第10章微生物的分类和鉴定课件.ppt

1、一、种以上的通用分类单元一、种以上的通用分类单元二、二、微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位 三、三、各大类微生物的分类系统纲要各大类微生物的分类系统纲要四、四、微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法l目前已知的微生物种数为目前已知的微生物种数为15 20万种，万种，对它们进行分类、鉴定和命名等工作才对它们进行分类、鉴定和命名等工作才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廓。能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廓。l生物种数：生物种数：150万余种万余种l是一门按微生物的亲缘关系把它们安排是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon

2、）的科学。）的科学。l分类、鉴定、命名。分类、鉴定、命名。l分类的任务：解决从个别到一般的问题。分类的任务：解决从个别到一般的问题。通过收集大通过收集大量有关个体描述的资料，经过科学的归纳，整理成一量有关个体描述的资料，经过科学的归纳，整理成一个科学的分类系统。个科学的分类系统。l鉴定的任务：从一般到个别的过程。鉴定的任务：从一般到个别的过程。通过详细观察和通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各种性状特征，然后描述一个未知名称纯种微生物的各种性状特征，然后查找现成的分类系统，以达到知类、辨名的目的。查找现成的分类系统，以达到知类、辨名的目的。l命名的任务：命名的任务：为一个新发现的微生物

3、按国际命名法规为一个新发现的微生物按国际命名法规给以一个新的学名。给以一个新的学名。l因此，分类是一项宏观的战略性工作，鉴定是一项微因此，分类是一项宏观的战略性工作，鉴定是一项微观的战术性工作，而命名则是一项创新的开拓性工作。观的战术性工作，而命名则是一项创新的开拓性工作。l经典分类学经典分类学l微生物系统学（微生物系统学（Microbial Systematics）分类的级别分类的级别一、种以上的系统分类单元一、种以上的系统分类单元二、微生物的学名二、微生物的学名（一）七级分类单元（一）七级分类单元 种以上的系统分类单元（种以上的系统分类单元（taxon或或category，也称分类阶元或分

4、类，也称分类阶元或分类群）自上而下依次可分七级，即：群）自上而下依次可分七级，即：界界Kingdom（拉：（拉：Regnum）门门Phylum（拉：（拉：Phylum）或）或Division（拉：（拉：Divisio）纲纲Class（拉：（拉：Classis）目目Order（拉：（拉：Ordo）科科Family（拉：（拉：Familia）属属Genus（拉：（拉：Genus）种种Species（拉：（拉：Species）在这七级中，在必要时每一级都可有若干辅助单元，故共可在这七级中，在必要时每一级都可有若干辅助单元，故共可有十余级。有十余级。l种：最基本得分类单位种：最基本得分类单位l微生物的

5、种：微生物的种：是一个基本分类单位，它是一大是一个基本分类单位，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。l因为大多数原核生物的细胞形态过于简单，在因为大多数原核生物的细胞形态过于简单，在高等生物中可用于定义种的几个主要性状，在高等生物中可用于定义种的几个主要性状，在微生物中是无法使用的。因此，在微生物尤其微生物中是无法使用的。因此，在微生物尤其在原核生物中，种的定义极其难定，至今还找在原核生物中，种的定义极其难定，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。不到一个公认的、明

6、确的种的定义。l在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株来作具体标本，这一典型菌株就是该种的菌株来作具体标本，这一典型菌株就是该种的模式种。模式种。l必须是一个种的具体活标本，是该菌种的活培必须是一个种的具体活标本，是该菌种的活培养物，它应保持着纯培养状态，在性状上必须养物，它应保持着纯培养状态，在性状上必须与原初描述密切相符。与原初描述密切相符。l模式菌株可用多种方式指定，例如可由原始作模式菌株可用多种方式指定，例如可由原始作者指定，如原始菌株已丧失则可再提一个新的者指定，如原始菌株已丧失则可再提一个新的模式，等等。模式，等等。l权威性的分类、鉴定

