蛋白质酶抗体标记课件.ppt
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- 蛋白质 抗体 标记 课件
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1、第十一章第十一章 标标 记记标记的概念标记的概念 指以共价键的方式将放射性元素指以共价键的方式将放射性元素(如(如3H、14C、32P、35S、125I)或非放射性物质或非放射性物质(如地高(如地高辛、生物素、酶、荧光素)辛、生物素、酶、荧光素)结合到某些生命物结合到某些生命物质质(如(如DNA、RNA、寡核苷酸、抗体、抗原及、寡核苷酸、抗体、抗原及某些小分子物质)某些小分子物质)上的过程上的过程 标记技术已在序列测定、分子杂交、免疫标记技术已在序列测定、分子杂交、免疫分析等领域得到广泛应用;主要用于生命物质分析等领域得到广泛应用;主要用于生命物质的定性、定量的定性、定量 由示踪物和被标记物构
2、成的复合物称为探由示踪物和被标记物构成的复合物称为探针或某物的标记物针或某物的标记物第一节第一节 核核 酸酸 标标 记记 核酸标记是指能与核酸标记是指能与特定核酸序列特定核酸序列(靶序列)发生(靶序列)发生特特异性互补异性互补(杂交),并(杂交),并含示踪物含示踪物的已知核酸片段(的已知核酸片段(DNA或或RNA)一、标记物的制备及类型一、标记物的制备及类型 20C,70Y磷酸化法磷酸化法切口平移法切口平移法 广泛用于分子克隆过程;广泛用于分子克隆过程;缺点:缺点:只能在核酸的只能在核酸的5端端引进一个放射性原子,会限制探针的比活度引进一个放射性原子,会限制探针的比活度探针含有模板探针含有模板
3、DNA双链序列片段,在某些情况下,探针的互双链序列片段,在某些情况下,探针的互补链会竞争靶补链会竞争靶DNA与探针的结合与探针的结合 20C,80Y中期中期体外转录体外转录RNA探针法探针法 此法合成效率高,不需分离模板此法合成效率高,不需分离模板DNA,但但 应避免应避免RNase污染污染(一一)制备方法制备方法(二二)核酸标记类型核酸标记类型(同位素同位素)核素标记核素标记 通常采用的同位素有通常采用的同位素有3232P P、3333P P、3535S S,其,其中中3232P P活性强,信号比较好活性强,信号比较好 放射性探针与固相载体上的靶核酸杂交后,洗涤除去未杂放射性探针与固相载体上
4、的靶核酸杂交后,洗涤除去未杂交的探针,再通过交的探针,再通过X-X-射线衍射和放射自显影检测分析结果射线衍射和放射自显影检测分析结果(但此法须在特殊实验室进行,防止同位素伤人)(但此法须在特殊实验室进行,防止同位素伤人)非同位素标记非同位素标记 以生物素、地高辛和荧光素等非核素为示以生物素、地高辛和荧光素等非核素为示踪物,采用发光法或生色法检测(此法灵敏度与核素标记相踪物,采用发光法或生色法检测(此法灵敏度与核素标记相仿,但无核素污染问题,已成为标记技术的发展趋势)仿,但无核素污染问题,已成为标记技术的发展趋势)二、非核素标记二、非核素标记 生物素、地高辛生物素、地高辛等非放射性示踪物都很容易
5、掺入到等非放射性示踪物都很容易掺入到DNA或或RNA中制成核酸探针。其信号可采用荧光染料、中制成核酸探针。其信号可采用荧光染料、碱性磷酸酶、辣根过氧化物酶直接与生物素偶联,或碱性磷酸酶、辣根过氧化物酶直接与生物素偶联,或用荧光染料、碱性磷酸酶与抗地高辛抗体偶联进行检用荧光染料、碱性磷酸酶与抗地高辛抗体偶联进行检测测 此法此法标记量足标记量足(一次反应可标记数(一次反应可标记数mg),),稳定性稳定性好好(有效期可达(有效期可达2年)年)(一)地高辛(一)地高辛(DIG)1.双链双链DNA探针标记探针标记随机引物介导法随机引物介导法随机引物:不均一的寡核苷酸混合物(随机引物:不均一的寡核苷酸混合
