医学文献检索与利用2机检基础课件.pptx

1、复旦大学图书馆文献检索教研室计计 算算 机机 信信 息息 检检 索索 基基 础础.一 基本概念二 数据库建立 三 检索原理四 检索步骤2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室2.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室3信息检索是信息用户的需求信息和信息集合信息的比较与信息检索是信息用户的需求信息和信息集合信息的比较与选择，即字形匹配选择，即字形匹配(match)(match)的过程。的过程。用户根据信息检索需求，对一定的信息集合采用一定的技用户根据信息检索需求，对一定的信息集合采用一定的技术手段，根据一定的线索与准则找出相关

2、的信息。术手段，根据一定的线索与准则找出相关的信息。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室41.1.信息收集信息收集 收集、筛选原始信息。收集、筛选原始信息。2.2.信息标引信息标引 提取、标注原始信息的特征，并进行规范化记录。提取、标注原始信息的特征，并进行规范化记录。3.3.信息存储信息存储 把把每个特征录入到对应的字段（每个特征录入到对应的字段（fieldfield）中。）中。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室5特征特征1特征特征2特征特征3特征特征4特征特征5特征特征n提取特征提取特征.2023-1-13复

3、旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室6标注特征标注特征规范化处理规范化处理中国中国图书馆图书馆分类法分类法医学医学主题词表主题词表（MeSH）规范格式规范格式字段名字段名.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室7*数据库中，描述一篇文献的所有字段组成一条记录（数据库中，描述一篇文献的所有字段组成一条记录（recordrecord）。）。*一段时间或某内容范围内的记录集合构成数据库文档（一段时间或某内容范围内的记录集合构成数据库文档（filefile）。）。*数据库的结构：数据库的结构：*文档（文档（FileFile）*记录（记录（Recor

4、dRecord）*字段（字段（FieldField）.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室8记录、字段记录、字段示例示例.用户输入检索语句分析转换处理需求数据库数据库分类法分类法概念词典概念词典控制词表控制词表原始信息筛选 特征提取与标注分类、索引等字形字形匹配匹配检索结果检索结果2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室9录入.四、信息检索步骤四、信息检索步骤1.分析课题，明确要求2.选择检索工具3.确定检索途径及标识4.确定检索运算符5.构筑检索语句，获取检索结果2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书

5、馆文献检索教研室10.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室111.1 1.1 内容内容特征特征分析分析l课题包含的主要概念，各概念的子概念，及其相互关系l概念对应的检索词，含同义词、缩写等形式及其对应英文.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室121.2 1.2 形式形式特征特征分析分析l检索年限检索年限 文献语种文献语种 文献类型文献类型l数据库一般提供菜单式界面供用户设定检索限制条件，不必数据库一般提供菜单式界面供用户设定检索限制条件，不必用检索式表达。用检索式表达。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复

6、旦大学图书馆文献检索教研室131.3 1.3 查准与查全分析查准与查全分析l了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断的信息，以解决研究中的具体问题，以“准准”为主；l申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时，需要全面地收集某主题范围的文献以鉴定新颖性，具有普查追溯的特点着眼于“全全”。l一般文献检索、研究中期要求查准和查全找到平衡点平衡点，则使用规范主题词表选词检索较好。l课题相关文献少则注重查“全全”，相关文献多则注重查“准准”。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室14l核心检索系统核心检索系统数据库多，文献量大，能系统、全面地获取课题相关

7、文献，有助于数据库多，文献量大，能系统、全面地获取课题相关文献，有助于发现交叉学科的文献。发现交叉学科的文献。l专业数据库专业数据库专指性强，专业文献收录全，能获取高相关度的论文。专指性强，专业文献收录全，能获取高相关度的论文。l全文数据库全文数据库能能直接下载全文，补充直接下载全文，补充核心检索系统核心检索系统和和专业数据库的不足专业数据库的不足l事实、数值数据库、网络检索引擎事实、数值数据库、网络检索引擎能能检索具体数值检索具体数值、事实信息，专业、事实信息，专业机构网站可了解课题背景信息和机构网站可了解课题背景信息和动态动态。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆

8、文献检索教研室15l核心检索系统核心检索系统定义：提供检索界面供用户输入检索指令，经检索后返回命中定义：提供检索界面供用户输入检索指令，经检索后返回命中结果的检索平台或软件。结果的检索平台或软件。一个检索系统可检索一个或多个数据库，同一个数据库也一个检索系统可检索一个或多个数据库，同一个数据库也可被收录在不同检索系统中。可被收录在不同检索系统中。例：例：MEDLINEMEDLINE数据库被数据库被5 5个检索系统收录个检索系统收录 Web of ScienceWeb of Science检索系统可以检索十多个数据库检索系统可以检索十多个数据库.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦

9、大学图书馆文献检索教研室16.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室17.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室18NCBINCBI包含的数据库包含的数据库.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室19中国知网包含的数据库中国知网包含的数据库.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室20l常用数据库常用数据库1.PubMed1.PubMed（文摘）（文摘）2.Web of science 2.Web of science 核心合集（文摘）核心合集（文摘）3

10、.OVID-EBM3.OVID-EBM循证医学数据库（文摘）循证医学数据库（文摘）4.Elsevier,EBSCO4.Elsevier,EBSCO期刊全文数据库期刊全文数据库5.PQDT 5.PQDT 学位论文数据库（部分全文）学位论文数据库（部分全文）6.6.中国学术期刊（全文）中国学术期刊（全文）7.7.中文科技期刊数据库（全文）中文科技期刊数据库（全文）8.8.中国生物医学文献数据库（文摘）中国生物医学文献数据库（文摘）9.9.超星数字图书馆（全文）超星数字图书馆（全文）10.10.独秀知识库（全文）独秀知识库（全文）.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索

11、教研室21Web of Science、中国知网、中国知网系统检索文献系统检索文献核心检索系统：核心检索系统：Elsevier等全文数据库等全文数据库深入挖掘详细内容深入挖掘详细内容全文数据库：全文数据库：百度百度、Google、数据库词表数据库词表熟悉专业术语及背景熟悉专业术语及背景网络检索引擎：网络检索引擎：卫生统计年鉴，搜数卫生统计年鉴，搜数专业事实、数值检索专业事实、数值检索参考工具数据库：参考工具数据库：.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室22检索途径检索途径检索标识（检索词）检索标识（检索词）3.1 3.1 分类检索分类检索分类名、分类号分类

12、名、分类号3.2 3.2 主题检索主题检索关键词、自由词、规范词关键词、自由词、规范词3.3 3.3 著者检索著者检索著者姓名著者姓名3.4 3.4 刊名检索刊名检索刊名缩写与全称刊名缩写与全称3.5 3.5 机构检索机构检索机构名称缩写与全称机构名称缩写与全称3.6 3.6 引文检索引文检索被引用文献的检索标识被引用文献的检索标识.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室23规范化工具：中图法规范化工具：中图法中国图书馆中国图书馆分类法分类法 Q Q 生物学生物学 R R 医药卫生医药卫生 R1 R1 预防医学与卫生学预防医学与卫生学 R6 R6 外科学外科

13、学 R65 R65 外科学各论外科学各论 R651R651头部及神经外科学头部及神经外科学 R651.15R651.15颅脑损伤颅脑损伤 分分类类号号分类名分类名.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室24子类子类.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室25n关键词检索关键词检索 课题：肾衰竭饮食治疗的相关文献课题：肾衰竭饮食治疗的相关文献 检索标识：关键词（著者文章提供）检索标识：关键词（著者文章提供）常用限制字段：关键词（常用限制字段：关键词（keywordkeyword）概念概念1 1：肾衰竭（：肾衰竭（renal

14、failurerenal failure）关键词：肾衰竭、肾衰、肾功能衰竭关键词：肾衰竭、肾衰、肾功能衰竭/不全等不全等 概念概念2 2：饮食治疗（：饮食治疗（diet therapydiet therapy）关键词：饮食、膳食、营养等关键词：饮食、膳食、营养等.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室26直接选择直接选择检索字段检索字段输入检索词输入检索词肾衰竭肾衰竭肾衰竭肾衰竭输入检索词输入检索词肾功能衰竭肾功能衰竭肾功能衰竭肾功能衰竭.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室27n 主题词检索主题词检索n主题词：由检索系

15、统的规范化主题词：由检索系统的规范化主题词表控制的统一检索用主题词表控制的统一检索用词词n医学主题词表（医学主题词表（Medical Subject Medical Subject HeadingsHeadings，MeSHMeSH）由由NLMNLM编制和修订，编制和修订，Medline Medline 和和 CBMCBM数据库采用数据库采用该词表对该词表对文献的主题进行规范化处理和标注。文献的主题进行规范化处理和标注。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室28文章文章A A 著者用词：著者用词：肾衰竭肾衰竭renal failure renal fail

16、ure 文章文章B B著者用词：著者用词：肾功能衰竭肾功能衰竭kidney failurekidney failure 由于作者的用词习惯不同，文献在录入数据库时将进行规范由于作者的用词习惯不同，文献在录入数据库时将进行规范化处理，用统一的词来标注相同主题的文献。化处理，用统一的词来标注相同主题的文献。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室29.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室30 文章文章B著者用词著者用词肾功能衰竭肾功能衰竭kidney failure主题词：主题词：肾功能衰竭肾功能衰竭MeSH:Renal I