7、手册中从未记载过权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分类并鉴定过的微生物。的一种新分类并鉴定过的微生物。l当按当按“法规法规”命名并进行发表时，应在命名并进行发表时，应在其学名后附其学名后附“spnov”或或“novsp”（species nova的缩写）。的缩写）。l在新种发表前，其模式菌株的培养物就在新种发表前，其模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的菌种保藏机构中，应存放在一个永久性的菌种保藏机构中，并允许人们能从中取得。并允许人们能从中取得。分别列举细菌、放线菌和真菌各一种。l种种：亲缘关系较近的微生物有机体的集合，它们在进化发育阶段上有一定的：亲缘关系较近的微生物有机体的集合，

8、它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性同源性70%l变种变种：从自然界分离到的微生物纯种，如果与典型种之间存在某些特征的差：从自然界分离到的微生物纯种，如果与典型种之间存在某些特征的差别，而这些特征又是稳定遗传的，则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯别，而这些特征又是稳定遗传的，则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽孢杆菌的黑色变种。草芽孢杆菌的黑色变种。l小种（亚种）小种（亚种）：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。l型：型：自然界存在的差异较小的

9、同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。l菌株（品系）菌株（品系）：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。l群：群：有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群类型统称为一个群 每一种微生物都有自己的名字，包每一种微生物都有自己的名字，包括俗名和学名两种。括俗名和学名两种。l普通的、通俗的、地区性的名字，

10、具有简明和大众化的优点，普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范围局限。例如：但往往涵义不够确切，易于重复，使用范围局限。例如：l“结核杆菌结核杆菌”Mycobacterium tuberculosis（结核分枝杆（结核分枝杆菌）；菌）；l“绿脓杆菌绿脓杆菌”Pseudomonas aeruginosa（铜绿假单胞菌）；（铜绿假单胞菌）；l“白色念珠菌白色念珠菌”Candida albicans（白色假丝酵母）；（白色假丝酵母）；l“金葡菌金葡菌”Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）；（金黄色葡萄球菌）；l“丙丁菌丙丁菌

11、”Clostridium acetobutylicum（丙酮丁醇梭菌）；（丙酮丁醇梭菌）；l“红色面包霉红色面包霉”Neurospora crassa（粗糙脉孢菌）。（粗糙脉孢菌）。l一个菌种的科学名称，用拉丁词或拉丁一个菌种的科学名称，用拉丁词或拉丁化的词组成。在出版物中应排成斜体字，化的词组成。在出版物中应排成斜体字，在书写或打字时，应在学名之下划一横在书写或打字时，应在学名之下划一横线，以表示它，应是斜体字母。线，以表示它，应是斜体字母。l林奈的双名法林奈的双名法通常由一个属名加一个种通常由一个属名加一个种名加词构成。名加词构成。属名词首需大写，种名加词字首需小写。l出现在分类学文献中的

12、学名，在此两者之后往往还加上首次定名人（用括号括住）、现名定名人和现名定名年份，但在一般使用时，这几个部分总是省略的。即：例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌）Escherichia coli（Migula）Castellani et Chalmers 1919例2：枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌）Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872例3：结核分枝杆菌Mycobacterium tuberculosis（Zopf）Lehmann et Newmann 1896例4：丙酮丁醇梭菌Clostridium acetobutylicum McCoy，Fred，Peters

13、on et Hastings 1926例5：铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa（Schroeter）Migula 1920例6：金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884l当该种是一个亚种当该种是一个亚种（subspecies，简称“subsp”，排正体字）或变种变种（variety，简称“var”，排正体字）时（在少数情况下），学名就应按学名就应按“三三名法名法”构成构成，即：例例1：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种Bacillus thuringiensis subspgalleria 例例2：椭圆酿酒酵母（

