酶的必需基团课件.ppt
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1、第三章第三章 酶酶生物催化剂(生物催化剂(Biocatalysts)生物催化剂:生物催化剂:由活细胞产生的,具有催化功能的生由活细胞产生的,具有催化功能的生物分子物分子。酶酶(enzyme)是由是由活细胞合成的活细胞合成的、对其、对其特异性特异性底物有底物有高效催化作用高效催化作用的的蛋白质蛋白质,是机体内催化各种,是机体内催化各种代谢反应最主要的催化剂代谢反应最主要的催化剂。核酶核酶(ribozyme)具有高效、特异催化作用的具有高效、特异催化作用的核酸(核酸(RNARNA)。主要参与主要参与RNARNA的剪接的剪接。酶催化的生物化学反应酶催化的生物化学反应,称为,称为酶促反应酶促反应Enz
2、ymatic reaction 在酶的催化下发生化学变化的物质在酶的催化下发生化学变化的物质,称为,称为底物底物substrate 单体酶单体酶:只有一条多肽链构成的酶。主要见水解酶只有一条多肽链构成的酶。主要见水解酶类。类。寡聚酶寡聚酶:由多个相同或不同亚基以非共价键连接的由多个相同或不同亚基以非共价键连接的酶酶 。如:乳酸脱氢酶由亚基。如:乳酸脱氢酶由亚基H H、MM形成的四聚体形成的四聚体。多酶体系多酶体系:在细胞内存在着许多由几种不同功能的在细胞内存在着许多由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物酶彼此聚合形成的多酶复合物。如:丙酮酸脱氢酶。如:丙酮酸脱氢酶体系。体系。多功能酶多功能
3、酶(串连酶)(串连酶):一些多酶体系在进化过程中一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,形成由一条多肽链组成却具有多由于基因的融合,形成由一条多肽链组成却具有多种不同催化功能的酶种不同催化功能的酶。如:脂肪酸合成酶系。如:脂肪酸合成酶系。一、酶的分子组成一、酶的分子组成 酶按其分子组成分为:(酶按其分子组成分为:(见图见图)单纯酶(单纯酶(simple enzyme):仅由氨基酸残基构成仅由氨基酸残基构成的酶的酶。如:淀粉酶、脲酶、脂酶、一些消化蛋白。如:淀粉酶、脲酶、脂酶、一些消化蛋白酶、核糖核酸酶等。酶、核糖核酸酶等。结合酶结合酶(conjugated enzyme):由蛋白质和非蛋由蛋白
4、质和非蛋白质组成白质组成。前者称为。前者称为酶蛋白酶蛋白(apoenzyme),),后者后者称为称为辅助因子辅助因子(辅酶或辅基)。辅助因子是金属(辅酶或辅基)。辅助因子是金属离子或小分子有机化合物,离子或小分子有机化合物,酶蛋白与辅助因子结酶蛋白与辅助因子结合形成的复合物合形成的复合物称为称为全酶全酶,只有全酶才有催化作只有全酶才有催化作用用。金属离子金属离子 辅助因子最为多见的是金属离子。辅助因子最为多见的是金属离子。含金属离子的酶分为:含金属离子的酶分为:金属酶金属酶:金属离子与酶结合紧密金属离子与酶结合紧密,提取的过程提取的过程中不易丢失中不易丢失,这类酶称为金属酶。如羧基肽酶、这类酶
5、称为金属酶。如羧基肽酶、黄嘌呤氧化酶等黄嘌呤氧化酶等。金属激活酶金属激活酶:金属离子虽为酶的活性所必需,金属离子虽为酶的活性所必需,却不与酶直接结合,而是通过底物相连接。却不与酶直接结合,而是通过底物相连接。这类酶称为金属激活酶这类酶称为金属激活酶。如己糖激酶等如己糖激酶等。金属离子在全酶中的作用金属离子在全酶中的作用 传电子传电子:作为酶活性中心的催化基团参作为酶活性中心的催化基团参与催化反应、传递电子与催化反应、传递电子。架桥梁架桥梁:作为连接酶与底物的桥梁,便作为连接酶与底物的桥梁,便于酶对底物起作用于酶对底物起作用。稳构象稳构象:稳定酶的构象所必需稳定酶的构象所必需。降斥力降斥力:中和
