遗传学课件14第十四章(表达调控).ppt
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- 遗传学 课件 14 第十四 表达 调控
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1、 第十四章 基因表达的调控 第一节第一节 基因的概念与发展基因的概念与发展一、经典遗传学的基因概念一、经典遗传学的基因概念 达尔文在达尔文在物种起源物种起源中,解释生物进化时对遗中,解释生物进化时对遗传和变异机制进行了假设,提出了泛生假说传和变异机制进行了假设,提出了泛生假说(hypothesis of pangenesishypothesis of pangenesis),认为遗传物质),认为遗传物质是存在于生物器官中的是存在于生物器官中的“泛子泛子”(pangenpangen)在)在世代间的传递和表现。基因(世代间的传递和表现。基因(genegene)概念的萌芽。)概念的萌芽。孟德尔提出生
2、物的单一性状是由颗粒状的孟德尔提出生物的单一性状是由颗粒状的遗传因遗传因子子(hereditary factorhereditary factor)所控制,还总结出了遗)所控制,还总结出了遗传的两条基本定律,即遗传因子的分离定律和自传的两条基本定律,即遗传因子的分离定律和自由组合定律由组合定律 。遗传的染色体学说遗传的染色体学说(Chromosomal theory of(Chromosomal theory of inheritance)inheritance),孟德尔遗传因子的行为与减数,孟德尔遗传因子的行为与减数分裂和受精中染色体的行为非常吻合,从而设分裂和受精中染色体的行为非常吻合,从
3、而设想把特定的遗传因子定位于特定的染色体上。想把特定的遗传因子定位于特定的染色体上。19091909年丹麦遗传学者约翰生(年丹麦遗传学者约翰生(Johanson WJohanson W)提出了提出了“基因基因”这个名词。这个名词。摩尔根等人对果蝇、玉米等的大量研究,建立摩尔根等人对果蝇、玉米等的大量研究,建立了基因和染色体为主体的经典遗传学。认为基了基因和染色体为主体的经典遗传学。认为基因是一种化学实体,以念珠状直线排列在染色因是一种化学实体,以念珠状直线排列在染色体上。基因不仅控制特定的性状,而且能够发体上。基因不仅控制特定的性状,而且能够发生突变(生突变(mutationmutation)
4、和随着染色体同源节段)和随着染色体同源节段的互换而交换。的互换而交换。经典遗传学的基因概念 基因具有染色体的主要属性,能自我复制,有相对的稳定性;是一个功能单位,控制正在发育的有机体的某一或某些性状;交换的最小单位,即在重组时不能再分割的单位;又是一个突变单位,可以基因是以整体进行突变的;重组单位和突变单位称为结构单位。基因既是一个结构单位,又是一个功能单位。基因既是一个结构单位,又是一个功能单位。二、现代遗传学的基因概念二、现代遗传学的基因概念 1957年法国遗传学家本泽尔根据T4噬菌体及其突变体的特性,精妙地设计了一个顺反测验(cis trans test)来研究基因的精细结构,提出了顺反
5、子(cistron)学说。这个学说不仅把生物中通过顺反效应(互补测定)而发现的遗传功能单位称为顺反子(实际上就是一个基因),打破了经典遗传学中关于基因是功能、突变、重组的“三位一体”概念及基因是不可分割的最小遗传单位的观点,而且认为基因是十分复杂的遗传和变异的单位。DNA是主要的遗传物质,一个基因是DNA的特定区段,包含特定的碱基序列。(1)突变子(2)重组子(3)顺反子在功能上被顺反测验或互补测验所规定,可转录一条完整的RNA分子,或编码一条多肽链的一段DNA序列。现代遗传学关于基因的概念现代遗传学关于基因的概念三、基因的类型三、基因的类型1 1、根据来源划分:核基因、线粒体基因、叶绿、根据
