第三章基因克隆和表达的载体课件.ppt
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1、2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 1基因工程基因工程Gene Engineering授课课时课时:40 40 学时,学时,实验:实验:20 20 学时学时 (S502),(S502),第第3 3周开始周开始(1(1单单2 2双周双周)考试方式考试方式:笔试笔试上课地点上课地点:1208,3511(69周)周)任课教师任课教师:谭志远教授,谭志远教授,办公室办公室,S508联系电话联系电话:85288311,Email 2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 2课程要求课程要求 通过本课程的学习,通过本课程的学
2、习,掌握基因工程的掌握基因工程的一些基本原理和基本操作技术等。一些基本原理和基本操作技术等。总成绩平时(总成绩平时(2020)实验()实验(3030)考试(考试(5050)平时成绩平时成绩(考查迟到、早退,课堂提问、考查迟到、早退,课堂提问、讨论、遵守课堂纪律等方面讨论、遵守课堂纪律等方面)2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 3教材和参考文献教材和参考文献1.楼士林等,基因工程,科学出版社,楼士林等,基因工程,科学出版社,20022.吴乃虎,基因工程原理(第二版上、下册),科学出版吴乃虎,基因工程原理(第二版上、下册),科学出版社,社,19983.张
3、惠展编著,张惠展编著,1999年出版,年出版,基因工程概论基因工程概论,华东理,华东理工大学出版社。工大学出版社。4.Watson,J.D et al.Recombinant DNA,W.H.Freeman and Company,New York,2ed,19925.Robert F.Weaver,Molecular Biology,科学出版社科学出版社,2000(影印版)(影印版)2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 4本课程内容本课程内容 第一章第一章 绪论绪论 第二章第二章 基因克隆的工具酶基因克隆的工具酶 第三章第三章 基因工程的载体基因工程
4、的载体 第四章第四章 目的基因的制备目的基因的制备 第五章第五章 目的基因导入和重组子的筛选目的基因导入和重组子的筛选 第六章第六章 外源基因的表达外源基因的表达 第七章第七章 基因操作的基本技术基因操作的基本技术 第八章第八章 植物基因工程及应用植物基因工程及应用 第九章第九章 动物基因工程及应用动物基因工程及应用 第十章第十章 医学基因工程及应用医学基因工程及应用2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 5第三章第三章 基因工程的载体基因工程的载体3.1 载体的功能及其特征载体的功能及其特征3.2 质粒克隆载体质粒克隆载体3.3 病毒(噬菌体)克隆载体
5、病毒(噬菌体)克隆载体3.4 酵母载体酵母载体3.5 人工染色体克隆载体人工染色体克隆载体2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 63.1 载体的功能及其特征载体的功能及其特征 载体:携带外源DNA进入宿主细胞的工具。载体:指能够运载外源指能够运载外源DNA片段(目的基因)片段(目的基因)进入受体细胞,具有自我复制能力,使外源进入受体细胞,具有自我复制能力,使外源DNA片段在受体细胞中得到扩增和表达,不被片段在受体细胞中得到扩增和表达,不被受体细胞的酶系统所破坏的一类受体细胞的酶系统所破坏的一类DNA分子。分子。载体的功能载体的功能:1.1.运送外源基因
6、高效转入受体细胞运送外源基因高效转入受体细胞2.2.为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因提供复制能力或整合能力3.3.为外源基因的扩增或表达提供条件为外源基因的扩增或表达提供条件 作为工程载体必备的条件作为工程载体必备的条件 具有多个单一的限制性内切酶酶切位点具有多个单一的限制性内切酶酶切位点 有复制起点,在受体细胞中能自我复制,或整合到有复制起点,在受体细胞中能自我复制,或整合到染色体染色体DNA上随染色体上随染色体DNA的复制而同步复制。的复制而同步复制。具有筛选转化子的选择性标记基因具有筛选转化子的选择性标记基因 安全,不含对受体细胞有害的基因,不会任意转入安全,不含对受体细胞有害