6、阴离子,降低反应中的静中和阴离子,降低反应中的静电斥力。电斥力。小分子有机化合物小分子有机化合物 小分子有机化合物在全酶中的作用小分子有机化合物在全酶中的作用:参与催化过程,起传递电子、质子或一参与催化过程,起传递电子、质子或一些基团的作用些基团的作用。小分子有机化合物作为辅助因子的种类小分子有机化合物作为辅助因子的种类不多,都属于维生素或维生素衍生物。不多,都属于维生素或维生素衍生物。常见的常见的见表见表 酶蛋白决定反应的酶蛋白决定反应的特异性特异性,辅助因子决,辅助因子决定反应的定反应的种类与性质种类与性质。辅助因子的分类辅助因子的分类 辅助因子辅助因子按其与酶蛋白结合的紧密程度与作按其与
7、酶蛋白结合的紧密程度与作用特点用特点分为分为:辅酶辅酶和和辅基辅基。辅酶辅酶:与酶蛋白结合疏松,可以用透析或超与酶蛋白结合疏松,可以用透析或超滤的方法除去。在两个酶促反应中充当质子滤的方法除去。在两个酶促反应中充当质子或基团供体和受体的作用或基团供体和受体的作用。如如NADNAD、NADPNADP。辅基辅基:与酶蛋白结合紧密,不能通过透析或与酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤将其除去,在反应中辅基不能离开酶蛋超滤将其除去,在反应中辅基不能离开酶蛋白。白。如金属离子多为此,如金属离子多为此,FADFAD、FMNFMN、生物生物素等。素等。二、酶的活性中心二、酶的活性中心 酶的活性中心酶的活性中心
8、:酶的必需基团在空间结构上酶的必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构、能与底彼此靠近,组成具有特定空间结构、能与底物特异地结合并将底物转化为产物,这一区物特异地结合并将底物转化为产物,这一区域称为酶的活性中心或活性部位。(域称为酶的活性中心或活性部位。(见图见图)。)。对于结合酶,辅酶或辅基参与酶活性中心的对于结合酶,辅酶或辅基参与酶活性中心的组成组成。酶的必需基团酶的必需基团:与酶活性密切相关的基团称与酶活性密切相关的基团称为必需基团。为必需基团。酶活性中心酶活性中心内内的必需基因的必需基因有两种:结合基团结合基团,其作用是与底物相结合,使底物其作用是与底物相结合,使底物与酶的一
9、定构象形成复合物与酶的一定构象形成复合物;催化基团催化基团,其作用是影响底物中某些化学键其作用是影响底物中某些化学键的稳定性,催化底物发生化学反应并将其转的稳定性,催化底物发生化学反应并将其转变成产物。变成产物。酶活性中心酶活性中心外外的必需基团的必需基团不参与活性中心的组成,但为维持活性中心应有的空间构象所必需。酶和一般催化剂的共性酶和一般催化剂的共性1.1.用量少而催化效率高。用量少而催化效率高。2.2.它能够改变化学反应的速度,但是不能它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应的平衡点。改变化学反应的平衡点。3.3.酶能够稳定底物形成的过渡状态,降低酶能够稳定底物形成的过渡状态,降低
10、反应的活化能,从而加速反应的进行。反应的活化能,从而加速反应的进行。活化能活化能:是指一定条件下,能使是指一定条件下,能使1 1摩尔底摩尔底物全部进入活化状态所需要的自由能物全部进入活化状态所需要的自由能一、酶促反应的特点一、酶促反应的特点1、高度的催化效率、高度的催化效率 酶的催化效率比无催化剂的自发反应速酶的催化效率比无催化剂的自发反应速度提高度提高10108 810102020倍,比无机催化剂的催倍,比无机催化剂的催化效率高化效率高10107 710101313倍。倍。如过氧化氢酶催化如过氧化氢酶催化H H2 2OO2 2分解的速度是分解的速度是FeFe2+2+催化其分解速度的催化其分解