6、来源划分:核基因、线粒体基因、叶绿体基因等。粗糙,难以表明基因的本质。体基因等。粗糙,难以表明基因的本质。2 2、根据结构和功能划分:结构基因、根据结构和功能划分:结构基因(structural(structural gene)gene)、调节基因、调节基因(regulator gene)(regulator gene)和操纵基因和操纵基因(operator gene)(operator gene)、重叠基因、重叠基因(overlapping(overlapping gene)gene)、隔裂基因、隔裂基因(split gene)(split gene)或断裂基因或断裂基因(interrupt
7、ed gene)(interrupted gene)、跳跃基因、跳跃基因(jumping(jumping gene)gene)或转座子或转座子(transposon)(transposon)、假基因、假基因(pseudogene)(pseudogene)等不同类型。等不同类型。结构基因:结构基因:可编码可编码RNARNA或蛋白质的一段或蛋白质的一段DNADNA序列;序列;调节基因:调节基因:其产物参与调控其他结构基其产物参与调控其他结构基因表达的基因;因表达的基因;操纵基因:操纵基因:是调节基因产物的靶位点,是调节基因产物的靶位点,当二者结合时,调控基因的表达;当二者结合时,调控基因的表达;重
8、叠基因重叠基因:指一段:指一段DNADNA的编码序列,由的编码序列,由于其阅读顺序的差异或者终止早晚的不于其阅读顺序的差异或者终止早晚的不同,同时编码两个或两个以上多肽链的同,同时编码两个或两个以上多肽链的基因;基因;隔裂基因:隔裂基因:有些基因内部核苷酸编码顺有些基因内部核苷酸编码顺序不是连续的,中间插入了一个或多个序不是连续的,中间插入了一个或多个不编码的序列,把基因隔裂开来,不编不编码的序列,把基因隔裂开来,不编码的序列称为内含子码的序列称为内含子(intron)(intron),那些被内,那些被内含子隔离开来一段一段翻译的编码序列,含子隔离开来一段一段翻译的编码序列,统称为外显子统称为
9、外显子(extron)(extron),被内含子隔裂的,被内含子隔裂的基因就为隔裂基因;基因就为隔裂基因;跳跃基因或转座子:有些含特殊结构的跳跃基因或转座子:有些含特殊结构的DNADNA序序列可从染色体上一个位置跳到另一个位置上,列可从染色体上一个位置跳到另一个位置上,甚至从一条染色体移动到另一条染色体上,这甚至从一条染色体移动到另一条染色体上,这个过程称为转座个过程称为转座(transposition)(transposition),转座可引发,转座可引发DNADNA链的断裂或重排而导致变异,发生转座的链的断裂或重排而导致变异,发生转座的DNADNA序列就为跳跃基因或转座子;序列就为跳跃基因
10、或转座子;假基因:假基因:DNADNA序列相似于某些正常基因的序列,序列相似于某些正常基因的序列,但处于其他的位置,其上有碱基的缺失、插入但处于其他的位置,其上有碱基的缺失、插入或突变而不能转录和翻译,是无功能的基因。或突变而不能转录和翻译,是无功能的基因。基因作用与性状表达基因对遗传性状表达的作用可分为直接的和间接的。直接的:基因控制合成的蛋白质为结构蛋白或功能蛋白。间接的:基因通过酶的合成,间接影响性状的表达。顺反测验及基因的精细结构顺反测验及基因的精细结构 1957年本泽尔根据年本泽尔根据T4噬菌体及突变的特噬菌体及突变的特性,设计了顺反测验。性,设计了顺反测验。rII区突变:区突变:侵
