计算化学的软硬件课件.ppt
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- 关 键 词:
- 计算 化学 软硬件 课件
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1、计算化学及其应用计算化学的软硬件Hardware and Software for Computation计算化学的工具 计算化学的基本工具是计算机 计算机包括两方面:硬件和软件计算机硬件的特点CPU个数:快,多,内存:大,快主板:稳定,显示器,显卡:通用,常见其它:一般主频高(2.0-3.0GHz),双CPU,多核CPU(双核,四核)1G,2G,4G,8G网络:千兆网局域网华硕等大品牌常见网卡Nvidia显卡,InsightII计算软件的特点 稳定 支持并行 支持大内存首选Unix/Linux系统Windows:个人使用Linux:计算使用Linux简介 常用系列:Redhat 7.28.0
2、9.0 企业版系列2.13.84.45.0 支持的硬件越来越多,但跟不上硬件的发展 其它系列:SuSE系列,Fedora Core系列,Debian系列,Ubuntu系列,BSD系列 版权:GNU(通用公共授权)Linux的架构 多用户系统:root为管理员,最高权限,管理系统和用户 文件系统以”/”为最高的根目录,所有文件,目录,硬件设备(硬盘,光驱)都是一个文件或目录 其文件格式是ext3,不是FAT32或NTFS,但是它可以读写FAT32文件,无法读写NTFS文件Linux的启动选项 Linux可启动为字符界面和视窗界面 文件/etc/inittab id:3:initdefault:字
3、符界面 id:5:initdefault:视窗界面 字符转视窗界面:startx 字符界面可以少使用内存100-400MB Gaussian计算采用字符界面 InsightII计算使用视窗界面搭建模型,字符界面计算Linux文件系统/bin:可执行的命令/dev:设备目录/etc:大多数设置文件,Linux启动,网络等/home:所有用户都在此/lib:库文件/usr:更多的命令,库文件,图形界面/root:管理员的主目录/sbin:系统命令,一般设置和查看系统信息Linux文件的属性 Linux用户分为不同的组 对于每个文件有三类用户:文件所有者 与文件所有者同组的 其它组的用户 文件的属性
4、:可读(r),可写(w),可执行性(x)文件的目录属性(d)文件属性表示 rwxrwxrwx drwxr-xr-x drwx-Linux基本命令:Shell Linux下人与机器的交流是通过shell进行的 Shell是一系列Linux命令以及类似c语言的控制结构组成 可以用一个命令完成一件事情 也可以把命令用控制结构组合起来完成复杂的重复劳动的事情,shell编程用户登录 login:用户名 password:密码 登录进去 exit (退出)Linux下的输入与输出 输入:命令文件 附加:命令文件 管道:命令|命令Linux文件名的通配符*:任意个字符,*.log 所有的log文件?:单个
5、字符,CH?.log:CH1.log CH2.log,Cha.log,Linux的简单命令 cat:在屏幕上显示文件的内容 cat 文件1 文件2 cat 文件1 文件2 文件a 把文件串起来放在另一个文件中 head n 显示文件的前n行 tail n 显示文件的最后n行 tail f 文件名 :监测文件的输出情况Linux的简单命令 grep grep 字符串 文件名 grep“SCF Done”CH3COOH.log grep i“SCF Done”CH3COOH.log cp cp filea fileb 文件拷贝 cp r dirA dirB 目录拷贝Linux的简单命令 ls ls
6、 显示当前目录下文件和目录 ls l 显示详细信息 ls a 把隐藏目录和文件(以.开头的文件)也显示.bashrc和.cshrc 登录时自动执行的命令文件,设置环境变量等 mkdir 目录名:创建目录 rm 文件名:删除文件;rm r 目录名:删除目录Linux的简单命令 ps 进程 ps e 查看所有进程 top 动态查看系统运行情况 q 退出top状态 kill-9 进程号:结束此进程Linux的简单命令 dos2unix 文件名:把DOS/windows格式的文件转换为Unix/Linux文件格式 df:查看磁盘剩余空间 cd:改变目录:用户主目录.:上一级目录 chmod:改变文件属
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