ZX第5章-基因的调控课件.ppt
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- ZX 基因 调控 课件
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1、分子遗传学分子遗传学 Molecular Genetics第第5 5章章 基因的调控基因的调控12第第5 5章章 基因的调控基因的调控5.1 基因调控的基本模型基因调控的基本模型5.2 调控序列与调控蛋白调控序列与调控蛋白5.3 基因的分子调控基因的分子调控5.4 原核生物操纵子的特点原核生物操纵子的特点5.5 因子级联调控模型因子级联调控模型5.6 真核基因的分子调控真核基因的分子调控多因子调控多因子调控5.7 真核基因的染色质调控真核基因的染色质调控5.8 转录后的基因调控转录后的基因调控5.9 真核基因的调控模型真核基因的调控模型Davidson-Britten模型模型5.10 真核基因
2、的多位点协同调控真核基因的多位点协同调控 随着人类及相关生物的基因组计划的完成随着人类及相关生物的基因组计划的完成,人人类将进入一个对数以万计的基因进行结构功能的类将进入一个对数以万计的基因进行结构功能的研究时代。研究时代。人类基因组仅仅含人类基因组仅仅含2.53万个基因万个基因,对真核基因,对真核基因的调控机制进行分析并确定基因如何行使它们的的调控机制进行分析并确定基因如何行使它们的功能,将是十分迫切而艰巨的任务。人类的发育功能,将是十分迫切而艰巨的任务。人类的发育、克隆、癌症的治疗、衰老与长寿等重大问题的、克隆、癌症的治疗、衰老与长寿等重大问题的探索与解决都说明,探索与解决都说明,今后的基
3、因调控的研究,将今后的基因调控的研究,将以真核细胞的基因调控为主。以真核细胞的基因调控为主。5研究基因表达调控的重要意义研究基因表达调控的重要意义1997-2003 籍贯:苏格兰籍贯:苏格兰3 S.H.E 组合组合6Life cycle of human being 7Alcohol metabolismEthanol 乙醇乙醇ADHAcetaldehyde乙醛乙醛Acetate乙酸乙酸ALDHADH1B.1:CaucasianADH1B.2:ChineseADH1B.3:IndianALDH1(cytoplasm)ALDH2(Mitochondria)50%of Chinese,Japane
4、se do not have ALDH2 activity8基因的表达是受到严格调控的基因的表达是受到严格调控的(一)时间特异性(一)时间特异性 往往与细胞或个体的特定分化、发育阶段相适往往与细胞或个体的特定分化、发育阶段相适应,又称应,又称阶段特异性阶段特异性。(二)空间特异性(二)空间特异性 由细胞在各组织器官的分布差异所决定的,故由细胞在各组织器官的分布差异所决定的,故又称为又称为细胞特异性细胞特异性或或组织特异性组织特异性。迎面桃花次第开迎面桃花次第开9基因表达的方式基因表达的方式(一)组成性表达(一)组成性表达 管家基因管家基因 (housekeepinghousekeeping g
5、enes)genes)在生命全过程都是必需的、且在一个生物个体在生命全过程都是必需的、且在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因。的几乎所有细胞中持续表达的基因。组成性基因表达组成性基因表达 管家基因较少受环境因素的影响,在个体发育管家基因较少受环境因素的影响,在个体发育的任一阶段都能在大多数细胞中持续表达。的任一阶段都能在大多数细胞中持续表达。10(二)诱导和阻遏表达(二)诱导和阻遏表达诱导表达诱导表达 在特定环境信号刺激下,基因表现为开放或增强,在特定环境信号刺激下,基因表现为开放或增强,表达产物增加。表达产物增加。阻遏表达阻遏表达 在特定环境信号刺激下,基因被抑制,从而使表在特定环境