11、染侵染B B菌株:大菌斑菌株:大菌斑 侵染侵染K12K12():无菌斑):无菌斑图图 8 84 4 计算重组值时的试验图解计算重组值时的试验图解 rx与与ry 间重组率:间重组率:2(r+r+噬菌体噬菌体)2在在K12()上生长的噬菌体数上生长的噬菌体数 100%=100%总噬菌体数总噬菌体数 在在B菌株上生长的噬菌体数菌株上生长的噬菌体数 多个两点测验作出多个两点测验作出rII区精细的遗传图区精细的遗传图顺反(互补)测验顺反(互补)测验r51和和r106是是rII区区的的2个突变体个突变体单独感染单独感染 K12()不能复制,不产生子代不能复制,不产生子代噬菌体。噬菌体。将将r51和和r10
12、6同时感染同时感染K12()菌株,产生菌株,产生子代噬菌体。子代噬菌体。复制与重组复制与重组谁先谁后?谁先谁后?r47与与r106共同感染共同感染K12()菌株,不产生菌株,不产生子代噬菌体。子代噬菌体。(同一个基因,不能功能互补)(同一个基因,不能功能互补)说明先功能互补、复制再重组。说明先功能互补、复制再重组。测定功能是否互补的测验称为互补试验。测定功能是否互补的测验称为互补试验。图图 8 86 6 突变座位与互补图解突变座位与互补图解 DNA水平上的调控转录调控翻译控制三个水平上三个水平上的调控的调控基因表达与调控第二节第二节 原核生物基因表达的调控原核生物基因表达的调控一、转录水平的调
13、控一、转录水平的调控 DNA元件:元件:DNA上一段序列,但它作为一种上一段序列,但它作为一种原位(原位(in situ)序列具有特殊的功能。由于它)序列具有特殊的功能。由于它只能作用同一条只能作用同一条DNA,因此称,因此称顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)。顺式作用位点通常总)。顺式作用位点通常总是在靶基因的上游。是在靶基因的上游。调节基因的产物可以自由地结合到其相应的靶调节基因的产物可以自由地结合到其相应的靶上,因此被为上,因此被为反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)。)。在细菌中,当几种酶参与同一个代谢途在细菌中,当几种酶参与
14、同一个代谢途径时,往往是这几种酶的合成同时启动,径时,往往是这几种酶的合成同时启动,产生编码所有蛋白质的一个或几个产生编码所有蛋白质的一个或几个多顺多顺反子反子(polycistronic)mRNA。真核生物。真核生物没有这种调控机制,真核生物基因转录没有这种调控机制,真核生物基因转录的是单顺反子(的是单顺反子(monocistronic)mRNA。负调控负调控(negative regulation):存:存在细胞中的阻遏在细胞中的阻遏物阻止转录过程。物阻止转录过程。图图14-2 正调控和负调控正调控和负调控 任何一种干扰基因表达的作用都属于负控制,任何一种干扰基因表达的作用都属于负控制,其
15、机制有:其机制有:阻遏蛋白和阻遏蛋白和DNA上的特异位点相结合,阻上的特异位点相结合,阻止止DNA聚合酶起始转录;聚合酶起始转录;阻遏蛋白和阻遏蛋白和RNA结合阻止翻译的起始,使结合阻止翻译的起始,使基因处于关闭状态。基因处于关闭状态。正调控正调控(positive regulation):调节蛋白的作):调节蛋白的作用不是阻止起始,而是帮助起始。它和用不是阻止起始,而是帮助起始。它和DNA以以及及RNA聚合酶相互作用来帮助起始。在正调控聚合酶相互作用来帮助起始。在正调控系统中,诱导物通常与另一蛋白质结合形成一系统中,诱导物通常与另一蛋白质结合形成一种激活子(种激活子(activator)复合
