氨基酸多肽蛋白质课件.pptx
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- 氨基酸 多肽 蛋白质 课件
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1、主要内容主要内容v第一节第一节 氨基酸氨基酸(Amino Acid)v第二节第二节 多肽多肽(Peptides)v第三节第三节 蛋白质蛋白质(Proteins)第一节第一节 氨基酸氨基酸(Amino Acids)v一、结构、分类与命名一、结构、分类与命名v二、性质二、性质v(一)物理性质(一)物理性质v(二)化学性质(二)化学性质(一一)氨基酸的结构氨基酸的结构20 standard amino acids in proteinsH2NHCOOHRHNH2COOHRL-amino acidD-amino acid一、结构、分类与命名一、结构、分类与命名 2、结构表示、结构表示vL-L-氨基酸氨
2、基酸CHOHHOCH2OHL-L-甘油醛甘油醛(对照标准对照标准)S-S-COOHHH2NRCOOHHH2NCH2SHL-L-半胱氨酸半胱氨酸R-R-半胱氨酸半胱氨酸(二二)分类分类分分 类类-COOH-COOH-NH-NH2 2氨基酸(数)氨基酸(数)酸性氨基酸酸性氨基酸2 2个个1 1个个2个个中性氨基酸中性氨基酸1 1个个1 1个个15个个碱性氨基酸碱性氨基酸1 1个个2 2个个3个个+H3NCOO-H+H2NCOO-H+H3NCOO-HCH3+H3NCOO-HCH(CH3)2+H3NCOO-HCH2+H3NCOO-HCH(CH3)CH(CH3)2CH2CH3Glycine(Gly)Al
3、anine(Ala)Valine(Val)Leucine(Leu)Isoleucine(Ile)Proline(Pro)甘氨酸丙氨酸缬氨酸亮氨酸异亮氨酸脯氨酸1.Nonpolar,aliphalic R groups(6)*骨骨架架变变化化(二二)结构和命名结构和命名UV 特征吸收:特征吸收:l l=280 nm+H3NCOO-HCH2+H3NCOO-HCH2+H3NCOO-HCH2Phenylalanine(Phe)Tyrosine(Tyr)Tryptophan(Try)苯丙氨酸酪氨酸色氨酸2.Aromatic R groups(3)NHOH+H3NCOO-HCH2OH+H3NCOO-HCH
4、OH+H3NCOO-HCH2SH+H3NCOO-HCH2+H3NCOO-HCH2CH2SCH3CONH2Serine(Ser)Threonine(Thr)Cysteine(Cys)Methionine(Met)Asparagine(Asn)Glutamine(Gln)丝氨酸苏氨酸半胱氨酸甲硫氨酸(蛋氨酸)门冬酰胺谷氨酰胺3.Polar,uncharged R groups(6)CH3+H3NCOO-HCH2CH2CONH2Acidic amino acidscontaining two carboxylic groups+H3NCOO-HCH2COO-+H3NCOO-HCH2CH2COO-As
5、partate(Asp)Glutamate(Glu)门 冬 氨 酸谷 氨 酸4.Negatively charged R groups(2)Basic amino acids containing two amino groups+H3NCOO-HCH2CH2Lysine(Lys)Arginine(Arg)赖氨酸精氨酸+H3NCOO-HCH2CH2CH25.Positively charged R groups(3)CH2CH2NH3+NHCNH2NH2+H3NCOO-HH2CHNNHguanidinoimidazoleHistidine组氨酸必需氨基酸(必需氨基酸(8 8种种)v三字符:三字
