断裂基因。外显子外显子(exon):在真核生物的结构基因中,:在真核生物的结构基因中,编码氨
16、基酸的序列称为外显子,它被数个编码氨基酸的序列称为外显子,它被数个内含子分隔成数个片段间隔排列。内含子分隔成数个片段间隔排列。内含子内含子(intron):在真核生物的结构基因:在真核生物的结构基因中,在编码氨基酸序列之间存在着数个非中,在编码氨基酸序列之间存在着数个非编码的序列称为内含子。编码的序列称为内含子。顺式调控原件顺式调控原件 顺式调控元件顺式调控元件(cis-acting elements):与结构基因:与结构基因表达调控相关,能够被基因调控蛋白特异性识别和表达调控相关,能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的结合的DNA序列。序列。包括:启动子、上游启动元件、增强子、加尾包括:启动子
17、、上游启动元件、增强子、加尾信号和一些其它反应元件。信号和一些其它反应元件。反式作用元件反式作用元件(trans-acting elements):一些可以:一些可以通过结合顺式元件二调节基因转录活性的蛋白因子。通过结合顺式元件二调节基因转录活性的蛋白因子。启动子启动子(promoter):(promoter):启动子是启动子是DNA分子可以分子可以与与RNA聚合酶特异识别和结合的部位,启动聚合酶特异识别和结合的部位,启动子位于结构基因的上游,每个结构基因的上游子位于结构基因的上游,每个结构基因的上游都含有一个启动子。都含有一个启动子。启动子具有高度的保守性,真核基因的启动子具有高度的保守性,
18、真核基因的启动子必须与转录因子结合后才能被启动子必须与转录因子结合后才能被RNA聚聚合酶识别与结合,并启动转录。这一点与原核合酶识别与结合,并启动转录。这一点与原核细胞不同。细胞不同。真核细胞的启动子元件是真核细胞的启动子元件是TATA盒盒(TATA box),位于转录起始点上游,位于转录起始点上游-25bp处。处。上游启动子元件上游启动子元件(upstream promoter element):是是TATA盒上游的一些特定的盒上游的一些特定的DNA序列,反式作序列,反式作用因子可与这些元件结合,通过参与促进用因子可与这些元件结合,通过参与促进RNA聚合聚合酶与酶与DNA的结合,调节的结合,
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