生物化学考研课件-第9章.ppt
- 【下载声明】
1. 本站全部试题类文档,若标题没写含答案,则无答案;标题注明含答案的文档,主观题也可能无答案。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
2. 本站全部PPT文档均不含视频和音频,PPT中出现的音频或视频标识(或文字)仅表示流程,实际无音频或视频文件。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
3. 本页资料《生物化学考研课件-第9章.ppt》由用户(晟晟文业)主动上传,其收益全归该用户。163文库仅提供信息存储空间,仅对该用户上传内容的表现方式做保护处理,对上传内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(点击联系客服),我们立即给予删除!
4. 请根据预览情况,自愿下载本文。本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
5. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007及以上版本和PDF阅读器,压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物化学 考研 课件
- 资源描述:
-
1、第第1111章章 蛋白质降解和氨基酸的分解代谢蛋白质降解和氨基酸的分解代谢(Protein degradation and amino acids catabolism)一、蛋白质的降解一、蛋白质的降解 蛋白质的营养蛋白质的营养 在消化道内的分解在消化道内的分解 在细胞内的降解在细胞内的降解 二、氨基酸的分解代谢二、氨基酸的分解代谢 脱氨基脱氨基 脱羧基脱羧基三、尿素的形成三、尿素的形成四、氨基酸碳骨架的氧化途径四、氨基酸碳骨架的氧化途径五、生糖氨基酸和生酮氨基酸五、生糖氨基酸和生酮氨基酸六、由氨基酸衍生的其他重要物质及其代谢六、由氨基酸衍生的其他重要物质及其代谢七、氨基酸代谢缺陷症七、氨基酸
2、代谢缺陷症1.维持细胞、组织的生长、更新和修补(主要功能)。2.参与多种重要的生理活动 催化、物质转运、代谢调节等。3.氧化供能(次要功能)。人体每日18%能量由蛋白质提供。蛋白质的营养作用蛋白质的营养作用Nutritional Function of Protein 一、蛋白质的降解一、蛋白质的降解 氮平衡氮平衡(nitrogen balance)蛋白质的含氮量平均为16%,可通过测定含氮量估算出蛋白质的量。氮平衡氮平衡:摄入食物的含氮量(摄入氮)与排泄物(尿与粪)中含氮量(排出氮)之间的关系。氮平衡的三种情况:氮平衡的三种情况:氮总平衡:摄入氮=排出氮(正常成人)氮正平衡:摄入氮 排出氮(
3、儿童、孕妇等)氮负平衡:摄入氮 植物蛋白质植物蛋白质。必需氨基酸必需氨基酸 (essential amino acid)必需氨基酸:指体内需要而又不能自身合必需氨基酸:指体内需要而又不能自身合成,必须由食物供给的氨基酸,共有成,必须由食物供给的氨基酸,共有8 8种:种:ValVal、IleIle、LeuLeu、ThrThr、MetMet、LysLys、PhePhe、TrpTrp。其余12种氨基酸体内可以合成,称非必需非必需氨基酸。氨基酸。目前有人将HisHis和和ArgArg称为营养半必需氨基称为营养半必需氨基酸酸,因为其在体内合成量较小。记忆方法:记忆方法:异亮氨酸异亮氨酸蛋氨酸蛋氨酸缬氨酸