7、的基因,不会任意转入受体细胞以外的其它生物细胞中。受体细胞以外的其它生物细胞中。分子量小,拷贝数多。分子量小,拷贝数多。携带外源基因的幅度宽携带外源基因的幅度宽2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 72023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 8自主复制型载体和附加载体的扩增方式 载体的类型载体的类型 应用范围应用范围:克隆载体、表达载体。:克隆载体、表达载体。应用对象应用对象:原核载体、真核载体(酵母、植:原核载体、真核载体(酵母、植物和动物)、穿梭载体。物和动物)、穿梭载体。构建来源构建来源:质粒载体、病毒或噬菌
8、体载体、:质粒载体、病毒或噬菌体载体、质粒质粒DNA与病毒或噬菌体与病毒或噬菌体DNA组成的载体、组成的载体、质粒质粒DNA与染色体与染色体DNA片段组成的载体。片段组成的载体。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 9克隆载体克隆载体(cloning vector)用于在受体细胞中进行目的用于在受体细胞中进行目的基因扩增基因扩增的的载体。一般具有较低的分子量、较高的拷贝载体。一般具有较低的分子量、较高的拷贝数和松弛型复制子。主要由细菌质粒或与其数和松弛型复制子。主要由细菌质粒或与其它质粒、噬菌体及真核生物病毒的它质粒、噬菌体及真核生物病毒的DNA重组重
9、组构建构建。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 10表达载体表达载体(expression vector)使使目的基因目的基因在宿主细胞在宿主细胞中得以中得以表达表达的的载体。可将重组体载体。可将重组体DNA导入适合的受体细导入适合的受体细胞,使所载的目的基因能够复制、转录和胞,使所载的目的基因能够复制、转录和翻译翻译。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 11穿梭载体穿梭载体(shuttle vector)又称又称双功能载体双功能载体(bifunctional vector)。能在两种不同的。能在两种不同的
10、生物体内复制的载体。生物体内复制的载体。同时具有细菌质粒的复制原点和真核生物可识别的病毒同时具有细菌质粒的复制原点和真核生物可识别的病毒复制原点或酵母菌的自主复制序列复制原点或酵母菌的自主复制序列(ARS),它即能在,它即能在原原核细胞中核细胞中扩增扩增又能在又能在真核细胞中复制和真核细胞中复制和表达表达。主要用于原核细胞与真核细胞之间进行基因转移,通常主要用于原核细胞与真核细胞之间进行基因转移,通常是将载体和待克隆的真核生物是将载体和待克隆的真核生物DNA片段先在细菌中克片段先在细菌中克隆,再转移到真核细胞中表达,并可提高外源基因的表隆,再转移到真核细胞中表达,并可提高外源基因的表达效率。达
11、效率。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 12病毒载体病毒载体(virus vector)常用的动物病毒表达载体可分为两大类:常用的动物病毒表达载体可分为两大类:整合型(整合型(integrated)载体)载体:即外源基因通过这种病毒载即外源基因通过这种病毒载体与宿主细胞的染色体整合,外源基因随宿主细胞基因体与宿主细胞的染色体整合,外源基因随宿主细胞基因组的复制而扩增。这类载体的代表是组的复制而扩增。这类载体的代表是 SV40PSV系列系列和逆转录病毒逆转录病毒表达载体和逆转录病毒逆转录病毒表达载体pLPGHL、pMSV 等。等。游离型游离型(tra
12、nsient)或称病毒颗粒型载体或称病毒颗粒型载体:这类载体携带外这类载体携带外源基因后,本质上仍然是一种完整或缺损的病毒,能够源基因后,本质上仍然是一种完整或缺损的病毒,能够以病毒颗粒的形式在宿主内自行复制或在辅助病毒存在以病毒颗粒的形式在宿主内自行复制或在辅助病毒存在下进行复制。这类载体有痘苗病毒、腺病毒、杆状病毒下进行复制。这类载体有痘苗病毒、腺病毒、杆状病毒载体从构建来源载体从构建来源分分 质粒载体质粒载体 病毒或噬菌体载体病毒或噬菌体载体 质粒质粒DNA与病毒或噬菌体与病毒或噬菌体DNA组成的载组成的载体体 质粒质粒DNA与染色体与染色体DNA片段组成的载体片段组成的载体2023年2