14、或酿酒酵母椭圆变种）：椭圆酿酒酵母（或酿酒酵母椭圆变种）Saccharomyces cerevisiae varellipsoideus 例例3：脆弱拟杆菌卵形亚种：脆弱拟杆菌卵形亚种Bacteroides fragilis subspovatusl是一个表示该种微生物主要特征的名词或用作是一个表示该种微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数，其第一个字母应大写。名词的形容词，单数，其第一个字母应大写。其词源可来自拉丁词、希腊词或其他拉丁化的其词源可来自拉丁词、希腊词或其他拉丁化的外来词，也可以组合方式形成。例如：外来词，也可以组合方式形成。例如：l由单个希腊词干组成的由单个希腊词干组成的

15、Clostridium（梭菌属）；（梭菌属）；l由两个拉丁词干组成的由两个拉丁词干组成的Lactobacillus（乳杆菌（乳杆菌属）；属）；l由拉丁和希腊词干混合组成的由拉丁和希腊词干混合组成的Flavobacterium（黄杆菌属）；（黄杆菌属）；l由拉丁化的人名组成的由拉丁化的人名组成的Shigella（志贺氏菌属）（志贺氏菌属）等。等。1、属（或亚属）名、属（或亚属）名l在前后有两个或数个学名排在一起，且在其属名相在前后有两个或数个学名排在一起，且在其属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个、两同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个、两个或三个字母，其后加一点。如：个或三个字母

16、，其后加一点。如：lBacillus（芽孢杆菌属）可写成（芽孢杆菌属）可写成“B”或或“Bac”；l Pseudomonas（假单胞菌属）可缩写成（假单胞菌属）可缩写成“P”或或“Ps”；lAspergillus（曲霉属）可写成（曲霉属）可写成“A”或或“Asp”等。等。l按规定，学名均应按拉丁字母发音规则按规定，学名均应按拉丁字母发音规则发音。事实上，英、美等国学者经常按发音。事实上，英、美等国学者经常按自己的文种来对学名发音，且影响颇大。自己的文种来对学名发音，且影响颇大。l代表一个种的次要特征，由拉丁词、希腊词或拉丁化的外来代表一个种的次要特征，由拉丁词、希腊词或拉丁化的外来词所组成。词

17、所组成。l字首一律小写（即使它是由某一人名衍化而来，首字母也不字首一律小写（即使它是由某一人名衍化而来，首字母也不应大写）。应大写）。l可以是一个形容词或名词。如果是形容词，其性必须与其形可以是一个形容词或名词。如果是形容词，其性必须与其形容的属名的性相一致，例如在容的属名的性相一致，例如在Staphylococcu saureus（金黄（金黄色葡萄球菌）中的属名与种名均为阳性词。色葡萄球菌）中的属名与种名均为阳性词。l在实际工作中，有时筛选到一个有用的菌种，其属名很易确在实际工作中，有时筛选到一个有用的菌种，其属名很易确定，但种名还未确定。在这种情况下，当发表论文或进行学定，但种名还未确定。

18、在这种情况下，当发表论文或进行学术交流时，其种的加词暂时可以用术交流时，其种的加词暂时可以用“sp”（正体字）代替。（正体字）代替。例如：例如：l“Bacillus sp”即表示一个尚未定出种名的芽孢杆菌，可即表示一个尚未定出种名的芽孢杆菌，可译为译为“一种芽孢杆菌一种芽孢杆菌”；l“Bacillus spp”（spp为为species复数的简写）表示一批复数的简写）表示一批尚未定种名的芽孢杆菌，故可译为尚未定种名的芽孢杆菌，故可译为“若干芽孢杆菌若干芽孢杆菌”。一、生物的界级分类学说一、生物的界级分类学说二、三域学说及其发展二、三域学说及其发展 对生物究竟分几界的问题，在人类发展对生物究竟分