4、缬氨酸赖氨酸赖氨酸亮氨酸亮氨酸色氨酸色氨酸苯丙氨酸苯丙氨酸苏氨酸苏氨酸借借 一一 两两 本本 淡淡 色色 书书 来来蛋白质的互补作用蛋白质的互补作用 指营养价值较低的蛋白质混合食用,其必需氨基酸可以互相补充而提高营养价值。其本质即为食物蛋白质之间在AA组成上的取长补短,互相补充。如谷类含Lys少,Trp多,而豆类含Lys多,Trp少,两者混合食用可提高营养价值。小麦小麦 6767大米大米 5757牛肉牛肉 6969大豆大豆 6464混合食用混合食用 8989蛋白质的消化、吸收和腐败蛋白质的消化、吸收和腐败Digestion,Absorption and Putrefaction of Prot
5、eins蛋白质消化的生理意义蛋白质消化的生理意义 由大分子转变为小分子,便于吸收。消除种属特异性和抗原性,防止过敏、毒性反应。机体对外源蛋白质的消化吸收机体对外源蛋白质的消化吸收 高等动物摄入的蛋白质在消化道内被胃蛋白酶、胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶、羧肽酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶氨肽酶等降解,全部转变成氨基酸,被小肠吸收。消化过程消化过程 自胃中开始,在小肠中完成。自胃中开始,在小肠中完成。(一)胃中的消化作用(一)胃中的消化作用胃蛋白酶的最适pH为1.52.5,对蛋白质肽键作用特异性差,产物主要为多肽及少量氨基酸。胃蛋白酶原胃蛋白酶原胃蛋白酶胃蛋
6、白酶+多肽碎片多肽碎片胃酸、胃蛋白酶胃酸、胃蛋白酶(pepsinogen)(pepsin)胃蛋白酶对乳中的酪蛋白有凝乳作用酪蛋白有凝乳作用,使之在 胃停留时间长,利于充分消化,对婴儿较重要。(二)小肠中的消化(二)小肠中的消化小肠是蛋白质消化的主要部位。小肠是蛋白质消化的主要部位。1.1.胰酶及其作用胰酶及其作用胰酶是消化蛋白质的主要酶,最适pH为7.0左右,包括内肽酶和外肽酶。内肽酶内肽酶(endopeptidase)(endopeptidase)水解蛋白质肽链内部的一些肽键,如胰蛋白酶、糜蛋白酶、弹性蛋白酶。外肽酶外肽酶(exopeptidase)(exopeptidase)自肽链的末段开
7、始每次水解一个氨基酸残基,如羧基肽酶(A、B)、氨基肽酶。肠液中酶原的激活肠液中酶原的激活胰蛋白酶原胰蛋白酶原 糜蛋白酶原糜蛋白酶原 羧基肽酶原羧基肽酶原 弹性蛋白酶原弹性蛋白酶原 肠激酶肠激酶(enterokinase)胰蛋白酶胰蛋白酶 糜蛋白酶糜蛋白酶 羧基肽酶羧基肽酶 弹性蛋白酶弹性蛋白酶 (trypsin)(exopeptidase)(carboxypeptidase)(elastase)可保护胰组织免受蛋白酶的自身消化作用。保证酶在其特定的部位和环境发挥催化作用。酶原还可视为酶的贮存形式。酶原激活的意义酶原激活的意义氨基肽酶氨基肽酶内肽酶内肽酶羧基肽酶羧基肽酶氨基酸氨基酸 +氨基酸氨
8、基酸二肽酶二肽酶蛋白水解酶作用示意图蛋白水解酶作用示意图2.2.小肠粘膜细胞对蛋白质的消化作用小肠粘膜细胞对蛋白质的消化作用主要是寡肽酶主要是寡肽酶(oligopeptidase)的作用,例如氨基肽酶的作用,例如氨基肽酶(aminopeptidase)及二肽酶及二肽酶(dipeptidase)等。等。蛋白水解酶作用的专一性蛋白水解酶作用的专一性蛋白酶专一性胃蛋白酶Ala、Leu、Phe、Trp、Met、Tyr的羧基形成的肽键胰蛋白酶Lys、Arg的羧基形成的肽键糜蛋白酶Phe、Tyr、Trp的羧基形成的肽键弹性蛋白酶脂肪族氨基酸的羧基形成的肽键氨基肽酶除了Pro外任何氨基酸的氨基形成的肽键羧基
9、肽酶A除了Lys、Arg、Pro外任何氨基酸的氨基形成的肽键羧基肽酶BLys、Arg的氨基形成的肽键二、氨基酸的吸收二、氨基酸的吸收吸收部位:主要在小肠吸收形式:氨基酸、二肽、三肽吸收机制:耗能的主动吸收过程三、三、蛋白质的腐败作用蛋白质的腐败作用肠道细菌对未被消化及未吸收的蛋白质或其消化产物所起的作用。腐败作用的产物大多有害,如胺、氨、苯如胺、氨、苯酚、吲哚酚、吲哚等;也可产生少量的脂肪酸及维生素等可被机体利用的物质。蛋白质的腐败作用蛋白质的腐败作用(putrefaction)胺类胺类(amines)的生成的生成蛋白质蛋白质 氨基酸氨基酸胺类胺类蛋白酶蛋白酶 脱羧基作用脱羧基作用 组氨酸组氨
