生物化学酶化学课件.ppt
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1、第第4 4章章 酶化学酶化学 本章要求本章要求 掌握酶的概念、酶的命名分类及催化作用的特点。掌握酶的概念、酶的命名分类及催化作用的特点。了解几种重要辅酶的结构与功能。了解几种重要辅酶的结构与功能。了解酶促反应动力学。了解酶促反应动力学。掌握各因素对酶促反应速度的影响。掌握各因素对酶促反应速度的影响。掌握酶活性中心的测定方法、酶的催化机制。掌握酶活性中心的测定方法、酶的催化机制。了解酶与化学相关学科的关系了解酶与化学相关学科的关系酶的发现酶的发现1773年,意大利科学家斯帕兰扎尼(年,意大利科学家斯帕兰扎尼(L.Spallanzani,1729-1799)设)设计了一个巧妙的实验:将肉块放入小巧
2、的金属笼中,然后让鹰吞下去。计了一个巧妙的实验:将肉块放入小巧的金属笼中,然后让鹰吞下去。过一段时间他将小笼取出,发现肉块消失了。于是,他推断胃液中一过一段时间他将小笼取出,发现肉块消失了。于是,他推断胃液中一定含有消化肉块的物质。但是什么,他不清楚。定含有消化肉块的物质。但是什么,他不清楚。1836年,德国科学家施旺(年,德国科学家施旺(T.Schwann,1810-1882)从胃液中提取)从胃液中提取出了消化蛋白质的物质。解开胃的消化之谜。出了消化蛋白质的物质。解开胃的消化之谜。1926年,美国科学家萨姆钠(年,美国科学家萨姆钠(J.B.Sumner,1887-1955)从刀豆种子)从刀豆
3、种子中提取出脲酶的结晶,并通过化学实验证实脲酶是一种蛋白质。中提取出脲酶的结晶,并通过化学实验证实脲酶是一种蛋白质。20世纪世纪30年代,科学家们相继提取出多种酶的蛋白质结晶,并指出年代,科学家们相继提取出多种酶的蛋白质结晶,并指出酶是一类具有生物催化作用的蛋白质。酶是一类具有生物催化作用的蛋白质。20世纪世纪80年代,美国科学家切赫(年代,美国科学家切赫(T.R.Cech,1947-)和奥特曼)和奥特曼(S.Altman,1939-)发现少数)发现少数RNA也具有生物催化作用。也具有生物催化作用。4.1 4.1 酶酶生物催化剂生物催化剂n酶酶是生物催化剂,是一类具有催化活性和特定空间构象是生
4、物催化剂,是一类具有催化活性和特定空间构象 的生物大分子,包括蛋白质和核酸(的生物大分子,包括蛋白质和核酸(RNA,Ribozyme RNA,Ribozyme)。)。n酶酶是维持生命体内正常的生理活动和新陈代谢的基本条件。是维持生命体内正常的生理活动和新陈代谢的基本条件。n酶催化的生物化学反应酶催化的生物化学反应酶促反应酶促反应。n酶酶能稳定能稳定底物底物的过渡态,降低反应的活化能,加速反应的进的过渡态,降低反应的活化能,加速反应的进行。行。n底物底物:在酶的催化下发生化学反应的物质在酶的催化下发生化学反应的物质4.1.1 4.1.1 酶的概念酶的概念+NAD+NADH+H+CH3CH2-OH
5、CH3CHO醇脱氢酶底物辅酶产物4.1.2 4.1.2 酶的命名及分类酶的命名及分类n(1)(1)习惯命名法习惯命名法:n根据其催化底物来命名根据其催化底物来命名;如;如催化水解淀粉的酶催化水解淀粉的酶淀淀粉酶粉酶;催化水解蛋白质的酶催化水解蛋白质的酶蛋白酶蛋白酶;n根据所催化反应的性质来命名根据所催化反应的性质来命名;谷氨酸谷氨酸丙氨酸:丙氨酸:谷丙转氨酶;谷丙转氨酶;n结合上述两个原则来命名结合上述两个原则来命名,n有时在这些命名基础上有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点加上酶的来源或其它特点。1.1.酶的命名酶的命名(2)(2)国际系统命名法国际系统命名法n系统名称包括底物名称、构