16、物,与基因启动子)复合物,与基因启动子DNA序列结合,激活基因起始转录。序列结合,激活基因起始转录。原核生物中基因表达以负调控为主。真核生物原核生物中基因表达以负调控为主。真核生物中则主要是正调控机制。中则主要是正调控机制。原核生物基因表达的调控主要发生在转录水平。原核生物基因表达的调控主要发生在转录水平。当需要某一特定基因产物时,合成这种当需要某一特定基因产物时,合成这种mRNA。当不需要这种产物时,当不需要这种产物时,mRNA转录受到抑制。转录受到抑制。(一)乳糖操纵元(一)乳糖操纵元(lac operonlac operon)三个结构基因的功能是:三个结构基因的功能是:lacZ编码编码-
17、半乳糖苷酶半乳糖苷酶,它,它可以切断乳糖的半乳糖苷键,产生半乳糖和葡萄糖;可以切断乳糖的半乳糖苷键,产生半乳糖和葡萄糖;lacY编码编码-半乳糖苷透性酶半乳糖苷透性酶,这种酶是膜结合蛋白,这种酶是膜结合蛋白,它构成转运系统,将半乳糖苷运入到细胞中;它构成转运系统,将半乳糖苷运入到细胞中;lacA编编码码-半乳糖苷乙酰转移酶半乳糖苷乙酰转移酶,其功能只将乙酰,其功能只将乙酰-辅酶辅酶A上上的乙酰基转移到的乙酰基转移到-半乳糖苷上。半乳糖苷上。1 1、乳糖操纵元模型、乳糖操纵元模型 三个结构基因上游有三个结构基因上游有2个顺式调控元件,即个顺式调控元件,即启动子启动子(promoter,P)和)和
18、操纵子操纵子(operator,O)。还有另)。还有另一个一个调节抑制基因调节抑制基因(lacI)位于所有基因的上游,但它)位于所有基因的上游,但它本身具有自己的启动子和终止子,成为独立的转录单本身具有自己的启动子和终止子,成为独立的转录单位,因此位,因此lacI基因通常不包括在基因通常不包括在lac操纵元之内。由于操纵元之内。由于lacI的产物是可溶性蛋白,它是能够分散到各处或结合的产物是可溶性蛋白,它是能够分散到各处或结合到分散的到分散的DNA位点上,是典型的反式作用调节物。位点上,是典型的反式作用调节物。这一个完整的调节系统包括结构基因和控制这这一个完整的调节系统包括结构基因和控制这些基
19、因表达的元件,形成了一个共同的调节单些基因表达的元件,形成了一个共同的调节单位,这种调节单位就称为位,这种调节单位就称为操纵元操纵元。操纵元的活。操纵元的活性是由调节基因控制的,调节基因的产物可以性是由调节基因控制的,调节基因的产物可以和操纵元上的顺式作用控制元件相互作用。和操纵元上的顺式作用控制元件相互作用。2 2、乳糖操纵元的负调控、乳糖操纵元的负调控lac基因编码一种基因编码一种阻遏蛋白。阻遏蛋阻遏蛋白。阻遏蛋白至少有两个结合白至少有两个结合位点,一个是结合位点,一个是结合诱导物(乳糖),诱导物(乳糖),另一个是结合操纵另一个是结合操纵子子O。当诱导物在相。当诱导物在相应位点结合时,它应
20、位点结合时,它改变了阻遏蛋白的改变了阻遏蛋白的构象,干扰了另一构象,干扰了另一位点的活性。阻遏位点的活性。阻遏蛋白结合在操纵子蛋白结合在操纵子O位点,阻止位点,阻止RNA聚聚合酶起始转录结构合酶起始转录结构基因。基因。2 2、乳糖操纵元的负调控、乳糖操纵元的负调控阻遏蛋白对于操纵阻遏蛋白对于操纵基因有很高的亲和基因有很高的亲和性,在缺乏诱导物性,在缺乏诱导物(乳糖)时,(乳糖)时,阻遏阻遏蛋白总是结合在操蛋白总是结合在操纵基因上,使得邻纵基因上,使得邻近的结构基因不能近的结构基因不能转录转录。但当诱导物。但当诱导物存在时,它和阻遏存在时,它和阻遏蛋白结合形成了一蛋白结合形成了一个阻遏蛋白复合体