6、物(612核苷酸单链核苷酸单链DNA)模板:单链模板:单链DNA酶:酶:DNA-pol(klenow片段)片段)合成原料:合成原料:dNTP混合物混合物标记物:标记物:Dig-dUTP其他试剂其他试剂 随机引物介导法是将线性随机引物介导法是将线性DNA模板上模板上多处多处与随机引物与随机引物杂交,在杂交,在DNA-pol的的 催化作用下,新链中掺入催化作用下,新链中掺入DIG-DIG-dUTPdUTP,从而提高标记的灵敏度(高效、高灵敏度)从而提高标记的灵敏度(高效、高灵敏度)试剂及操作(课本)试剂及操作(课本)切口平移法切口平移法原理:原理:当双链当双链DNA分子的一条链有切口时,分子的一条
7、链有切口时,E.coli-DNA-pol可将核苷酸残基(如可将核苷酸残基(如Dig-11-dUTP)加到切口处的)加到切口处的3-OH端;又由于该酶具有端;又由于该酶具有53外切酶活性外切酶活性,所以它可从,所以它可从切口的切口的5端除去核苷酸。端除去核苷酸。5端除去和端除去和3端加入核苷酸端加入核苷酸同时进同时进行,导致切口沿着行,导致切口沿着DNA模板链移动模板链移动2.2.单链单链DNADNA探针制备探针制备单链单链DNA探针的优点探针的优点 不存在互补双链,避免了不存在互补双链,避免了DNA双链在重新复性时形成双链在重新复性时形成无效杂交体的可能性无效杂交体的可能性方法方法 合成可克隆
8、于噬菌粒或合成可克隆于噬菌粒或M13噬菌体载体上的噬菌体载体上的DNA片段,片段,并以其作为模板合成与其互补的探针(并以其作为模板合成与其互补的探针(为为DNA)将克隆于特定载体(带有可被噬菌体依赖于将克隆于特定载体(带有可被噬菌体依赖于DNA的的RNA-pol识别的启动子)上的靶序列转录成识别的启动子)上的靶序列转录成RNA探针探针;再在反转录酶的催化作用下制备再在反转录酶的催化作用下制备cDNA探针探针 方法方法需分离探针和未标记的核酸,而方法需分离探针和未标记的核酸,而方法只需只需用不含用不含RNase的的DNase降解即可;故克隆降解即可;故克隆DNA片段的片段的体外转录法体外转录法是
9、合成单链是合成单链DNA探针的较好方法探针的较好方法3.PCR合成合成DNA探针探针 第一次循环之前于第一次循环之前于95变性变性7min,随后每次循环的条,随后每次循环的条件是:件是:95变性变性45s,60退火退火1min,72 延伸延伸2min(一(一个循环)个循环)用用PCR法制备的法制备的DIG探针探针灵敏度高灵敏度高(即使含有很少量的(即使含有很少量的副产物,也会明显影响杂交的特异性;所以在杂交之前,副产物,也会明显影响杂交的特异性;所以在杂交之前,要用凝胶电泳纯化探针)要用凝胶电泳纯化探针),数量大数量大4.寡核苷酸探针的制备寡核苷酸探针的制备 用用DIG-11-ddUTP制备寡
10、核苷酸探针,制备出来制备寡核苷酸探针,制备出来的探针有的探针有3端端-、5端端-寡核苷酸标记和寡核苷酸标记和3-端尾部寡端尾部寡核苷酸标记之分核苷酸标记之分(1)3端端-寡核苷酸探针寡核苷酸探针(2)3-端尾部寡核苷酸探针端尾部寡核苷酸探针 在在寡核苷酸寡核苷酸3-端加上端加上10100个碱基的尾巴。可提高个碱基的尾巴。可提高探针的灵敏度探针的灵敏度 在标记过程中,末端转移酶可将在标记过程中,末端转移酶可将DIG-11-dUTP加到寡加到寡核苷酸的核苷酸的3-尾端尾端 但探针的尾巴加长,可能会产生非特异性反应。所以但探针的尾巴加长,可能会产生非特异性反应。所以在杂交之前,通过一竞争序列(如在杂
