第十章核酸的酶促降解和核苷酸代谢课件.ppt
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- 第十 核酸 降解 核苷酸 代谢 课件
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1、第十章第十章 核酸的酶促降解和核苷酸代谢核酸的酶促降解和核苷酸代谢仲恺农业工程学院仲恺农业工程学院化学化工学院化学化工学院主要内容主要内容第一节第一节 核酸的酶促降解核酸的酶促降解第二节第二节 核苷酸的分解代谢核苷酸的分解代谢第三节第三节 核苷酸的生物合成核苷酸的生物合成n核酸在生物体内可以被降解核酸在生物体内可以被降解n外源核酸在动物体的小肠内被降解外源核酸在动物体的小肠内被降解胰核酸酶胰核酸酶肠粘膜释放的磷酸二酯酶肠粘膜释放的磷酸二酯酶n降解产物在小肠内被转化和吸收降解产物在小肠内被转化和吸收n核酸的降解一般核酸的降解一般不为生物提供能量不为生物提供能量第一节第一节 核酸的酶促降解核酸的酶
2、促降解n一、核酸酶对核酸的降解一、核酸酶对核酸的降解n1、核酸酶、核酸酶n核酸是由许多核苷酸通过核酸是由许多核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接而成的大分子化合物。磷酸二酯键连接而成的大分子化合物。n核酸通过酶促降解可产生分子量大小不同的核苷酸片段及相关产物、单核酸通过酶促降解可产生分子量大小不同的核苷酸片段及相关产物、单核苷酸。核苷酸。n能够降解核酸中磷酸二酯键的酶统称为核酸酶。能够降解核酸中磷酸二酯键的酶统称为核酸酶。n2、核酸酶种类、核酸酶种类n根据核酸酶对底物专一性的不同,分为:核糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶根据核酸酶对底物专一性的不同,分为:核糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶、非特异性核酸酶、非特异
3、性核酸酶n根据对底物的作用方式分为:核酸内切酶、核酸外切酶。其中核酸内切根据对底物的作用方式分为:核酸内切酶、核酸外切酶。其中核酸内切酶还可以分为非特异性核酸内切酶和限制性核酸内切酶。酶还可以分为非特异性核酸内切酶和限制性核酸内切酶。水解酯键水解酯键 水解水解3-酯键酯键5-(寡)核苷酸(寡)核苷酸 的方式的方式 水解水解5-酯键酯键 3-核苷酸核苷酸二、核糖核酸酶(二、核糖核酸酶(RNase)n能对核糖核酸中磷酸二酯键水解作用的酶。包括内切酶和外切酶。能对核糖核酸中磷酸二酯键水解作用的酶。包括内切酶和外切酶。n1、核酸内切酶、核酸内切酶n(1)种类)种类n(2)脱氧核糖核酸酶)脱氧核糖核酸酶
4、n是一类特异水解是一类特异水解DNA的酶类,也作用于磷酸二酯键。常见的内切酶有:的酶类,也作用于磷酸二酯键。常见的内切酶有:酶酶作用位点作用位点RNase 嘧啶核苷酸的嘧啶核苷酸的C3位的磷酸与相邻核苷酸位的磷酸与相邻核苷酸C5羟基形成的磷酸二酯键羟基形成的磷酸二酯键RNase T1鸟嘌呤核苷酸的鸟嘌呤核苷酸的C3位的磷酸与相邻核苷酸位的磷酸与相邻核苷酸C5羟基形成的磷酸二酯键羟基形成的磷酸二酯键RNase U2嘌呤核苷酸的嘌呤核苷酸的C3位的磷酸与相邻核苷酸位的磷酸与相邻核苷酸C5羟基形成的磷酸二酯键羟基形成的磷酸二酯键酶酶作用位点作用位点产物产物DNase 任意任意3-羟基和羟基和5-磷酸