11、速度的8.38.310109 9倍。倍。这种高度加速的酶促反应机制,主要是这种高度加速的酶促反应机制,主要是因为降低了反应活化能。(因为降低了反应活化能。(见图见图)2、高度特异性、高度特异性 一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并产生一定的化学键,催化一定的化学反应并产生一定的产物的特性的产物的特性称为称为酶的特异性或专一性酶的特异性或专一性。根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,特异性分为三种特异性分为三种:绝对特异性、相对特异性、立体异构特异性。绝对特异性、相对特异性、立体异构特异性
12、。(1)绝对特异性)绝对特异性 绝对特异性绝对特异性:酶只能作用于特定结构的酶只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物。这种特异性称为绝对特定结构的产物。这种特异性称为绝对特异性。特异性。如:琥珀酸脱氢酶仅催化琥珀酸脱氢生如:琥珀酸脱氢酶仅催化琥珀酸脱氢生成延胡索酸。成延胡索酸。(2)相对特异性)相对特异性 相对特异性相对特异性:酶作用于酶作用于一类化合物或一种化一类化合物或一种化学键学键,这种特异性称相对特异性,这种特异性称相对特异性。这种选择性不太严格较差(专一性相对较差)。如磷酸酯酶等。相对特异性分为:族类特异性:对底物仅要求
13、其化学键和一侧的基团。键特异性:对底物仅选择性要求其化学键,不要求其键的二侧基团。(3)立体异构特异性)立体异构特异性 立体异构特异性立体异构特异性:酶仅作用于立体异构体中酶仅作用于立体异构体中的一种,酶对立体异构物的这种选择称为立的一种,酶对立体异构物的这种选择称为立体异构特异性体异构特异性 根据旋光异构和几何异构的要求可分为根据旋光异构和几何异构的要求可分为:旋光异构特异性旋光异构特异性:如精氨酸酶只水解L-精氨酸,不能催化D-精氨酸水解。几何异构特异性几何异构特异性:如延胡索酸酶仅催化反丁烯二酸(延胡索酸)生成苹果酸,而对顺丁烯二酸(马来酸)无作用。3、酶促反应的可调节性、酶促反应的可调
14、节性 体内代谢特通过对酶活性的激活或抑制,体内代谢特通过对酶活性的激活或抑制,对反应途径中的关键酶进行调节,也可对反应途径中的关键酶进行调节,也可对酶合成进行诱导或阻遏作用对酶进行对酶合成进行诱导或阻遏作用对酶进行的调节。因此体内化学反应得以有精确的调节。因此体内化学反应得以有精确调控下进行。调控下进行。二、酶促反应的机制二、酶促反应的机制1、酶、酶-底物复合物的形成与诱导契合假说底物复合物的形成与诱导契合假说 酶与底物相互接近时,其结构相互诱导,相酶与底物相互接近时,其结构相互诱导,相互变形和相互适应,进而相互结合,这一过互变形和相互适应,进而相互结合,这一过程称为酶程称为酶底物结合的诱导契
15、合假说。(底物结合的诱导契合假说。(见见图图)2、邻近效应与定向排列、邻近效应与定向排列 在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心心.一方面一方面底物底物在酶活性中心的有效在酶活性中心的有效浓度浓度大大大大增增加加,有利于提高反应速度。,有利于提高反应速度。另一方面,由于活性中心的立体结构和相关另一方面,由于活性中心的立体结构和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定向定位,反应的基团相互接近,并被严格定向定位,使酶促反应具有高效率和专一性特点。使酶促反应具有高效率和专一性特点。3、多元
16、催化、多元催化 酶是两性电解质,同一种酶兼有酸、碱酶是两性电解质,同一种酶兼有酸、碱双重催化作用。双重催化作用。4、表面效应、表面效应 疏水环境可排除水分子对酶和底物功能疏水环境可排除水分子对酶和底物功能基团的干扰性吸引或排斥,防止在底物基团的干扰性吸引或排斥,防止在底物与酶之间形成水化膜,有利于酶与底物与酶之间形成水化膜,有利于酶与底物的密切接触。的密切接触。一种酶的催化反应常常是多种催化机制一种酶的催化反应常常是多种催化机制的综合作用,所以酶促反应具有极高的的综合作用,所以酶促反应具有极高的催化效率。催化效率。酶动力学酶动力学是研究酶促反应的速度以及各种因是研究酶促反应的速度以及各种因素对
