大肠杆菌中的基因表达2课件.ppt
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- 大肠杆菌 中的 基因 表达 课件
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1、第二章第二章 基因工程制药基因工程制药第一节第一节 概概 述述第二节第二节 目的基因的获得目的基因的获得第三节第三节 基因表达基因表达第四节第四节 基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性第五节第五节 基因工程菌中试基因工程菌中试第六节第六节 重组工程菌的培养重组工程菌的培养第七节第七节 基因工程药物的分离纯化基因工程药物的分离纯化第八节第八节 变性蛋白的复性变性蛋白的复性第九节第九节 基因工程药物的质量控制基因工程药物的质量控制 第二章第二章 基因工程制药基因工程制药 一、基因工程技术生产药品的优点一、基因工程技术生产药品的优点 二、基因工程药物生产的基本过程二、基因工程药物生产的基本过程
2、三、国内外基因工程药物研究进展三、国内外基因工程药物研究进展 第一节第一节 概概 述述第一节第一节 概概 述述基因工程技术诞生:基因工程技术诞生:20世纪世纪70年代年代 现代生物技术的发展现代生物技术的发展 基因工程基因工程:应用应用DNA重组技术,按照人们的重组技术,按照人们的意愿意愿,在,在基因基因水平上改变生物水平上改变生物 遗传性,创造新的生物物种,通过工程化手段为人类提供有用产品遗传性,创造新的生物物种,通过工程化手段为人类提供有用产品和服和服 务的技术。务的技术。一、基因工程技术生产药品的优点一、基因工程技术生产药品的优点 1.大量生产过去通过常规生化分离提取技术难以获得(富集)
3、的大量生产过去通过常规生化分离提取技术难以获得(富集)的 生理活性蛋白和多肽。生理活性蛋白和多肽。2.提供足够数量的生理活性物质。提供足够数量的生理活性物质。3.开发更多的内源性生理活性物质。开发更多的内源性生理活性物质。4.通过基因工程和蛋白质工程对天然生理活性物质进行改造,优通过基因工程和蛋白质工程对天然生理活性物质进行改造,优 化天然的生理活性物质。化天然的生理活性物质。5.利用基因工程技术可获得新型化合物,扩大药物筛选来源。利用基因工程技术可获得新型化合物,扩大药物筛选来源。6.降低成本,提高产品质量。降低成本,提高产品质量。二、基因工程药物生产的基本过程二、基因工程药物生产的基本过程
4、 1.目的基因的获得目的基因的获得 2.构建构建DNA重组体重组体 上游技术上游技术 3.构建工程菌构建工程菌 4.工程菌的发酵工程菌的发酵 5.外源基因表达产物的分离纯化外源基因表达产物的分离纯化 6.产品的检验产品的检验三、国内外基因工程药物研究进展三、国内外基因工程药物研究进展 目前研制的基因工程药物主要包括目前研制的基因工程药物主要包括:1.免疫性蛋白,如各种抗原和单克隆抗体免疫性蛋白,如各种抗原和单克隆抗体;2.细胞因子,如各种干扰素、白细胞介素、集落刺激生长因子细胞因子,如各种干扰素、白细胞介素、集落刺激生长因子 表皮生长因子、凝血因子;表皮生长因子、凝血因子;3.激素,如胰岛素、
5、生长激素、心钠素;激素,如胰岛素、生长激素、心钠素;4.酶类,如尿激酶、链激酶、葡激酶、组织型纤维蛋白溶酶激酶类,如尿激酶、链激酶、葡激酶、组织型纤维蛋白溶酶激 活剂、超氧化物歧化酶等。活剂、超氧化物歧化酶等。Vitamin A 第二节第二节 目的基因的获得目的基因的获得 一、一、反转录法反转录法 二、化学合成法二、化学合成法 一、反转录法一、反转录法 1mRNA的纯化的纯化 (1)选择表达目的蛋白质丰度高的)选择表达目的蛋白质丰度高的 mRNA的生物材料。的生物材料。(2)分离)分离总总RNA。(3)分离)分离mRNA(多聚(多聚T纤维素)纤维素)2cDNA第一链的合成(第一链的合成(RT-
