生物化学 第十二章 核酸代谢课件.ppt
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1、四川省精品课程 生物化学第十二章第十二章 核酸代谢核酸代谢四川省精品课程 生物化学1 1.核苷酸是合成核苷酸是合成DNADNA和和RNARNA所必需的前体。所必需的前体。2 2.ATP.ATP是生物体内能量代谢中通用的高能化是生物体内能量代谢中通用的高能化合物,是合物,是联系产能反应和需能反应的主要联系产能反应和需能反应的主要物质。物质。3 3.核苷酸的衍生物是糖类、脂类等核苷酸的衍生物是糖类、脂类等合成中前合成中前体的活化形式体的活化形式。四川省精品课程 生物化学4 4.腺苷酸腺苷酸是许多辅酶如是许多辅酶如NADNAD+、NADPNADP+、FADFAD和和CoASHCoASH的组成成分。的
2、组成成分。5 5.cAMPcAMP、cGMPcGMP等是代谢调节物质。等是代谢调节物质。6 6.有些核苷酸如有些核苷酸如ATPATP、GTPGTP、UTPUTP、CTPCTP是许是许多磷酸激酶的多磷酸激酶的辅酶辅酶。四川省精品课程 生物化学第十二章第十二章 核酸代谢核酸代谢第一节、核苷酸代谢第一节、核苷酸代谢第二节、第二节、DNADNA的生物合成的生物合成第三节、第三节、RNARNA的生物合成的生物合成四川省精品课程 生物化学第一节第一节 核苷酸代谢核苷酸代谢 一、核苷酸的分解代谢一、核苷酸的分解代谢 二、核苷酸的合成代谢二、核苷酸的合成代谢 三、脱氧核糖核苷酸的合成三、脱氧核糖核苷酸的合成四
3、川省精品课程 生物化学 核酸酶核酸酶 核苷酸酶核苷酸酶 核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶 核酸核酸 核苷酸核苷酸 核苷核苷 碱基碱基+戊糖戊糖-1P一一、核苷酸分解代谢核苷酸分解代谢磷酸磷酸核苷水解酶核苷水解酶碱基碱基+戊糖戊糖四川省精品课程 生物化学(一一)核酸酶核酸酶(1)根据对底物的根据对底物的 专一性分为专一性分为(2)根据切割位点分为)根据切割位点分为核糖核酸酶核糖核酸酶(RNase)脱氧核糖核酸酶脱氧核糖核酸酶(DNase)非特异性核酸酶非特异性核酸酶核酸内切酶核酸内切酶(DNase,RNase)核酸外切酶核酸外切酶(蛇毒磷酸二蛇毒磷酸二酶、牛脾磷酸二酯酶酶、牛脾磷酸二酯酶)四川省精品课程
4、 生物化学(二二)限制性内切酶限制性内切酶原核生物中存在着一类能识别外源原核生物中存在着一类能识别外源DNADNA双螺旋中双螺旋中4-84-8个个碱基对所组成的特异的具有二重旋转对称性的碱基对所组成的特异的具有二重旋转对称性的回文序回文序列列,并在此序列的某位点水解,并在此序列的某位点水解DNADNA双螺旋链,产生粘双螺旋链,产生粘性末端或平末端,这类酶称为性末端或平末端,这类酶称为限制性内切酶限制性内切酶。四川省精品课程 生物化学四川省精品课程 生物化学(三)嘌呤的分解代谢(三)嘌呤的分解代谢 不同种类的生物分解嘌呤的能力不同,产物也不同。不同种类的生物分解嘌呤的能力不同,产物也不同。人、灵