11、交之前,通过一竞争序列(如polyA序列等)序列等)“预杂预杂交交”,或者改变设计条件等措施可降低非特异性反应(如,或者改变设计条件等措施可降低非特异性反应(如P201“b”)(3 3)55端端-寡核苷酸探针寡核苷酸探针 在合成待标记寡核苷酸至最后一步时,按固相氨基磷在合成待标记寡核苷酸至最后一步时,按固相氨基磷酸盐法,使酸盐法,使5端氨基化,将用氨水处理载体释放的寡核苷端氨基化,将用氨水处理载体释放的寡核苷酸与酸与DIG反应制成标记于反应制成标记于5端的寡核苷酸探针端的寡核苷酸探针5.RNA探针的制备探针的制备 采用体外转录法制备采用体外转录法制备先先克隆克隆合适的模板合适的模板DNA到相应
12、的转录载体(如噬菌体)到相应的转录载体(如噬菌体)将得到的重组将得到的重组DNA线性化线性化RNA-pol催化核苷三磷酸在强启动子下游固定位点开始催化核苷三磷酸在强启动子下游固定位点开始转转录录,并将修饰的核苷酸(如,并将修饰的核苷酸(如DIG-UTP)掺入到)掺入到RNA链中,从链中,从而获得具有一定长度和较高活性的而获得具有一定长度和较高活性的RNA探针(每探针(每2025个核个核苷酸可结合一个苷酸可结合一个DIG-11-UTP)(二)生物素(二)生物素 用生物素标记的探针与靶核酸杂交后,探针上的生物用生物素标记的探针与靶核酸杂交后,探针上的生物素能与链霉菌亲和素(或称链霉菌白蛋白)素能与
13、链霉菌亲和素(或称链霉菌白蛋白)-酶直接结合,酶直接结合,亲和素与生物素的结合力强(结合常数亲和素与生物素的结合力强(结合常数 );这类);这类蛋白质有蛋白质有4个结合生物素的位点,所以它既可与酶标记的个结合生物素的位点,所以它既可与酶标记的生物素结合,又可以与探针中的生物素结合生物素结合,又可以与探针中的生物素结合1510aK1.切口平移法制备生物素酰化的探针切口平移法制备生物素酰化的探针 此法采用生物素此法采用生物素-11-dUTP制备探针,每制备探针,每1kbDNA可掺可掺入约入约50个生物素分子个生物素分子2.随机引物介导法制备生物素酰化探针随机引物介导法制备生物素酰化探针(三)两种新
14、标记法(三)两种新标记法扫若仑标记和分子灯塔探针扫若仑标记和分子灯塔探针1.扫若仑标记扫若仑标记 扫若仑(扫若仑(psoralen)是一种天然的三环化合物,其带有)是一种天然的三环化合物,其带有胺活性基团衍生物可用来标记多种核酸(如胺活性基团衍生物可用来标记多种核酸(如DNA、RNA、PCR产物和寡核苷酸等)。用其制成的探针灵敏度高(可产物和寡核苷酸等)。用其制成的探针灵敏度高(可达达fg级别)级别)扫若仑标记为非酶促反应,是用波长扫若仑标记为非酶促反应,是用波长320400nm的紫外的紫外光照射,引起光循环反应,使带胺基的扫若仑以三环平面光照射,引起光循环反应,使带胺基的扫若仑以三环平面形式
15、插入核酸分子,并以共价键结合形成探针,形式插入核酸分子,并以共价键结合形成探针,DNA和和RNA时,共价键结合的位置分别在时,共价键结合的位置分别在dT和和U处;探针中扫若处;探针中扫若仑衍生物的含量与核酸中胸苷(仑衍生物的含量与核酸中胸苷(dT)或尿苷()或尿苷(U)的含量)的含量成正比关系成正比关系2.分子灯塔探针分子灯塔探针概念概念 用新的非核素化合物标记,用于检测特别序列核酸用新的非核素化合物标记,用于检测特别序列核酸的核酸探针的核酸探针特征特征 由由25个核苷酸组成个核苷酸组成灯中间环形的灯中间环形的15个核苷酸与靶个核苷酸与靶DNA是互补序列;灯是互补序列;灯竿一端的竿一端的5个核