13、月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 143.2 质粒克隆载体质粒克隆载体3.2.1 质粒的生物学特性质粒的生物学特性3.2.1.1 质粒质粒DNA的复制的复制3.2.1.2 质粒质粒DNA的不亲和性或互不相容性的不亲和性或互不相容性3.2.1.3 质粒的转移和迁移性质粒的转移和迁移性3.2.1.4 质粒的重组性质粒的重组性3.2.1.5 显性质粒和隐性质粒显性质粒和隐性质粒3.2.2 质粒载体的构建质粒载体的构建3.2.2.1 理想的质粒载体应具备的条件理想的质粒载体应具备的条件3.2.2.2 构建质粒载体应遵循的原则构建质粒载体应遵循的原则3.2.2.3 常见
14、质粒载体及其构建常见质粒载体及其构建3.2.2.4 质粒载体的评价质粒载体的评价2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 15质粒(质粒(plasmid)指独立存在于宿主细胞染色体外、能够自我复制的指独立存在于宿主细胞染色体外、能够自我复制的DNA分子。分子。广泛存在于细菌细胞中,在某些蓝藻、真菌和绿藻细胞广泛存在于细菌细胞中,在某些蓝藻、真菌和绿藻细胞中也发现;在酵母、眼虫、衣藻等真核生物中也存在。中也发现;在酵母、眼虫、衣藻等真核生物中也存在。绝大多数为绝大多数为环状双链环状双链DNA分子;极少数为线性质粒和分子;极少数为线性质粒和RNA质粒。质粒。环
15、状双链质粒环状双链质粒DNA的三种构型:的三种构型:超螺旋超螺旋(SC)/共价闭合环形共价闭合环形(cccDNA,covalently closed circular DNA);开环;开环(oc-DNA,open circular DNA);线性;线性(L-DNA,linear DNA)2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 162023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 172023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 183.2.1 质粒的生物学特性质粒的生物学特性(一)自主复制性
16、(一)自主复制性质粒质粒DNADNA携带有自己的复制起始区(携带有自己的复制起始区(oriori)以及一个)以及一个控制质粒拷贝数的基因,因此它能独立于宿主细胞的染控制质粒拷贝数的基因,因此它能独立于宿主细胞的染色体色体DNADNA而自主复制。不同的质粒在宿主细胞内的拷贝数而自主复制。不同的质粒在宿主细胞内的拷贝数也不同,少则几个多则几百个不等,当然由于质粒上并也不同,少则几个多则几百个不等,当然由于质粒上并没有复制酶的基因,所以其复制需要使用宿主细胞复制没有复制酶的基因,所以其复制需要使用宿主细胞复制染色体染色体DNADNA的多种酶群。的多种酶群。(二)不相容性(二)不相容性利用同一复制系统
17、的不同质粒(利用同一复制系统的不同质粒(RNAI RNAII RopRNAI RNAII Rop因因子)如果被导入同一细胞中,它们在复制及随后分配到子)如果被导入同一细胞中,它们在复制及随后分配到子细胞的过程中,就会彼此竞争,它们在单细胞中的拷子细胞的过程中,就会彼此竞争,它们在单细胞中的拷贝数也会有差异,拷贝多的复制更快,结果在细菌繁殖贝数也会有差异,拷贝多的复制更快,结果在细菌繁殖几代之后,细菌的子细胞中绝大多数都含有占优势的质几代之后,细菌的子细胞中绝大多数都含有占优势的质粒,因而这两种质粒中只能有一种长期稳定地留在细胞粒,因而这两种质粒中只能有一种长期稳定地留在细胞中,这就是所谓的中,
18、这就是所谓的质粒不相容性质粒不相容性。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 19(三)可扩增性(三)可扩增性质粒就其复制方式而言分为两类:质粒就其复制方式而言分为两类:松弛型复制松弛型复制及及严谨型复制严谨型复制。pMB1pMB1或或ColEIColEI类质粒复制子的复制完全类质粒复制子的复制完全依靠宿主细胞提供的半衰期较长的复制酶及蛋白因子依靠宿主细胞提供的半衰期较长的复制酶及蛋白因子(DNADNA聚合酶聚合酶I I,IIIIII,RNARNA聚合酶以及聚合酶以及dnaBdnaB、dnaCdnaC、dnaDdnaD、dnaZdnaZ的产物),因此在蛋
19、白质合成中断时,质的产物),因此在蛋白质合成中断时,质粒复制能持续合成,这样当用氯霉素抑制蛋白质合成粒复制能持续合成,这样当用氯霉素抑制蛋白质合成并阻断细菌染色体复制时,带有并阻断细菌染色体复制时,带有pMB1pMB1或或ColEIColEI复制子复制子的质粒将利用丰富的原料大量复制,最后每个细胞可的质粒将利用丰富的原料大量复制,最后每个细胞可以积聚以积聚2000-30002000-3000个拷贝,这叫做个拷贝,这叫做氯霉素扩增。氯霉素扩增。但另外两种质粒(但另外两种质粒(psc101psc101和和p15Ap15A)的复制子的复制受)的复制子的复制受质粒上编码的蛋白因子的正调节。氯霉素抑制蛋