6、信号刺激下,基因被抑制,从而使表达产物减少。达产物减少。11(三)协调表达(三)协调表达 在一定机制控制下,功能相关的一组基因,协在一定机制控制下,功能相关的一组基因,协调一致,共同表达。调一致,共同表达。121213 基因表达调控可在几个不同水平上进行。基因表达调控可在几个不同水平上进行。在高度复杂的生物、细胞及其代谢过程中,在高度复杂的生物、细胞及其代谢过程中,基因表达是高度有序的。如在高等生物中,基因表达是高度有序的。如在高等生物中,特定的细胞已分化成高度特化的细胞,特定的细胞已分化成高度特化的细胞,人人类眼睛的细胞只能合成眼色特有的蛋白,类眼睛的细胞只能合成眼色特有的蛋白,其绝不可能合
7、成肝细胞中特有的解毒酶,其绝不可能合成肝细胞中特有的解毒酶,各种特定细胞能阻遏不同类别的基因的表各种特定细胞能阻遏不同类别的基因的表达。达。14 基因表达的调控对生物是极端重要的。基因表达的调控对生物是极端重要的。1.真核生物:各种不同类型的细胞能阻遏不同类型基因真核生物:各种不同类型的细胞能阻遏不同类型基因的表达。的表达。2.细菌具有阻遏基因表达的能力。细菌具有阻遏基因表达的能力。在进化中,细胞具备了一套机制,它能抑制那些并非在进化中,细胞具备了一套机制,它能抑制那些并非必须的酶的基因和激活那些在某一时间内明显必须的必须的酶的基因和激活那些在某一时间内明显必须的酶的基因。达到这一目的的二个条
8、件:酶的基因。达到这一目的的二个条件:1)必须具备关闭或打开每种特定基因的方法;)必须具备关闭或打开每种特定基因的方法;2)对应该激活一种特定基因或一组基因的特定环境具备)对应该激活一种特定基因或一组基因的特定环境具备正确识别的能力。正确识别的能力。1516Three levels controlThree levels control17Gene regulation very complex in eukaryotes cells!5.1 5.1 基因调控的基本模型基因调控的基本模型 5.1.1 5.1.1 原核基因调控基本模型原核基因调控基本模型 1961 1961年,提出年,提出乳糖操
9、纵子模型乳糖操纵子模型,19881988探明,探明,除了启动子邻近下游的操纵区外,还在除了启动子邻近下游的操纵区外,还在-93-93位、位、+402+402位有两个操纵区。位有两个操纵区。1990 1990年得到调节蛋白年得到调节蛋白LacILacI的结晶,并清楚的结晶,并清楚LacILacI以四聚体形式结合于以四聚体形式结合于21bp21bp的操作区。如,异丙基的操作区。如,异丙基硫代半乳糖苷(硫代半乳糖苷(IPTGIPTG)与)与LacILacI结合,结合,LacILacI的四聚的四聚体变构而脱离操作区。体变构而脱离操作区。乳糖操纵子模型乳糖操纵子模型2020 阻遏蛋白阻遏蛋白激活蛋白激活
10、蛋白原核生物的表达调控原核生物的表达调控2121经典:乳糖操纵子经典:乳糖操纵子(lactose(lactose operonoperon)Jacob and Monod2222u细菌对乳糖的利用及其相关的细菌对乳糖的利用及其相关的酶酶:乳糖乳糖(在通透酶作用下进入细菌)在通透酶作用下进入细菌)半乳糖苷酶半乳糖苷酶(细菌中少量存在)(细菌中少量存在)半乳糖苷酶半乳糖苷酶(细菌中少量存在)(细菌中少量存在)葡萄糖葡萄糖+半乳糖半乳糖半乳糖苷酶半乳糖苷酶 (细菌中少量存在)(细菌中少量存在)转乙酰基酶转乙酰基酶-功能未详功能未详2323IPOZYa控制位点控制位点结构基因结构基因u乳糖操纵子(乳糖
