第三章转录及其调控课件.ppt
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- 第三 转录 及其 调控 课件
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1、第三章转录及其调控第三章转录及其调控2021/2/42重点难点v转录、启动子、增强子的概念v转录反应体系v原核生物转录的大致过程v真核生物转录后加工v转录水平的调节方式 原核生物的操纵子模式 真核生物的顺式作用元件与反式作用因子2021/2/43生物体在遗传信息传递过程中,以生物体在遗传信息传递过程中,以DNADNA为模板,在为模板,在DNADNA依赖的依赖的RNARNA聚合酶(聚合酶(DNA-dependent RNA DNA-dependent RNA polymerasepolymerase)催化下,以)催化下,以4 4种三磷酸核苷(种三磷酸核苷(ATPATP、GTPGTP、CTPCTP
2、、UTPUTP)为原料,合成)为原料,合成RNARNA的过程称为的过程称为转录(转录(transcriptiontranscription)。)。2021/2/44复制和转录的区别复制和转录的区别复制复制转录转录模板模板两股链均复制两股链均复制全部基因组被复制全部基因组被复制只有模板链转录(不对称转录)只有模板链转录(不对称转录)任一种细胞内仅部分基因转录任一种细胞内仅部分基因转录原料原料dNTPNTP酶酶DNA聚合酶聚合酶RNA聚合酶聚合酶产物产物子代双链子代双链DNAmRNA,tRNA,rRNA等等碱基配对碱基配对A-T,G-CA-T,G-C,A-U2021/2/45目录第一节第一节 原核
3、生物原核生物转录转录第二节第二节 真核生物转录真核生物转录第三节第三节 转录调控转录调控第四节第四节 转录及其调控系统与药物转录及其调控系统与药物2021/2/462021/2/47目录一、原核生物转录模板、酶及相关因子(一)原核生物转录模板(二)原核生物RNA聚合酶(三)原核生物转录相关因子二、原核生物转录过程(一)原核生物转录起始(二)(二)原核生物转录延长(三)原核生物转录终止2021/2/48一、转录模板、酶及相关因子v 在在DNADNA分子的双链上,按碱基配对规律能指导分子的双链上,按碱基配对规律能指导转录生成转录生成RNARNA的一股链作为模板指导转录,另的一股链作为模板指导转录,
4、另一股链则不转录,这种模板的选择性称为一股链则不转录,这种模板的选择性称为不对不对称转录(称转录(asymmetric transcriptionasymmetric transcription)。(一)转录模板(一)转录模板2021/2/495GCAGTACATGTC33cgtgatgtacag55GCAGUACAUGUC3NAlaValHisValC编码链编码链(codingstrand)模板链(模板链(templatestrand)mRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译一、转录模板、酶及相关因子2021/2/410(二)原核生物(二)原核生物RNARNA聚合酶聚合酶v在模板链在模板链DNA
5、DNA碱基序列的指导下,按碱基配对碱基序列的指导下,按碱基配对规律把四种核糖核苷三磷酸聚合成规律把四种核糖核苷三磷酸聚合成RNARNA链。链。v需二价金属离子,如需二价金属离子,如MnMn2+2+、ZnZn2+2+。v不需要引物并且也没有校正活性。不需要引物并且也没有校正活性。一、转录模板、酶及相关因子2021/2/411亚基亚基分子量分子量每分子酶中所含数目每分子酶中所含数目功功能能365122决定哪些基因被转录决定哪些基因被转录1506181与转录全过程有关(催化)与转录全过程有关(催化)1556131结合结合DNA模板模板110001功能尚不清楚功能尚不清楚702631辨认起始位点辨认起