6、PCR,随机引物),随机引物)3cDNA第二链的合成第二链的合成4cDNA克隆克隆5将重组体导入宿主细胞将重组体导入宿主细胞 S 1RNaseH核酸发夹结构克隆定向酶入噬菌体质粒T、A、转染电击化学法一、反转录法一、反转录法6cDNA文库的鉴定文库的鉴定 显色抗性失活抗性获得抗体差示寡核苷酸探针核酸探针一、反转录法一、反转录法7目的目的cDNA克隆的分离和鉴定克隆的分离和鉴定 计算机辅助分析阅读测序酶切 、一、反转录法一、反转录法 优点:优点:准确性高准确性高、人工接头、改进、利用、人工接头、改进、利用 局限性:局限性:1小分子量的蛋白或多肽小分子量的蛋白或多肽 2已知核苷酸顺序或氨基酸顺序已
7、知核苷酸顺序或氨基酸顺序 3费用较高费用较高 二、化学合成法二、化学合成法Vitamin B2 基因表达的成败,直接影响药品的质量、成本。基因表达是外基因表达的成败,直接影响药品的质量、成本。基因表达是外 源基因在生物体转录、翻译以及所有加工过程,是外源基因异源转录源基因在生物体转录、翻译以及所有加工过程,是外源基因异源转录 翻译利用宿主功能的过程,也是外源翻译利用宿主功能的过程,也是外源DNA、RNA、Pr克服宿主细胞克服宿主细胞 进攻,保护自身的过程。进攻,保护自身的过程。第三节第三节 基因表达基因表达 1.原核细胞(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、链霉菌等)原核细胞(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、链霉
8、菌等)2.真核细胞(酵母、丝状真菌、动物细胞等)真核细胞(酵母、丝状真菌、动物细胞等)一、宿主菌的选择一、宿主菌的选择 1原核细胞原核细胞(1)大肠杆菌)大肠杆菌 优点:遗传背景清晰,生长迅速。优点:遗传背景清晰,生长迅速。缺点:胞内表达,提取困难。缺点:胞内表达,提取困难。包含体形式,需复性。包含体形式,需复性。表达后不存在修饰作用,应用受限。表达后不存在修饰作用,应用受限。翻译产物的翻译产物的N末端常多余一个甲硫氨酸残基(末端常多余一个甲硫氨酸残基(AUG启始密码子启始密码子 编码)容易引起免疫反应。编码)容易引起免疫反应。大肠杆菌产生内毒素给纯化带来不便。大肠杆菌产生内毒素给纯化带来不便
9、。蛋白酶水解作用破坏产物。蛋白酶水解作用破坏产物。一、宿主菌的选择一、宿主菌的选择 1原核细胞原核细胞(2)枯草芽孢杆菌)枯草芽孢杆菌 优点:分泌能力强,产物可直接到培养液中。优点:分泌能力强,产物可直接到培养液中。缺点:蛋白酶水解活性更强。缺点:蛋白酶水解活性更强。(3)链霉菌)链霉菌 优点:不致病优点:不致病 分泌能力强分泌能力强 具有糖基化能力具有糖基化能力 缺点:培养条件要求高、遗传稳定性差缺点:培养条件要求高、遗传稳定性差一、宿主菌的选择一、宿主菌的选择 2真核细胞真核细胞(1)酵母:无毒、倍增时间短、分泌功能、糖基化作用、使之)酵母:无毒、倍增时间短、分泌功能、糖基化作用、使之 成
10、为理想的宿主。成为理想的宿主。(2)丝状真菌:肽剪切、糖基化。)丝状真菌:肽剪切、糖基化。(3)哺乳动物细胞:产品保真性高,生产效率低)哺乳动物细胞:产品保真性高,生产效率低。一、宿主菌的选择一、宿主菌的选择1载体载体 表达载体必须具备下列条件:表达载体必须具备下列条件:载体能独立复制载体能独立复制 具有多克隆(具有多克隆(MCS)位点和标记基因)位点和标记基因 具有很强的启动子具有很强的启动子 具有调节基因具有调节基因 具有很强的终止子具有很强的终止子 具有产生带有具有产生带有SD序列和序列和AUG的的mRNA的能力的能力二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达 基因工程药物研究中常
