第二章药物设计原理和方法课件.ppt
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- 第二 药物 设计 原理 方法 课件
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1、l类似物设计类似物设计:以现有药物或具有生物活性的物:以现有药物或具有生物活性的物质为先导物,按预先的设想经结构修饰或改造,质为先导物,按预先的设想经结构修饰或改造,以获得疗效比先导物更好、毒副作用更低的新以获得疗效比先导物更好、毒副作用更低的新药的设计方法。药的设计方法。l先导物的来源和选择先导物的来源和选择l目的目的:获得供临床应用的新药;用作药理探针,获得供临床应用的新药;用作药理探针,用于基本药理和生理现象的研究用于基本药理和生理现象的研究,以加深对先导以加深对先导分子在基本生物学中的认识分子在基本生物学中的认识l主要途径主要途径:生物电子等排、环类似物、烃链同:生物电子等排、环类似物
2、、烃链同系化及环大小位置异构体、立体异构与几何异系化及环大小位置异构体、立体异构与几何异构体、先导物的碎片类似物、改变原子间距等构体、先导物的碎片类似物、改变原子间距等l将刚性结构部分引入柔性分子中,使分子整体将刚性结构部分引入柔性分子中,使分子整体或局部成为刚性结构,从而使药效基团固定在或局部成为刚性结构,从而使药效基团固定在有利于与受体结合的特定空间位置,并使整个有利于与受体结合的特定空间位置,并使整个分子处于优势构象状态,以增强类似物的药理分子处于优势构象状态,以增强类似物的药理活性活性NCH3COOC2H5l先导物的二倍先导物的二倍l为另一异构体的六倍为另一异构体的六倍 NCOC2H5
3、CH3NCCH3OC2H5H3CCOCH2CH2ONCH3CH3CH3NOCOCH3H3CH3CCH3NOCOCH3CH3CH3CH3相当于胆碱伸展构象,活性强相当于胆碱伸展构象,活性强 l烃链同系化:改变油水分配系数,从而改变了烃链同系化:改变油水分配系数,从而改变了体内的吸收、分布及排泄等性质。体内的吸收、分布及排泄等性质。l环的大小改变:影响构象优势、改变基团间空环的大小改变:影响构象优势、改变基团间空间的相互关系,干扰与受体的最佳结合。间的相互关系,干扰与受体的最佳结合。l环位置异构体:改变环电荷分布(芳环)环位置异构体:改变环电荷分布(芳环);影响影响分子与相应受体的结合。分子与相应
4、受体的结合。lN-甲基、乙基、丙基,活性增强甲基、乙基、丙基,活性增强lN-正丁基正丁基,无活性,无活性R=H CH3 C2H5 C3H7nC4H9n去甲阿扑吗啡NOHHOHR选择性的选择性的5-HT2受体激动剂受体激动剂 NHOHCH2CH2NH2NHCH2CH2NH2Ol一个有机手性分子的所有立体异构体往往都显示出广泛、一个有机手性分子的所有立体异构体往往都显示出广泛、不同的生理活性,而且是不可预测的。不同的生理活性,而且是不可预测的。NFNOCOOHOCH3HNH3Cl抑酶活性:抑酶活性:S-(-)-(-)-体是体是R-(+)-(+)-体的体的9.3倍,是消旋体的倍,是消旋体的1.3倍。
5、抑菌活性倍。抑菌活性S体强于体强于R体体8-128倍。倍。l己烯雌酚己烯雌酚E-型异构体的活性比型异构体的活性比Z-型异构体强型异构体强10倍倍OHOHOHOH反式反式(E-型型)顺式顺式(Z-型型)l确定结构复杂的先导分子中的活性必需结构部确定结构复杂的先导分子中的活性必需结构部分,得到结构简单的类似物。即先导分子降解、分,得到结构简单的类似物。即先导分子降解、修饰的某些碎片。修饰的某些碎片。ABCDE去E环NH3CHOABCD吗吗啡啡吗吗啡啡烃烃类类(那那洛洛啡啡尔尔)作作用用强强4 4倍倍ABD去C环NH3CH3CCH3CH3HO苯苯吗吗喃喃类类(喷喷他他佐佐新新)几几乎乎无无成成瘾瘾性
6、性H3CNCOOC2H5DA去B环 哌哌替替定定镇镇痛痛作作用用为为吗吗啡啡的的1 1/5 5ONH3CHOOHl多肽链螺旋结构中二个连续螺圈的距离为多肽链螺旋结构中二个连续螺圈的距离为5.35。多肽链伸展到最长时相邻二个肽键距离为多肽链伸展到最长时相邻二个肽键距离为3.61。5.385.38NNONO3.617.26.模仿药物模仿药物l每一个新颖结构药物问世每一个新颖结构药物问世对其结构进行修饰对其结构进行修饰和改造和改造具有类似作用的药物(模仿药物)具有类似作用的药物(模仿药物)l省时省钱、不受专利权限制省时省钱、不受专利权限制l开发新药的重要途径之一开发新药的重要途径之一l优点:优点:低