5、形成的酯键磷酸形成的酯键5-磷酸寡聚脱氧核苷酸片段磷酸寡聚脱氧核苷酸片段DNase 3-磷酸和磷酸和5-羟基形成的酯键羟基形成的酯键3-磷酸寡聚脱氧核苷酸片段磷酸寡聚脱氧核苷酸片段限制性内切酶限制性内切酶-n2、核酸外切酶、核酸外切酶n常见的核酸外切酶有蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶。常见的核酸外切酶有蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶。n对核糖核酸和脱氧核糖核酸都能分解,专一性不高。对核糖核酸和脱氧核糖核酸都能分解,专一性不高。n蛇毒磷酸二酯酶:从核酸蛇毒磷酸二酯酶:从核酸3端开始逐个水解下端开始逐个水解下5-核苷酸核苷酸n牛脾磷酸二酯酶:从游离牛脾磷酸二酯酶:从游离5端开始逐个水解下端开始逐个
6、水解下3-核苷酸核苷酸外切核酸酶对核酸的水解位点外切核酸酶对核酸的水解位点5 p p p pOHB p p p3 BBBBBBB牛脾磷酸二酯酶牛脾磷酸二酯酶5 5 端外切得:端外切得:3 3核苷酸核苷酸蛇毒磷酸二酯酶蛇毒磷酸二酯酶3 3 端外切得:端外切得:55核苷酸核苷酸 pn脱嘌呤脱嘌呤/脱嘧啶(脱嘧啶(AP)核酸内切酶的作用)核酸内切酶的作用n能识别去除了碱基的核酸(无嘌呤酸、无嘧啶酸)磷酸二酯键,并能识别去除了碱基的核酸(无嘌呤酸、无嘧啶酸)磷酸二酯键,并切除糖基,使核酸链断开。切除糖基,使核酸链断开。n3、限制性内切酶、限制性内切酶n限制性核酸内切酶又称限制性酶,可识别限制性核酸内切
7、酶又称限制性酶,可识别DNA分子中内部特异性的碱分子中内部特异性的碱基序列,并在该部位切断基序列,并在该部位切断DNA双链。双链。n 具有很强的专一性:顺序专一性或结构专一性具有很强的专一性:顺序专一性或结构专一性n对底物对底物DNA有特异的识别位点(又称识别序列),这些位点的长度一有特异的识别位点(又称识别序列),这些位点的长度一般在般在48个碱基对范围内,而且通常有一个二重对称轴,即个碱基对范围内,而且通常有一个二重对称轴,即53方方向的残基序列在两条链上是一样的,这样的序列叫回文结构,切割后向的残基序列在两条链上是一样的,这样的序列叫回文结构,切割后形成黏性末端或平齐末端。形成黏性末端或
8、平齐末端。n核酸链经酶切割后形成错开的切口,使每条单链的一端带有识别顺序核酸链经酶切割后形成错开的切口,使每条单链的一端带有识别顺序中的几个互补碱基,这样的末端称为黏性末端。中的几个互补碱基,这样的末端称为黏性末端。n环状或线状的双链环状或线状的双链DNA分子经限制性内切酶作用后都形成线状双链分子经限制性内切酶作用后都形成线状双链DNA。n这类酶主要在细菌中产生。因为这类酶自身这类酶主要在细菌中产生。因为这类酶自身DNA酶切位点往往经甲基酶切位点往往经甲基化修饰受到保护,因此其主要功能在于降解外面入侵的化修饰受到保护,因此其主要功能在于降解外面入侵的DNA,而不降,而不降解自身细胞中的解自身细
9、胞中的DNA。是基因重组用酶,是胞内。是基因重组用酶,是胞内DNA的的“卫士卫士”。返回返回DNA第二节第二节 核苷酸的分解代谢核苷酸的分解代谢n一、核苷酸的降解一、核苷酸的降解 n核苷酸酶广泛分布于生物体内核苷酸酶广泛分布于生物体内磷酸磷酸核苷酸核苷酸核苷核苷核苷酸酶或核苷酸酶或磷酸单酯酶磷酸单酯酶n核苷酸降解为核苷核苷酸降解为核苷n生物体内普遍存在的磷酸单酯酶或核苷酸酶可催化生物体内普遍存在的磷酸单酯酶或核苷酸酶可催化2-,3-和和5-核苷核苷酸的水解;特异性强的磷酸单酯酶只能水解酸的水解;特异性强的磷酸单酯酶只能水解3-核苷酸和核苷酸和5-核苷酸,核苷酸,对不同的碱基也有选择性。对不同的
10、碱基也有选择性。n核苷酸中糖苷键的断裂核苷酸中糖苷键的断裂n催化该反应的酶称为核苷酸核苷酶,主要在微生物(细菌)中存在催化该反应的酶称为核苷酸核苷酶,主要在微生物(细菌)中存在n核苷酸的脱氨反应与核苷酸转换核苷酸的脱氨反应与核苷酸转换n带氨基的核苷酸在核苷酸脱氨酶的作用下可脱掉氨基带氨基的核苷酸在核苷酸脱氨酶的作用下可脱掉氨基 而转变成另一种核苷酸。而转变成另一种核苷酸。n核苷的分解代谢核苷的分解代谢n核苷的代谢去路核苷的代谢去路n核苷的水解:核苷水解酶主要存在于植物和微生物中,只对核糖核苷核苷的水解:核苷水解酶主要存在于植物和微生物中,只对核糖核苷起作用,对脱氧核糖核苷无作用起作用,对脱氧核