19、几界的问题，在人类发展历史上存在着一个由浅入深、由简至繁、历史上存在着一个由浅入深、由简至繁、由低级至高级的认识过程。由低级至高级的认识过程。l三域：细菌域（真细菌域）、古生菌域三域：细菌域（真细菌域）、古生菌域（古细菌域）、真核生物域。（古细菌域）、真核生物域。l古生菌域的微生物：都是一些极端微生古生菌域的微生物：都是一些极端微生物。包括：嗜热菌、嗜热嗜酸菌、嗜盐物。包括：嗜热菌、嗜热嗜酸菌、嗜盐菌、嗜压菌以及产甲烷菌。菌、嗜压菌以及产甲烷菌。16S rRNA系统发育树系统发育树一、一、Bergey氏原核生物分类系统纲要氏原核生物分类系统纲要二、真菌的分类系统纲要二、真菌的分类系统纲要伯杰氏

20、系统细菌学手册伯杰氏系统细菌学手册（简称（简称系统手册系统手册）包括古细菌在内的所有细菌放在原核生物界，包括古细菌在内的所有细菌放在原核生物界，细菌分类鉴定的依据。细菌分类鉴定的依据。薄壁菌门：指革兰氏阴性、薄壁类型的原核生物。薄壁菌门：指革兰氏阴性、薄壁类型的原核生物。厚壁菌门：指革兰氏阳性、细胞壁厚而硬型的原核厚壁菌门：指革兰氏阳性、细胞壁厚而硬型的原核 生物。生物。柔膜菌门：指无细胞壁、细胞柔软的原核生物。柔膜菌门：指无细胞壁、细胞柔软的原核生物。疵壁菌门：指细胞壁中缺乏常规肽聚糖成分的原核疵壁菌门：指细胞壁中缺乏常规肽聚糖成分的原核 生物。生物。将至今已记载的将至今已记载的4935种原

21、核生物分为：种原核生物分为：1、古生菌界、古生菌界包括：包括：2门、门、5组、组、8纲、纲、11目、目、17科、科、63属，共属，共208 个种。个种。2、细菌界、细菌界包括：包括：16门、门、26组、组、27纲、纲、62目、目、163科、科、814属，属，共共4 727个种。个种。l菌物与真菌两者之间的关系菌物与真菌两者之间的关系：把菌物列入真核生物域的把菌物列入真核生物域的3个界中，即：个界中，即：一、微生物分类鉴定中的经典方法一、微生物分类鉴定中的经典方法 微生物分类鉴定技术的四个不同水平微生物分类鉴定技术的四个不同水平1、细胞的形态和习性水平、细胞的形态和习性水平 观察细胞的形态特征、

22、运动性、酶反应、营养要求和生长条观察细胞的形态特征、运动性、酶反应、营养要求和生长条件等。件等。2、细胞组分水平、细胞组分水平 细胞组成成分例如细胞壁成分，细胞氨基酸库，脂类，醌类，细胞组成成分例如细胞壁成分，细胞氨基酸库，脂类，醌类，光合色素等的分析。光合色素等的分析。3、蛋白质水平、蛋白质水平 氨基酸序列分析、凝胶电泳和各种免疫标记技术。氨基酸序列分析、凝胶电泳和各种免疫标记技术。4、核酸水平、核酸水平 核酸分子杂交，核酸分子杂交，G+Cmol值的测定，遗传信息的转化和转值的测定，遗传信息的转化和转导，导，16S或或18S rRNA寡核苷酸序列分析，重要基因序列分析寡核苷酸序列分析，重要基

23、因序列分析和全基因组测序等。和全基因组测序等。经典的分类方法经典的分类方法 在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指标尚为细胞的形态和习性，这类方法称作经典的分类标尚为细胞的形态和习性，这类方法称作经典的分类鉴定方法。是相对于现代的分类鉴定方法而言的。鉴定方法。是相对于现代的分类鉴定方法而言的。微生物分类鉴定的经典方法局限于利用常规的方微生物分类鉴定的经典方法局限于利用常规的方法来鉴定微生物细胞的形态、习性和构造，主要是在法来鉴定微生物细胞的形态、习性和构造，主要是在第一个水平上进行的。第一个水平上进行的。微生物分类鉴定理论和方法的发展：后四个水平微

