第七章蛋白质的分离纯化课件.ppt
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- 第七 蛋白质 分离 纯化 课件
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1、第七章第七章 蛋白质的性质和分离纯化蛋白质的性质和分离纯化Properties and Purification of Protein目的:目的:1.1.研究蛋白质的分子结构;研究蛋白质的分子结构;2.2.研究蛋白质的生物功能;研究蛋白质的生物功能;3.3.蛋白质应用。蛋白质应用。方法方法:利用各种性质差别。利用各种性质差别。第一节第一节 蛋白质的性质蛋白质的性质一、蛋白质的酸碱性质一、蛋白质的酸碱性质v蛋白质为两性电解质蛋白质为两性电解质v蛋白质等电点蛋白质等电点v蛋白质在其等电点偏酸溶液中带正电荷,蛋白质在其等电点偏酸溶液中带正电荷,在偏碱溶液中带负电荷,在等电点在偏碱溶液中带负电荷,在等
2、电点pHpH时时为两性离子。蛋白质溶液处于等电点时,为两性离子。蛋白质溶液处于等电点时,溶解度最小;粘度、渗透压、膨胀性及溶解度最小;粘度、渗透压、膨胀性及导电能力也降为最低值。导电能力也降为最低值。蛋白质在等电点的溶解度最小蛋白质在等电点的溶解度最小疏水区域疏水区域蛋白质分子上的电荷与疏水区蛋白质分子上的电荷与疏水区v等离子点:在没有其他盐类干扰时,蛋等离子点:在没有其他盐类干扰时,蛋白质质子供体基团解离出的质子数与质白质质子供体基团解离出的质子数与质子受体基团结合的质子数相等时的子受体基团结合的质子数相等时的pH,pH,为为蛋白质特征常数。蛋白质特征常数。v蛋白质相对分子量在蛋白质相对分子
3、量在600060001 000 0001 000 000之之间。测定分子量的主要方法有化学组成法、间。测定分子量的主要方法有化学组成法、渗透压法、超离心法(沉降分析法)、凝渗透压法、超离心法(沉降分析法)、凝胶过滤法、聚丙烯酰胺凝胶电泳等。胶过滤法、聚丙烯酰胺凝胶电泳等。二、蛋白质分子量及其确定方法二、蛋白质分子量及其确定方法v化学组成法化学组成法:最低最低M=M=元素元素(分子分子)分子量分子量/元素元素(分子分子)百分含量百分含量 v渗透压法渗透压法:Mr=cRT:Mr=cRT/v超离心法超离心法:Mr:Mr=RTs/(1-)D=RTs/(1-)D v凝胶过滤凝胶过滤:logMrlogMr
4、 =K=K1 1-K K2 2V Ve evSDSSDSPAGEPAGE法法:logMr:logMr=-b=-bR R v氨基酸序列分析计算氨基酸序列分析计算 元素原子量元素原子量(分子分子量分子分子量)v最低相对分子量最低相对分子量=元素元素(分子分子)百分含量百分含量肌红蛋白含铁量为肌红蛋白含铁量为0.335%,其最低分子量可,其最低分子量可按下式算出:按下式算出:Fe原子量原子量(55.8)v最低相对分子量最低相对分子量=Fe元素百分含量元素百分含量(0.335%)=16700化学组成测定最低相对分子量化学组成测定最低相对分子量v真实分子量是最低相对分子质量的真实分子量是最低相对分子质量
5、的n n倍,倍,这里这里n n是每个蛋白质分子中铁原子的数目。是每个蛋白质分子中铁原子的数目。因为肌红蛋白中,因为肌红蛋白中,n nl l,所以其真实,所以其真实M Mr r就就是是1670016700。又如血红蛋白含铁也是。又如血红蛋白含铁也是0.335%0.335%,即最低即最低M Mr r亦为亦为1670016700,但根据其他方法测得,但根据其他方法测得的的M Mr r是是6800068000。可见每一分子血红蛋白含有。可见每一分子血红蛋白含有四个铁原子,即四个铁原子,即n n4 4,因此其真实,因此其真实M Mr r16700167004=668004=66800。v有时蛋白质分子中