5、长类、鸟类、某些爬虫类将嘌呤分解成人、灵长类、鸟类、某些爬虫类将嘌呤分解成尿酸尿酸,其他生物还可将尿酸进一步分解成其他生物还可将尿酸进一步分解成尿囊素、尿囊酸、尿囊素、尿囊酸、尿素、甚至尿素、甚至COCO2 2、NHNH3 3。核酸中的嘌呤主要是核酸中的嘌呤主要是Ade、Gua首先首先脱氨脱氨,分别生成,分别生成次黄嘌呤和黄嘌呤次黄嘌呤和黄嘌呤,再进一步代谢生成,再进一步代谢生成尿酸尿酸。鸟嘌呤脱氨酶鸟嘌呤脱氨酶腺嘌呤核腺嘌呤核苷脱氨酶苷脱氨酶四川省精品课程 生物化学尿酸过多导致痛风(尿酸过多导致痛风(gout)四川省精品课程 生物化学四川省精品课程 生物化学四川省精品课程 生物化学(四)(四
6、)嘧啶的分解代谢嘧啶的分解代谢-丙氨酸丙氨酸四川省精品课程 生物化学-氨基异丁酸氨基异丁酸四川省精品课程 生物化学二、核苷酸的合成代谢二、核苷酸的合成代谢 概述:概述:从头合成从头合成基本途径基本途径 半合成(补救合成)半合成(补救合成)(CO2/NH3/AA/戊糖)戊糖)核苷酸核苷酸 dNDP分解的现成嘌呤、嘧啶分解的现成嘌呤、嘧啶ATP(一)(一)嘌呤核苷酸的合成嘌呤核苷酸的合成嘌呤环中各原子的来源嘌呤环中各原子的来源四川省精品课程 生物化学5P核糖焦磷酸(核糖焦磷酸(PRPPPRPP)次黄嘌呤核苷酸(次黄嘌呤核苷酸(IMP)其他嘌呤核苷酸其他嘌呤核苷酸1 1、主要合成途径、主要合成途径O
7、OHHHOHHNH2HCH2OP 1 1-氨氨 基基-5 5-磷磷 酸酸 核核 苷苷(5 5-磷磷 酸酸 核核 糖糖 胺胺,P PR RA A)PPi 酰胺转移酶谷氨酰胺谷氨酸OOHHHOHHHCH2OOPPOPOOHHHOHOHHHCH2OPAMPATPMg2+磷磷酸酸核核糖糖焦焦磷磷酸酸 (P PR RP PP P)5 5-磷磷酸酸核核糖糖 PRPP合成酶HNHCNCCCNCHNORH2NHCNHCCCNCHNOROH2NH2NCCCNCHNORPPPH2OFH4FH4K+NHH2NCCCNCHNORPHCCH2COOHCOOHHOH2NCCCNCHNORPH2NCHCNCHNRPCH2C
8、NHCHHNRPHNOCH2CNHCHHNRPOOH2OATP,M g2+CO2H2OATPOOHHHOHHHN HCH2POATP,Mg2+Mg2+COH2CNH2OHCOH2CNH2FH4FH4ATPMg2+OOHHHOHHNH2HCH2OP-5 5-次黄嘌呤核苷酸(IMP)-5 5-5 5-甲甲酰酰胺胺基基咪咪唑唑-4 4-甲甲酰酰胺胺核核苷苷酸酸 (F FA AI IC CA AR R)-5 5-5 5-氨氨基基咪咪唑唑-4 4-甲甲酰酰胺胺核核苷苷酸酸(A AI IC CA AR R)环环水水解解酶酶转甲酰基酶N10-甲酰-5 5-5 5-氨氨基基咪咪唑唑-4 4-(N N-琥琥珀珀
9、酸酸)-甲甲酰酰胺胺核核苷苷酸酸(S SA AI IC CA AR R)延胡索酸裂解酶-5 5-5 5-氨氨基基咪咪唑唑-4 4-羧羧酸酸核核苷苷酸酸(C CA AI IR R)-5 5-5 5-氨氨基基咪咪唑唑核核苷苷酸酸(A AI IR R)-5 5-甲甲酰酰甘甘氨氨脒脒核核苷苷酸酸(F FG GA AM M)-5 5-甲甲酰酰甘甘氨氨酰酰胺胺核核苷苷酸酸(F FG GA AR R)天冬氨酸AIR合成酶谷氨酰胺谷氨酸羧化酶甘甘氨氨酰酰胺胺核核苷苷酸酸 (G GA AR R)甘氨酸N5,N10-甲炔转甲酰基酶ADP+PiGAR合成酶 1 1-氨氨基基-5 5-磷磷酸酸核核苷苷(5 5-磷磷酸