11、操纵子(Lactose operon)结构结构调控基因调控基因24IOO诱导剂诱导剂u乳糖操纵子的负调控乳糖操纵子的负调控251.操纵基因(操纵基因(Operator,简称简称O),),起到基因开关的作用。起到基因开关的作用。2.启动基因(启动基因(Promoter,简称,简称P),),是是RNA聚合酶结合的部聚合酶结合的部位,能起动位,能起动ZYA基因的表达,基因的表达,POZYA在在DNA上几个相邻接上几个相邻接的基因共同组成一个功能单位称操纵子。的基因共同组成一个功能单位称操纵子。3.调节基因(调节基因(I基因),基因),能编码产生一种阻遏蛋白,该蛋白能能编码产生一种阻遏蛋白,该蛋白能识
12、别和结合到操纵基因上,并能阻止识别和结合到操纵基因上,并能阻止RNA聚合酶启动的转聚合酶启动的转录,使乳糖操纵子处于关闭状态,一般情况下,阻遏蛋白录,使乳糖操纵子处于关闭状态,一般情况下,阻遏蛋白总是结合在操纵基因总是结合在操纵基因O区,使操纵子关闭。区,使操纵子关闭。如何开启操纵子表达?如何开启操纵子表达?当环境中存在乳糖及其类似物时(称为诱导物),它们能与当环境中存在乳糖及其类似物时(称为诱导物),它们能与阻遏物分子结合,改变阻遏蛋白的构型,使其不能再与操阻遏物分子结合,改变阻遏蛋白的构型,使其不能再与操纵基因纵基因O区结合。这时,操纵基因便开启,结合到启动子区结合。这时,操纵基因便开启,
13、结合到启动子上的上的RNA聚合酶能顺利启动聚合酶能顺利启动ZYA基因的表达,合成相应的基因的表达,合成相应的三种酶。三种酶。26二、其他基因二、其他基因I基因:基因:编码阻遏蛋白,能阻断编码阻遏蛋白,能阻断ZYA基因的表达。基因的表达。O操纵基因:操纵基因:是是DNA上与阻遏物结合的特异性位置。上与阻遏物结合的特异性位置。阻遏物一旦结合到阻遏物一旦结合到O基因上,就能阻止由基因上,就能阻止由RNA聚聚合酶催化的转录起动。合酶催化的转录起动。启动基因启动基因操纵子:操纵子:是几个基因协同表达的遗传功能单位。由是几个基因协同表达的遗传功能单位。由启动基因,操纵基因和转录成一条启动基因,操纵基因和转
14、录成一条mRNA分子的分子的几个相邻的基因组成的功能单位。几个相邻的基因组成的功能单位。27三、乳糖操纵子阻遏物具有两种识别功能三、乳糖操纵子阻遏物具有两种识别功能1.能识别操纵子上特定的操纵基因的序列;能识别操纵子上特定的操纵基因的序列;2.能识别乳糖或乳糖类似物,能识别乳糖或乳糖类似物,当阻遏物与乳糖或类当阻遏物与乳糖或类似物结合时,阻遏物分子的构型将发生变化,从似物结合时,阻遏物分子的构型将发生变化,从而使阻遏物失去了对操纵基因的亲和作用。阻遏而使阻遏物失去了对操纵基因的亲和作用。阻遏物将从物将从DNA上脱落下来。上脱落下来。对对Lac系统的阻遏作用的解除称为诱导,能使阻遏物系统的阻遏作
15、用的解除称为诱导,能使阻遏物失活并导致失活并导致Lac基因表达的乳糖类似物称为诱导物。基因表达的乳糖类似物称为诱导物。5.1.2 5.1.2 真核基因调控基本模型真核基因调控基本模型 在真核生物中,在真核生物中,DNADNA被装配成核小体结构的染色被装配成核小体结构的染色质。质。染色质是真核细胞基因调控的主要结构染色质是真核细胞基因调控的主要结构。真核细胞的调控过程中启用联合调控机制,细真核细胞的调控过程中启用联合调控机制,细胞中不同的特异的调控蛋白参与不同的调控机制胞中不同的特异的调控蛋白参与不同的调控机制,以启动和关闭基因表达。,以启动和关闭基因表达。根据根据协同性和协同作用的原则协同性和