11、用的表达载体基因工程药物研究中常用的表达载体 (1)PBV220系统系统 PL、PR串联启动子,增强启动信号。串联启动子,增强启动信号。rrnB基因的终止信号。基因的终止信号。PL、PR与与rrnB之间有之间有MCS及及SD序列。序列。CITS857抑制子基因(温控诱导)抑制子基因(温控诱导)质粒较小(质粒较小(366kb),便于插入大的外源基因),便于插入大的外源基因二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达PBG-2:由由PBV220衍生衍生,可以表达与可以表达与IgG结合的融合蛋白,并且是有蛋结合的融合蛋白,并且是有蛋白剪切位点,便于表达后纯化及白剪切位点,便于表达后纯化及纯化后剪
12、切。纯化后剪切。二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达(2)PET系统系统 IPTG诱导(异丙基诱导(异丙基-硫代硫代-D-半乳糖苷)半乳糖苷)多克隆位点上有多克隆位点上有NdeI或或NCOI单一切点,切开后粘性末端为单一切点,切开后粘性末端为 ATG,便于外源基因插入表达。,便于外源基因插入表达。在外源基因的在外源基因的N末端可融合末端可融合6个个His,便于纯化。,便于纯化。二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达2影响目的基因在大肠杆菌中表达的因素影响目的基因在大肠杆菌中表达的因素(1)外源基因的拷贝数)外源基因的拷贝数(2)启动子的强弱)启动子的强弱(3)SD序列的有
13、效性序列的有效性(4)SD与与ATG的间距的间距(5)密码子的组成(偏爱性)密码子的组成(偏爱性)(6)产物的稳定性)产物的稳定性(7)产物对宿主的影响)产物对宿主的影响二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达3表达形式表达形式(1)融合蛋白,增强稳定性。)融合蛋白,增强稳定性。(2)非融合表达。)非融合表达。二、大肠杆菌中的基因表达二、大肠杆菌中的基因表达 1载体载体 YEP类(酵母附加体质粒)类(酵母附加体质粒)由大肠杆菌质粒,由大肠杆菌质粒,2m质粒和质粒和Trp或或URA3组成,组成,ARS来自来自2m质粒。质粒。YRP(酵母复制型质粒)(酵母复制型质粒)ARS来自染色体来自染
14、色体DNA、TrP1、URA3双标及大肠杆菌质粒。双标及大肠杆菌质粒。YCP(酵母着丝粒型质粒)(酵母着丝粒型质粒)除具有除具有YRP元件外,还具有着粒成份。元件外,还具有着粒成份。三、酵母中的基因表达三、酵母中的基因表达 YIP(酵母整合型质粒)(酵母整合型质粒)含有可与染色体进行同源重组的序列含有可与染色体进行同源重组的序列 酵母表达型质粒酵母表达型质粒 分泌型表达质粒分泌型表达质粒 带有控制蛋白质分泌的信号序列带有控制蛋白质分泌的信号序列三、酵母中的基因表达三、酵母中的基因表达2影响目的基因在酵母中表达的因素影响目的基因在酵母中表达的因素 (1)外源基因的拷贝数)外源基因的拷贝数 (2)
15、TATA盒启动子成分盒启动子成分 (3)分泌信号序列)分泌信号序列 (4)终止序列)终止序列 (5)翻译后修饰)翻译后修饰 (6)对宿主影响)对宿主影响三、酵母中的基因表达三、酵母中的基因表达 基因工程菌在传代过程中经常出现质粒不稳定的现象,基因工程菌在传代过程中经常出现质粒不稳定的现象,质粒不稳定分为分裂不稳定和结构不稳定。质粒不稳定分为分裂不稳定和结构不稳定。第四节第四节 基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性 1.质粒的分裂不稳定性:质粒的分裂不稳定性:指工程菌分裂时出现一定比列不含质粒的子代菌的现象。指工程菌分裂时出现一定比列不含质粒的子代菌的现象。主要与两个因素有关:主要与两个因素
