[医疗保健]免疫炎症相关基因多态性与课件.ppt
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- 关 键 词:
- 医疗保健 免疫 炎症 相关 基因 多态性 课件
- 资源描述:
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1、 免疫炎症相关基因多态性与免疫炎症相关基因多态性与非小细胞肺癌预后的关联研究非小细胞肺癌预后的关联研究 南京医科大学公共卫生学院南京医科大学公共卫生学院免疫炎症与肿瘤发生发展的机制免疫炎症与肿瘤发生发展的机制Schetter et al.Carcinogenesis.2010;31:37-49IL4IL4 C-5 C-589T89T和和C-33TC-33T基因多态性基因多态性共同影响肾细胞癌预后共同影响肾细胞癌预后Kleinrath et al.J Clin Oncol.2007;25:845-51.变量变量HR95%CIP年龄年龄1.01.0-1.00.953性别性别1.30.7-2.30.
2、386分级分级I-II1.0III2.01.0-3.70.05IV5.42.4-11.90.001IL4基因型基因型3.11.4-6.9 6028349.815625.0性别男43476.424124.70.805女13423.67027.8病理类型腺癌35362.219226.20.519鳞癌18432.49924.0其它315.52017.9肿瘤分期I14425.44660.40.001II7112.52947.6III22138.913319.6IV13223.210313.4手术否20035.215515.30.001是36864.815636.8化疗或放疗 无10618.74733.
3、00.102有46281.326423.5研究对象一般情况研究对象一般情况基因多态性选择和检测基因多态性选择和检测n 候选基因策略选择潜在功能性候选基因策略选择潜在功能性SNPsp宿主免疫炎症通路:宿主免疫炎症通路:52个基因个基因p5侧翼区,侧翼区,5UTR,3UTR,外显子区氨基,外显子区氨基酸改变的酸改变的SNP:187个位点个位点n Illumina Golden Gate芯片进行基因分型芯片进行基因分型p设计失败:设计失败:15个位点个位点p分型成功率低分型成功率低(90%)或明显不符合或明显不符合HWE:18个位点个位点GeneSNPsLocationAllelesLog-rank
4、 PAdditive modelDominant modelRecessive modelCOX2rs204175 flanking regionC:G0.0710.9990.022IFNA1rs13321905 flanking regionA:G0.0200.0060.774IFNAR2rs4986956Phe8SerG:A0.0100.0020.273IFNGR2rs9808753Gln64ArgA:G0.0760.2400.027IL1Ars18005875-UTRG:A0.0380.0810.138IL1Ars18007945 flanking regionG:A0.0300.064
5、0.138IL1Ars17561Ala114SerC:A0.0290.0880.104IL1Ars13040373-UTRA:G0.0350.1080.104IL5Rrs117134195 UTRA:G0.0120.4980.005IL-8rs40735 flanking regionA:T0.1060.4020.035IL8RBrs11265793-UTRA:G0.0670.0200.513IL10RArs96103-UTRA:G0.0720.0420.111.TLR10rs11096957His241AsnC:A0.0730.0270.212单因素分析单因素分析NSCLCNSCLC预后相关
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