6、符:Val,Leu,Ile,Thr,Met,Trp,Lys,Phev中文名:中文名:缬、亮、异亮、苏、蛋、色、赖、苯丙缬、亮、异亮、苏、蛋、色、赖、苯丙v体内不能合成,必需由食物提供的氨基酸。体内不能合成,必需由食物提供的氨基酸。修饰氨基酸的结构修饰氨基酸的结构L-胱氨酸 L-羟脯氨酸 L-羟赖氨酸 L-甲赖氨酸H2N+CH2CH2CH2CH2CHNH2CO2-CH3H3N+CH2CHCH2CH2CHCOO-OHNH2COO-C+NH3CH2HSSCH2CCOO-H+NH3N+HOCOO-HH非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸v定义:不参与构成蛋白质但却以各种形式分布于定义:不参与构成蛋白质但却以各
7、种形式分布于植物、细菌和动物体内的这些氨基酸。植物、细菌和动物体内的这些氨基酸。v形式存在:以形式存在:以游离游离或或结合形式结合形式存在的氨基酸。存在的氨基酸。包括:包括:-氨基酸氨基酸 -氨基酸氨基酸 -氨基酸氨基酸 -氨基酸氨基酸 D-D-氨基酸氨基酸例子例子非蛋白质氨基酸氨基酸作用鸟氨酸瓜氨酸精氨酸的代谢中间体-氨基丁酸是谷氨酸的脱羧产物脑内的重要神经递质-丙氨酸/构成维生素泛酸的基本成分D-丙氨酸D-谷氨酸/细菌的肽聚糖的成分D-赖氨酸D-鸟氨酸/某些革兰氏阳性菌的糖肽中的成分二、性质二、性质(Properties)v(一)物理性质(一)物理性质v(二)化学性质(二)化学性质 1 1
8、、酸碱两性与等电点、酸碱两性与等电点 2 2、脱羧反应、脱羧反应(decarboxylation)(decarboxylation)3 3、与、与HNOHNO2 2反应反应 4 4、与茚三酮、与茚三酮(ninhydrin)(ninhydrin)反应反应 5 5、成肽反应、成肽反应 1 1)酸碱性酸碱性 (acid-base properties)(acid-base properties)氨基酸氨基酸既是酸又是碱既是酸又是碱2 2)易于水,不溶于非极性溶剂。易于水,不溶于非极性溶剂。3 3)固体熔点高(固体熔点高(200-300200-300)4 4)旋光性旋光性 (optical activ
9、ity)(optical activity)+H3N C HCOO-R氨基酸的结构氨基酸的结构存在形式:存在形式:氨基酸在结晶状态或在接近中性的溶液中是以氨基酸在结晶状态或在接近中性的溶液中是以两性离两性离子子(dipolar ion)的形式存在的的形式存在的,是一种是一种内盐内盐(inner salt)(一)物理性质(一)物理性质原理:由于这些溶剂对水的亲和力强于蛋白质分子而破坏了蛋白质周围的水化膜,使蛋白质沉淀等电点(Isoelectric Point,pI)有些蛋白质还含有微量磷、铁、锌、铜、钼、碘等元素苯丙氨酸 脯氨酸 门冬氨酸 赖氨酸AutoMSFit 检索报告虽有环肽存在,但绝大多
10、数的肽呈链状,称为多肽链1、球状蛋白质(globular protein)L-胱氨酸 L-羟脯氨酸例如清蛋白、球蛋白、谷蛋白、精蛋白、硬蛋白等邓健 制作 张鲁雁 审校十肽以下的称为寡肽(oligopeptide)思考题:Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu 与 Leu-Ala-Tyr-Gly-Ser 相同吗?羧肽酶A水解断裂那些不是Arg(精)和Lys(赖)的C-端氨基酸原理:这是因为蛋白质在pHpI的溶液中带负电荷,可与这些重金属正离子结合成不溶性的蛋白盐而沉淀。当变性蛋白质去掉变性因素后,能恢复原有性质,这种变性称为可逆变性或称复性二肽(dipeptide)(二)蛋白质的胶体性质正电荷/