6、某一氨基酸的含量特别少,有时蛋白质分子中某一氨基酸的含量特别少,应用同样的原理,由这一氨基酸含量的分析应用同样的原理,由这一氨基酸含量的分析结果,也可以计算蛋白质的最低相对分子质结果,也可以计算蛋白质的最低相对分子质量。量。v例如牛血清清蛋白含色氨酸例如牛血清清蛋白含色氨酸0.58%,计算所,计算所得的最低相对分子质量是得的最低相对分子质量是35200。用其他方。用其他方法测得的法测得的Mr是是69000,所以每分子牛血清清,所以每分子牛血清清蛋白含有两个色氨酸残基。蛋白含有两个色氨酸残基。渗透压法渗透压法v渗透压是溶液的依数性渗透压是溶液的依数性质之一质之一,是单位体积内溶是单位体积内溶质质
7、点数的函数质质点数的函数,与溶质与溶质的性质和形状无关。的性质和形状无关。v唐南平衡影响渗透压测定。唐南平衡影响渗透压测定。v尽量采用接近等电点的缓冲液作膜内外尽量采用接近等电点的缓冲液作膜内外的溶剂,并增加缓冲液中无机盐的浓度。的溶剂,并增加缓冲液中无机盐的浓度。沉降速度法沉降速度法FcFbFfv蛋白质在离心场中沉降时蛋白质在离心场中沉降时:vF Fc c(离心力离心力)=m mp p2(离心加速度)离心加速度)vF Fb b(浮力浮力)=V Vp p2=m mp p2vF Ff f(摩擦力摩擦力)=f f=f(d f(d/dt/dt)v通过测定沉降界面的移动速度测定通过测定沉降界面的移动速
8、度测定Mr.dx/dtMr.dx/dt为为常数常数v F Fc c-F-Fb b =F Ff fv (d (d/dt/dt)m)mp p(1-1-)2 f f=v沉降系数:单位离心力场的沉降速度叫沉降系数,沉降系数:单位离心力场的沉降速度叫沉降系数,用用s s表示。表示。s=(dx/dt)/s=(dx/dt)/2 2=m=mp p(1-)/f(1-)/f 沉降系数只与分子的大小和形状有关,当分子形沉降系数只与分子的大小和形状有关,当分子形状相似时,状相似时,s s与分子量成正比。因此与分子量成正比。因此s s常用作生物常用作生物大分子的大小表示方法。大分子的大小表示方法。v由于由于s s值较小
9、,因此用值较小,因此用1 11010-13-13秒表示秒表示1 1个沉降系个沉降系数单位(数单位(Svedberg unitSvedberg unit)。)。S S值与温度和溶剂值与温度和溶剂有关,所以,一个分子的沉降系数定义为摄氏有关,所以,一个分子的沉降系数定义为摄氏2020度,水溶液条件下的度,水溶液条件下的s s值为标准。值为标准。1S=11S=11010-13-13(s s)v由于蛋白质分子的沉降速度同时受到分子的大小由于蛋白质分子的沉降速度同时受到分子的大小和形状的影响,大小与质量有关、而形状与其扩散和形状的影响,大小与质量有关、而形状与其扩散系数有关:系数有关:m mp p=Mr
10、=Mr/N /N f=RT/ND f=RT/ND(爱因斯坦(爱因斯坦-萨德兰德方程)萨德兰德方程)s=ms=mp p(1-)/f(1-)/f Mr=RTsD(1 )v是溶剂的密度(是溶剂的密度(g/cmg/cm3 3););是蛋白质是蛋白质的偏微比容(即当加入的偏微比容(即当加入1g1g干物质于无限大干物质于无限大体积的溶剂中时溶液体积的增量)(蛋白体积的溶剂中时溶液体积的增量)(蛋白质溶于水的偏微比容约为质溶于水的偏微比容约为0.74 cm0.74 cm3 3/g/g););R R是气体常数(是气体常数(8.314 J/(Kmol8.314 J/(Kmol)););T T是是绝对温度(绝对温