20、白质质粒上编码的蛋白因子的正调节。氯霉素抑制蛋白质合成后,这类质粒便不能持续复制。合成后,这类质粒便不能持续复制。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 20(四)可转移性(四)可转移性在天然条件下,很多天然质粒都可以通过在天然条件下,很多天然质粒都可以通过细菌接合细菌接合作用从一种宿主细胞内转移到另外一作用从一种宿主细胞内转移到另外一种宿主内,这种转移依赖于质粒上的种宿主内,这种转移依赖于质粒上的tratra基因基因产物。产物。3.2.1.1 质粒质粒DNA的复制的复制 受质粒和宿主细胞双重遗传系统的控制受质粒和宿主细胞双重遗传系统的控制 质粒:质粒:
21、(1)复制起点)复制起点 (2)控制)控制质粒质粒DNA复制强度复制强度的有关基因:的有关基因:cop:指令宿主细胞合成阻遏物,阻遏物的累积阻指令宿主细胞合成阻遏物,阻遏物的累积阻止质粒的继续复制。止质粒的继续复制。rep:指令宿主细胞合成一种调节蛋白,促进质粒的指令宿主细胞合成一种调节蛋白,促进质粒的复制复制。par序列序列:该序列附着在细胞膜上,使质粒分子在细该序列附着在细胞膜上,使质粒分子在细胞分裂时正确地分配到子细胞中,维持相对稳定的拷胞分裂时正确地分配到子细胞中,维持相对稳定的拷贝数。贝数。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 21松弛型和严
22、谨型质松弛型和严谨型质粒粒 拷贝数拷贝数(copies):指一个宿主细胞内某种质粒的数量:指一个宿主细胞内某种质粒的数量与宿主染色体数量(通常为一条染色体)之比。与宿主染色体数量(通常为一条染色体)之比。严谨严谨型质粒型质粒(stringent plasmid):拷贝数为拷贝数为1至几个的质至几个的质粒。粒。松弛型质粒松弛型质粒(relaxed plasmid):拷贝数多于拷贝数多于10个的质粒。个的质粒。严谨或松弛与质粒的大小及宿主类型有关。严谨或松弛与质粒的大小及宿主类型有关。含松弛型质粒的细菌在含含松弛型质粒的细菌在含氯霉素氯霉素的培养基中培养时,可的培养基中培养时,可使质粒大量扩增。使
23、质粒大量扩增。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 223.2.1.2 质粒质粒DNA的不亲和性或互不相容的不亲和性或互不相容性性(incompatibility)指在无选择压力的情况下,两种亲缘关系密切的指在无选择压力的情况下,两种亲缘关系密切的不同质粒不能在同一个寄主细胞中稳定共存的现不同质粒不能在同一个寄主细胞中稳定共存的现象。象。亲和性质粒亲和性质粒:指能同寓于一细胞中的不同质粒。:指能同寓于一细胞中的不同质粒。不亲和性质粒不亲和性质粒:指不能同寓于一细胞中的不同质:指不能同寓于一细胞中的不同质粒。一般为粒。一般为亲缘关系密切亲缘关系密切的质粒
24、的质粒;野生型质粒与野生型质粒与其衍生的重组质粒其衍生的重组质粒。2023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 232023年2月11日17时22分欢迎02级农业生物技术班同学们听课!Slide 24质粒不亲和性的机制质粒不亲和性的机制 受相同阻遏物的制约受相同阻遏物的制约 在细胞膜上有相同的结合位点在细胞膜上有相同的结合位点3.2.1.3 质粒的转移和迁移质粒的转移和迁移接合质粒接合质粒(conjugative plasmid):指质粒所携带的指质粒所携带的基因基因的功能是使细胞彼此有效地接触,的功能是使细胞彼此有效地接触,以便将质粒以便将质粒DNA从供体细
25、胞转移至受体细胞。如:质从供体细胞转移至受体细胞。如:质粒上的粒上的tra基因基因使宿主细胞(大肠杆菌)产生菌毛,合使宿主细胞(大肠杆菌)产生菌毛,合成细胞表面物质,促使宿主细胞与受体细胞接合。成细胞表面物质,促使宿主细胞与受体细胞接合。分子较大、拷贝数少、宿主广、自行接合转移、较不安分子较大、拷贝数少、宿主广、自行接合转移、较不安全。如:全。如:F质粒、质粒、Ti质粒等质粒等。非接合质粒非接合质粒(non-conjugative plasmid):分子小、拷贝数多、不会自行接合转移,安全。如:分子小、拷贝数多、不会自行接合转移,安全。如:ColE1质粒等。质粒等。基因工程中选用基因工程中选用
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