10、酸核核糖糖胺胺,P PR RA A)合成酶IMPIMP的合成要点:的合成要点:(1 1)在磷酸核糖分子上)在磷酸核糖分子上逐步合成嘌呤环逐步合成嘌呤环;(2 2)PRPPPRPP(磷酸核糖焦磷酸)(磷酸核糖焦磷酸)是重要的中间代谢物,是重要的中间代谢物,它不仅参与嘌呤核苷酸的从头合成,而且参与嘧啶核它不仅参与嘌呤核苷酸的从头合成,而且参与嘧啶核苷酸的从头合成及两类核苷酸的补救合成。苷酸的从头合成及两类核苷酸的补救合成。(3 3)PRPPPRPP合成酶合成酶和和酰胺转移酶酰胺转移酶为关键酶。为关键酶。IMPAMPXMPH2OATPNADH+H+AspGlnGluGMPGTP腺腺苷苷酸酸代代琥琥珀
11、珀酸酸 (A AM MP PS S)AMPS合成酶AMPS裂裂解解酶酶延胡索酸GMP合合成成酶酶IMP脱脱氢氢酶酶NAD+H2OHNNNNNHR-5-PHNNHNNOR-5-PCHHOOCCH2COOHOIMP是是AMP和和GMP的前体。的前体。ATP和和GTP的生成的生成AMPADPATPATPADPATPADPATPADPATPADPGMPGDPGTP激激酶酶激激酶酶激激酶酶激激酶酶四川省精品课程 生物化学(4)(4)四氢叶酸(四氢叶酸(FHFH4 4)是一碳单位的载体是一碳单位的载体 嘌呤核苷酸合成特点嘌呤核苷酸合成特点(1)(1)先先形成形成IMPIMP,然后在单磷酸的水平上转然后在单
12、磷酸的水平上转变成变成AMPAMP、GMPGMP。(2)IMP(2)IMP合成从合成从5 5-P-P-核糖开始的,在核糖开始的,在ATPATP参参与下先形成与下先形成PRPPPRPP (3)(3)嘌呤的各个原子是在嘌呤的各个原子是在PRPPPRPP的的C C1 1上逐渐上逐渐加上去的。由加上去的。由AspAsp、GlnGln、GlyGly、甲酸、甲酸、COCO2 2 提供提供N N和和C C.四川省精品课程 生物化学2 2、补救合成、补救合成A AP PR RT TA AM MP P+P PP Pi i腺腺嘌嘌呤呤+P PR RP PP P腺腺嘌嘌呤呤磷磷酸酸核核糖糖转转移移酶酶次次黄黄嘌嘌呤
13、呤-鸟鸟嘌嘌呤呤磷磷酸酸核核糖糖转转移移酶酶(H HG GP PR RT T)鸟鸟嘌嘌呤呤+P PR RP PP PG GM MP P+P PP Pi iATP ADPATP ADPAMPAMP腺苷激酶腺苷激酶腺嘌呤核苷腺嘌呤核苷四川省精品课程 生物化学补救合成的生理意义补救合成的生理意义 (1)节省能量及一些氨节省能量及一些氨基酸的消耗基酸的消耗;(2)体内某些组织器官体内某些组织器官(如脑、骨髓等)只(如脑、骨髓等)只能进行嘌呤核苷酸补能进行嘌呤核苷酸补救合成。救合成。四川省精品课程 生物化学(二二)嘧啶核苷酸的合成嘧啶核苷酸的合成 小分子化合物小分子化合物嘧啶环,再与核糖磷嘧啶环,再与核