11、糖核苷无作用n核苷的磷酸解作用:反应可逆,反应过程中糖构型由核苷的磷酸解作用:反应可逆,反应过程中糖构型由-型转变为型转变为-型型n核苷的相互转换核苷的相互转换n核苷的排泄:主要为修饰核苷酸,不被分解,也不被利用核苷的排泄:主要为修饰核苷酸,不被分解,也不被利用n核苷酸三级水平的降解核苷酸三级水平的降解n脱氨作用主要发生在核苷酸和核苷水平脱氨作用主要发生在核苷酸和核苷水平二、嘌呤的分解二、嘌呤的分解n嘌呤类化合物的分解代谢可以在核苷酸、核苷和嘌呤类化合物的分解代谢可以在核苷酸、核苷和碱基三个水平上进行(腺嘌呤核苷脱氢酶和腺嘌碱基三个水平上进行(腺嘌呤核苷脱氢酶和腺嘌呤核苷酸脱氢酶活性较高)呤核
12、苷酸脱氢酶活性较高)n嘌呤碱最终代谢产物:嘌呤碱最终代谢产物:人类、灵长类、鸟类、爬行类、人类、灵长类、鸟类、爬行类、大多数昆虫:直接排出尿酸大多数昆虫:直接排出尿酸大多数生物:尿酸在尿酸氧化酶大多数生物:尿酸在尿酸氧化酶作用下被氧化脱羧生成作用下被氧化脱羧生成尿囊素尿囊素、CO2、H2O2除人和猿类外的哺乳动物:直接除人和猿类外的哺乳动物:直接排出排出尿囊素尿囊素其他多数种类的生物:尿囊素经其他多数种类的生物:尿囊素经尿囊素酶水解成尿囊素酶水解成尿囊酸尿囊酸(一些硬(一些硬骨鱼的嘌呤代谢排泄物)骨鱼的嘌呤代谢排泄物)大多数鱼类及两栖类:大多数鱼类及两栖类:尿素尿素、乙、乙醛酸(尿囊酸酶)醛酸
13、(尿囊酸酶)甲壳类、海洋无脊椎动物:甲壳类、海洋无脊椎动物:NH3和和CO2(脲酶)(脲酶)腺嘌呤核苷腺嘌呤核苷次黄嘌呤核苷次黄嘌呤核苷n腺嘌呤核苷酸首先生成次黄嘌呤核苷腺嘌呤核苷酸首先生成次黄嘌呤核苷n其中脱氨可发生在核苷其中脱氨可发生在核苷/核苷酸水平核苷酸水平n次黄嘌呤核苷在核苷磷酸化酶作用下生成次黄嘌呤,再经次黄嘌呤氧次黄嘌呤核苷在核苷磷酸化酶作用下生成次黄嘌呤,再经次黄嘌呤氧化酶催化氧化成黄嘌呤。黄嘌呤在黄嘌呤氧化酶作用下氧化成尿酸。化酶催化氧化成黄嘌呤。黄嘌呤在黄嘌呤氧化酶作用下氧化成尿酸。次次n鸟嘌呤核苷酸经脱氨基生成黄嘌呤,再在黄嘌呤氧化酶催化下生成鸟嘌呤核苷酸经脱氨基生成黄嘌
14、呤,再在黄嘌呤氧化酶催化下生成尿酸尿酸n痛风:嘌呤代谢紊乱疾病。嘌呤代谢产生过多的尿酸,痛风:嘌呤代谢紊乱疾病。嘌呤代谢产生过多的尿酸,由于其溶解度很差,易在关节、软组织、软骨、肾等处由于其溶解度很差,易在关节、软组织、软骨、肾等处形成尿酸钠晶体并沉积引起灼痛。形成尿酸钠晶体并沉积引起灼痛。n如果发生如果发生HGPRT的缺陷,不能以补救途径合成嘌呤核的缺陷,不能以补救途径合成嘌呤核苷酸,吸收或合成的嘌呤碱不完全降解,导致大量尿酸苷酸,吸收或合成的嘌呤碱不完全降解,导致大量尿酸积累,也引起肾结石和痛风。积累,也引起肾结石和痛风。nHGPRT:次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖酶:次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖酶
15、n 痛风治疗可采用别嘌痛风治疗可采用别嘌呤醇,抑制黄嘌呤氧呤醇,抑制黄嘌呤氧化酶的活性,从而逐化酶的活性,从而逐步减少尿和血中的尿步减少尿和血中的尿酸含量。酸含量。n 正常人血清中尿酸含正常人血清中尿酸含量为量为0.120.36mmol/L,含量超过,含量超过0.47mmol/L时就会导时就会导致痛风症的发生。致痛风症的发生。三、嘧啶的分解三、嘧啶的分解n 包括脱氨基、氧化、还原包括脱氨基、氧化、还原、水解和脱羧基作用等。、水解和脱羧基作用等。有氨基的嘧啶先水解脱氨有氨基的嘧啶先水解脱氨基。基。n 哺乳动物体内,主要在肝哺乳动物体内,主要在肝脏进行。人和某些动物:脏进行。人和某些动物:核苷酸或