17、酶促反应速度的影响机制。素对酶促反应速度的影响机制。影响酶反应速度的因素影响酶反应速度的因素:底物浓度、酶浓度、温度、底物浓度、酶浓度、温度、pH、抑制剂、激抑制剂、激活剂等。活剂等。一、底物浓度对反应速度的影响一、底物浓度对反应速度的影响 在其因素不变的情况下,底物浓度的变化对在其因素不变的情况下,底物浓度的变化对反应速度的影响(反应速度的影响(见图见图)解释酶促反应中底物浓度和反应速度关系可解释酶促反应中底物浓度和反应速度关系可用:用:中间产物学说中间产物学说。(。(见图见图)(一)米(一)米-曼氏方程式曼氏方程式 Michaelis和和Menten根据中间产学说的理根据中间产学说的理论,
18、并借助于论,并借助于反应速度(反应速度(V)与底物浓度与底物浓度S 的曲线,研究酶的动力学,得出的曲线,研究酶的动力学,得出V与与S 的数学公式,称米的数学公式,称米-曼方程式。曼方程式。V=Vmax SKm+SKm m 即为米氏常数,即为米氏常数,Vmaxmax为最大反应速度为最大反应速度米米-曼氏方程式的推导曼氏方程式的推导 方程式的推导首先设立假设:方程式的推导首先设立假设:(1)将反应过程限于初速度)将反应过程限于初速度(2)S 超过超过 E,S 的变化在测定初速的变化在测定初速度的过程中可忽略不计。度的过程中可忽略不计。K1 K3 E +S ES E +P 酶酶 底物底物 K2 中间
19、产物中间产物 酶酶 产物产物ES的生成速度的生成速度=K1(E-ES)S -(3)ES的分解速度的分解速度=K2 ES +K3 ES -(4)当反应处于稳态时,当反应处于稳态时,ES的生成速度的生成速度=ES的分解速度的分解速度,即,即 K1(E-ES)S=K2 ES +K3 ES 经整理经整理,(E-ES)S/ES=(K2+K3)/K1令令 Km=(K2+K3)/K1 Km为米氏常数,则为米氏常数,则 ES=E S/(Km+S)-(5)由于反应速度取决于单位时间内产物由于反应速度取决于单位时间内产物P的生成量,所以的生成量,所以 V=K3 ES将(将(5)式代入得:)式代入得:V=K3 ES
20、/(Km+S)-(6)当底物浓度很高,所有的酶都与底物生成中间产物(即当底物浓度很高,所有的酶都与底物生成中间产物(即E=ES时,反应时,反应达最大速度达最大速度。即。即 Vmax=K3 ES=K3 E 代入(代入(6)式)式,得米氏方程式得米氏方程式:Vmax S V =Km+S(二)(二)Km与与Vmax的意义的意义1、当反应速度为最大速度一半时,当反应速度为最大速度一半时,K Kmm等等于酶促反应速度为最大速度一半时的底于酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度物浓度。米氏方程式变换为:整理得Km=S2、在在K K2 2K K3 3特定情况下特定情况下,K Kmm=K=K2 2/K/K1
21、1,近似于近似于ESES的解离常数的解离常数KsKs,但不等同但不等同KsKs。K Kmm表示酶对表示酶对底物的亲和力。底物的亲和力。K Kmm值愈小,酶与底物的亲和值愈小,酶与底物的亲和力愈大,力愈大,酶的催化活性高,不要很高的底物酶的催化活性高,不要很高的底物浓度即可达最大反应速度。反之,亲和力小,浓度即可达最大反应速度。反之,亲和力小,催化活性低催化活性低。3、K Kmm值是酶的特征性常数之一值是酶的特征性常数之一,只与酶的结,只与酶的结构,酶所催化的底物和反应环境(如温度,构,酶所催化的底物和反应环境(如温度,pH,pH,离子强度)有关,与酶的浓度无关。离子强度)有关,与酶的浓度无关。
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