14、糖磷酸结合酸结合UMP,关键的中间化合物是关键的中间化合物是乳乳清酸清酸,其他嘧啶核苷酸则由,其他嘧啶核苷酸则由尿苷酸尿苷酸转转变而来。变而来。N3C2N1C6C5C4氨基甲酰氨基甲酰磷酸磷酸天冬氨酸天冬氨酸嘧啶碱(嘧啶碱(UMPUMP)合成的元素来源合成的元素来源=O=OdR-5-P1 1、嘧啶核苷酸的主要合成过程、嘧啶核苷酸的主要合成过程氨基甲酰磷酸合成酶氨基甲酰磷酸合成酶谷氨酰胺谷氨酰胺+H H2 2N NC CO OP PO OH HO O-O OO OC CO O2 2-2ATP2ATP2ADP+Pi2ADP+PiGluGluC CH H C CO OO OH HNH2C CH H2
15、 2H HO OO OC CPiPi天冬氨酸氨基甲酰转移酶天冬氨酸氨基甲酰转移酶二氢乳清酸酶二氢乳清酸酶脱氢酶脱氢酶N NA AD DH HN NA AD D+C CO O2 2脱羧酶脱羧酶尿尿嘧嘧啶啶核核苷苷酸酸C CN NC C H HC C H HC CO OO OR RN NH H5 5P P氨甲酰天冬氨酸氨甲酰天冬氨酸N NH H2 2C CN NC CH HC CH H2 2C CO OH HO OO OH HC CO OO OH H二氢乳清酸二氢乳清酸C CN NC CH HC CH H2 2C CO OO OH HN NH HC CO OO OH H乳清酸乳清酸C CN NC
16、CC CH HC CO OO OH HN NH HC CO OO OH H磷酸核糖磷酸核糖转移酶转移酶PRPPPRPPPPiPPi乳乳清清酸酸核核苷苷酸酸C CN NC CC C H HC CO OO OR RN NH HC C O O O O H H5 5P P氨基甲酰磷酸氨基甲酰磷酸四川省精品课程 生物化学 氨基甲酰磷酸合成酶氨基甲酰磷酸合成酶-氨基甲酰磷酸合成酶氨基甲酰磷酸合成酶-分分 布布 线粒体(肝)线粒体(肝)胞液(所有细胞)胞液(所有细胞)氮氮 源源 氨氨 谷氨酰胺谷氨酰胺变构激活剂变构激活剂 N-N-乙酰谷氨酸乙酰谷氨酸 无无功功 能能 尿素合成尿素合成 嘧啶的合成嘧啶的合成氨
17、基甲酰磷酸合成酶的比较氨基甲酰磷酸合成酶的比较UMP UDP、UTPATPCTP(氨基化(氨基化 GLn)由由UTPUTP生成生成CTPCTP的反应发生的反应发生在三磷酸核苷的水平上。在三磷酸核苷的水平上。四川省精品课程 生物化学2 2、嘧啶核苷酸的补救合成途径、嘧啶核苷酸的补救合成途径尿尿苷苷激激酶酶尿尿嘧嘧啶啶核核苷苷+A AT TP P U UM MP P+A AD DP P嘧嘧啶啶磷磷酸酸核核糖糖转转移移酶酶嘧嘧啶啶+P PR RP PP P(嘧嘧啶啶:尿尿嘧嘧啶啶,胸胸腺腺嘧嘧啶啶,乳乳清清酸酸,不不包包括括胞胞嘧嘧啶啶)嘧嘧啶啶核核苷苷酸酸+P PP Pi i三、脱氧核糖核苷酸的合
18、成三、脱氧核糖核苷酸的合成体内脱氧核糖核苷酸由核糖核苷二磷酸水平还原而成体内脱氧核糖核苷酸由核糖核苷二磷酸水平还原而成(脱氧胸腺嘧啶核苷酸除外脱氧胸腺嘧啶核苷酸除外)1.1.在在NDPNDP(核苷二磷酸)水平上:核苷二磷酸)水平上:ADP dADP dATPGDP dGDP dGTPCDP dCDP dCTPH2 H2OATP ADP酶酶1酶酶2酶酶1:核糖核苷酸还原酶:核糖核苷酸还原酶 酶酶2:激酶:激酶2 2 dTTPdTTP的生成的生成UDP dUDPdUMP dTMP dTDPdTTPdCMPH2H2OPi甲基化甲基化脱氨基脱氨基(主要)(主要)N5,N10-甲烯四氢叶酸甲烯四氢叶酸四