16、有关:(1)含质粒菌产生不含质粒子代的频率,质粒丢失率与)含质粒菌产生不含质粒子代的频率,质粒丢失率与 宿主菌、质粒特性和培养条件有关。宿主菌、质粒特性和培养条件有关。(2)含质粒菌与不含质粒菌比生长速率的差异的大小。)含质粒菌与不含质粒菌比生长速率的差异的大小。2.质粒的结构不稳定性:质粒的结构不稳定性:指指DNA从质粒上丢失或碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变。从质粒上丢失或碱基重排、缺失所致工程菌性能的改变。一、质粒不稳定产生的原因:一、质粒不稳定产生的原因:1.选择合适的宿主菌选择合适的宿主菌 2.选择合适的载体选择合适的载体 3.选择压力选择压力 4.分阶段控制培养分阶段控制培养 5
17、.控制培养条件控制培养条件 6.固定化固定化二、提高质粒稳定性的方法二、提高质粒稳定性的方法 一、工程菌选择一、工程菌选择二、反应器(发酵罐)设计二、反应器(发酵罐)设计三、发酵培养基组成三、发酵培养基组成四、工艺最佳化与参数监测控制四、工艺最佳化与参数监测控制第五节第五节 基因工程菌中试基因工程菌中试一、基因工程菌的培养方式一、基因工程菌的培养方式二、基因工程菌的培养工艺二、基因工程菌的培养工艺三、基因工程菌的培养设备三、基因工程菌的培养设备第六节第六节 重组工程菌的培养重组工程菌的培养 基因工程产品纯化前的性质:基因工程产品纯化前的性质:目的产物在体系中含量较低目的产物在体系中含量较低 体
18、系中组份复杂(细胞、代谢物、残留培养基及无机盐等)体系中组份复杂(细胞、代谢物、残留培养基及无机盐等)目的产物稳定性差:对目的产物稳定性差:对pH、温度、金属离子、有机溶剂、温度、金属离子、有机溶剂、剪切力、表面活性剂等十分敏感,容易失活、变性。剪切力、表面活性剂等十分敏感,容易失活、变性。第七节第七节 基因工程药物的分离纯化基因工程药物的分离纯化一、建立分离纯化工艺需了解的各种因素一、建立分离纯化工艺需了解的各种因素 1.含目的产物的初始物料的特点含目的产物的初始物料的特点 利用基因工程菌进行发酵生产的产物,其上游过程中的各种因素利用基因工程菌进行发酵生产的产物,其上游过程中的各种因素 均对
19、分离纯化技术和工艺有直接影响。这些因素包括:均对分离纯化技术和工艺有直接影响。这些因素包括:(1)菌种类型、形式,各种生物学性质,产物和副产物种类、)菌种类型、形式,各种生物学性质,产物和副产物种类、产物在细胞内所处的位置,表达方式(胞内、胞外、包含体),产物在细胞内所处的位置,表达方式(胞内、胞外、包含体),代谢物种类,产物类似物、毒素和能降解产物的酶类等;代谢物种类,产物类似物、毒素和能降解产物的酶类等;(2)原材料和培养基的来源及质量是否稳定;)原材料和培养基的来源及质量是否稳定;(3)生产工艺和条件。包括灭菌方法和条件,生产方式)生产工艺和条件。包括灭菌方法和条件,生产方式(连续、批连
20、续、批 式、半连续式、半连续),生产周期,生产能力,工艺控制条件及方式等;,生产周期,生产能力,工艺控制条件及方式等;(4)初始物料的物理、化学和生物学特性。包括产物浓度、主要杂质)初始物料的物理、化学和生物学特性。包括产物浓度、主要杂质 种类和浓度、盐的种类和浓度、溶解度、种类和浓度、盐的种类和浓度、溶解度、pH、粘度、流体力学性、粘度、流体力学性 质和热力学性质等。质和热力学性质等。一、建立分离纯化工艺需了解的各种因素一、建立分离纯化工艺需了解的各种因素2.物料中杂质种类和性质物料中杂质种类和性质 物料中杂质种类和性质包括相关性和非相关性杂质的含量、物料中杂质种类和性质包括相关性和非相关性