16、核苷水平也可进核苷酸或核苷水平也可进行行嘧啶分解的还原途径嘧啶分解的还原途径n胞嘧啶胞嘧啶 尿嘧啶尿嘧啶二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶-脲基丙酸脲基丙酸-丙氨酸丙氨酸n-丙氨酸经转氨基作用去氨基后还可以进一步参加有机酸代谢丙氨酸经转氨基作用去氨基后还可以进一步参加有机酸代谢n胸腺嘧啶代谢与其类似,生成胸腺嘧啶代谢与其类似,生成-氨基异丁酸氨基异丁酸胞嘧啶脱氨酶胞嘧啶脱氨酶还原还原脲基丙酸酶脲基丙酸酶二氢尿嘧啶酶二氢尿嘧啶酶n嘧啶碱基分解的氧化途径嘧啶碱基分解的氧化途径返回第三节第三节 核苷酸的生物合成核苷酸的生物合成n一、核糖核苷酸的生物一、核糖核苷酸的生物合成合成 n合成代谢的两条途径:合成代谢的两条
17、途径:n从头合成途径从头合成途径:以氨基酸和:以氨基酸和某些小分子物质为原料,经某些小分子物质为原料,经一系列酶促反应逐渐掺入到一系列酶促反应逐渐掺入到原子合成核苷酸,这是从无原子合成核苷酸,这是从无到有的合成过程。是体内核到有的合成过程。是体内核苷酸合成的主要途径。(肝苷酸合成的主要途径。(肝组织)组织)n补救途径或重新利用途径补救途径或重新利用途径:以细胞内现存的碱基和核苷以细胞内现存的碱基和核苷为原料,经过简单反应合成为原料,经过简单反应合成核苷酸的过程。(脑、骨髓核苷酸的过程。(脑、骨髓)核糖、氨基酸、CO2、NH3核糖核苷酸脱氧核苷酸辅酶RNA核苷碱基脱氧核苷DNAn核苷酸合成的基本
18、途径核苷酸合成的基本途径1、嘌呤核苷酸的生物合成、嘌呤核苷酸的生物合成n嘌呤环中各原子来源嘌呤环中各原子来源甘氨酸甘氨酸天冬氨酸天冬氨酸谷氨酰胺谷氨酰胺N10-次甲基四氢叶酸次甲基四氢叶酸甲酸盐甲酸盐n(1)从头合成途径)从头合成途径nATP+核糖核糖-5-磷酸磷酸n5-磷酸核糖焦磷酸(磷酸核糖焦磷酸(PRPP)n次黄嘌呤核苷酸(次黄嘌呤核苷酸(IMP)n其他嘌呤核苷其他嘌呤核苷n无机磷酸和无机磷酸和Mg2+是是PRPP合成酶的激活剂,合成酶的激活剂,ADP、AMP、GMP、IMP和和2,3-二磷酸甘油是它的抑制剂。二磷酸甘油是它的抑制剂。n5-磷酸核糖的活化磷酸核糖的活化酶促反应酶促反应PR
19、PP合成酶合成酶n酶促反应分五元环和六元环两个阶段酶促反应分五元环和六元环两个阶段n1)五元环合成)五元环合成nPRPP+谷氨酰胺谷氨酰胺5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸-N-甲酰甘氨酰甲酰甘氨酰胺核苷酸胺核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸5-氨基咪唑核苷酸(五元环)氨基咪唑核苷酸(五元环)nPRPP+谷氨酰胺谷氨酰胺5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺转酰胺酶转酰胺酶5-5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺5-5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸合合成成酶酶甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸转转甲甲酰酰基基酶酶来自甲酸(盐)来自甲酸(盐)n5-磷