16、协同作用的原则,一个生物可以,一个生物可以通过启用通过启用少数少数调控蛋白完成调控蛋白完成多种多种调控作用。调控作用。在一个基因的在一个基因的启动启动/关闭关闭的基本模型中,其上的基本模型中,其上游是一段核心启动子序列与基因相邻。游是一段核心启动子序列与基因相邻。核心启动子:是结合核心启动子:是结合RNARNA聚合酶聚合酶及辅助因子及辅助因子,引导,引导polpol从正确的起始位点开始转录部位。从正确的起始位点开始转录部位。仅靠仅靠核心启动子核心启动子的上游是一段的上游是一段调节启动子调节启动子,上,上游或下游的远处游或下游的远处是增强子序列是增强子序列(图(图5.25.2)。)。激活因子与调
17、节启动子和增强子结合,并通过激活因子与调节启动子和增强子结合,并通过结合在核心启动子上的结合因子与溶液中的基本结合在核心启动子上的结合因子与溶液中的基本转录机构的相互作用,使基本转录机构集结到核转录机构的相互作用,使基本转录机构集结到核心启动子上,而激活基因转录。心启动子上,而激活基因转录。有些激活因子在所有的细胞中表达,而一些仅在有些激活因子在所有的细胞中表达,而一些仅在某些特定的细胞中表达,调控细胞中某些特殊功能某些特定的细胞中表达,调控细胞中某些特殊功能的基因。的基因。基本转录因子复合体基本转录因子复合体5.2 5.2 调控序列与调控蛋白调控序列与调控蛋白 基因调控完全是一个基因调控完全
18、是一个DNADNA与蛋白质与蛋白质相互作用相互作用的过程。的过程。一些特异的一些特异的DNADNA序列作为相应的基因的开关,序列作为相应的基因的开关,一些基因调控蛋白结合上去打开一些基因调控蛋白结合上去打开/关闭这些开关,关闭这些开关,称为称为:正调控(正调控(positive regulationpositive regulation)或负调控(或负调控(negative regulation negative regulation)。)。相应的调控蛋白则称为相应的调控蛋白则称为:激活因子(激活因子(activaorsactivaors)或抑制因子或抑制因子(repressors)(repr
19、essors)。5.2.1 DNA5.2.1 DNA双螺旋的表面可被调控蛋白识别双螺旋的表面可被调控蛋白识别 基因表达总是在基因表达总是在DNADNA双螺旋的一条链上进行,双螺旋的一条链上进行,想象中的调控蛋白要结合到调控序列上必须把想象中的调控蛋白要结合到调控序列上必须把DNADNA双螺旋打开,然后再结合上去。现在知道并不需双螺旋打开,然后再结合上去。现在知道并不需要如此。要如此。暴露在暴露在DNADNA双螺旋大、小沟表面的酶对碱双螺旋大、小沟表面的酶对碱基的外缘都提供了它的氢键供体、氢键受体以及基的外缘都提供了它的氢键供体、氢键受体以及疏水区的情况各异的型式,这些型式是反映四种疏水区的情况
20、各异的型式,这些型式是反映四种碱基的准确信息;碱基的准确信息;调控蛋白就是依靠它们的识别调控蛋白就是依靠它们的识别来与调控序列结合。但是,来与调控序列结合。但是,只有在大沟中才能反只有在大沟中才能反映出四个碱基对排列的完整信息映出四个碱基对排列的完整信息。调控蛋白一般调控蛋白一般都结合于大沟中。(图都结合于大沟中。(图5.45.4)5.2.2 5.2.2 调控蛋白可以识别调控蛋白可以识别DNADNA的几何构型的几何构型 DNA DNA双螺旋中,每两个相邻的核苷酸对准确地双螺旋中,每两个相邻的核苷酸对准确地弯曲弯曲36360 0,形成每十个核苷酸对一个螺旋的几何,形成每十个核苷酸对一个螺旋的几何