11、度(K K););s s为沉降系数;为沉降系数;D D是扩散是扩散系数。系数。v凝胶是由胶体溶液凝结而成的固体物质。凝胶是由胶体溶液凝结而成的固体物质。不论是天然凝胶还是人工合成的凝胶,不论是天然凝胶还是人工合成的凝胶,它们的内部都具有很细微的多孔网状结它们的内部都具有很细微的多孔网状结构。凝胶层析的机理是分子筛效应构。凝胶层析的机理是分子筛效应(又称又称分子筛层析分子筛层析),如同过筛那样,它可以把,如同过筛那样,它可以把物质按分子大小不同进行分离,但这种物质按分子大小不同进行分离,但这种“过筛过筛”与普通的过筛不一样。与普通的过筛不一样。凝胶过滤法测定蛋白质分子量凝胶过滤法测定蛋白质分子量
12、分子筛层析的工作原理分子筛层析的工作原理v在洗脱过程中,大分子不能进入凝胶内在洗脱过程中,大分子不能进入凝胶内部而沿凝胶颗粒间的空隙最先流出柱外,部而沿凝胶颗粒间的空隙最先流出柱外,而小分子可以进人凝胶颗粒内部的多孔而小分子可以进人凝胶颗粒内部的多孔网状结构,流速缓慢,以致最后流出柱网状结构,流速缓慢,以致最后流出柱外,从而使样品中分子大小不同的物质外,从而使样品中分子大小不同的物质得到分离。得到分离。A.A.小分子由于扩散作用进入凝胶颗粒内部而被滞小分子由于扩散作用进入凝胶颗粒内部而被滞留,大分子被排阻在凝胶颗粒外面,在颗粒之留,大分子被排阻在凝胶颗粒外面,在颗粒之间迅速通过。间迅速通过。B
13、.(1)B.(1)蛋白质混合物上柱;蛋白质混合物上柱;(2)(2)洗脱开始,小分子扩散进入凝胶颗粒内,大洗脱开始,小分子扩散进入凝胶颗粒内,大分子则被排阻在颗粒之外,大小分子开始分开;分子则被排阻在颗粒之外,大小分子开始分开;(3)(3)小分子被滞留,大分子向下移动,大小分小分子被滞留,大分子向下移动,大小分子完全分开;子完全分开;(4)(4)大分子行程较短,已洗脱出层析柱,小分大分子行程较短,已洗脱出层析柱,小分子尚在行进中。子尚在行进中。V Vt t-V-Vo o 或或V Vi i+V+Vm mV Vt tV Vo ovV Vo o:外水体积,可用不被凝胶滞留的大分子物:外水体积,可用不被
14、凝胶滞留的大分子物质的溶液质的溶液(最好有颜色以便于观察,如血红蛋最好有颜色以便于观察,如血红蛋白,印度黑墨水,分子量约白,印度黑墨水,分子量约200200万的蓝色葡聚万的蓝色葡聚糖一糖一20002000等等)通过实验测量求出。通过实验测量求出。vV Vi i:内水体积,可:内水体积,可由由gWgWR R求得求得(g(g为干凝胶重,为干凝胶重,W WR R为凝胶的为凝胶的“吸水量吸水量”,以,以mLmLg g表示表示)。vV Vm m :凝胶基质体积。:凝胶基质体积。vV Vt t:总体积。:总体积。V Vt t=V=Vm m+V+Vo o+V+Vi ivV Ve e:为洗脱体积。:为洗脱体积
15、。分配系数分配系数K Kd dv可以把凝胶层析看成是液可以把凝胶层析看成是液-液分配层析。液分配层析。固定相是凝胶珠内部水相(固定相是凝胶珠内部水相(V Vi i),流动相),流动相是凝胶外部水相(是凝胶外部水相(V Vo o)。)。K Kd d为样品在两相为样品在两相间的分配系数,也可以说间的分配系数,也可以说K Kd d是分子量不同是分子量不同的溶质在凝胶内部和外部的分配系数,只的溶质在凝胶内部和外部的分配系数,只与被分离物分子的大小和凝胶颗粒孔隙的与被分离物分子的大小和凝胶颗粒孔隙的大小分布有关,而与柱的粗细长短无关,大小分布有关,而与柱的粗细长短无关,也就是说它对特定物质为常数,与柱的
