第三章酶第八本科药学本科优质课件.ppt
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1、第三章酶第八本科药学本科第三章酶第八本科药学本科优选第三章酶第八版本科药学本优选第三章酶第八版本科药学本科科v公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。v1850年,年,L.Pasteur认为发酵是酵母细胞生命活动的结认为发酵是酵母细胞生命活动的结果。果。v1877年,年,Kuhne首次提出首次提出Enzyme一词。一词。v1897年,年,Buchner兄弟用不含细胞的酵母提取液,实现兄弟用不含细胞的酵母提取液,实现了发酵。了发酵。v1926年,年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。v1982年,年,Cech首次发现首次发现RNA也具
2、有酶的催化活性,提也具有酶的催化活性,提出核酶出核酶(ribozyme)的概念。的概念。v1995年,年,Jack W.Szostak研究室首先报道了具有研究室首先报道了具有DNA连连接酶活性接酶活性DNA片段,称为脱氧核酶片段,称为脱氧核酶(deoxyribozyme)。第一节第一节 酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能v单体酶单体酶v寡聚酶寡聚酶v多酶体系多酶体系v多功能酶或串联酶多功能酶或串联酶 仅具有三级结构的酶。仅具有三级结构的酶。由多个相同或不同亚基以非共价键连接由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。组成的酶。由几种不同功能的酶彼此聚合形成由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶
3、复合物。的多酶复合物。多种不同催化功能存在于一条多肽链中。多种不同催化功能存在于一条多肽链中。一、酶的分子组成中常含有辅助因子一、酶的分子组成中常含有辅助因子酶分子可根据其化学组成的不同,分为两类:酶分子可根据其化学组成的不同,分为两类:单纯酶单纯酶酶蛋白酶蛋白结合酶结合酶辅助因子辅助因子辅酶辅酶辅基辅基全酶全酶(按其与酶蛋白结(按其与酶蛋白结合的紧密程度)合的紧密程度)与酶蛋白结合疏松,可用与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。透析或超滤的方法除去。与酶蛋白结合紧密,不可与酶蛋白结合紧密,不可用透析或超滤的方法除去。用透析或超滤的方法除去。*全酶分子中各部分在催化反应中的作用全酶分子中
4、各部分在催化反应中的作用v酶蛋白决定反应的特异性及其催化机制酶蛋白决定反应的特异性及其催化机制v辅助因子决定反应的种类与性质辅助因子决定反应的种类与性质辅助因子多为小分子有机化合物或金属离子辅助因子多为小分子有机化合物或金属离子 作为辅助因子的有机化合物多为作为辅助因子的有机化合物多为B族维生素的族维生素的衍生物或卟啉化合物衍生物或卟啉化合物 它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子(或基团)或起运载体作用(或基团)或起运载体作用转移的基团转移的基团辅酶或辅基辅酶或辅基名称名称所含的维生素所含的维生素氢原子(质子)氢原子(质子)NAD(辅酶(辅酶I)尼克酰胺
5、(维生素尼克酰胺(维生素PP)之一)之一NADP(辅酶(辅酶II)尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP)之一)之一FMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)醛基醛基TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)酰基酰基辅酶辅酶A(CoA)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸烷基烷基钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类维生素维生素B12二氧化碳二氧化碳生物素生物素生物素生物素氨基氨基磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)甲基、甲烯基、甲炔基、