6、始位点大肠埃希菌(大肠埃希菌(Ecoli)RNA聚合酶各亚基的功能聚合酶各亚基的功能2称为全酶(称为全酶(holoenzyme),),称为核心酶(称为核心酶(coreenzyme)。)。一、转录模板、酶及相关因子2021/2/412(三)原核生物转录相关因子(三)原核生物转录相关因子v 由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量46kD。v 能结合RNA,以对poly C的结合力最强,对poly dC/dG组成的DNA的结合能力低得多。v ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。1.因子因子一、转录模板、酶及相关因子2021/2/4132.2.调节基因所编码的调节基因所编码的因子因子特
7、异因子:决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力;阻遏蛋白:可识别、结合特异DNA序列,抑制基因转录,介导负调节;激活蛋白:可结合启动序列邻近的DNA序列,提高RNA聚合酶与启动序列结合能力,增强RNA聚合酶的转录活性,是一种正调控。CAP一、转录模板、酶及相关因子2021/2/414v分解代谢物基因激活蛋白(catabolite gene activator protein,CAP)就是一种典型的激活蛋白。有些基因在没有激活蛋白存在时,RNA聚合酶很少或根本不能结合启动序列,无法转录。3.3.其他因子其他因子 除上述因子外,还有一些蛋白质参与转录过程。例如,大肠埃希菌的nu
8、sA蛋白能协助RNA聚合酶识别某些特征性的终止位点。一、转录模板、酶及相关因子2021/2/415二、原核生物转录过程(一)原核生物转录起始(一)原核生物转录起始1.1.原核生物原核生物RNARNA聚合酶与模板的辨认结合聚合酶与模板的辨认结合原核生物通常是以操纵子(原核生物通常是以操纵子(operon)作为转录和)作为转录和调控的基本单位。调控的基本单位。结构基因结构基因启动子启动子其他调控序列其他调控序列(promoter)RNA-pol2021/2/416vRNARNA聚合聚合酶保酶保护法护法二、原核生物转录过程2021/2/417二、原核生物转录过程开始转录开始转录TTGACAAACTG
9、T-35区区(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 RNA-pol辨认位点辨认位点(recognitionsite)5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 2021/2/4182.2.原核生物转录起始过程原核生物转录起始过程闭合转录复合体(闭合转录复合体(closedtranscriptioncomple)形成;)形成;开放转录复合体(开放转录复合体(opentranscriptioncomplex)形成;)形成;转录起始复合物形成。转录起始复合物形成。二、原核生物转录过程RNApol(2)-D
10、NA-pppGpN-OH3 转录起始复合物转录起始复合物:5-pppG-OH+NTP5-pppGpN-OH3+ppi2021/2/419二、原核生物转录过程nE.coli的转录起始和延长2021/2/420(二)原核生物转录延长(二)原核生物转录延长二、原核生物转录过程1.亚基脱落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,与模板结聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着合松弛,沿着DNA模板前移;模板前移;2.在核心酶作用下,在核心酶作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链不断延链不断延长。长。(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi2021/2/421二、原核生物转录过程大肠埃希菌的转录
11、泡局部结构示意图转录泡转录泡(transcriptionbubble):RNA-pol(核心酶)(核心酶)DNARNA2021/2/422二、原核生物转录过程原核生物转录延长与蛋白质的翻译同时进行5 3 DNA核糖体RNARNA聚合酶在同一DNA模板上,有多个转录同时在进行;转录尚未完成,翻译已在进行。2021/2/423(三)原核生物转录终止(三)原核生物转录终止v当当RNARNA聚合酶核心酶(聚合酶核心酶()滑行到操纵)滑行到操纵子的终止部位时,就在子的终止部位时,就在DNADNA模板上停顿下来不再前模板上停顿下来不再前行,转录生成的行,转录生成的RNARNA产物链从转录复合物上脱落下产物
