基因表达调控课件-003.ppt
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- 基因 表达 调控 课件 _003
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1、主要内容:主要内容:一、基因表达调控基本概念与原理一、基因表达调控基本概念与原理二、原核基因转录调节二、原核基因转录调节三、真核基因转录调节三、真核基因转录调节1ppt课件目的要求:目的要求:1、掌握基因表达调控基本概念与原理、掌握基因表达调控基本概念与原理2、熟悉原核基因转录调节、熟悉原核基因转录调节3、了解真核基因转录调节、了解真核基因转录调节2ppt课件前言前言1 介绍:基因表达的概念介绍:基因表达的概念1.1基因(基因(gene)编码有功能的蛋白质多肽链或编码有功能的蛋白质多肽链或RNA所需的所需的全部核苷酸序列(通常全部核苷酸序列(通常DNA,也有也有RNA),是是一个功能性的遗传单
2、位,也是突变或重组一个功能性的遗传单位,也是突变或重组单位单位1.2 1.2 基因组基因组(genome)(genome)细胞或生物体内一整套的遗传物质。细胞或生物体内一整套的遗传物质。3ppt课件2 2、原核基因的结构特征、原核基因的结构特征原核基因组常以操纵子(原核基因组常以操纵子(operonoperon)的形式作为表达和调控)的形式作为表达和调控的基本单元,它包括功能上彼此相关的结构基因和调控部位,的基本单元,它包括功能上彼此相关的结构基因和调控部位,受调节基因产物的调节,转录产物为单个多顺反子。受调节基因产物的调节,转录产物为单个多顺反子。大肠杆菌乳糖操纵子结构大肠杆菌乳糖操纵子结构
3、lacIlacYPlacOlacZlacA启动子启动子阻遏蛋阻遏蛋白基因白基因结构基因结构基因操纵基因操纵基因操纵子:原核生物中几个功能相关的结构基因成簇串联操纵子:原核生物中几个功能相关的结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协同单位(排列组成的一个基因表达的协同单位(DNA序列)。序列)。4ppt课件 大多数真核基因的编码序列被不能编码的额外序列所分大多数真核基因的编码序列被不能编码的额外序列所分隔,以不连续的方式排列在隔,以不连续的方式排列在DNA上,因此这类基因也叫上,因此这类基因也叫断断裂基因(裂基因(split gene)。隔断基因的线性表达而在剪接过程中隔断基因的线性表达而在剪
4、接过程中被除去的核酸序列被除去的核酸序列称内含子(称内含子(intron),在断裂基因及其初在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列的核酸序列叫外显叫外显子(子(exon)。)。3、真核基因的结构特征、真核基因的结构特征5ppt课件4.4.遗传信息的表达遗传信息的表达 各种生物基因中,绝大部分基因贮存的遗传信息都是蛋各种生物基因中,绝大部分基因贮存的遗传信息都是蛋白质的一级结构信息,部分基因贮存的是白质的一级结构信息,部分基因贮存的是tRNAtRNA、rRNArRNA等等RNARNA的一级结构信息。除少数的一级结构信息。除少数RNARNA病毒
5、可将遗传信息直接从病毒可将遗传信息直接从RNARNA输出以外,大部分生物(包括逆转录病毒)的遗传信息都输出以外,大部分生物(包括逆转录病毒)的遗传信息都是从是从DNADNA分子中输出的。遗传信息的表达,就是贮存于分子中输出的。遗传信息的表达,就是贮存于DNADNA中的信息转变成具体的中的信息转变成具体的RNARNA分子或蛋白质分子。通过这些生分子或蛋白质分子。通过这些生物大分子的功能活动使生物体表现出各种各样的生理功能物大分子的功能活动使生物体表现出各种各样的生理功能及千差万别的生物性状。及千差万别的生物性状。6ppt课件 DNA DNA可以作为模板直接指导可以作为模板直接指导RNARNA分子
6、的生物合成,分子的生物合成,这一过程称为这一过程称为转录转录。DNADNA不能作为直接模板将其携不能作为直接模板将其携带的信息转移到蛋白质分子中,需要先通过转录带的信息转移到蛋白质分子中,需要先通过转录过程将遗传信息传递到过程将遗传信息传递到RNARNA分子中,再通过翻译过分子中,再通过翻译过程将程将RNARNA分子上的核苷酸序列信息转变为蛋白质分分子上的核苷酸序列信息转变为蛋白质分子中的氨基酸序列。对于编码蛋白质的基因来说,子中的氨基酸序列。对于编码蛋白质的基因来说,其遗传信息的表达包括其遗传信息的表达包括转录和翻译转录和翻译两个阶段。两个阶段。7ppt课件5 5 转录模板转录模板 DNA分