6、型、反应性系统名称包括底物名称、构型、反应性质,最后加一个酶字质,最后加一个酶字。n例如:例如:n习惯名称习惯名称:谷丙转氨酶谷丙转氨酶n系统名称系统名称:丙氨酸:丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶n酶催化的反应酶催化的反应:n谷氨酸谷氨酸 +丙酮酸丙酮酸 -酮戊二酸酮戊二酸 +丙氨酸丙氨酸 (2)(2)国际系统命名法国际系统命名法例如:例如:n习惯名称习惯名称:乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶n系统名称系统名称:乳酸乳酸:NAD+氧化还原酶氧化还原酶 催化的反应催化的反应 乳酸乳酸+NAD+NAD+丙酮酸丙酮酸+NADH+H+NADH+H+n繁琐繁琐 A.A.根据酶蛋白结构特点分类根据酶蛋白
7、结构特点分类单体酶:单体酶:由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子。由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子。一般为水解酶。一般为水解酶。寡聚酶寡聚酶:由两条或多条肽链组成的酶分子。由两条或多条肽链组成的酶分子。为大多数为大多数酶。酶。多酶复合体:多酶复合体:由多种酶彼此镶嵌成的复合体由多种酶彼此镶嵌成的复合体,它们相它们相互配合依次进行互配合依次进行,催化,催化连续的连续的 一系列一系列相关相关反应。反应。如丙如丙酮酸脱氢酶复合体。酮酸脱氢酶复合体。多功能酶:多功能酶:一条多肽链上含有两种或两种以上催化活一条多肽链上含有两种或两种以上催化活性的酶,往往是基因融合的产物。性的酶,往往是基因融合的
8、产物。如如脂肪酸合成酶脂肪酸合成酶。2.2.酶的分类酶的分类B.B.据酶所催化的反应类型据酶所催化的反应类型n水解酶水解酶 催化底物的加水分解反应。催化底物的加水分解反应。n主要包括主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。等。n例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应:催化的脂的水解反应:H2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OHn氧化氧化-还原酶还原酶:催化氧化催化氧化-还原反应。还原反应。n主要包括主要包括脱氢酶脱氢酶(dehydrogenase)(dehydrogenase)和氧化酶和氧化酶(Oxidase(Oxid
9、ase)。n如,乳酸脱氢酶如,乳酸脱氢酶(Lactatase(Lactatase)催化乳酸的脱氢反应。催化乳酸的脱氢反应。CH3CHCOOHOHNAD+H+CH3CCOOHONADHn转移酶转移酶:催化基团转移反应,即将一个底物分子的基催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。例如,团或原子转移到另一个底物的分子上。例如,谷丙转谷丙转氨酶氨酶催化的氨基转移反应。催化的氨基转移反应。CH3CHCOOHNH2HOOCCH2CH2CCOOHOHOOCCH2CH2CHCOOHNH2CH3CCOOHOn裂合酶裂合酶:催化从底物分子中移去一个基团催化从底物分子中移去一个基团或
10、原子形成双键的反应及其逆反应。或原子形成双键的反应及其逆反应。n主要包括主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。等。n例如,例如,延胡索酸水合酶催化延胡索酸水合酶催化的反应。的反应。HOOCCH=CHCOOHH2OHOOCCH2CHCOOHOHn异构酶异构酶:催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。团或原子的重排过程。例如,例如,6-6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。OOHOHOHOHCH2OPO32-OCH2OHOHOHOHCH2OPO32-6-磷酸葡萄糖异构酶6-磷酸葡萄糖6-磷酸