21、杂质的含量、化学性质、结构、相对分子质量、电荷性质及数量、生物学特性、化学性质、结构、相对分子质量、电荷性质及数量、生物学特性、稳定性稳定性(对热、对热、pH、盐、有机溶剂等、盐、有机溶剂等)、溶解度、分配系数、挥发性、溶解度、分配系数、挥发性及吸附性能等。及吸附性能等。二、建立分离纯化工艺需了解的各种因素二、建立分离纯化工艺需了解的各种因素 3.目的产物的特性目的产物的特性 目的产物特性主要有产物的化学、物理和生物学特性。目的产物特性主要有产物的化学、物理和生物学特性。包括化学组成、相对分子质量、等电点、电荷分布及密度、溶解包括化学组成、相对分子质量、等电点、电荷分布及密度、溶解度、稳定性度
22、、稳定性(对热、冷冻、对热、冷冻、pH、盐、有机溶剂和金属离子等、盐、有机溶剂和金属离子等)、疏水性、疏水性、扩散性、扩散系数、分配系数、吸附性能、生物活性、亲和性、配、扩散性、扩散系数、分配系数、吸附性能、生物活性、亲和性、配基种类、表面活性等。基种类、表面活性等。二、建立分离纯化工艺需了解的各种因素二、建立分离纯化工艺需了解的各种因素 4.产品质量要求产品质量要求 产品质量要求主要包括产品质量指标,产品用途,对纯度、生产品质量要求主要包括产品质量指标,产品用途,对纯度、生物活性、比活的要求。允许的杂质种类和最大允许含量,特殊杂质物活性、比活的要求。允许的杂质种类和最大允许含量,特殊杂质的种
23、类和最大允许量,以及对使用的影响,产品剂型、贮存稳定性的种类和最大允许量,以及对使用的影响,产品剂型、贮存稳定性等。等。二、分离纯化的基本过程二、分离纯化的基本过程 基因工程药物的分离纯化一般包括细胞破碎、固液分离、浓缩与初基因工程药物的分离纯化一般包括细胞破碎、固液分离、浓缩与初步纯化、高度纯化直至得到纯品、成品加工等步骤。步纯化、高度纯化直至得到纯品、成品加工等步骤。二、分离纯化的基本过程二、分离纯化的基本过程分离纯化的技术特点:分离纯化的技术特点:条件温和条件温和 选择性好选择性好 收率要高收率要高 纯化过程快速纯化过程快速三、细胞的破碎方法三、细胞的破碎方法1.细胞收集 2.细胞破碎膜
24、过滤离心 物理破碎法:高压匀浆法、高速珠磨法、超声破碎法、高压挤压法化学破碎法:渗透冲击、增溶法、脂溶法生物破碎法:酶溶法(溶菌酶、甘露糖酶、壳多糖酶等)超声破碎法超声破碎法四、固液分离四、固液分离分离细胞碎片常用的方法有分离细胞碎片常用的方法有:1.离心沉淀:高速离心、超速离心2.膜过滤:微滤、超滤和反渗透3.双水相萃取:聚乙二醇-葡聚糖 聚乙二醇-无机盐五、重组蛋白质的分离纯化五、重组蛋白质的分离纯化 分离纯化主要依赖色谱分离方法。分离纯化主要依赖色谱分离方法。色谱技术包括:色谱技术包括:离子交换色谱、疏水色谱、反相色谱、亲和色谱、离子交换色谱、疏水色谱、反相色谱、亲和色谱、凝胶过滤色谱、
25、高效液相色谱等。凝胶过滤色谱、高效液相色谱等。五、重组蛋白质的分离纯化五、重组蛋白质的分离纯化 1.离子交换层析:离子交换层析:是以离子交换剂为固定相,是以离子交换剂为固定相,依据流动相中的组分离子与交换依据流动相中的组分离子与交换 剂上的平衡离子进行可逆交换时剂上的平衡离子进行可逆交换时 的结合力大小的差别而进行分离的结合力大小的差别而进行分离 的一种层析方法。的一种层析方法。pH、两性分子、侧链、两性分子、侧链、COONH 3五、重组蛋白质的分离纯化五、重组蛋白质的分离纯化 2.疏水层析:疏水层析:是利用蛋白质表面的疏水区域与固定相上疏水性基团相互作是利用蛋白质表面的疏水区域与固定相上疏水
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