7、子上转录出分子上转录出RNA的区段,称为结构基因的区段,称为结构基因(structural gene)。DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的的一股单链,称为模板链一股单链,称为模板链(template strand),也称作有,也称作有意义链或意义链或Watson链。相对的另一股单链是编码链链。相对的另一股单链是编码链(coding strand),也称为反义链或,也称为反义链或Crick链。链。8ppt课件5GCAGTACATGTC 33 c g t g a t g t a c a g 55GCAGUACAUGUC 3NAla Val His V
8、al C编码链编码链模板链模板链mRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译9ppt课件5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链结构基因结构基因转录方向转录方向转录方向转录方向10ppt课件不对称转录不对称转录(asymmetric transcription)在在DNA分子双链上某一区段,一股链用分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录作模板指引转录,另一股链不转录;模板链并非永远在同一条单链上。模板链并非永远在同一条单链上。11ppt课件 mRNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子遗传学将编码一个
9、多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子为多顺反子(polycistron)。真核真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron)。12ppt课件原核生物的多顺反子原核生物的多顺反子真核生物的单顺反子真核生物的单顺反子非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPP5 3 蛋白质蛋白质PPPmG
10、-5 3 蛋白质蛋白质13ppt课件6 6 小小 结结(中心法中心法则)则)复复 制制DNADNARNAPrion转录转录逆转录逆转录翻翻译译?改改 变变构构象象复复制制RNA14ppt课件第二章第二章 基因表达调控基因表达调控Regulation of Gene ExpressionRegulation of Gene Expression15ppt课件(一)基因表达(一)基因表达(Gene ExpressionGene Expression)基因携带的遗传信息,经过一系列的生基因携带的遗传信息,经过一系列的生化反应,最终产生具有生物学功能的产物的过化反应,最终产生具有生物学功能的产物的过程
11、程,也就是基因的转录和翻译过程也就是基因的转录和翻译过程Process Process of transcription and translation of transcription and translation(产物(产物可以是蛋白质、可以是蛋白质、tRNAtRNA、rRNArRNA)。DNA转录转录mRNA翻译翻译蛋白质蛋白质16ppt课件(二)顺式作用元件是调节转录的(二)顺式作用元件是调节转录的DNADNA片段片段 1.1.启动子(启动子(PromoterPromoter)位于转录起始单位点上游并为位于转录起始单位点上游并为RNARNA聚合酶识别、结合和启动赚率聚合酶识别、结合和
12、启动赚率的的DNADNA序列。序列。1.11.1原核启动子(原核启动子(promoterpromoter)启动子是基因启动子是基因55端上游的一段启动基因转录的核苷酸序列,端上游的一段启动基因转录的核苷酸序列,是是RNA pol RNA pol 和其他转录因子结合的部位。和其他转录因子结合的部位。原核基因的启动子定位在转录起始位点(原核基因的启动子定位在转录起始位点(initiation siteinitiation site,ISIS)上游)上游5-10bp5-10bp处,由处,由-35-35区和区和-10-10区组成,从启动子到终止子区组成,从启动子到终止子(terminatortermi