11、果糖n合成酶,又称为连接酶合成酶,又称为连接酶:能够催化:能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形成反应。键的形成反应。这类反应在热力学上都是这类反应在热力学上都是非自发进行的反应,必须与非自发进行的反应,必须与ATPATP分解反应相互偶联。分解反应相互偶联。nA+B+ATP+H-O-H AA+B+ATP+H-O-H A-B+ADP+PiB+ADP+Pi n例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。n核酸酶核酸酶:唯一的非蛋白酶。:唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的它是一类特殊的RNARNA,能够催化能够催化RNARNA分子中的分子中的磷
12、酸酯键的水解磷酸酯键的水解及其逆反及其逆反应。应。33333333335555555555BBBBBPPP+POHPPBBBBPPPPPBP4.1.3 4.1.3 酶催化作用的特性酶催化作用的特性 酶是自然界催化活性最高的一类催化剂。可使酶是自然界催化活性最高的一类催化剂。可使反应速率提高反应速率提高1061012倍,比普通催化剂效能倍,比普通催化剂效能至少高几倍以上至少高几倍以上。例如:过氧化氢分解例如:过氧化氢分解 2H2O2 2H2O +O2 用用Fe()催化,效率为催化,效率为610-4 mol/molS,用过氧化氢酶催化,效率为用过氧化氢酶催化,效率为6 106 mol/molS。用
13、用-淀粉酶催化淀粉水解,淀粉酶催化淀粉水解,1克克结晶酶在结晶酶在65 C条件下可催条件下可催化化2吨吨淀粉水解。淀粉水解。1.高效性高效性(1)反应专一性:)反应专一性:酶一般只能选择性地催化一种或一类相同类酶一般只能选择性地催化一种或一类相同类型的化学反应,且无副产物生成。型的化学反应,且无副产物生成。如蛋白质水解酶只能选择水解蛋白质或肽中特如蛋白质水解酶只能选择水解蛋白质或肽中特定的肽键定的肽键。2.选择性选择性(2)底物专一性)底物专一性n一种酶只能作用于某一种或某一类结构、性质相似的物质。一种酶只能作用于某一种或某一类结构、性质相似的物质。n据酶对底物专一性的程度和类型,可分为:据酶
14、对底物专一性的程度和类型,可分为:结构专一性结构专一性:有些酶对底物的要求非常严格,只作用于一种有些酶对底物的要求非常严格,只作用于一种特定的底物特定的底物绝对专一性绝对专一性;有些酶的作用对象是一类化合物或一类化学键有些酶的作用对象是一类化合物或一类化学键相对专相对专一性。一性。H2NCNH2O+H2O脲酶2NH3+CO2NHCNHCHCPheOR2OTyrTrp胰凝乳蛋白酶(2)底物专一性)底物专一性n手性专一性:手性专一性:酶能专一地与手性底物结合并催酶能专一地与手性底物结合并催化这类底物发生反应。化这类底物发生反应。n如胰蛋白酶只能水解如胰蛋白酶只能水解L-氨基酸形成的肽键;氨基酸形成
15、的肽键;而不而不影响影响D-氨基酸形成的肽键氨基酸形成的肽键n淀粉酶只能选择性地水解淀粉酶只能选择性地水解D-葡萄糖形成的葡萄糖形成的1,4-糖糖苷键,而不影响苷键,而不影响L-葡萄糖形成的葡萄糖形成的1,4-糖苷键。糖苷键。(2)底物专一性)底物专一性n几何专一性:几何专一性:有些酶只能选择性地催化某种几何异有些酶只能选择性地催化某种几何异构底物的反应,而对另一种构型则无催化作用。构底物的反应,而对另一种构型则无催化作用。n如延胡索酸水合酶只能催化延胡索酸水合生成苹果酸,如延胡索酸水合酶只能催化延胡索酸水合生成苹果酸,对马来酸则不起作用:对马来酸则不起作用:COOHHOOC+H2O延胡索酸水