21、构型。后来发现多数核苷酸段都有不规则之处,构型。后来发现多数核苷酸段都有不规则之处,如核苷酸对的倾斜、螺旋弯曲度大于或小于如核苷酸对的倾斜、螺旋弯曲度大于或小于3636度度使双螺旋有轻度的弯曲,累积可使使双螺旋有轻度的弯曲,累积可使DNADNA出现明显出现明显的弯曲。另一个有关的特点是某些序列有可以变的弯曲。另一个有关的特点是某些序列有可以变形的倾向。这些都可被调控蛋白所识别。形的倾向。这些都可被调控蛋白所识别。在识别过程中,在识别过程中,蛋白与蛋白与DNADNA紧密结合紧密结合,DNADNA做出一做出一定程度的变形。定程度的变形。5.2.3 5.2.3 调控蛋白含有识别调控蛋白含有识别DNA
22、DNA序列的结构型式序列的结构型式 调控蛋白对调控蛋白对DNADNA的识别,归根结底是对的识别,归根结底是对DNADNA序列序列的识别。主要是蛋白质对一定区域的的识别。主要是蛋白质对一定区域的DNADNA双螺旋的双螺旋的特异表面的特异表面的强烈互补强烈互补。调控蛋白都含有一种与调控蛋白都含有一种与DNADNA结合的结合的结构基序(结构基序(structural motifstructural motif)。)。这些型式的每一种都是以这些型式的每一种都是以螺旋及螺旋及 折叠与折叠与DNADNA大沟相结合大沟相结合。(图。(图5.65.6)大沟含有大沟含有DNADNA序列相互识别的足够信息序列相互
23、识别的足够信息 最简单、最常见的一种就是最简单、最常见的一种就是HTHHTH(helix-turn helix-turn helix motifhelix motif)型式。)型式。HTHHTH有两个有两个螺旋构成期间螺旋构成期间有一小段氨基酸连接,两个有一小段氨基酸连接,两个螺旋间的相互作用螺旋间的相互作用使之保持一定角度。使之保持一定角度。HTHHTH肽链的肽链的羧基端羧基端为识别螺旋为识别螺旋,与,与DNADNA大沟中的大沟中的DNADNA结合;结合;氨基端氨基端识别特异识别特异DNADNA序序列方面起作用。列方面起作用。螺旋螺旋-转角转角-螺旋螺旋(HTH)最早发现于噬菌体的阻抑蛋白中
24、。一个最早发现于噬菌体的阻抑蛋白中。一个螺旋螺旋位于位于DNADNA宽沟中,另一个位于穿过宽沟中,另一个位于穿过DNADNA的角中。的角中。5.3 5.3 基因的分子调控基因的分子调控 基因的表达与抑制实际上是一个分子水平上的基因的表达与抑制实际上是一个分子水平上的开开/关机制,而板动这个开关的是细胞周围环境关机制,而板动这个开关的是细胞周围环境中的各种信号。这种开关机制普遍存在于原核及中的各种信号。这种开关机制普遍存在于原核及真核细胞之中,只不过有简单与复杂而己。真核细胞之中,只不过有简单与复杂而己。5.3.1 5.3.1 单因子调控单因子调控-色氨酸操纵子色氨酸操纵子 色氨酸操纵子(色氨酸
25、操纵子(tryptophan operon),5个相邻个相邻的的trp基因。基因。Trp作为一个作为一个辅阻遏物辅阻遏物,其活化特异,其活化特异的的抑制者抑制者与与trp 操纵基因结合阻止转录。操纵基因结合阻止转录。色氨酸抑色氨酸抑制者是一种制者是一种HTH型调控蛋白型调控蛋白,两个色氨酸分子与两个色氨酸分子与其结合后才能与其结合后才能与trp操纵子操纵子DNA大沟结合。大沟结合。色氨酸抑制着色氨酸抑制着是色氨酸调控是色氨酸调控trptrp操纵子的唯一因操纵子的唯一因子,而子,而色氨酸色氨酸则是开关这个因子的单一信号。则是开关这个因子的单一信号。色氨酸阻抑蛋白(色氨酸阻抑蛋白(HTHHTH)的
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