12、链从转录复合物上脱落下来,即转录终止(来,即转录终止(terminationtermination)。)。v原核生物转录终止包括依赖原核生物转录终止包括依赖因子的与非依赖因子的与非依赖因子的二种转录终止机制。因子的二种转录终止机制。二、原核生物转录过程2021/2/424二、原核生物转录过程1.1.依赖依赖 因子的转录终止因子的转录终止2021/2/425二、原核生物转录过程2.2.非依赖非依赖 因子的转录终止因子的转录终止2021/2/4262021/2/427目录一、真核生物转录酶及相关因子一、真核生物转录酶及相关因子(一)真核生物(一)真核生物RNARNA聚合酶聚合酶(二)真核生物转录相
13、关因子(二)真核生物转录相关因子二、真核生物转录过程二、真核生物转录过程(一)真核生物转录起始(一)真核生物转录起始(二)真核生物转录延长(二)真核生物转录延长(三)真核生物转录终止(三)真核生物转录终止三、真核生物三、真核生物RNARNA成熟成熟(一)真核生物(一)真核生物mRNAmRNA的成熟的成熟(二)真核生物(二)真核生物tRNAtRNA的成熟的成熟(三)真核生物(三)真核生物rRNArRNA的成熟的成熟(四)非编码(四)非编码RNARNA的加工成熟的加工成熟(五)(五)RNARNA编辑编辑2021/2/428一、真核生物转录酶及相关因子v真核生物真核生物的的RNARNA种类种类 编码
14、编码RNARNA(mRNAmRNA)非编码非编码RNARNA 管家非编码管家非编码RNARNA:直接或间接参与蛋白质合成:直接或间接参与蛋白质合成(tRNAtRNA,rRNArRNA,snRNAsnRNA,snoRNAsnoRNA等)等)调控非编码调控非编码RNARNA短链非编码短链非编码RNARNA(非编码小(非编码小RNARNA)中链非编码中链非编码R RNANA长链非编码长链非编码R RNANA2021/2/429一、真核生物转录酶及相关因子(一)真核生物(一)真核生物RNARNA聚合酶聚合酶种类种类转录产物转录产物rRNA的前体的前体45SrRNAmRNA前体前体hnRNA,lncRN
15、A,piRNA,miRNAtRNA,5SrRNAsnRNA对鹅膏蕈碱对鹅膏蕈碱的反应的反应耐受耐受敏感敏感高浓度下敏感高浓度下敏感细胞内定位细胞内定位核仁核仁核内核内核内核内2021/2/430一、真核生物转录酶及相关因子v 是真核生物中最活跃的RNA聚合酶;v 最大亚基肽链的C末端氨基酸残基序列为(YSPTSPS)n。不同生物种属的n值不同,一般在2060。主要由含羟基氨基酸组成的重复序列,称为羧基末端结构域(carboxyl terminal domain,CTD)。CTD上的酪氨酸、丝氨酸和苏氨酸残基可被蛋白激酶作用发生磷酸化,在从转录起始过渡到延长时有重要作用。RNA聚合酶2021/2
16、/431一、真核生物转录酶及相关因子(二)真核生物转录相关因子(二)真核生物转录相关因子1.1.转录因子转录因子v在真核细胞核中,能够协助在真核细胞核中,能够协助RNARNA聚合酶转录聚合酶转录RNARNA的的蛋白质被统称为蛋白质被统称为转录因子转录因子(transcriptional transcriptional factorfactor,TFTF)。)。v人类基因组约编码人类基因组约编码2 0002 000种转录因子。真核生物转种转录因子。真核生物转录因子种类很多,有多种分类方式。录因子种类很多,有多种分类方式。2021/2/432参与参与RNA-polRNA-pol转录的转录的TFTF