17、nsufficiency 文章文章A A，B B均被标注上规范化的主题词均被标注上规范化的主题词 文章文章A著者用词著者用词肾衰竭肾衰竭renal failure主题词：主题词：肾功能衰竭肾功能衰竭MeSH:Renal Insufficiency.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室31.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室32n 自由词检索自由词检索n自由词：自由词：著者写文章时所用的自然词语著者写文章时所用的自然词语,可以出现在关键词可以出现在关键词、标题、文摘、标题、文摘、全文中。全文中。n最新文献尚未建立规范词

18、时使用自由词检索最新文献尚未建立规范词时使用自由词检索 。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室33*检索标识：著者姓名检索标识：著者姓名*英文数据库经常对著者姓名的格式进行规范化处理。英文数据库经常对著者姓名的格式进行规范化处理。*著者姓名的转换：姓全称在前，名首字母在后著者姓名的转换：姓全称在前，名首字母在后 *Jason SmithJason Smith Henry M.Williams Henry M.Williams 闻玉梅闻玉梅 Smith JWilliams HMWen ym.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检

19、索教研室34*检索标识：刊名缩写或全称检索标识：刊名缩写或全称*常用限制字段：常用限制字段：SOSO，Publication Name,journal,Publication Name,journal,刊名，出处等刊名，出处等*刊名全称检索刊名全称检索 New England Journal of MedicineNew England Journal of Medicine*有的英文数据库对刊名的书写格式进行了规范化处理，也可以有的英文数据库对刊名的书写格式进行了规范化处理，也可以用数据库制定的标准刊名缩写检索用数据库制定的标准刊名缩写检索 如：如：N Engl J Med N Engl J

20、 Med（PubMedPubMed）.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室35*检索标识：机构名缩写或全称检索标识：机构名缩写或全称*有的英文数据库用全称检索：有的英文数据库用全称检索：Fudan UniversityFudan University*有的英文数据库对机构的书写格式进行了规范化处理，只能用有的英文数据库对机构的书写格式进行了规范化处理，只能用数据库制定的标准机构名缩写检索：数据库制定的标准机构名缩写检索：Fudan UnivFudan Univ（Web of ScienceWeb of Science）.2023-1-13复旦大学图书馆文献

21、检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室36n引文回溯引文回溯是在文献原文后的参考文献（被引用文献）中筛选与课题是在文献原文后的参考文献（被引用文献）中筛选与课题相关文献的方法。相关文献的方法。n 例：例：课题：课题：干扰素治疗干扰素治疗肾综合征出血热疗效研究肾综合征出血热疗效研究.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室37冯智霖，徐邦强冯智霖，徐邦强.干扰素干扰素-1b治疗肾综合症出血热的临床疗效治疗肾综合症出血热的临床疗效.中国临床药学杂中国临床药学杂志志.2003，12(1)：9-10.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索

22、教研室38n引文检索：通过被引用文献的特征，来检索引用文献。引文检索：通过被引用文献的特征，来检索引用文献。n被引文献特征包括：被引文献特征包括：*某一著者的文献被什么人、什么文章引用？被引用的次数？某一著者的文献被什么人、什么文章引用？被引用的次数？*某期刊被文献引用的次数？某期刊被文献引用的次数？*某主题的文献被引用的次数等。某主题的文献被引用的次数等。n常见限制字段：引文常见限制字段：引文,参考文献参考文献,cited author,cited author等等.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室39.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室

23、复旦大学图书馆文献检索教研室40*专利专利号（号（patent numberpatent number）检索）检索*国际标准连续出版物编号（国际标准连续出版物编号（ISSNISSN）检索）检索*化学物质登记号（化学物质登记号（CAS registry numberCAS registry number）检索）检索*分子式（分子式（formulaformula）检索）检索*记录顺序号（记录顺序号（accession numberaccession number）检索）检索*化合物结构图检索（化合物结构图检索（structure searchstructure search）检索）检索*.2023

24、-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室41检索运算符：用于连接不同的检索词、进行比较运算或对字段检索运算符：用于连接不同的检索词、进行比较运算或对字段进行统计运算的符号进行统计运算的符号n逻辑逻辑算符（布尔算符）算符（布尔算符）n精确精确匹配符（短语匹配匹配符（短语匹配）n位置位置算符（邻近算符算符（邻近算符）n截截词符与通配符词符与通配符.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室42逻辑逻辑“与与”：表示两个检索词必须同时出现，表示：表示两个检索词必须同时出现，表示“相交相交”关系。关系。有有“and”and”，“*”，“并且并且

25、”，“与与”，“并含并含”等表达形式。等表达形式。A B A and B 肾衰竭肾衰竭 and 血透血透.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室43.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室44逻辑逻辑“或或”：表示两个检索词至少出现其中一个，表示表示两个检索词至少出现其中一个，表示“并列并列”关关系。系。有有“or”or”，“+”+”，“或者或者”，“或或”等表达形式。等表达形式。B A or BA肾衰肾衰 or 肾衰竭肾衰竭 or 肾功能衰竭肾功能衰竭.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索