10、酸组胺组胺 色氨酸色氨酸 色胺色胺 酪氨酸酪氨酸酪胺酪胺 赖氨酸赖氨酸尸胺尸胺苯丙氨酸苯丙氨酸苯乙胺苯乙胺其它有害物质的生成其它有害物质的生成酪氨酸酪氨酸 苯酚苯酚半胱氨酸半胱氨酸 硫化氢硫化氢 色氨酸色氨酸 吲哚吲哚-羟酪胺和苯乙醇胺结构类似儿茶酚胺,它们可取代儿茶酚胺与脑细胞结合,但不能传递神经冲动,使大脑发生异常抑制。因而将其称为假假神经递质神经递质(false neurotransmitter)。苯乙胺苯乙胺苯乙醇胺苯乙醇胺CH2CH2NH2CH2CH2NH2CH2NH2COHHCH2NH2COHH酪胺酪胺-羟酪胺羟酪胺CH2CH2NH2OHCH2CH2NH2OHCH2NH2COHHO
11、HCH2NH2COHHOH细胞内蛋白质的降解细胞内蛋白质的降解 细胞内的蛋白质是处于不断地周转的。一些异常的蛋白质、不需要的蛋白质异常的蛋白质、不需要的蛋白质需要清除。对一种特定的蛋白质来说,它在细胞中的含量取决于合成和降解的速率。通过对一些代谢途径的关键酶的合成和降解,控制酶的含量,也是控制代谢途径运行的一个重要措施。细胞内蛋白质降解的机构细胞内蛋白质降解的机构 蛋白质降解是限制在细胞内的特定区域的,一种是称为蛋白酶体蛋白酶体的大分子结构,另一种是具有单层膜的溶酶体(细胞器)。溶酶体中含有约50种水解酶,它与吞噬泡吞噬泡及细胞内产生的一些自噬泡自噬泡融合,然后将摄取的各种蛋白质全部降解,对被
12、降解的蛋白质没有选择性。被降解的蛋白质在进入蛋白酶体蛋白酶体降解之前,需要被泛肽泛肽标记。真核生物中蛋白质的两条降解途径的比较真核生物中蛋白质的两条降解途径的比较不依赖ATP利用组织蛋白酶(cathepsin)降解外源性蛋白、膜蛋白和长寿命的细胞内蛋白 依赖泛素依赖泛素(ubiquitin)的降解过程的降解过程 溶酶体内降解过程溶酶体内降解过程依赖ATP降解异常蛋白和短寿命蛋白泛肽泛肽 泛肽泛肽(ubiquitin)又名遍在蛋白质、泛素又名遍在蛋白质、泛素,它是一个由76个氨基酸残基组成的小蛋白质。它通过其C端Gly的羧基与被降解的蛋白质的氨基蛋白质的氨基共价结合,通常结合在LysLys的的氨
13、基氨基上,这是一个需要消耗ATP的反应。这样给被降解的蛋白质作了一个标记,随后将靶蛋白质引入蛋白酶体中降解。可有多个泛肽连接到靶蛋白上,形成多泛肽链,后面的每一个泛肽的C端羧基连接到前一个泛肽的Lys48Lys48的的氨基氨基上。The Nobel Prize in Chemistry 2004for the discovery of ubiquitin-mediated protein degradationAaron Ciechanover Avram HershkoIrwin Rose Proteins build up all living things:plants,animals
14、and therefore us humans.In the past few decades biochemistry has come a long way towards explaining how the cell produces all its various proteins.Aaron Ciechanover,Avram Hershko and Irwin Rose went against the stream and at the beginning of the 1980s discovered one of the cells most important cycli