24、生物分类鉴定理论和方法的发展：后四个水平 化学分类学化学分类学 数值分类学数值分类学1、获得该微生物的纯种培养物；、获得该微生物的纯种培养物；2、测定一系列必要的鉴定指标；、测定一系列必要的鉴定指标；3、查找权威性的鉴定手册。、查找权威性的鉴定手册。指长期以来在微生物常规鉴定中普遍采指长期以来在微生物常规鉴定中普遍采用的一些形态、生理、生化、生态、生用的一些形态、生理、生化、生态、生活史、血清学反应等指标。活史、血清学反应等指标。霉菌等形体较大的真菌霉菌等形体较大的真菌以形态特征为主以形态特征为主放线菌和酵母菌放线菌和酵母菌形态和生理特征并用形态和生理特征并用细菌细菌形态、生理、生化遗传等指标

25、形态、生理、生化遗传等指标病毒病毒电子显微镜、生化、免疫、致病性电子显微镜、生化、免疫、致病性1、API细菌数值鉴定系统细菌数值鉴定系统2、“Enterotube”系统系统3、“Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统全自动和手动细菌鉴定系统能同时测定能同时测定20项以上生化指标项以上生化指标 在在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。自动化、快速自动化、快速 可鉴定细菌有可鉴定细菌有11401140多多种、酵母菌种、酵母菌267267种、目前已种、目前已经可用于丝状真菌。经可用于丝状真菌。每个孔中

26、含有每个孔中含有不同的底物不同的底物菌悬液或菌悬液或无菌水无菌水（一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型（一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型（二）细胞化学成分用作鉴定指标（二）细胞化学成分用作鉴定指标（三）数值分类法（统计分类法）（三）数值分类法（统计分类法）l每一种微生物均有其自己特有的、稳定的DNA成分和结构，不同微生物间DNA成分和结构的差异程度代表着它们间亲缘关系的远近。因此，测定每种微生物DNA的若干重要数据，是微生物鉴定中极其重要的指标。lDNA碱基比例指（碱基比例指（G+C）mol值，简称值，简称“GC比比”，即指鸟，即指鸟嘌呤（嘌呤（G）和胞嘧啶（）和胞嘧啶（C）在整个）在整个DNA中

27、的摩尔百分比。中的摩尔百分比。l在不同细菌中，在不同细菌中，G+Cmol值的变化幅度较大（值的变化幅度较大（3075），），而脊椎动物的种间则较一致（而脊椎动物的种间则较一致（4045）。）。l亲缘关系相近的种，其核苷酸的排列顺序也相近，因此其亲缘关系相近的种，其核苷酸的排列顺序也相近，因此其G+Cmol值也接近。值也接近。G+Cmol值不同的两个种，它们的亲值不同的两个种，它们的亲缘关系就必然较远。缘关系就必然较远。l一般地说，同一种微生物，其种内各菌株间的一般地说，同一种微生物，其种内各菌株间的G+Cmol值值可相差可相差2.54.0，相差过少（低于，相差过少（低于2），则没有分类学上），

28、则没有分类学上的意义；若相差在的意义；若相差在5以上，可认为已是两个不同的种了；要以上，可认为已是两个不同的种了；要是相差超过是相差超过10，则可考虑它们是属于不同的属。，则可考虑它们是属于不同的属。l因此，因此，G+Cmol值的用途主要在于排除不确切的分类单元，值的用途主要在于排除不确切的分类单元，而不是用它去建立一个新的分类单元。而不是用它去建立一个新的分类单元。l亲缘关系越近的微生物，其碱基顺序就越接近，反之亦然。一般地说，G+Cmol值相差1，则DNA碱基序列的共同区域就约减少9；若G+Cmol值的差异超过10，则DNA碱基序列的共同区就极少了。l若要确定它们确属同一个种，就必须通过核