17、的作用的作用转录因子转录因子功能功能TFDTBP亚基结合亚基结合TATA盒盒TFA辅助辅助TBP-DNA结合结合TFB稳定稳定TFD-DNA复合物,结合复合物,结合RNApolTFE解螺旋酶解螺旋酶,结合结合TFHTFF促进促进RNApol结合及作为其他因子结结合及作为其他因子结合的桥梁合的桥梁TFH解旋酶、作为蛋白激酶催化解旋酶、作为蛋白激酶催化CTD磷酸化磷酸化2021/2/433一、真核生物转录酶及相关因子2.2.其他因子其他因子 v与启动子上游元件结合的蛋白质,称为上游因子与启动子上游元件结合的蛋白质,称为上游因子(upstream factorupstream factor)。上游因
18、子可协助调节转录的效)。上游因子可协助调节转录的效率。率。v与远隔调控序列如增强子等结合的反式作用因子;与远隔调控序列如增强子等结合的反式作用因子;v在某些特殊生理或病理情况下被诱导产生的可诱导在某些特殊生理或病理情况下被诱导产生的可诱导因子。因子。2021/2/434二、真核生物转录过程(一)真核生物转录起始(一)真核生物转录起始v真核生物的转录起始阶段,主要是RNA聚合酶、转录因子TF与DNA模板形成转录起始前复合物(pre-initiation complex,PIC)的过程2021/2/435二、真核生物转录过程(二)真核生物转录延长(二)真核生物转录延长v真核生物转录延长过程与原核生
19、物大致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。vRNA-pol前移处处都遇上核小体。v转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚现象。2021/2/436二、真核生物转录过程(三)真核生物转录终止(三)真核生物转录终止v真核生物的转录终止与转录产物的加工密切相关。真核生物的转录终止与转录产物的加工密切相关。v真核生物真核生物RNARNA聚合酶聚合酶转录产生转录产生hnRNAhnRNA的过程,直至的过程,直至出现多聚腺苷酸信号为止,即转录终止的修饰点序出现多聚腺苷酸信号为止,即转录终止的修饰点序v成熟成熟mRNAmRNA的的55端端“帽子帽子”结构和结构和33端的端的poly Apoly
20、A尾尾是在加工过程中产生的是在加工过程中产生的2021/2/437三、真核生物RNA成熟v在真核生物中,几乎所有的初级转录产物都需一定程度的加工才能成为具有生物学功能的RNA分子v真核生物初级转录产物的成熟主要在细胞核内进行。v成熟过程包括核苷酸的部分水解、剪接反应、5端和3端的“加帽”和“加尾”,以及核苷酸的修饰等。2021/2/438三、真核生物RNA成熟n几种主要的修饰方式:几种主要的修饰方式:1.剪接剪接(splicing)2.剪切剪切(cleavage)3.修饰修饰(modification)5.RNA RNA编辑编辑(RNAediting)4.添加添加(addition)2021/
21、2/439三、真核生物RNA成熟(一)真核生物(一)真核生物mRNAmRNA的成熟的成熟1.mRNA1.mRNA的剪接的剪接v 去除初级转录产物上的内含子,把外显子连接起来使之成为成熟mRNA的过程称为剪接。v 剪接过程中内含子区段弯曲,使相邻的两个外显子互相靠近而利于剪接,称为套索RNA。v 内含子近3端的嘌呤甲基化是形成套索所必需的。v 大多数内含子序列的5端都以GU开始,而以3端AG-OH结束。5-GUAG-OH-3称为剪接接口(splicing junction)或边界序列。2021/2/440三、真核生物RNA成熟vhnRNAhnRNA的剪接发生在剪接体(的剪接发生在剪接体(spli
22、cesomesplicesome),自),自2020世纪世纪7070年代后期年代后期RNARNA剪接现象发现以来,科学家们剪接现象发现以来,科学家们一直在探索其中的分子奥秘,中国科学家施一公一直在探索其中的分子奥秘,中国科学家施一公研究组研究组20152015年年8 8月月2121日,在日,在科学科学(Science)(Science)发发表论文阐述了单颗粒冷冻电子显微技术(冷冻电表论文阐述了单颗粒冷冻电子显微技术(冷冻电镜)解析的酵母剪接体近原子分辨率的三维结构镜)解析的酵母剪接体近原子分辨率的三维结构,并在此结构基础上分析了剪接体对前体信使,并在此结构基础上分析了剪接体对前体信使RNARN
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