26、教研室45.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室46.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室47逻辑逻辑“非非”：表示含有前一检索词同时不含有后一检索词，表示：表示含有前一检索词同时不含有后一检索词，表示“不包含不包含”关系。有关系。有“not”not”，“-”-”，“不包含不包含”，“排除排除”等表达形式。等表达形式。A B肾衰竭肾衰竭 not 慢性慢性A not B.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室48肾衰竭肾衰竭-慢性慢性.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦

27、大学图书馆文献检索教研室49*运算次序：运算次序：not and ornot and or*改变运算次序用括号改变运算次序用括号*例例：序列分析的工具和方法：序列分析的工具和方法 检索式：序列检索式：序列分析分析 并且（工具并且（工具 或者或者 方法）方法）.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室50为何不把序列分析写在前面？.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室51严格按输入的词组或短语形式匹配，不能插词，词序不能互换。严格按输入的词组或短语形式匹配，不能插词，词序不能互换。*表达形式：半角的双引号或表达形式：半角的双

28、引号或“精确匹配精确匹配”选项。选项。*短语中含禁用词（短语中含禁用词（and,or,notand,or,not等），必须用等），必须用“”“”括起，否则系括起，否则系统将把统将把andand作为逻辑运算符处理。作为逻辑运算符处理。例：例：“acute and chronic low back pain”acute and chronic low back pain”.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室52.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室53不用不用“”“”的的检索结果检索结果.2023-1-13复旦大学图书馆

29、文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室54*用于限定检索词之间的间隔单词数。用于限定检索词之间的间隔单词数。*有有adj,near,N,Wadj,near,N,W等表达形式。等表达形式。*例：例：tongue w/2 basetongue w/2 base（ElsevierElsevier）表示两个检索词中间最多允许插表示两个检索词中间最多允许插2 2个词，词序可以互换。个词，词序可以互换。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室55*可检出以下短语：可检出以下短语：*base of the tonguebase of the tongue；*base

30、of tonguebase of tongue；*tongue basetongue base；*作用：检全同一概念的不同表达形式作用：检全同一概念的不同表达形式.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室56*截词符：截词符：*，?,$,#等，可用于词尾、词中或词首，替代等，可用于词尾、词中或词首，替代0 0个或个或任意多个字符。任意多个字符。*例：右截：例：右截：computecompute*可检索到以下词：可检索到以下词：compute,computers,computed compute,computers,computed 等等.2023-1-13复旦

31、大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室57n检索语句又检索语句又称检索提问式称检索提问式，检索式，是，检索式，是用户向检索系统表达检用户向检索系统表达检索需求的句式索需求的句式。n检索语句包含：检索语句包含：检索检索方式、检索字段、检索运算符、检索词、方式、检索字段、检索运算符、检索词、检索年限等。检索年限等。n高级高级检索：检索：年年 between(2010,2015)between(2010,2015)并且并且 (篇名篇名=肾衰竭肾衰竭 或者或者 篇名篇名=肾功能衰竭肾功能衰竭 )(精确精确匹配匹配)并且并且 (主题主题=血透血透)(模糊匹配模糊匹配).2023-1-13复

32、旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室58*自由词检索自由词检索检索语句：检索语句：TI=(dna SequencTI=(dna Sequenc*and(method$or tool$or and(method$or tool$or instrument$)and TS=humaninstrument$)and TS=human*自由词检索限在自由词检索限在ti ti 字段中，可提高检出文献的相关性。字段中，可提高检出文献的相关性。*在没有规范化主题词表的数据库中，可以使用字段限定来调在没有规范化主题词表的数据库中，可以使用字段限定来调整检出文献的篇数和相关度。整检出文献的篇数

33、和相关度。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室59.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室60*主题词检索主题词检索*一般通过词表选词，无需输入检索式。一般通过词表选词，无需输入检索式。*检索语句：检索语句：序列分析序列分析,DNA/,DNA/仪器和设备仪器和设备/方法方法 不加权不加权:扩展扩展 AND AND 人类人类 特征词特征词*“方法，仪器设备方法，仪器设备”为副主题词，为副主题词，“人类人类”在限定检索中选择。在限定检索中选择。.2023-1-13复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室61.本本次次重点重点分析课题，明确要求内容特征内容特征&形式特征形式特征查准查准 or or 查全查全选择检索工具确定检索途径及标识主题检索主题检索作者检索作者检索引文检索引文检索确定检索运算符布尔逻辑布尔逻辑精确匹配精确匹配截词符截词符构筑检索语句，获取检索结果.