11、负级 负电荷/正级 负电荷/正级肽中的氨基酸单位称为氨基酸残基(amino acid residue)现在有四个氨基酸:苯丙氨酸pI=5.(二)化学性质(二)化学性质v1、酸碱性与等电点酸碱性与等电点 (1)两性电离两性电离R C COO-NH3+HR C COOHNH3+H+H+Amino acids are ampholytes(两性电解质两性电解质)碱性电离碱性电离酸性电离酸性电离RCHCOO-NH3+HClNaOHNH3ClCOOHCHRNH2COONaCHR+-酸碱性酸碱性铵盐铵盐羧酸盐羧酸盐(2)氨基酸的电离平衡)氨基酸的电离平衡v在三种离子共同存在于一个平衡体系中在三种离子共同存
12、在于一个平衡体系中v以哪种离子为主取决于氨基酸的结构和溶液的酸以哪种离子为主取决于氨基酸的结构和溶液的酸碱度。碱度。NH3+COO-CH+RCHCOOHCHNH2RRNH3COO-OH-H+H+OH-阳离子阳离子 两性离子两性离子 阴离子阴离子Low pHHigh pH等电点等电点(Isoelectric Point,pI)定义:在某一定义:在某一pH 值下,氨基酸所带正电荷的数值下,氨基酸所带正电荷的数目与负电荷的数目正好相等,即目与负电荷的数目正好相等,即净电荷为零净电荷为零,该该 pH 值为该氨基酸的值为该氨基酸的等电点等电点(pI)。v1、amino acids 几乎全部以两性离子几乎
13、全部以两性离子 I 的形式存的形式存在(并伴以极少量的阳性离子在(并伴以极少量的阳性离子 和阴性离子和阴性离子)v2、氨基酸的溶解度最小、氨基酸的溶解度最小等电点时等电点时(1 1)氨基酸结构的影响)氨基酸结构的影响氨基酸氨基酸pI酸性氨基酸酸性氨基酸4.0中性氨基酸中性氨基酸5.06.5碱性氨基酸碱性氨基酸7.5(2 2)溶液酸碱度的影响)溶液酸碱度的影响NH3+COO-CH+RCHCOOHCHNH2RRNH3COO-OH-H+H+OH-pKa COOH:2.2 pKb:11.8 pKa NH3+:9.4 pKb:4.6pHPI 阳离子阳离子 两性离子两性离子 阴离子阴离子氨基酸的电泳示意图
14、氨基酸的电泳示意图 PH精氨酸丙氨酸天冬氨酸278.5正电荷正电荷/负级负级 正电荷正电荷/负级负级 正电荷正电荷/负级负级正电荷正电荷/负级负级 负电荷负电荷/正级正级 负电荷负电荷/正级正级正电荷正电荷/负级负级 负电荷负电荷/正级正级 负电荷负电荷/正级正级2、脱羧反应、脱羧反应(decarboxylation)RCHCOO-NH3+RCH2NH2CO2OH-NNHCH2CHCO2-NH3+脱羧酶NNHCH2CH2CO2NH2H3NCH2CH2CH2CH2-C-COO+HNH3+酶H2NCH2CH2CH2CH2-CH2NH2-+CO2组胺组胺尸胺尸胺-氨基丁酸(氨基丁酸(GABA)v-氨
15、基丁酸氨基丁酸v是由谷氨酸中是由谷氨酸中-羧基脱羧后转变而成羧基脱羧后转变而成v是脑内存在的重要神经递质是脑内存在的重要神经递质L-L-谷氨酸谷氨酸 -氨基丁酸氨基丁酸 3、与、与HNO2反应反应v根据放氮的体积,可测定氨基酸根据放氮的体积,可测定氨基酸的含量。的含量。N-端测序:Edman降解法:可用于自动测序可用半透膜将蛋白质与小分子物质分离而得以纯化有些蛋白质还含有微量磷、铁、锌、铜、钼、碘等元素UV 特征吸收:l=280 nm原理:破坏蛋白质胶体周围的水化膜Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu leucine enkephalin(1)两性电离 多肽链的选择性水解(酶法和化学法)7,