7、成本、活性或生物利用度超过已上市低成本、活性或生物利用度超过已上市药物药物l据统计,在据统计,在1975-1994年的年的20年间共上市的年间共上市的1061个个新药中,新药中,“me too”药物就占了药物就占了76%。可见新药的。可见新药的模仿性创新一直是新药研究开发的一条主要途径。模仿性创新一直是新药研究开发的一条主要途径。l这种开发新药的短线策略国外成功的例子很多。这种开发新药的短线策略国外成功的例子很多。l如当年寻找抑制胃酸分泌、治疗消化道溃疡药物时,如当年寻找抑制胃酸分泌、治疗消化道溃疡药物时,通过抑制组胺通过抑制组胺H2受体展开深入研究,花费大量人受体展开深入研究,花费大量人力物
8、力,历经漫长过程,研制成功了力物力,历经漫长过程,研制成功了西咪替丁西咪替丁l之后不出数年,一批之后不出数年,一批“me-too药药”纷纷上市,其研纷纷上市,其研究费用远低于西咪替丁。究费用远低于西咪替丁。l从结构比较可以看出,兰索拉唑是奥美拉唑的结构从结构比较可以看出,兰索拉唑是奥美拉唑的结构类似物,属类似物,属“me-too药药”。l从专利的保护范围可以看出,兰索拉唑与奥美拉唑从专利的保护范围可以看出,兰索拉唑与奥美拉唑除了一个氟取代的烷基外,几乎完全相同。除了一个氟取代的烷基外,几乎完全相同。l说明它是在充分研究奥美拉唑的保护范围基础上,说明它是在充分研究奥美拉唑的保护范围基础上,在不侵
9、犯专利权的前提下进行的在不侵犯专利权的前提下进行的专利边缘创新专利边缘创新。NOCH3H3CCH3CH2SONNOCH3NOCH2CF3CH3CH2SONNHH奥奥美美拉拉唑唑(A As st tr ra a,1 19 98 88 8年年)兰兰索索拉拉唑唑(武武田田,1 19 99 91 1年年)l 1994年默克上市了第一个血管紧张素年默克上市了第一个血管紧张素受体拮抗受体拮抗剂洛沙坦剂洛沙坦l1996年汽巴年汽巴-嘉基(诺华)即上市了缬沙坦嘉基(诺华)即上市了缬沙坦l1997年史克年史克-必成上市了爱普沙坦,山洛菲上市了必成上市了爱普沙坦,山洛菲上市了依布沙坦,武田上市了垻地沙坦,依布沙坦
10、,武田上市了垻地沙坦,l美国家庭产品公司的美国家庭产品公司的tasosatan也完成了也完成了期临床,期临床,等待批准上市。等待批准上市。l现在西方上市一个全新结构药物后现在西方上市一个全新结构药物后3-4年,日年,日本即可上市其本即可上市其“me-too”药。药。l如葛兰素如葛兰素1990年上市了年上市了5-HT3受体阻断剂类止受体阻断剂类止吐药昂丹司琼吐药昂丹司琼l日本即于日本即于1994年上市其年上市其“me-too药药”阿扎司琼阿扎司琼l1996年又上市了另一个同类药年又上市了另一个同类药ramosetronl瑞士山道士公司也于瑞士山道士公司也于1994年上市了年上市了“me-too药
11、药”托派司琼托派司琼l澳大利亚也于澳大利亚也于1998年上市了多拉司琼年上市了多拉司琼l日本在日本在“me-too药药”的研究上已取得了巨大的成功。的研究上已取得了巨大的成功。l以二氢吡啶类钙拮抗剂为例,自从以二氢吡啶类钙拮抗剂为例,自从1975年上市第一年上市第一个二氢吡啶类钙拮抗剂硝苯地平后,日本即积极研个二氢吡啶类钙拮抗剂硝苯地平后,日本即积极研究结构类似的药物,究结构类似的药物,1981年山之内公司上市了世界年山之内公司上市了世界上第二个二氢吡啶类钙拮抗剂尼卡地平。上第二个二氢吡啶类钙拮抗剂尼卡地平。l德国拜尔到德国拜尔到1985年才上市尼莫地平。此后,从年才上市尼莫地平。此后,从19
12、89年至年至1996年,日本几乎每年上市一个二氢吡啶类钙年,日本几乎每年上市一个二氢吡啶类钙拮抗剂,到拮抗剂,到1997年,全世界共上市二氢吡啶类钙拮年,全世界共上市二氢吡啶类钙拮抗剂抗剂17个,其中日本公司开发的占了将近一半。个,其中日本公司开发的占了将近一半。l由于日本重视由于日本重视“me-too药药”研究,所以每年上研究,所以每年上市的新药数增加很快。市的新药数增加很快。l1984年上市新药数居世界年上市新药数居世界第四第四,1985年仅次于年仅次于美国居美国居第二位第二位,从,从1986-1995年,日本每年上年,日本每年上市新药数居市新药数居世界首位世界首位。l从从引进到模仿引进到