13、nator)为一个转录单位。)为一个转录单位。-10-10区的碱基序列较保守,由区的碱基序列较保守,由T T和和A A组成,大肠杆菌的组成,大肠杆菌的-10-10区为区为TATAATTATAAT,故称,故称TATA boxTATA box或或 Pribnow-nowPribnow-now。-35-35区的碱基序列以区的碱基序列以TTGTTG最为保守,肠杆菌的最为保守,肠杆菌的-35-35区为区为TTGACATTGACA,因子识别并结合因子识别并结合-35-35区,区,RNARNA聚合酶的特异性由聚合酶的特异性由 因子决定,因子决定,而启动子的强弱则由而启动子的强弱则由-35-35区和区和 因子
14、的特异性和亲和力因子的特异性和亲和力决定。决定。从从ISIS到到-10-10区之间的区之间的5-10bp5-10bp间隔称间隔称5-leader5-leader序列。序列。17ppt课件大肠杆菌基因启动子图示大肠杆菌基因启动子图示-35-10IS5-leader+1上游上游下游下游5启动子启动子18ppt课件1.21.2、真核生物的启动子、真核生物的启动子真核基因的真核基因的型启动子型启动子(promoterpromoter)真核基因的真核基因的TATATATA为为,并且距离较远。并且距离较远。没有没有-区。区。在上游还有、和在上游还有、和(八聚体)等结构,并与盒一起组成(八聚体)等结构,并与
15、盒一起组成型基因的启动子型基因的启动子。必须明确,并不是所有的。必须明确,并不是所有的型基因都具备型基因都具备这种调控元件,有的基因就没有盒(如这种调控元件,有的基因就没有盒(如的早期基因)。的早期基因)。由于由于型启动子无型启动子无-35区,也没有区,也没有 因子,因此,因子,因此,RNA pol 与与启动子的结启动子的结 合至少与合至少与4种转录因子(种转录因子(TF AD)有关。)有关。19ppt课件20ppt课件1.3 哺乳类哺乳类RNA聚合酶聚合酶启动子中的元件序列启动子中的元件序列元件名称元件名称共同序列共同序列结合的蛋白因子结合的蛋白因子名名 称称分子量分子量结合结合DNA长度长
16、度TATAboxTATAAAATBP30,00010bpGC boxGGGCGGSP-1105,00020bpCAAT boxGGCCAATCTCTF/NF160,00022bpOctamerATTTGCATOct-176,00010bpOct-253,00020bpkBGGGACTTTCCNFkB44,00010bpATFGTGACGTAFT?20bp21ppt课件 1.4 启动子中的元件的分类启动子中的元件的分类 可以分为两种:可以分为两种:核心启动子元件核心启动子元件(core promoter element)指RNA聚合酶起始转录所必需的最小的DNA序列,包括转录起始点及其上游25/
17、30bp处的TATA盒。核心元件单独起作用时只能确定转录起始位点和产生基础水平的转录。22ppt课件 上游启动子元件(upstream promoter element)包括通常位于70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及距转录起始点更远的上游元件。这些元件与相应的蛋白因子结合能提高或改变转录效率。不同基因具有不同的上游启动子元件,其位置也不相同,这使得不同的基因表达分别有不同的调控。23ppt课件2.增强子增强子(enhancer)指远离转录起始点、决定基因的时间、指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序序列。列。3.沉默子沉默
18、子(silencer)某些基因的负性调节元件,当其结合特异某些基因的负性调节元件,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。4.转录终止子转录终止子(Terminator of transcription)5.其他其他24ppt课件三、基因表达调控的基本三、基因表达调控的基本的规律的规律(一)、基因表达具有时间性及空间性(一)、基因表达具有时间性及空间性1.时间特异性时间特异性Temporal specificity or stage specificity 按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生
19、。多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶间顺序发生。多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性。段特异性。2.空间特异性空间特异性Spatial specificity or cell specificity or tissue specificity 在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现,又称细胞特异性或组织特异性。织空间顺序出现,又称细胞特异性或组织特异性。25ppt课件(二)、基因表达的方式(二)、基因表达的方式 1.组成性表达组成性表达 管家基因管家基因 housekeeping gene 有些基因在生命全过程都是必需的