16、苷酸与另一端的个核苷酸与另一端的5个核苷酸是互补个核苷酸是互补在在5 和和3端分别耦合一种荧光素(发光剂)和非荧端分别耦合一种荧光素(发光剂)和非荧光素(熄灭剂)光素(熄灭剂)分子灯塔探针的熄灭剂可吸收发光剂发射的能量。分子灯塔探针的熄灭剂可吸收发光剂发射的能量。在室温条件下,分子灯塔的构型可确保发光剂和熄灭在室温条件下,分子灯塔的构型可确保发光剂和熄灭剂紧密互补结合,致使荧光基团处于熄灭状态,无荧剂紧密互补结合,致使荧光基团处于熄灭状态,无荧光产生;一旦当灯塔探针的光产生;一旦当灯塔探针的15个核苷酸与靶个核苷酸与靶DNA或或RNA序列杂交时,其发光剂和熄灭剂便相互分离,产序列杂交时,其发光
17、剂和熄灭剂便相互分离,产生荧光生荧光三、核素标记三、核素标记 标记核酸的核素有标记核酸的核素有32P、33P、35S和和3H。其中。其中 32P是制备是制备高比活度放射性探针常用的一种同位素;高比活度放射性探针常用的一种同位素;33P比比32P使用安使用安全;全;35S能量低,不会引起核酸损伤,常用于制备稳定的比能量低,不会引起核酸损伤,常用于制备稳定的比活度低的探针,但对许多酶的活性有影响;活度低的探针,但对许多酶的活性有影响;3H标记的探针标记的探针常用于原位杂交、核酸的合成和降解分析常用于原位杂交、核酸的合成和降解分析 由于不同放射性同位素对人体伤害和环境污染程度不同,由于不同放射性同位
18、素对人体伤害和环境污染程度不同,因此实际操作时根据检测要求结合实验室条件选择相应的因此实际操作时根据检测要求结合实验室条件选择相应的标记方法标记方法(一)双链(一)双链DNA探针探针1.切口平移法切口平移法原理原理 类似于非核素类似于非核素DIG标记中的切口平移法,所不同的标记中的切口平移法,所不同的是,此处用高放射活性标记的核苷酸置换原来的核苷酸是,此处用高放射活性标记的核苷酸置换原来的核苷酸操作要点操作要点 将将DNase和和E.coli-DNA-pol催化的反应分催化的反应分开进行,这样可避免开进行,这样可避免DNase在聚合反应过程中降解在聚合反应过程中降解DNA2.随机引物介导法随机
19、引物介导法 方法与方法与DIG-随机引物介导法制备随机引物介导法制备DNA探针相似,即用探针相似,即用DNase水解小牛胸腺水解小牛胸腺DNA(或鲑鱼精(或鲑鱼精DNA),产生),产生612核苷酸的单链核苷酸的单链DNA或随机或随机6聚合体核苷酸的混合物作为引聚合体核苷酸的混合物作为引物;以变性的闭环物;以变性的闭环DNA或线性或线性DNA作为模板,在作为模板,在klenow片段的催化作用下,介导产生片段的催化作用下,介导产生DNA探针探针 分为分为游离游离DNA片段为模板片段为模板和和固定固定DNA片段为模板片段为模板制备制备探针探针(1)以游离)以游离DNA片段为模板制备探针片段为模板制备
20、探针 模板模板DNA用限制性内切酶消化,电泳纯化或乙醇沉淀用限制性内切酶消化,电泳纯化或乙醇沉淀后,与其他试剂混合制备探针后,与其他试剂混合制备探针(2)以固定)以固定DNA片段为模板制备探针片段为模板制备探针 DNA经电泳后,用经电泳后,用EB染色,切下染色,切下DNA色带,加水后沸色带,加水后沸水浴使其变性,然后水浴使其变性,然后37(固定固定),再加其他试剂室温或),再加其他试剂室温或37制备探针制备探针(二)(二)RNA探针的制备(体外转录法)探针的制备(体外转录法)四、标记物纯化四、标记物纯化 标记物纯化就是除去未标记的同位素或非同位标记物纯化就是除去未标记的同位素或非同位素产物素产