19、川省精品课程 生物化学四川省精品课程 生物化学第二节第二节 DNADNA的生物合成的生物合成在在DNADNA合成时,决定其结构特异性的遗传信息只能合成时,决定其结构特异性的遗传信息只能来于自身,因此必须由原来的来于自身,因此必须由原来的DNADNA作为模板合成新作为模板合成新的的DNADNA分子。新合成的分子。新合成的DNADNA分子是模板分子是模板DNADNA分子的分子的复制品,故复制品,故DNADNA的生物合成亦称的生物合成亦称DNADNA的复制的复制。四川省精品课程 生物化学一、参与一、参与DNADNA复制的酶及蛋白因子复制的酶及蛋白因子 (一)一)DNADNA聚合酶聚合酶(二)二)DN
20、ADNA连接酶连接酶(三)与解除三)与解除DNADNA高级结构有关的酶及高级结构有关的酶及蛋白因子蛋白因子四川省精品课程 生物化学(1 1)以四种脱氧核苷酸三磷酸为底物;)以四种脱氧核苷酸三磷酸为底物;(2 2)反应需要有模板的指导;)反应需要有模板的指导;(3 3)反应需要有)反应需要有3 3-OHOH存在;存在;(4 4)DNADNA链的合成方向为链的合成方向为5 53 3;(5 5)需要引物。)需要引物。(一)一)DNADNA聚合酶:聚合酶:5 5 3 3 四川省精品课程 生物化学 DNADNA聚合酶聚合酶 DNADNA聚合酶聚合酶 DNADNA聚合酶聚合酶亚基数目亚基数目 单体酶单体酶
21、 单体酶单体酶 2222多亚基酶多亚基酶 5 35 3聚合活性聚合活性 +中中 +很低很低 +很高很高3 53 5外切活性外切活性 +5 35 3外切活性外切活性 +-+-主要是对主要是对DNADNA损伤的修损伤的修复;以及复;以及在在DNADNA复制时复制时切除切除RNARNA引物并填补其引物并填补其留下的空隙。留下的空隙。修复紫外光修复紫外光引起的引起的DNADNA损损伤伤DNA DNA 复制的主要聚合复制的主要聚合酶酶.1.1.原核生物中的原核生物中的DNADNA聚合酶聚合酶(大肠杆菌大肠杆菌):):四川省精品课程 生物化学2.2.真核细胞真核细胞DNADNA聚合酶:聚合酶:亚基数亚基数
22、44425分子量(分子量(KD)25036-38160-300170256细胞内定位细胞内定位核核核核线粒体线粒体核核核核35外切外切活性活性功能功能引物合成引物合成修复修复复制复制复制复制修复修复四川省精品课程 生物化学3535OHOHP P二)、二)、DNADNA连接酶连接酶:四川省精品课程 生物化学三)、与解除三)、与解除DNADNA高级结构有关的酶及蛋白因子高级结构有关的酶及蛋白因子 通过水解通过水解ATPATP将将DNADNA两条链打开。两条链打开。E.coliE.coli中的中的reprep蛋白就是解链酶蛋白就是解链酶。每解开一对碱每解开一对碱基需要水解基需要水解2 2个个ATPA
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