20、酸核糖胺磷酸核糖胺甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸-N-甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸合合成成酶酶甲酰甘氨脒核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸5-5-氨基氨基-咪唑核苷酸咪唑核苷酸合合成成酶酶n-N-甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸5-氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸N N5 5-羧基氨基咪唑核苷酸羧基氨基咪唑核苷酸5-5-氨基氨基-咪唑核苷酸咪唑核苷酸氨基咪唑核苷氨基咪唑核苷酸羧化酶酸羧化酶n2)六元环合成(形成次黄苷酸)六元环合成(形成次黄苷酸)n5-氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸5-氨基咪唑氨基咪唑-
21、4-羧酸核苷酸羧酸核苷酸5-氨基咪唑氨基咪唑-4-N-琥珀琥珀酸氨甲酰核苷酸酸氨甲酰核苷酸 5-氨基咪唑氨基咪唑-4-甲酰胺核苷酸甲酰胺核苷酸次黄嘌呤核苷酸(次黄嘌呤核苷酸(腺嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸+鸟嘌呤核苷酸)鸟嘌呤核苷酸)n5-氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酸核苷酸羧酸核苷酸n5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酸核苷酸羧酸核苷酸5-氨基咪唑氨基咪唑-4-N-琥珀酸氨甲酰核苷酸琥珀酸氨甲酰核苷酸5-5-氨基氨基-咪唑咪唑-4-4-羧酸核苷酸羧酸核苷酸N-N-琥珀琥珀-5-5-氨基咪唑氨基咪唑-4-4-氨甲酰核苷酸氨甲酰核苷酸5-5-氨基咪唑氨基咪唑-4-4(N-N-琥珀
22、基)甲酰胺核苷酸琥珀基)甲酰胺核苷酸5-5-氨基咪唑氨基咪唑-4-4-氨甲酰核苷酸氨甲酰核苷酸n5-氨基咪唑氨基咪唑-4-N-琥珀酸氨甲酰核苷酸琥珀酸氨甲酰核苷酸 5-氨基咪唑氨基咪唑-4-甲酰胺核苷酸甲酰胺核苷酸5-5-甲酰氨基咪唑甲酰氨基咪唑-4-4-氨甲酰核苷酸氨甲酰核苷酸次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸n5-氨基咪唑氨基咪唑-4-甲酰胺核苷酸甲酰胺核苷酸次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤次黄嘌呤核苷酸核苷酸腺苷酸腺苷酸黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸鸟苷酸鸟苷酸腺苷酸代琥珀酸腺苷酸代琥珀酸由由IMP合成合成AMP和和GMPn(2)补救途径)补救途径n1)由碱基和)由碱基和1-磷酸核糖在核苷磷酸化
23、酶催化下合成核苷,然后再由核磷酸核糖在核苷磷酸化酶催化下合成核苷,然后再由核苷磷酸激酶催化磷酸化形成核苷酸苷磷酸激酶催化磷酸化形成核苷酸n2)嘌呤直接接受)嘌呤直接接受5-磷酸核糖焦磷酸的磷酸核糖,接合成嘌呤核苷酸。磷酸核糖焦磷酸的磷酸核糖,接合成嘌呤核苷酸。嘌呤核苷酸合成补救途径嘌呤核苷酸合成补救途径 磷酸核糖转移酶磷酸核糖转移酶嘌呤嘌呤+PRPPA(G)MP+PPi嘌呤嘌呤+1-P-核糖核糖嘌呤核苷嘌呤核苷 AMPATP ADP核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶腺苷激酶腺苷激酶2、嘧啶核苷酸的生物合成、嘧啶核苷酸的生物合成n嘌呤环中各原子来源嘌呤环中各原子来源CO2GlnAsp(1)从头合成途径(细
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