16、合酶COOHCOOH+H2OxCH2CHCOOHCOOHHO3.反应条件温和反应条件温和n酶促反应一般在酶促反应一般在pH=58的水溶液中进行,的水溶液中进行,反应温度在反应温度在2040。n由于反应条件温和,使某些不希望的副反应如由于反应条件温和,使某些不希望的副反应如分解反应、异构化反应和消旋化反应等尽可能分解反应、异构化反应和消旋化反应等尽可能减少。减少。n由于酶本身是蛋白质,高温或其它苛刻的物理由于酶本身是蛋白质,高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活或化学条件,将引起酶的失活。4.2 4.2 酶的非蛋白组分酶的非蛋白组分辅酶(辅酶(coenzymecoenzyme)和金属离子
17、)和金属离子n根据酶的组成情况,可以将酶分为两大类:根据酶的组成情况,可以将酶分为两大类:n单纯蛋白酶单纯蛋白酶:如核酸水解酶,它们的组成为单一蛋白质,其:如核酸水解酶,它们的组成为单一蛋白质,其本身的氨基酸残基即可形成催化活性中心,并能有效的实施本身的氨基酸残基即可形成催化活性中心,并能有效的实施催化功能。催化功能。n结合蛋白酶结合蛋白酶:某些酶,例如氧化:某些酶,例如氧化-还原酶等,其分子中除了蛋还原酶等,其分子中除了蛋白质外,还含有非蛋白组分白质外,还含有非蛋白组分.n结合蛋白酶的蛋白质部分称为酶蛋白,非蛋白质部分包括辅结合蛋白酶的蛋白质部分称为酶蛋白,非蛋白质部分包括辅酶及金属离子酶及
18、金属离子(或辅因子或辅因子cofactorcofactor)。n酶蛋白与辅助成分组成的完整分子称为全酶。酶蛋白与辅助成分组成的完整分子称为全酶。n全酶全酶 =酶蛋白酶蛋白 +辅助成分(辅酶或金属离子)辅助成分(辅酶或金属离子)n单纯的酶蛋白无催化功能,只有全酶具有催化作用单纯的酶蛋白无催化功能,只有全酶具有催化作用.4.2.1 4.2.1 辅酶辅酶n小分子有机化合物,与酶蛋白结合在一起并小分子有机化合物,与酶蛋白结合在一起并协同实施催化作用。协同实施催化作用。n是一类具有特殊化学结构和功能的化合物。是一类具有特殊化学结构和功能的化合物。n是多种酶不可缺少的辅助部分。是多种酶不可缺少的辅助部分。
19、1.1.辅酶的结构特点与功能辅酶的结构特点与功能n大多具有大多具有氧化还原性质或基团转移能力氧化还原性质或基团转移能力n参与的酶促反应主要为参与的酶促反应主要为氧化氧化-还原反应或基团还原反应或基团转移反应。转移反应。n大多数辅酶的前体主要是水溶性大多数辅酶的前体主要是水溶性B B族维生素。族维生素。n维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。(1)(1)维生素维生素PPPP(维生素(维生素B B3 3)n烟酸和烟酰胺烟酸和烟酰胺n能维持神经组织的健康。缺乏时表现出神经营能维持神经组织的健康。缺乏时表现出神经营养障碍,出现皮炎。养障碍,出现皮炎。NCOOHNC
20、ONH2n在体内转变为辅酶在体内转变为辅酶I和辅酶和辅酶II。(1)(1)维生素维生素PPPP和和NADNAD+和和NADPNADP+n NADNAD+(烟酰胺烟酰胺-腺嘌呤二核苷酸,又称为辅腺嘌呤二核苷酸,又称为辅酶酶I)I)和和NADPNADP+(烟酰胺烟酰胺-腺嘌呤磷酸二核苷酸腺嘌呤磷酸二核苷酸,又称为辅酶又称为辅酶II)II)是维生素烟酰胺的衍生物,是维生素烟酰胺的衍生物,OCH2OPOPOCH2OHOHO OO-O-N+CONH2OOHOH(OPO3H2)NNNH2NN功能:在脱氢酶催化的氧化在脱氢酶催化的氧化-还原反应中,起着电子和质子还原反应中,起着电子和质子的传递体作用。的传递
