基因芯片技术在心血管研究中的应用课件.ppt

1、n1986 Dulbecco在在Science撰文撰文“肿瘤肿瘤研究的转折点研究的转折点:人类基因组的测序人类基因组的测序”，提出，提出全面解读人类基因组序列。全面解读人类基因组序列。n1990.10 美国国家卫生研究机构率先启动人美国国家卫生研究机构率先启动人类基因组计划类基因组计划 实验方法和技术的产实验方法和技术的产生生 n2003.4 人类基因组计划完成人类基因组计划完成 后基因后基因组时代组时代乳腺癌诊断组织芯片乳腺癌诊断组织芯片蛋白质芯片示意图蛋白质芯片示意图基因芯片原型基因芯片原型 根据碱基互补配对的原理，根据碱基互补配对的原理，标记的待测样本标记的待测样本DNADNA与芯片上特

2、定位置的探针杂交，与芯片上特定位置的探针杂交，通过分析处理芯片的杂交检测图像确定靶通过分析处理芯片的杂交检测图像确定靶DNADNA序列，序列，这样就可对细胞和组织中大量的基因信息进行分析。这样就可对细胞和组织中大量的基因信息进行分析。原位合成方法的工作原理原位合成方法的工作原理基因芯片技术流程基因芯片技术流程 基因芯片对基因表达谱的分析基因芯片对基因表达谱的分析限制性片段长度多态性限制性片段长度多态性 微卫星标记微卫星标记421.ATCCTGTACCTACGTGTACAATAGTA.CTGATCATCTCTATGGG.2.ATCCTGTTCCTACGTGTACAATAGTA.CTGATCATC

3、TCTATGGG.3.ATCCTGTACCTACGTGTACAATAGTA.CTGATCAGCTCTATGGG.123SNP1SNP2单核苷酸多态性（单核苷酸多态性（SNPs）1.群体关联分析群体关联分析2.家系连锁分析家系连锁分析n2007年年Samani 等应用等应用Affymetrix 500K SNP芯片芯片,对德国人心肌梗死家庭研究对德国人心肌梗死家庭研究(GerMI)中中875例心肌梗死病例和例心肌梗死病例和1644名对照进行基因名对照进行基因型检测型检测,发现了除发现了除9p21区域的位点区域的位点rs1333049外的外的6个与冠心病显著关联的位点个与冠心病显著关联的位点。nR

4、ysa等等 以含以含4 000个个CDNA/表达序列标签表达序列标签(EST)微阵列检微阵列检测自发性高血压引起的进行性左心室肥大小鼠心室基因表测自发性高血压引起的进行性左心室肥大小鼠心室基因表达，证实了进行性左心室肥大与收缩蛋白和利钠肽基因的达，证实了进行性左心室肥大与收缩蛋白和利钠肽基因的表达增高有关。并对表达增高有关。并对20个月和个月和12个月的自发性高血压小鼠个月的自发性高血压小鼠心室基因表达进行了比较，发现了有心室基因表达进行了比较，发现了有92个已知基因和个已知基因和35个个EST表达有差异，其中的上调基因主要编码细胞结构和信表达有差异，其中的上调基因主要编码细胞结构和信号蛋白，

5、大多数的下调基因则编码与脂肪酸和能量代谢相号蛋白，大多数的下调基因则编码与脂肪酸和能量代谢相关的蛋白质。关的蛋白质。nLitvin等通过下腔静脉造瘘造成小鼠因体积负荷而导致心等通过下腔静脉造瘘造成小鼠因体积负荷而导致心肌肥大，用肌肥大，用Afymetrix基因表达芯片检测心肌中基因表达芯片检测心肌中PLF基因基因家族的表达水平，发现在心肌肥大的过程中其表达水平升家族的表达水平，发现在心肌肥大的过程中其表达水平升高，而通过手术降低负荷后其表达水平则下降，表明心肌高，而通过手术降低负荷后其表达水平则下降，表明心肌肥大的发展与肥大的发展与PLF基因家族的表达水平有关，从而为心肌基因家族的表达水平有关

6、，从而为心肌肥大的基因治疗提供了可能。肥大的基因治疗提供了可能。在药物代谢酶中在药物代谢酶中,CYP2D6 及及CYP2C9 的基因多态性对药物的基因多态性对药物治疗的疗效及不良反应的影响受到广泛关注。如根据治疗的疗效及不良反应的影响受到广泛关注。如根据CYP2D6 基因的多态性将患者分为基因的多态性将患者分为3种类型即弱代谢者、正种类型即弱代谢者、正常代谢者和超速代谢者。弱代谢者常代谢者和超速代谢者。弱代谢者1d仅需给药仅需给药1次就能维持次就能维持药效药效,而且不用给予缓释制剂，而超速代谢者就必须缩短给而且不用给予缓释制剂，而超速代谢者就必须缩短给药间隔。药间隔。载脂蛋白载脂蛋白E 的基因型能影响降血脂药苯扎贝特的的基因型能影响降血脂药苯扎贝特的降血脂作用，降血脂作用，E4 基因型患者用苯扎贝特治疗时，基因型患者用苯扎贝特治疗时，降胆固醇和低密度脂蛋白作用明显小于降胆固醇和低密度脂蛋白作用明显小于E2 和和E3基因型。基因型。