13、模仿,再从,再从模仿到创新模仿到创新,是日本制药,是日本制药工业由弱变强的成功经验。工业由弱变强的成功经验。l“me-too药物药物”研究中使用的主要技术手段多研究中使用的主要技术手段多为运用先导物优化的原理方法和技术。为运用先导物优化的原理方法和技术。l研究先导物性质研究先导物性质:结构、理化性质、作用机制、:结构、理化性质、作用机制、药效、副作用、毒性的类型和大小、体内过程、药效、副作用、毒性的类型和大小、体内过程、相关代谢物相关代谢物l明确优化目的,确定修饰目标明确优化目的,确定修饰目标 不足不足针对性优化修饰针对性优化修饰模仿优化前提模仿优化前提l最小修饰原则最小修饰原则:优先设计先导
14、物仅作微小变化:优先设计先导物仅作微小变化的类似物,经简单有机反应获得的类似物,经简单有机反应获得l运用与先导物相关的生化知识运用与先导物相关的生化知识l经济学评估经济学评估(合成路线、合成原料)(合成路线、合成原料)l非手性改造非手性改造:去掉手性中心又保持活性的设计:去掉手性中心又保持活性的设计会减少研究工作量。会减少研究工作量。模仿优化原则模仿优化原则l两个相同的或不同的药物经共价键连接,缀合成两个相同的或不同的药物经共价键连接,缀合成新的分子,称为孪药。新的分子,称为孪药。l早在早在19世纪中叶,人们就设计将两个药物的基本世纪中叶,人们就设计将两个药物的基本结构拼合在一个分子中,以期获
15、得毒副作用减少,结构拼合在一个分子中,以期获得毒副作用减少,药理效应增加的新药。药理效应增加的新药。l生物化学、分子药理学和有机合成化学等相关学生物化学、分子药理学和有机合成化学等相关学科的发展,逐渐将这种方法称之为拼合原理科的发展,逐渐将这种方法称之为拼合原理。l定义定义:将两种药物的结构拼合在一个分子内,或:将两种药物的结构拼合在一个分子内,或将两者的药效基团兼容在一个分子中,使形成的将两者的药效基团兼容在一个分子中,使形成的药物或兼具两者的性质,强化药理作用,减少各药物或兼具两者的性质,强化药理作用,减少各自的毒副作用;或使两者发挥各自的活性,协同自的毒副作用;或使两者发挥各自的活性,协
16、同地完成治疗过程。地完成治疗过程。l利用拼合原理形成的新分子,一般在利用拼合原理形成的新分子,一般在体外无生物体外无生物活性活性,而进入体内后,经相关酶的酶促分解后才,而进入体内后,经相关酶的酶促分解后才能发挥相应的药理作用。因此,拼合原理从某种能发挥相应的药理作用。因此,拼合原理从某种意义上讲属意义上讲属前药前药的范畴。的范畴。l同孪药同孪药:由两个相同药效结构单位或药效基团由两个相同药效结构单位或药效基团结合而成。可是对称分子亦可是不对称分子。结合而成。可是对称分子亦可是不对称分子。l异孪药异孪药:由两个不同药效结构单位或药效基团:由两个不同药效结构单位或药效基团结合而成的孪药称为异孪药。
17、异孪药是不对称结合而成的孪药称为异孪药。异孪药是不对称分子。分子。l孪药的两个药效单位的结合形式,主要有链状孪药的两个药效单位的结合形式,主要有链状结合,相互直接结合和相互重叠结合,间隔基结合,相互直接结合和相互重叠结合,间隔基团可以是单链、聚合物链、芳环等。团可以是单链、聚合物链、芳环等。A+A/BA/BA链状结合A/BA直接结合A A/B相互重叠结合NNH2NHNNHNl两分子的胆碱酯酶抑制剂他克林经两分子的胆碱酯酶抑制剂他克林经7个亚甲基个亚甲基相连接,得到同孪药物,其抗胆碱酯酶活性强相连接,得到同孪药物,其抗胆碱酯酶活性强于他克林于他克林1000倍倍。可认为两个吖啶环以适宜的。可认为两
18、个吖啶环以适宜的距离同时结合于胆碱酯酶活性部位的两个腔内距离同时结合于胆碱酯酶活性部位的两个腔内 NHOOOOH3CNO2H3CCH3OOHNH3CCH3OOCH3O2Nl结构对称的双结构对称的双-1,4-二氢吡啶类化合物的活性是二氢吡啶类化合物的活性是硝苯地平的硝苯地平的10倍。倍。l阿斯匹林阿斯匹林-对乙酰氨基酚的拼合对乙酰氨基酚的拼合NHOCCOCH3OOCOCH3目的:降低毒副作用目的:降低毒副作用l目的:目的:避免烟酸颜面潮红、皮肤瘙痒及刺激胃肠等副避免烟酸颜面潮红、皮肤瘙痒及刺激胃肠等副作用,增强降血脂活性,延长作用时间。作用,增强降血脂活性,延长作用时间。ORROROOROROR
19、R=CONl目的:目的:从不同的环节增强杀菌活性从不同的环节增强杀菌活性SNCH2NOCONHNSOCH2OCOOHCONOCH2CH2FFNNCH3l肼呔嗪与肼呔嗪与-受体阻断剂(洛尔类药物)制得的受体阻断剂(洛尔类药物)制得的孪药普齐地洛具有血管扩张和孪药普齐地洛具有血管扩张和-受体阻断的双受体阻断的双重作用。重作用。NNHNNH2OOHNHCH3H3CCH3CH3OONO2OOl非甾体抗炎药长期应用易引起胃肠道溃疡、出血,甚至穿孔非甾体抗炎药长期应用易引起胃肠道溃疡、出血,甚至穿孔等副作用;而等副作用;而NO能抑制胃酸分泌,促进粘液分泌,调节粘能抑制胃酸分泌,促进粘液分泌,调节粘膜血流量