16、物也就是说它对特定物质为常数,与柱的物理条件无关。理条件无关。v K Kd d=(V=(Ve e-V-Vo o)/V)/Vi i vK Kd d可以有下列几种情况:可以有下列几种情况:v(1)(1)当当K Kd d=O=O时,则时,则V Ve e=V=Vo o,即对于根本不能进入凝,即对于根本不能进入凝胶内部的大分子物质胶内部的大分子物质(全排阻全排阻),洗脱体积等于空,洗脱体积等于空隙容积隙容积(组分组分I)I)。v(2)(2)当当K Kd d=1=1时,时,V Ve e=V=Vo o+V+Vi i,即小分子可完全渗入凝,即小分子可完全渗入凝胶内部时,洗脱体积应为外水体积与内水体积之胶内部时
17、,洗脱体积应为外水体积与内水体积之和和(组分组分)。(3)(3)当当0K0Kd d111,表示凝胶对组分有吸附作用,此时,表示凝胶对组分有吸附作用,此时V Ve eVVo o+V+Vi i,例如一些芳香族化合物的洗脱容积,例如一些芳香族化合物的洗脱容积远超出理论计算的最大值,这些化合物的远超出理论计算的最大值,这些化合物的K Kd d11,如苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸在如苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸在SephadexSephadex G-G-2525中的中的K Kd d值分别为值分别为1.21.2,1.41.4和和2.22.2。v已知已知 K Kd d=(V Ve e-V-Vo o)/V/Vi i,
18、将,将V Vt t-V-Vo o代替代替V Vi i,则则K Kavav=(V Ve e-V-Vo o)/(V Vt t-V-Vo o)即即 V Ve e=V=Vo o+K+Kavav(V Vt t-V-Vo o)v实际上,将原来以水作为固定相实际上,将原来以水作为固定相(V(Vi i)改为水与改为水与凝胶颗粒凝胶颗粒(V(Vt t-V-Vo o)作为固定相,而洗脱剂作为固定相,而洗脱剂(V(Ve e-V-Vo o)作为流动相。作为流动相。K Kavav与与K Kd d对交联度小的凝胶差别较对交联度小的凝胶差别较小,而对交联度大的凝胶差别大。小,而对交联度大的凝胶差别大。v在一般情况下,凝胶对
19、组分没有吸附作用时,在一般情况下,凝胶对组分没有吸附作用时,当流动相流过当流动相流过V Vt t体积后,所有的组分都应该被体积后,所有的组分都应该被洗出来,这一点为凝胶层析法的特点。洗出来,这一点为凝胶层析法的特点。有效分配系数有效分配系数K KavavlogMrlogMr =K=K1 1-K K2 2V Ve eSDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGESDS-PAGE)测定分子量测定分子量 vSDSSDS(十二烷基硫酸钠)是一种阴离子去污剂,(十二烷基硫酸钠)是一种阴离子去污剂,可破坏蛋白质氢键和疏水作用使蛋白质变性。可破坏蛋白质氢键和疏水作用使蛋白质变性。v
20、SDSSDS带有很多负电荷,与蛋白质结合(带有很多负电荷,与蛋白质结合(1.41.4克克SDS/1SDS/1克蛋白质)后,克蛋白质)后,SDSSDS的负电荷远远超过了蛋的负电荷远远超过了蛋白质分子原有的电荷,蛋白质分子原有的电荷就白质分子原有的电荷,蛋白质分子原有的电荷就变得无足轻重了,所以在电场上移动的速度完全变得无足轻重了,所以在电场上移动的速度完全取决于蛋白质分子的大小。取决于蛋白质分子的大小。v在在SDSSDS和巯基乙醇存在下,蛋白质和亚基的肽链和巯基乙醇存在下,蛋白质和亚基的肽链完全伸展成长棒状(完全伸展成长棒状(1.8nm1.8nm),其分子量与肽链的),其分子量与肽链的长度成比例