15、cal processes,regulated protein degradation.For this,they are being rewarded with this years Nobel Prize in Chemistry.死亡之吻死亡之吻要被降解的蛋白质都会受到标记要被降解的蛋白质都会受到标记-泛素分子泛素分子.蛋蛋白质被标记后迅速在细胞的垃圾站白质被标记后迅速在细胞的垃圾站-蛋白酶体中蛋白酶体中降解降解.泛素泛素76个氨基酸的小分子蛋白(8.5kD)普遍存在于真核生物而得名一级结构高度保守1.1.泛素化泛素化 (ubiquitination)泛素与选择性被降解蛋白质形成共价连接
16、,并使其激活。2.2.蛋白酶体蛋白酶体(proteasome)对泛素化蛋白质的降解对泛素化蛋白质的降解泛素介导的蛋白质降解过程泛素介导的蛋白质降解过程泛素泛素泛素在泛素在进化进化中保留了中保留了76个氨基酸的蛋个氨基酸的蛋白质白质 包含几个赖氨酸包含几个赖氨酸(K6,K29,K48,K63)允许多泛素化允许多泛素化通过其羧基末端通过其羧基末端与与靶蛋白的赖氨酸靶蛋白的赖氨酸相相结合结合 泛素化响应于各种刺激泛素化响应于各种刺激MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG Ubiquiti
17、n Isopeptide Bond(异肽键异肽键)TargetproteinTargetlysinee-aminogroupUbcarboxyterminusMonoubiquitylationMultiple monoubiquitylationK48 polyubiquitylationprotein targeting to proteasomesUbiquitination ModesOther polyubiquitylation(e.g.K63)regulation of protein activity orlocalization E E1 1:泛肽活化酶泛肽活化酶E E2 2
18、:泛肽载体蛋白泛肽载体蛋白E E3 3:泛肽蛋白质连接酶泛肽蛋白质连接酶泛肽泛肽泛素共轭作用泛素共轭作用:一个三步机理一个三步机理泛肽(Ub)活化酶 E1在泛素C-末端的Gly和E1活性部位的Cys之间形成高能硫酯(ATP/AMP)泛肽载体蛋白 E2UB转移到一个E2的Cys 形成一个新的硫醇酯泛肽蛋白质连接酶 E3UB在UB的C-末端Gly 和-靶蛋白的赖氨酸氨之间形成异肽键泛素化需要多个蛋白泛素化需要多个蛋白Ub added tolysinesE E1 1:泛肽活化酶泛肽活化酶E E2 2:泛肽载体蛋白泛肽载体蛋白E E3 3:泛肽蛋白质连接酶泛肽蛋白质连接酶E1,E2,&E3每一步过程调
19、控的特异性增强:E1:只有一个(?)E2:10-12(相应的调控蛋白家族)E3:许多与结构无关(终极生物特异性)泛肽蛋白质连接酶泛肽蛋白质连接酶 E3在识别和选择被降解蛋白质的过程中起着重要的作用。E3是通过备选蛋白质N端氨基酸的性质来选择靶蛋白质的,以Met、Ser、Ala、Thr、Val、Gly或Cys为N末端的蛋白质对泛肽介导的降解途径有抗性,而以Arg、Lys、His、Phe、Tyr、Trp、Leu、Asn、Gln、Asp或Glu为N末端的蛋白质的半寿期只有230分钟。E3有3个不同蛋白底物结合位点:类型类型结合结合N N末端为碱性氨基酸的蛋白质末端为碱性氨基酸的蛋白质,如Arg、Ly
20、s或His;类型类型结合具有大疏水基团结合具有大疏水基团N N末端氨基酸的蛋白末端氨基酸的蛋白质质,如Phe、Tyr、Trp或Leu;类型类型结合其他结合其他N N末末端氨基酸的蛋白质。端氨基酸的蛋白质。以酸性氨基酸为N末端的蛋白质的降解需要tRNA参与,将Arg-tRNA的Arg转移到酸性蛋白质的N末端,使之转变成碱性N末端,然后与泛肽连接。被泛肽介导降解蛋白质的特点被泛肽介导降解蛋白质的特点 大多数具有敏感敏感N N末端氨基酸残基末端氨基酸残基的蛋白质不是正常的细胞内蛋白质,而很可能是分泌性蛋白质,这些蛋白质通过信号肽酶的作用暴露出敏感的N末端氨基酸残基。也许N末端识别系统的功能就是识别和