21、个阻遏蛋白复合体,不再和操纵基因,不再和操纵基因结合。这样,在没结合。这样,在没有阻遏蛋白有阻遏蛋白操操纵子互作时,纵子互作时,RNA聚合酶才能起始转聚合酶才能起始转录结构基因,产生录结构基因,产生乳糖代谢酶。乳糖代谢酶。协同调控(协同调控(coordinate regulation):所):所有的一组基因都一起表达或一起关闭。有的一组基因都一起表达或一起关闭。mRNA一般总是从一般总是从5 开始转录,所以诱导开始转录,所以诱导总是导致总是导致-半乳糖苷酶、透性酶和乙酰半乳糖苷酶、透性酶和乙酰转移酶按一定顺序出现。转移酶按一定顺序出现。lacZ、lacY、lacA三个基因的产物总保持同样的当量
22、三个基因的产物总保持同样的当量关系。关系。3 3、乳糖操纵元的正调控、乳糖操纵元的正调控 当细菌细胞处于既有大量乳糖又有葡萄糖时的情况会怎当细菌细胞处于既有大量乳糖又有葡萄糖时的情况会怎样呢?样呢?实际上只要有葡萄糖存在,细菌细胞就不产生实际上只要有葡萄糖存在,细菌细胞就不产生-半乳糖半乳糖苷酶。这说明,除了阻遏蛋白能抑制苷酶。这说明,除了阻遏蛋白能抑制lac操纵元转录外操纵元转录外,还有其它因子也能有效地抑制,还有其它因子也能有效地抑制mRNA转录,而这个因转录,而这个因子的活性与葡萄糖有关。子的活性与葡萄糖有关。乳糖乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶半乳糖和葡萄糖半乳糖和葡萄糖葡萄糖葡萄糖腺苷酸环
23、化酶腺苷酸环化酶抑制抑制ATP前体前体环式环式Amp(cAmp)与代谢激活蛋与代谢激活蛋白(白(CAP)结)结合(合(cAmp的的受体蛋白受体蛋白)cAmp-CAP复合物复合物作为操纵元的正调控因子作为操纵元的正调控因子缺乏葡萄糖时缺乏葡萄糖时,有利于,有利于cAmp-CAP复合物的形成复合物的形成。当。当cAmp-CAP复合物的二聚体插入到复合物的二聚体插入到lac启动子区启动子区域特异核苷酸序列时,使启动子域特异核苷酸序列时,使启动子DNA弯曲形成新的弯曲形成新的构型,构型,RNA聚合酶与这种聚合酶与这种 DNA 新构型的结合更加牢新构型的结合更加牢固,转录效率更高。因此,当细胞既有乳糖与
24、阻遏固,转录效率更高。因此,当细胞既有乳糖与阻遏蛋白结合,又有蛋白结合,又有cAmp-CAP结合在启动子结合在启动子DNA序列序列时,时,lac启动子的转录效率最高。启动子的转录效率最高。有葡萄糖存在时有葡萄糖存在时,不能形成,不能形成cAmp,也就没有操纵元的,也就没有操纵元的正调控因子正调控因子cAmp-CAP复合物,因此基因不表达。复合物,因此基因不表达。核酸核酸-蛋白质互作研究结果进一步证实,单独的蛋白质互作研究结果进一步证实,单独的cAmp-CAP复合复合体,或体,或RNA聚合酶,与聚合酶,与lac启动子结合的亲和力都不高,启动子结合的亲和力都不高,与其它与其它DNA分子的亲和力也很
25、低。如果二者同时与分子的亲和力也很低。如果二者同时与lac启启动子动子DNA结合,可以迅速形成紧密牢固的复合体,表现结合,可以迅速形成紧密牢固的复合体,表现为典型的协调结合(为典型的协调结合(coorperative binding)的方式。)的方式。(二)色氨酸操纵元(二)色氨酸操纵元(trp operontrp operon)色氨酸操纵元控制的是合成代谢,最终的产物是色氨酸。在培养基中缺乏Trp时操纵子打开,而加入Trp 时将促进trp操纵子的关闭,也就是最终产物色氨酸或某种物质对转录将起到阻遏的作用,而不是诱导的作用,在其操纵元中不存在cAMP-CAP位点。色氨酸阻遏蛋白只有和色氨酸结合
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