6、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基等一碳单位甲酰基等一碳单位四氢叶酸四氢叶酸叶酸叶酸部分辅酶(辅基)在催化中的作用部分辅酶(辅基)在催化中的作用(一)别构效应剂通过改变酶的构象而调节酶的活性(二)酶的降解与一般蛋白质降解途径相同这种抑制作用称为反竞争性抑制作用。它们在酶促反应中主要参与传递电子、质子(或基团)或起运载体作用反应速率与底物浓度成正比;心脏疾病LDH1及LDH2上升,LDH3及LDH5下降;二、底物足够时酶浓度对反应速率的影响呈直线关系D-葡糖-6-磷酸水解酶二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位O OR1982年,Cech首次发现RNA也具有酶的催化活性,提出核酶(ribozy
7、me)的概念。一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或几个短肽TPP(焦磷酸硫胺素)(三)酶的催化机制呈多元催化作用中和阴离子,降低反应中的静电斥力等Km可近似表示酶对底物的亲和力二、每一种酶均有其系统名称和推荐名称金属离子的作用金属离子的作用作为酶活性中心的催化基团参与催化反作为酶活性中心的催化基团参与催化反应应在酶与底物间起桥梁作用在酶与底物间起桥梁作用中和阴离子,降低反应中的静电斥力等中和阴离子,降低反应中的静电斥力等稳定酶的构象稳定酶的构象 辅助因子多为小分子有机化合物或金属离子辅助因子多为小分子有机化合物或金属离子最常见的辅助因子最常见的辅助因子金属酶金属酶金属激活酶金属激活酶某些金属
8、酶和金属激活酶某些金属酶和金属激活酶 金属酶金属酶金属离子金属离子 金属激活酶金属激活酶金属离子金属离子过氧化氢酶过氧化氢酶FeFe2+2+丙酮酸激酶丙酮酸激酶K K+、MgMg2+2+过氧化物酶过氧化物酶FeFe2+2+丙酮酸羧化酶丙酮酸羧化酶MnMn2+2+、ZnZn2+2+谷胱甘肽过氧谷胱甘肽过氧化物酶化物酶SeSe2+2+蛋白激酶蛋白激酶MgMg2+2+、MnMn2+2+固氮酶固氮酶MoMo2+2+己糖激酶己糖激酶MgMg2+2+核糖核苷酸还核糖核苷酸还原酶原酶MnMn2+2+磷脂酶磷脂酶C CCaCa2+2+羧基肽酶羧基肽酶ZnZn2+2+细胞色素氧化酶细胞色素氧化酶CuCu2+2+
9、碳酸酐酶碳酸酐酶ZnZn2+2+脲酶脲酶NiNi2+2+碱性磷酸酶碱性磷酸酶MgMg2+2+柠檬酸合酶柠檬酸合酶K K+二、酶的活性中心是酶分子中执行其二、酶的活性中心是酶分子中执行其催化功能的部位催化功能的部位酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化学基团一些与酶活性密切相关的化学基团。n必需基团必需基团(essential group)(essential group)指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物
10、。并将底物转化为产物。n酶的活性中心酶的活性中心 (active(active center)center)活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 位于活性中心以外,维持酶活性中心位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象和(或)作为调节剂的结应有的空间构象和(或)作为调节剂的结合部位所必需。合部位所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团底底 物物 活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 活性中心活性中心 n溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心三、同工酶催化相同的化学反应三、同工酶催化相同的化学反应同工酶同工酶 :
11、是指催化相同的化学反应,而:是指催化相同的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。质不同的一组酶。可由不同基因或等位基因编码的多肽可由不同基因或等位基因编码的多肽链,也可由同一基因转录生成的不同链,也可由同一基因转录生成的不同mRNAmRNA翻译的不同多肽链组成的蛋白质。翻译的不同多肽链组成的蛋白质。酶分子可根据其化学组成的不同,分为两类:有机磷(敌百虫、敌敌畏、对硫磷)不可逆抑制羟基酶的活性中心酶原(zymogen)通过改变底物浓度对酶进行调节等非溶酶体蛋白酶降解途径(又称依赖ATP和泛素的降解途径)有机磷化合物 羟基酶心脏疾病