21、清除任何入侵的异质蛋白质或分泌性蛋白质。蛋白酶体蛋白酶体 蛋白酶体是一个大的寡聚体结构,有一个中空的腔。古细菌Thermoplasma acidophilum的蛋白酶体为20S、700kD的桶状结构,由两种不同的亚基和组成,它们缔合成7777四个堆积的环。这个桶有15nm高,直径11nm,中间有一个可分为3个区域的空腔,蛋白质降解就发生在这个腔中。两端的7环解折叠被降解的蛋白质,并将其送入中央的腔内,而亚基具有蛋白裂解活性。蛋白酶体降解蛋白质的产物为79个氨基酸残基的寡肽。古细菌古细菌T.acidophilumT.acidophilum 20S 20S蛋白酶体的结构蛋白酶体的结构 顶面观顶面观
22、 侧面观侧面观 纵剖面观纵剖面观真核细胞中的蛋白酶体真核细胞中的蛋白酶体 真核细胞含有两种蛋白酶体:20S和26S蛋白酶体。26S蛋白酶体(1700kD)是一个45nm长的结构,是在20S蛋白酶体的两端各加上1个19S的帽结构或称PA700(Proteasome activator-700kD),这种帽结构至少由15个不同的亚基组成,其中许多有ATP酶活性。与古细菌20S蛋白酶体不同,真核细胞的蛋白酶体含有7 个不同的亚基及7 个不同的亚基。蛋白酶体蛋白酶体 由两个多亚基部分组成 20S 蛋白酶体 密封桶型 含有蛋白酶活性 将蛋白质降解到 7-9 个氨基酸组成的肽 19S caps 具有调节亚
23、基 连接到 20S的两个末端形成 26S 复合物 识别K48 泛素 转移泛素,因此泛素可以被循环使用 连接ATP酶以便将底物折叠装入20S区域ATP consuming process氨基酸代谢库氨基酸代谢库(metabolic pool)食物蛋白经消化吸收的氨基酸(外源性氨基酸)与体内组织蛋白降解产生的氨基酸(内源性氨基酸)混在一起,分布于体内各处参与代谢,称为氨基酸代谢库。二、氨基酸的分解代谢二、氨基酸的分解代谢氨基酸氨基酸代谢库代谢库食物蛋白质食物蛋白质消化吸收消化吸收 组织组织蛋白质蛋白质分解分解 体内合成氨基酸体内合成氨基酸 (非必需氨基酸非必需氨基酸)氨基酸代谢概况氨基酸代谢概况-
24、酮酸酮酸 脱氨基作用脱氨基作用 酮酮 体体氧化供能氧化供能糖糖胺胺 类类脱羧基作用脱羧基作用氨氨 尿素尿素代谢转变代谢转变其它含氮化合物其它含氮化合物(嘌呤、嘧啶等嘌呤、嘧啶等)合成合成 氨基酸分解代谢氨基酸分解代谢 氨基酸是合成蛋白质和肽类物质的基本成分,可以氧化释放出能量,还可以转变成各种其他含氮物质。氨基酸的分解一般有三步:氨基酸的分解一般有三步:1.1.脱氨基;脱氨基;2.2.脱下的氨基排出体外,或转变成尿素或尿酸排出脱下的氨基排出体外,或转变成尿素或尿酸排出体外;体外;3.3.氨基酸脱氨后的碳骨架进入糖代谢途径彻底氧化。氨基酸脱氨后的碳骨架进入糖代谢途径彻底氧化。碳骨架也可以进入其他
25、代谢途径用于合成其他物质。碳骨架也可以进入其他代谢途径用于合成其他物质。氨基酸代谢概况氨基酸代谢概况生物固氮生物固氮硝酸还原硝酸还原一一 氨基酸的脱氨基作用氨基酸的脱氨基作用定义:定义:指氨基酸脱去氨基生成相应指氨基酸脱去氨基生成相应-酮酸的过程。酮酸的过程。脱氨基脱氨基方式方式:转氨基作用氧化脱氨基联合脱氨基非氧化脱氨基转氨基和氧化脱氨基偶联转氨基和氧化脱氨基偶联转氨基和嘌呤核苷酸循环偶联转氨基和嘌呤核苷酸循环偶联(一)转氨基作用(一)转氨基作用(transamination)1.定义:在转氨酶(transaminase)的作用下,某一氨基酸去掉-氨基生成相应的-酮酸,而另一种-酮酸得到此氨
展开阅读全文