16、请问在以下pH条件下进行电泳,各氨基酸的主要存在形式是什么?在外电场作用下,移向阳极还是阴极?第十七章 氨基酸、多肽和蛋白质 第二节 肽四、蛋白质的理化性质第一节 氨基酸(Amino Acid)(二)蛋白质的胶体性质等电点(Isoelectric Point,pI)pHPI作 用:降低体内血糖含量中和了蛋白质分子的电荷(3)肽键呈反式构型 与C-N键相连的O与H或两个C原子之间一般呈较稳定的反式构型。缩写成:丙-半胱-亮 或 Ala-Cys-Leu(五)蛋白质的颜色反应4、与茚三酮、与茚三酮(ninhydrin)反应反应v 茚三酮茚三酮 -氨基酸氨基酸 蓝紫色蓝紫色(Ruhemanns pur
17、ple)鉴别:鉴别:-氨基酸氨基酸5、成肽反应、成肽反应v二肽(dipeptide)R-CHHNCNHOCCHROH2NCHCORH2NCHCOOR-酰胺键或称肽键例题与习题例题与习题现在有四个氨基酸:苯丙氨酸现在有四个氨基酸:苯丙氨酸pI=5.5、脯氨酸、脯氨酸pI=6.3、门冬、门冬氨酸氨酸pI=2.8和赖氨酸和赖氨酸pI=9.7,请问在以下,请问在以下pH条件下进行电条件下进行电泳,各氨基酸的主要存在形式是什么?在外电场作用下,泳,各氨基酸的主要存在形式是什么?在外电场作用下,移向阳极还是阴极?移向阳极还是阴极?苯丙氨酸苯丙氨酸 脯氨酸脯氨酸 门冬氨酸门冬氨酸 赖氨酸赖氨酸(1)pH=7
18、.0(2)pH=6.0(3)pH=5.0(4)pH=2.0正正 阴极阴极 正正 阴极阴极 负负 阳极阳极 正正 阴极阴极负负 阳极阳极 负负 阳极阳极 负负 阳极阳极 正正 阴极阴极正正 阴极阴极 正正 阴极阴极 正正 阴极阴极 正正 阴极阴极负负 阳极阳极 正正 阴极阴极 负负 阳极阳极 正正 阴极阴极人民卫生电子音像出版社30 CCH2NRHOCCOHNRHOH+H2O第十七章 氨基酸、多肽和蛋白质 第二节 肽 肽肽是氨基酸残基之间彼此通过是氨基酸残基之间彼此通过酰胺键酰胺键(肽肽键键)连接而成的一类化合物。其通式为:连接而成的一类化合物。其通式为:CCOHH2NAmino acidRHO
19、 CCOHNRHOHH+Amino acid氨基酸氨基酸 氨基酸氨基酸 二二 肽肽 多肽分子中的酰胺键称为多肽分子中的酰胺键称为肽键肽键(peptide bond),一般为一般为-COOH 与与-NH2 脱水缩合而成。脱水缩合而成。肽也以肽也以的形式存在。的形式存在。邓健 制作 张鲁雁 审校31 二肽分子的两端仍存在着游离的二肽分子的两端仍存在着游离的-NH3+和和-COO-,因此它可以再与另一分子氨基酸脱水缩因此它可以再与另一分子氨基酸脱水缩合形成合形成三肽三肽;同样依次可形成同样依次可形成四肽四肽、五肽五肽。H3N+CH COR1NH CH COR2NH CHR3CO NH CHR4CO2
20、H四肽四肽 l十肽以下的称为十肽以下的称为寡肽寡肽(oligopeptide)l大于十肽的称为大于十肽的称为多肽多肽(polypeptide)l肽中的氨基酸单位称为肽中的氨基酸单位称为氨基酸残基氨基酸残基(amino acid residue)第十七章 氨基酸、多肽和蛋白质 第二节 肽 上页上页下页下页首页首页 自然界存在多种肽类物质自然界存在多种肽类物质 青霉素青霉素 短杆菌肽短杆菌肽S SNHOOCHNROOSPenicillineL-ValD-Cys脑啡肽脑啡肽 Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu leucine enkephalin Tyr-Gly-Gly-Phe-Met meth