12、LDH1及LDH2上升,LDH3及LDH5下降;反应速率与底物浓度成正比;研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。这样,既减少从中间产物转化为产物的量,也同时减少从中间产物解离出游离酶和底物的量。a)抑制剂只与酶底物复合物结合;各种可逆性抑制作用的比较抑制剂对酶有一定选择性只能催化热力学允许的化学反应;酶的催化不需要较高的反应温度。(二)酶和底物的结合有形成中间产物尼克酰胺(维生素PP)之一第 四 节 酶 的 调 节(二)酶的降解与一般蛋白质降解途径相同P +EOH P +HXHHHHHHH MHHMMHMMMMMMMLDH1 (H4)LDH2(H3M)LDH3(H2M2)LDH4(HM3)L
13、DH5 (M4)乳酸脱氢酶的同工酶乳酸脱氢酶的同工酶n举例举例 1LDH同工酶同工酶红细胞红细胞白细胞白细胞血清血清骨骼肌骨骼肌心肌心肌肺肺肾肾肝肝脾脾LDH1(H4)431227.10731443210LDH2(H3M)444934.70243444425LDH3(H2M2)123320.95335121110LDH4(HM3)1611.7160512720LDH5(M4)005.7790120565人体各组织器官人体各组织器官LDHLDH同工酶谱(活性同工酶谱(活性%)LDH1LDH1乳酸亲和力高,乳酸亲和力高,LDH5LDH5丙酮酸亲和力高丙酮酸亲和力高心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝
14、病病人血清LDH同工酶谱的变化同工酶谱的变化1 1酶酶活活性性心肌梗死酶谱心肌梗死酶谱正常酶谱正常酶谱肝病酶谱肝病酶谱2 23 34 45 5临床相关(一般规律)临床相关(一般规律)1.1.心脏疾病心脏疾病LDH1LDH1及及LDH2LDH2上升,上升,LDH3LDH3及及LDH5LDH5下降;下降;2.2.急性肝炎急性肝炎LDH5LDH5明显升高,明显升高,随病情好转逐渐恢复正常;随病情好转逐渐恢复正常;3.3.慢性肝炎一般处于正常范慢性肝炎一般处于正常范围,部分病例可见围,部分病例可见LDH5LDH5有所有所升高;升高;n举例举例 2 CK1(BB)CK2(MB)CK3(MM)脑脑 心肌心
15、肌 骨骼肌骨骼肌肌酸激酶肌酸激酶(CK)同工酶同工酶CK2常作为临床早期诊断心肌梗死的一项生化指标常作为临床早期诊断心肌梗死的一项生化指标 第二节第二节 酶的工作原理酶的工作原理 酶与一般催化剂的共同点酶与一般催化剂的共同点 在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点。反应的平衡点。(一)酶对底物具有极高的催化效率(一)酶对底物具有极高的催化效率 一、一、酶反应特点酶反应特点酶的催化效率通常比非催化反应高酶的催化效率通常比非催化反应高10108
16、810102020倍,比一般催化剂高倍,比一般催化剂高10107 710101313倍。倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不需要较高的反应温度。底物底物催化剂催化剂反应温度反应温度()速率常数速率常数苯酰胺苯酰胺H+522.410-6OH-538.510-6-胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶2514.9尿素尿素H+627.410-7脲酶脲酶215.0106H2O2Fe2+5622某些酶与一般催化剂催化效率的比较某些酶与一般催化剂催化效率的比较 一种酶仅作用于一种或一类化合物,一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶
17、的这种特性称为并生成一定的产物。酶的这种特性称为酶的特异性或专一性。酶的特异性或专一性。酶的特异性酶的特异性(二)酶促反应具有高度的特异性(二)酶促反应具有高度的特异性1.1.绝对专一性绝对专一性只能作用于特定结构的底物,进行一种专只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物一的反应,生成一种特定结构的产物 。如脲。如脲酶仅能催化尿素水解生成酶仅能催化尿素水解生成COCO2 2和和NHNH3 3。2.2.相对专一性相对专一性依据底物分子中的特定的化学键或特定的基依据底物分子中的特定的化学键或特定的基团,因而可以作用于含有相同化学键或化学基团,因而可以作用于含有相同化学键
18、或化学基团的一类化合物。团的一类化合物。(三)酶的活性与酶量具可调节性(三)酶的活性与酶量具可调节性对酶生成与降解量的调节对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节酶催化效力的调节通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等(四)酶具有不稳定性(四)酶具有不稳定性二、酶通过促进底物形成过渡态二、酶通过促进底物形成过渡态而提高反应速率而提高反应速率(一)酶比一般催化剂更有效地降低反应活(一)酶比一般催化剂更有效地降低反应活化能化能活化能:底物分子从初态转变到活化活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量。态所需的能量。能能 量量 改改 变变活活 化化 过过 程程过渡态过渡态酶催化活