29、酸若要确定它们确属同一个种，就必须通过核酸分子间的杂交。分子间的杂交。l从实验得知，各菌株DNA的同源性在70以上者，属于种的水平；在20以上者，则可能属于属的水平。l通过分析原核或真核细胞中的rRNA寡核苷酸序列同源性程度，以确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法。l16SrRNA和18SrRNA普遍存在于原核生物和真核生物细胞中，故可用以比较它们在进化上的相互联系。rRNA被称作细胞中的“活化石”。掌握某微生物全部遗传信息。1细胞壁的化学组分细胞壁的化学组分 2全细胞水解液的糖型全细胞水解液的糖型 3磷酸类脂成分的分析磷酸类脂成分的分析4枝菌酸的分析枝菌酸的分析 5醌类的分析醌类的分析

30、6气相色谱技术用于微生物鉴定气相色谱技术用于微生物鉴定 利用细胞壁组分进行细菌化学分类工作。为用放线菌的形态特征和化学组分相结合的方法划分属提供了科学的依据。为用放线菌的形态特征和化学组分相结合的方法划分属提供了科学的依据。现以放线菌为例，其糖型可分四类：现以放线菌为例，其糖型可分四类：位于细菌、放线菌的细胞膜上的磷酸类脂成分，位于细菌、放线菌的细胞膜上的磷酸类脂成分，在不同属中有所不同，故可用于鉴别放线菌属在不同属中有所不同，故可用于鉴别放线菌属的重要指标之一。的重要指标之一。l枝菌酸存在于诺卡氏菌属、分枝杆菌属和棒杆枝菌酸存在于诺卡氏菌属、分枝杆菌属和棒杆菌属菌属3属称作属称作“诺卡氏菌形

31、放线菌诺卡氏菌形放线菌”中，它们中，它们在形态、结构和细胞壁上难以区分，但它们所在形态、结构和细胞壁上难以区分，但它们所含的枝菌酸却差别明显，分别含有含的枝菌酸却差别明显，分别含有80、50、30个碳原子，可对它们分属。个碳原子，可对它们分属。l在细菌和放线菌中所含有甲基萘醌（VK）和泛醌（辅酶Q）。在放线菌分类鉴定上有重要价值。l气相色谱技术可分析微生物细胞组分和代谢产物中的脂肪酸和醇类等成分，对厌氧菌的鉴定十分有用。l是一种依据数值分析的原理、借助现代计算机技术对拟分类是一种依据数值分析的原理、借助现代计算机技术对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似程度进行统计、归类的的微生物对象按大量

32、表型性状的相似程度进行统计、归类的方法。方法。l现代的数值分类学必须借助于电子计算机，因此又称电子计现代的数值分类学必须借助于电子计算机，因此又称电子计算机分类学。算机分类学。l在工作开始时，必须先准备好一批待研究菌株和有关典型菌在工作开始时，必须先准备好一批待研究菌株和有关典型菌种的菌株，它们被称作种的菌株，它们被称作OTU（运筹分类单位，（运筹分类单位，operationaltaxonomicunits）。要用）。要用50个以上甚至几百个特征个以上甚至几百个特征进行比较，且所用特征越多，其结果也就越精确。在比较不进行比较，且所用特征越多，其结果也就越精确。在比较不同菌株时，都要采用相同的可比特征，包括形态的、生理的、同菌株时，都要采用相同的可比特征，包括形态的、生理的、生化的、遗传的、生态的和免疫的特征等。生化的、遗传的、生态的和免疫的特征等。l1、计算两菌株间的相关系数、计算两菌株间的相关系数l2、列出相似度矩阵、列出相似度矩阵l3、将矩阵图转换成树状谱、将矩阵图转换成树状谱