21、ionine enkephalinL-ValD-OrnL-proD-PheL-LeuL-OrnL-ValL-ProL-PheL-Luegramicidin S人民卫生电子音像出版社33虽有环肽存在虽有环肽存在,但绝大多数的肽呈链状但绝大多数的肽呈链状,称为称为多肽链多肽链 H3N+CH COR1NH CH COR2NH CHR3CONH CHRnCO2Hl N-末端末端(N-terminal end):保留游离:保留游离 的一端的一端,也叫也叫氨基末端氨基末端,一般写在肽链的左边。,一般写在肽链的左边。l C-末端末端(N-terminal end):保留有保留有 的一端,的一端,也叫也叫羧基
22、末端羧基末端,通常写在肽链的右边。通常写在肽链的右边。l 肽链骨架肽链骨架:所有链状多肽都有一个共同的骨架所有链状多肽都有一个共同的骨架一、肽的结构和命名一、肽的结构和命名 上页上页下页下页首页首页v三肽三肽(tripeptide)(tripeptide)。CONHH3N+CHCH3CHCONHCOOCHCH2SHCH2CH(CH3)2-v命名:命名:以以C-C-末端的氨基酸为母体,其末端的氨基酸为母体,其它氨基酸残基称氨酰它氨基酸残基称氨酰依次依次命出。命出。v丙氨酰半胱氨酰亮氨酸丙氨酰半胱氨酰亮氨酸v缩写成:丙缩写成:丙-半胱半胱-亮亮 或或 Ala-Cys-Leuv简写成:简写成:A-C
23、-L思考题:思考题:Ser-Gly-Tyr-Ala-LeuSer-Gly-Tyr-Ala-Leu 与与 Leu-Ala-Tyr-Gly-SerLeu-Ala-Tyr-Gly-Ser 相同吗相同吗?肽键平面肽键平面 v肽单元肽单元(-C-C-CO-NH-C-CO-NH-C-)v特征:特征:v(1 1)肽单元是平面结构肽单元是平面结构。v(2 2)肽键具有局部双键性质肽键具有局部双键性质。v(3 3)肽键呈反式构型肽键呈反式构型 与与C-NC-N键相连的键相连的O O与与H H或两个或两个C C 原子之间一般呈较稳定的原子之间一般呈较稳定的反式构型。反式构型。Peptide Bonds肽键的平面特
24、征肽键的平面特征透析法是实验或工业生产上提取和纯化蛋白质常用的方法 The number and kinds of amino acids(一)蛋白质的两性电离和等电点(2)溶液酸碱度的影响原理:由于这些溶剂对水的亲和力强于蛋白质分子而破坏了蛋白质周围的水化膜,使蛋白质沉淀致使蛋白质生物活性丧失和理化性质改变1、活性蛋白质(active protein)水中形成的颗粒直径:1lOOnm当变性蛋白质去掉变性因素后,能恢复原有性质,这种变性称为可逆变性或称复性二肽分子的两端仍存在着游离的-NH3+和-COO-,因此它可以再与另一分子氨基酸脱水缩合形成三肽;同样依次可形成四肽、五肽。因此,只要测出生
25、物样品中的含氮量,就可粗略计算出其蛋白质的含量蛋白质的分子量:有的可达数千万原理:这是因为蛋白质在pHpI的溶液中带负电荷,可与这些重金属正离子结合成不溶性的蛋白盐而沉淀。(2)溶液酸碱度的影响pHPI三肽(tripeptide)。正电荷/负级 负电荷/正级 负电荷/正级Peptide Bonds氨基酸在结晶状态或在接近中性的溶液中是以两性离子(dipolar ion)的形式存在的,是一种内盐(inner salt)二、性质(Properties)R SH2氧化硫醇二硫化物RS SR 二硫键(二硫键(Disulfide bond)Disulfide Bonds(二硫键)烫发的过程是一个旧二硫烫
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