19、性最高时反应体系的pH。如果酶的总浓度已知,可从Vmax计算 酶的转换数(turnover number),即动力学常数K3。非必需激活剂:如,Cl-对淀粉酶O OR+EOH1877年,Kuhne首次提出Enzyme一词。这一过程称为酶-底物结合的诱导契合。仅具有三级结构的酶。温度升高,酶促反应速率升高;一、酶活性的调节是对酶促反应速率的快速调节慢性肝炎一般处于正常范围,部分病例可见LDH5有所升高;可由不同基因或等位基因编码的多肽链,也可由同一基因转录生成的不同mRNA翻译的不同多肽链组成的蛋白质。动力学特点:Vmax不变,表观Km增大。抑制剂仅与酶和底物形成的中间产物(ES)结合,使中间产
20、物ES的量下降。关系式为V=K3 E消化管内蛋白酶以酶原形式分泌,不仅保护消化器官本身不受酶的水解破坏;RO OTPP(焦磷酸硫胺素)只能催化热力学允许的化学反应;肌酸激酶(CK)同工酶1/S(二)酶和底物的结合有形成中间产物(二)酶和底物的结合有形成中间产物1.1.诱导契合作用使酶与底物密切结合诱导契合作用使酶与底物密切结合酶底物复合物酶底物复合物E+SE+PES酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶为酶-底物结合的诱导契合。底物结合的诱导契合。羧肽酶的诱导契合模式羧
21、肽酶的诱导契合模式 底物底物2.2.邻近效应与定向排列使诸底物正确定邻近效应与定向排列使诸底物正确定位于酶的活性中心位于酶的活性中心 实际上是将分子间的反应变成类似于分子实际上是将分子间的反应变成类似于分子内的反应,从而提高反应速率。内的反应,从而提高反应速率。3.3.表面效应使底物分子去溶剂化表面效应使底物分子去溶剂化与酶结合帮助底物分子排除周围大量水分与酶结合帮助底物分子排除周围大量水分子干扰性吸引和排斥,防止水化膜的形成子干扰性吸引和排斥,防止水化膜的形成(三)酶的催化机制呈多元催化作用(三)酶的催化机制呈多元催化作用2.共价催化作用共价催化作用3.亲核催化作用亲核催化作用1.酸碱催化作
22、用酸碱催化作用第三节第三节 酶促反应动力学酶促反应动力学n概念概念研究各种因素对酶促反应速率的影研究各种因素对酶促反应速率的影响,并加以定量的阐述。响,并加以定量的阐述。n影响因素包括影响因素包括酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、pHpH、温度、温度、抑制剂、激活剂等。抑制剂、激活剂等。研究一种因素的影响时,其余各因研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。素均恒定。一、底物浓度对反应速率影响的作图呈矩一、底物浓度对反应速率影响的作图呈矩形双曲线形双曲线在其他因素不变在其他因素不变的情况下,底物浓的情况下,底物浓度对反应速率的影度对反应速率的影响呈矩形双曲线关响呈矩形双曲线关系。系。当底物浓度
23、较低时当底物浓度较低时反应速率与底物浓度成正比;反反应速率与底物浓度成正比;反应为一级反应。应为一级反应。随着底物浓度的增高随着底物浓度的增高反应速率不再成正比例加速;反反应速率不再成正比例加速;反应为混合级反应。应为混合级反应。当底物浓度高达一定程度当底物浓度高达一定程度反应速率不再增加,达最大速率;反反应速率不再增加,达最大速率;反应为零级反应应为零级反应二、每一种酶均有其系统名称和推荐名称中和阴离子,降低反应中的静电斥力等由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将
24、底物转化为产物。-胰凝乳蛋白酶+二肽在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应速率的影响呈矩形双曲线关系。酶催化活性最高时反应体系的pH。1.辅助因子决定反应的种类与性质优选第三章酶第八版本科药学本科CK2常作为临床早期诊断心肌梗死的一项生化指标这一过程称为酶-底物结合的诱导契合。m:米氏常数(Michaelis constant)活性中心以外的必需基团酶原(zymogen)(三)酶原需要通过激活过程才能产生有活性的酶反应速率不再成正比例加速;S:底物浓度:底物浓度V:不同:不同S时的反应速率时的反应速率Vmax:最大反应速率:最大反应速率(maximum velocity)m:米氏常数:米氏常数
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