20、,如果缺少、有些基因在生命全过程都是必需的,如果缺少、细胞不能正常生存,这类基因被称为管家基因。细胞不能正常生存,这类基因被称为管家基因。组成性基因表达组成性基因表达constitutive gene expression 管家基因较少受环境因素的影响,在个体发育管家基因较少受环境因素的影响,在个体发育的任一阶段都能在大多数细胞中持续表达的任一阶段都能在大多数细胞中持续表达。26ppt课件2.2.适应性表达(适应性表达(Adaptive expressionAdaptive expression)诱导表达诱导表达 induction 有些基因在特定环境信号刺激下,有些基因在特定环境信号刺激下,
21、表达增强,称表达增强,称为诱导表达。为诱导表达。阻遏表达阻遏表达repression 另有一些基因在特定环境信号刺激下,表达水平另有一些基因在特定环境信号刺激下,表达水平下降,下降,称为阻遏表达称为阻遏表达。27ppt课件3.3.协调表达协调表达 在一定机制控制下,使功能相关联的一组在一定机制控制下,使功能相关联的一组基因协调一致、共同表达,称此为协调表基因协调一致、共同表达,称此为协调表达达(coordinate expression)。这种调节称这种调节称为协调调节为协调调节(coordinate regulation)28ppt课件1 反式作用因子反式作用因子类别类别(后面讲)(后面讲)
22、概念:凡直接或者间接与顺式元件相互作概念:凡直接或者间接与顺式元件相互作用并影响基因表达的蛋白质用并影响基因表达的蛋白质类别类别A 普通转录因子普通转录因子(三)、基因表达调控的分子基础是(三)、基因表达调控的分子基础是DNA/DNA/蛋白质的相互作用蛋白质的相互作用 29ppt课件B 特异转录因子特异转录因子(special transcription factors)为个别基因转录所必需,决定该基因的为个别基因转录所必需,决定该基因的时间、空间特异性表达。时间、空间特异性表达。转录激活因子转录激活因子转录抑制因子转录抑制因子30ppt课件2.转录调节因子结构转录调节因子结构DNA结合域结合
23、域转录激活域转录激活域TF蛋白质蛋白质-蛋白质结合域蛋白质结合域(二聚化结构域)(二聚化结构域)谷氨酰胺富含域谷氨酰胺富含域酸性激活域酸性激活域脯氨酸富含域脯氨酸富含域锌指锌指(zinc finger)-螺旋螺旋其他其他31ppt课件四、基因表达调控的生物学意义四、基因表达调控的生物学意义1 1)使细胞能适应环境变化,以维持其增殖、分化使细胞能适应环境变化,以维持其增殖、分化2 2)促进个体生长、发育促进个体生长、发育 32ppt课件 原核生物和真核生物在基因表达调控的细节上原核生物和真核生物在基因表达调控的细节上尽管差异很大,但两者的调控模式却具有惊人的相尽管差异很大,但两者的调控模式却具有
24、惊人的相似性和可比性,除此之外,原核生物和真核生物的似性和可比性,除此之外,原核生物和真核生物的基因表达调控元件也具有统一性。然而,不管是原基因表达调控元件也具有统一性。然而,不管是原核生物还是真核生物,核生物还是真核生物,转录环节是最主要的调控位转录环节是最主要的调控位点点。基因调控元件按其属性可分为核酸和蛋白质两。基因调控元件按其属性可分为核酸和蛋白质两大类,所有基因表达调控模式的大类,所有基因表达调控模式的实质无非是实质无非是两者之两者之间的相互作用,包括核酸分子内或分子间的相互作间的相互作用,包括核酸分子内或分子间的相互作用、用、核酸分子与蛋白分子之间的相互作用核酸分子与蛋白分子之间的
25、相互作用以及蛋白以及蛋白分子内或分子间的相互作用。其中第二种作用尤为分子内或分子间的相互作用。其中第二种作用尤为重要。重要。33ppt课件第二节第二节 原核生物基因表达的调控原核生物基因表达的调控 一、转录水平的调控一、转录水平的调控 (一)影响转录的因素(一)影响转录的因素 二、翻译水平的调控二、翻译水平的调控(二)转录的调控机制(二)转录的调控机制(一)(一)SD序列对翻译的影响序列对翻译的影响(二)(二)mRNA的稳定性的稳定性(三)翻译产物对翻译的调控(三)翻译产物对翻译的调控(四)小分子(四)小分子RNA的调控作用的调控作用 34ppt课件介绍:介绍:原核生物原核生物mRNA结构的特
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