20、,直接促进溃疡愈合。膜血流量,直接促进溃疡愈合。l根据上述原理,在酮洛芬的结构上偶联一个能产生根据上述原理,在酮洛芬的结构上偶联一个能产生NO的部的部分(引入硝酸酯类分(引入硝酸酯类NO供体),制成孪药,所得化合物在体供体),制成孪药,所得化合物在体内释放原药和内释放原药和NO,抗炎活性与原药相当,但胃肠道的副作,抗炎活性与原药相当,但胃肠道的副作用明显小于原药。用明显小于原药。lIrving Langmuir(1919)lGrimm(1925)s Hydride Displacement Lawl电子等排的定义:简单地讲,具有相等价电子等排的定义:简单地讲,具有相等价电子的原子或基团称为电子
21、等排体。电子的原子或基团称为电子等排体。l一价电子等排体:一价电子等排体:H-X-CH3 l二价电子等排体:二价电子等排体:-S-O-CH2-l三价电子等排体:三价电子等排体:-N=-CH=-P=生物电子等排体:凡具有相似的理化性质,又能生物电子等排体:凡具有相似的理化性质,又能产生相似或相反的生物活性的原子或基团。产生相似或相反的生物活性的原子或基团。l分类:分类:l经典的生物电子等排体经典的生物电子等排体l非经典的生物电子等排体非经典的生物电子等排体Target Identificationand ValidationLead IdentificationLead Optimization
22、PreclinicalDevelopmetClinical DevelopmentBioisosterismShapeElectronic DistributionLipid solutionWater solutionpKaChemical reactivityHydrogen BondingSizeEight Parameters1.Structural.If the moiety that is replaced by a bioisostere has a structural role in holding other functionalities in a particular
23、geometry,then size,shape,and hydrogen bonding will be important.ShapeHydrogen bindingSizeEight Parameters2.Receptor interactions.If the moiety replaced is involved in a specific with a receptor or enzyme,then all of the parameters except lipid and water solubility will be important.ShapeElectronic D
24、istributionpKaChemical reactivityHydrogen BondingSizeEight Parameters3.Pharmacokinetics.If the moiety replaced is necessary for absorption,transport,and excretion of the compound then lipophilicity,hydrophilicity,pKa,and hydrogen bonding will be important.Lipid solutionWater solutionpKaHydrogen Bond
25、ingEight Parameters4.Metabolism.If the moiety replaced is involved in blocking or aiding metabolism,then the chemical reactivity will be important.Chemical reactivityEight Parameters1.经典的生物电子等排体经典的生物电子等排体la.一价电子等排体一价电子等排体NHHNOOHNHHNOOFH2NSO2NHCONHC4H9H3CSO2NHCONHC4H9ClSO2NHCONHC3H7氨磺丁脲甲磺丁脲氯磺丙脲NNNNCH
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