21、物 并非所有探针都需纯化,通常用于膜杂交的探并非所有探针都需纯化,通常用于膜杂交的探针不需纯化,而用于原位杂交的探针则需要纯化。针不需纯化,而用于原位杂交的探针则需要纯化。常用的纯化方法有常用的纯化方法有萃取萃取/沉淀法沉淀法、层析法层析法、离心法离心法和和电泳法电泳法等等(一)(一)EtOH沉淀法沉淀法加加1l糖原溶液(糖原溶液(20mg/ml20mg/ml)到含探针的试管中,混匀)到含探针的试管中,混匀加加2 23 3倍体积冷倍体积冷EtOH,低温,低温沉淀,离心分离沉淀,并用沉淀,离心分离沉淀,并用少量少量70%70%冷冷EtOH洗涤洗涤干燥的沉淀物溶于干燥的沉淀物溶于TE缓冲液中,低温
22、贮存缓冲液中,低温贮存(二)层析法(二)层析法SepharoseCL-4B柱层析柱层析 层析结果用层析结果用PAGE检测检测SephadexG-50或或G-25柱层析柱层析五、探针的鉴定五、探针的鉴定 主要鉴定探针的长度、示踪物的掺入率及特异性主要鉴定探针的长度、示踪物的掺入率及特异性(一)杂交法(一)杂交法用靶用靶DNA或或RNA鉴定探针的特异性鉴定探针的特异性根据示踪物的性质,采取相应方法(如荧光、化学发根据示踪物的性质,采取相应方法(如荧光、化学发光、酶联免疫等)检测其含量光、酶联免疫等)检测其含量根据凝胶电泳根据凝胶电泳Rf值检测探针长度值检测探针长度(二)酸沉淀法(二)酸沉淀法 主要
23、用于测定放射性核素标记的探针,检测放射性核素主要用于测定放射性核素标记的探针,检测放射性核素的掺入率。的掺入率。原理:原理:先用强酸(如冰乙酸)沉淀探针(与前体先用强酸(如冰乙酸)沉淀探针(与前体dNTP、NTP分离),再测定其放射性强度;根据放射性强度计算分离),再测定其放射性强度;根据放射性强度计算放射性核素的掺入率放射性核素的掺入率(三)色谱法(三)色谱法 如用如用DIG标记的探针其酯溶性增强,可用标记的探针其酯溶性增强,可用RP-HPLC分分离检测离检测?(四)比色法(四)比色法 根据标记物在某条件下能呈色的性质,采取相应的显根据标记物在某条件下能呈色的性质,采取相应的显色剂显色后,比
24、色色剂显色后,比色(五)发光法(五)发光法 先用紫外照射法将靶先用紫外照射法将靶DNA交联到膜(如尼龙膜)交联到膜(如尼龙膜)上,再使探针上,再使探针DNA或或RNA与交联到膜上的与交联到膜上的DNA杂交,杂交,封藏,至暗室中暴光,用合适的封藏,至暗室中暴光,用合适的X线片接收,并用图线片接收,并用图像仪对印记斑点进行扫描像仪对印记斑点进行扫描 第二节第二节 蛋白质蛋白质(酶、抗体酶、抗体)标记标记 通常通常抗体与抗原抗体与抗原、酶与底物酶与底物、激素与受体激素与受体等物等物质之间发生的特异反应,其结果通常不能从检测仪质之间发生的特异反应,其结果通常不能从检测仪上直接读出或者用肉眼查觉,一般都
25、需要借助发色、上直接读出或者用肉眼查觉,一般都需要借助发色、发光试剂,或者同位素、酶试剂标记产生具有发光试剂,或者同位素、酶试剂标记产生具有高度高度专一性的探针专一性的探针来判断来判断目目 的的掌握蛋白质的常见标记物的种类及标记方法掌握蛋白质的常见标记物的种类及标记方法掌握核素和非核素标记掌握核素和非核素标记一、标记方法一、标记方法 抗体(抗体(IgGIgG)或蛋白质的标记方法包括)或蛋白质的标记方法包括 酶标记酶标记、荧光标记荧光标记、生物素标记生物素标记、有色金属标记有色金属标记等等 1 1、酶标记、酶标记 l常用于标记抗体的常用于标记抗体的酶酶 辣根过氧化酶辣根过氧化酶(HRP)碱性磷酸
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