21、体作用。NADNAD+分子的功能部分是烟酰胺环分子的功能部分是烟酰胺环N+HRCONH2N:HRCONH2+4H3CCOHHHH3CC+O:HH:H3CCOH+H+N:RCONH24HH氧化型还原 型N+HRCONH2H3CCOHDHH3CCOH+H3O+N:RCONH24HDNAD+(R)-(-)-1-氘代乙醇+H2O酶+乙醛N+HRCONH2H3CCOHHDH3CCOD+H3O+N:RCONH24HHNAD+(S)-(-)-1-氘代乙醇+H2O酶+1-氘代乙醛手性选择性手性选择性(2)(2)核黄素(核黄素(VBVB2 2)n核黄素核黄素(维生素维生素B B2 2)由核糖醇由核糖醇和和6 6
22、,7-7-二甲基异吡咯嗪两二甲基异吡咯嗪两部分组成。部分组成。n缺乏时组织呼吸减弱,代谢缺乏时组织呼吸减弱,代谢强度降低。主要症状为口腔强度降低。主要症状为口腔发炎,舌炎、角膜炎、皮炎发炎,舌炎、角膜炎、皮炎等。等。(2)(2)核黄素和核黄素和FADFAD、FMNFMNnFAD(FAD(黄素黄素-腺嘌呤二核苷酸腺嘌呤二核苷酸)和和FMN(FMN(黄素单核苷黄素单核苷酸酸)是核黄素是核黄素(维生素维生素B B2 2)的衍生物,的衍生物,CH3CH3NCCNHNNOOCH2CHCHCHCH2OPOOHOHOHOOHOCH2OHOHNNNH2NNFMN FAD功能:在脱氢酶催化的氧化在脱氢酶催化的氧
23、化-还原反应中,起着电子和质子还原反应中,起着电子和质子的传递体作用。的传递体作用。与酶分子共价键相连接,称为辅基COO-COO-+EFADCOO-COO-+EFADH2琥珀酸脱氢酶延胡羧酸脱氢酶氧化型还原型NNNHNH3CH3CROO+2H-2H110NNNHHNH3CH3CROOHHFAD or FMNFADH2 or FMNH2FAD和和FMN 分子的功能部分是异吡咯嗪环分子的功能部分是异吡咯嗪环(3)(3)泛酸(泛酸(VB5VB5)n维生素维生素(B5)-(B5)-泛酸是由泛酸是由,-二羟基二羟基-二甲基丁二甲基丁酸和一分子酸和一分子-丙氨酸缩合而成丙氨酸缩合而成。n辅酶辅酶A A是生
24、物体内代谢反应中乙酰化酶的辅酶,是生物体内代谢反应中乙酰化酶的辅酶,它的前体是泛酸。它的前体是泛酸。CH2CCH3CH3CHOHCONHCH2CH2CNHCH2CH2SHOOOOHPOOHHONNNH2NNOPOOOHPOOOHCH2功能:传递酰基功能:传递酰基(3)(3)泛酸和辅酶泛酸和辅酶A(CoA)A(CoA)乙酸与辅酶乙酸与辅酶A A的的-SH-SH结合形成乙酰辅酶结合形成乙酰辅酶A A,是,是糖代谢的重要中间体。糖代谢的重要中间体。CH3COOH+HS CoA +ATPCH3COS-CoA +ADP+Pi硫激酶(4)(4)叶酸(叶酸(Flolic acid)n叶酸,叶酸,又称为蝶酰谷
25、氨酸,维生素又称为蝶酰谷氨酸,维生素B11B11。n最早从植物叶子中提取而得名最早从植物叶子中提取而得名 n缺乏叶酸可引起巨红细胞性贫血以及白细胞减少症,对缺乏叶酸可引起巨红细胞性贫血以及白细胞减少症,对孕妇尤其重要孕妇尤其重要 NNNNH2NOHCH2NHCOHNCHCOOH(CH2)2CH312345678喋啶对氨基苯甲酸叶酸 F谷氨酸(4)(4)叶酸和四氢叶酸叶酸和四氢叶酸(FH(FH4 4或或THFA)THFA)n四氢叶酸是合成酶的辅酶,其前体是叶酸。四氢叶酸是合成酶的辅酶,其前体是叶酸。NNH2NOHNNHHCH2HHHNHCONHCHCOOHCH2CH2COOHn四氢叶酸的主要作用
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