21、。长度成比例。logMlogM=a-b=a-bR三、蛋白质的胶体性质三、蛋白质的胶体性质v具有胶体的一切特性(布郎运动、丁达具有胶体的一切特性(布郎运动、丁达尔现象、不能透过半透膜、具有吸附能尔现象、不能透过半透膜、具有吸附能力)力)v亲水胶体稳定性亲水胶体稳定性 :(:(1 1)直径)直径1-100nm1-100nm;(2 2)水化层()水化层(3 3)双电层)双电层v溶胶(蛋白质颗粒分散在水中)、凝胶溶胶(蛋白质颗粒分散在水中)、凝胶(水分散在蛋白质颗粒中)(水分散在蛋白质颗粒中)蛋白质的胶体性质蛋白质的胶体性质v蛋白质溶液是一种胶体溶液;蛋白质溶液是一种胶体溶液;v特定的空间构象,分子量
22、一定特定的空间构象,分子量一定 分子筛分子筛层析;层析;v在大部分在大部分pHpH条件下,蛋白质分子同时存在两条件下,蛋白质分子同时存在两种电荷种电荷 等电点沉淀,盐溶,盐析,电等电点沉淀,盐溶,盐析,电泳,离子交换层析等;泳,离子交换层析等;v一般而言,蛋白质分子上同时存在疏水和亲一般而言,蛋白质分子上同时存在疏水和亲水区域水区域 有机溶剂沉淀,疏水层析有机溶剂沉淀,疏水层析。四、蛋白质的沉淀四、蛋白质的沉淀 消除稳定蛋白质的因素,就会导致蛋白消除稳定蛋白质的因素,就会导致蛋白质沉淀。通常进行蛋白质沉淀的方法有以质沉淀。通常进行蛋白质沉淀的方法有以下几种:下几种:1.1.盐析法盐析法 2.2
23、.有机溶剂沉淀法有机溶剂沉淀法 3.3.重金属盐沉淀法重金属盐沉淀法 4.4.生物碱试剂和某些酸沉淀法生物碱试剂和某些酸沉淀法 5.5.热变性沉淀法热变性沉淀法 前两种方法可以使蛋白质不变性,后前两种方法可以使蛋白质不变性,后3 3种种方法通常会使蛋白质变性。方法通常会使蛋白质变性。蛋白质的盐析蛋白质的盐析硫酸铵对马血红蛋白的溶解度的影响硫酸铵对马血红蛋白的溶解度的影响离子强度离子强度第二节第二节 蛋白质分离纯化及含量测定蛋白质分离纯化及含量测定蛋白质分离纯化的总目标蛋白质分离纯化的总目标:v增加制品的纯度或比活性(单位蛋白质增加制品的纯度或比活性(单位蛋白质重量中目标蛋白质的含量或生物活性)
24、重量中目标蛋白质的含量或生物活性)蛋白质分离纯化的基本原则蛋白质分离纯化的基本原则:v选择好的材料选择好的材料v了解目的蛋白质的稳定性了解目的蛋白质的稳定性v探索有效的抽提法和浓缩法探索有效的抽提法和浓缩法v建立一套层析的组合建立一套层析的组合v以较好的方法贮存以较好的方法贮存一、一、初初(粗粗)提提 v组织、细胞破碎组织、细胞破碎v缓冲液提取。缓冲液提取。二、粗分级分离二、粗分级分离 (粗纯化)(粗纯化)v盐析盐析 v有机溶剂沉淀有机溶剂沉淀 v等电点沉淀等电点沉淀v超滤浓缩等超滤浓缩等三、细分级分离三、细分级分离 (精纯化)(精纯化)v分子筛层析分子筛层析v亲和层析亲和层析v疏水疏水/反相
25、层析反相层析 v离子交换层析离子交换层析v吸附层析吸附层析v电泳等电泳等四、结晶四、结晶蛋白质分离纯化的步骤及具体方法蛋白质分离纯化的步骤及具体方法v蛋白质分子的大小蛋白质分子的大小v蛋白质溶解度蛋白质溶解度v蛋白质电荷状况蛋白质电荷状况v蛋白质吸附性质蛋白质吸附性质v蛋白质生物学亲和性蛋白质生物学亲和性依据蛋白质性质的分离纯化方法依据蛋白质性质的分离纯化方法一、依据分子大小不同的纯化方法一、依据分子大小不同的纯化方法1 1、透析和超滤、透析和超滤 透析:分离无机盐、透析:分离无机盐、单糖等小分子。单糖等小分子。超滤:分离无机盐、超滤:分离无机盐、单糖等小分子。单糖等小分子。透析示意图透析示意
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