基于筛选途径药物发现课件.ppt
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1、本章主要内容 一、化合物的来源 二、组合化学和化合物组合库 三、筛选模型和方法学第一节化合物的来源一、天然产物的提取 (一)植物群 (二)动物群 (三)微生物 (四)海洋化学 (五)人体生物化学二、化学合成的化合物三、研究机构库存化合物药物发现药物发现 先导化合物先导化合物候选药物候选药物上市药物上市药物 先导发现的两条途径:先导发现的两条途径:随机筛选随机筛选/偶然发现偶然发现 合理药物设计合理药物设计(Rational drug design,RDD)MBDD+SBDD+PBDD=RDD天然药物研究现状天然药物研究中的问题中药作为天然药物的优势动物药神农尝百草神农尝百草,一日而遇七十毒一日
2、而遇七十毒微生物药物随机筛选随机筛选/偶然发现偶然发现结构多样性的发现途径结构多样性的发现途径 药物发现领域中最激动人心的部分药物发现领域中最激动人心的部分 一直到一直到2020世纪世纪7070年代,最主要的先导化合物发现年代,最主要的先导化合物发现方式;至今仍不可替代方式;至今仍不可替代,仍然是药物发现的主要方仍然是药物发现的主要方式之一式之一u 天然天然/合成化合物的随机筛选合成化合物的随机筛选/偶然发现(药化主导偶然发现(药化主导)u 药理活性研究的意外发现(药理主导)药理活性研究的意外发现(药理主导)u 组合化学与高通量筛选(自动化技术)组合化学与高通量筛选(自动化技术)天然产物天然产
3、物/合成物合成物偶然发现与随机筛选偶然发现与随机筛选(药化主导)(药化主导)植物来源的药物发现植物来源的药物发现1803年 德国药师 萨顿从阿片中分离到黄色结晶吗啡五千年老药:3400 B.C.两河流域苏美尔人种植罂粟“the Source of Joy”吗啡在临床中不可替代吗啡在临床中不可替代 WHO(2000)中度和严重癌症疼痛,至今尚未有能够替代阿片类药物的中度和严重癌症疼痛,至今尚未有能够替代阿片类药物的疗法;建议各国制定保证医疗和科研用麻醉品充足供应的疗法;建议各国制定保证医疗和科研用麻醉品充足供应的计划。计划。柳叶刀柳叶刀杂志杂志(2007)社论社论 医源成瘾性医源成瘾性0.01%
4、;日剂量超过;日剂量超过1.8g产生的呼吸抑制作用产生的呼吸抑制作用也不影响患者存活率;应该鼓励内科医生有效使用阿片缓也不影响患者存活率;应该鼓励内科医生有效使用阿片缓解患者临终前的病痛。解患者临终前的病痛。世界范围吗啡医用消耗量世界范围吗啡医用消耗量28.7吨吨/年年(中国法律:贩卖阿片(中国法律:贩卖阿片100g/Death Penalty)知叶红豆杉知叶红豆杉Taxus breuifilia 树皮提取物树皮提取物紫杉醇紫杉醇紫杉醇生源途径困难的化解紫杉醇生源途径困难的化解 含量为树皮干重含量为树皮干重0.005%-0.07%,1公斤紫杉醇需要公斤紫杉醇需要15-30吨吨树皮,剥树皮,剥1
5、500-2000棵大树棵大树(50-250年成材年成材)紫杉醇产量紫杉醇产量500公斤公斤/年;市场需求(年;市场需求(4.8吨吨/年);原料药年);原料药价格(价格(18万美元万美元/公斤比黄金贵的药物)公斤比黄金贵的药物)动物、微生物来源的药物发现动物、微生物来源的药物发现海洋中药物的发现 中华人民共和国药典收载了海藻、瓦楞子、石决明、牡蛎、昆布、海马、海龙、海螵蛸.合成物的偶然发现合成物的偶然发现一个合成中间体的意外一个合成中间体的意外为什么基团替换会引起活性巨大的变化?为什么基团替换会引起活性巨大的变化?胍基:活性提高1000倍3-戊氧基:活性提高1000倍扎那米韦扎那米韦奥司他韦奥司
6、他韦配基与神经氨酸酶配基与神经氨酸酶作用方式的意外作用方式的意外改变!改变!紫杉醇半合成中间体的意外惊喜紫杉醇半合成中间体的意外惊喜一个生物碱下脚料的命运一个生物碱下脚料的命运蒂巴因的蒂巴因的“新生新生”药理活性研究的意外发现药理活性研究的意外发现(药理主导)(药理主导)“种豆得瓜种豆得瓜”的药理研究的药理研究(一一)“种豆得瓜种豆得瓜”的药理研究的药理研究(二二)EDED治疗药物治疗药物“三剑客三剑客”“种豆得瓜种豆得瓜”的药理研究的药理研究(三三)长春碱类抗肿瘤药物长春碱类抗肿瘤药物“失败失败”的合理药物设计的合理药物设计扑热息痛的冤案扑热息痛的冤案in vivoin vivo药物发现药物
7、发现人体代谢深加工后的新产品人体代谢深加工后的新产品筛选途径药物发现筛选途径药物发现的新方法、新趋势的新方法、新趋势二、组合化学二、组合化学固相合成法固相合成法(Solid Phase Synthesis)(Solid Phase Synthesis)固相反应的优势:固相反应的优势:产物纯化很容易,一般只需过滤即可 产物收率、纯度较高 容易实现自动化操作平行合成法平行合成法(Parallel Synthesis)(Parallel Synthesis)混分法混分法(Mix and Split Synthesis)(Mix and Split Synthesis)经典组合化学的不足之处经典组合化
8、学的不足之处血压平血压平长春瑞滨 紫杉酚 红霉素 奎尼定 多样性合成库多样性合成库(Diverse Oriented Synthesis,DOSDiverse Oriented Synthesis,DOS)三、筛选模型和方法学 高通量筛选(活性筛选)高通量筛选(活性筛选)高内涵筛选高内涵筛选研究药物对细胞行为的影响研究药物对细胞行为的影响细胞周期、细胞粘附和扩散、细胞运动、细胞毒性、凋亡、神经生长、分子转位、G蛋白偶联受体信号传导快速进行数百万个生化、快速进行数百万个生化、遗传和药理试验遗传和药理试验(自动化技术、数据处(自动化技术、数据处理及控制软件)理及控制软件)HCS概念和应用范围 1、
9、概念 高内涵筛选是由硬件和软件组合,在细胞水平上集合自动化荧光图像扫描、数据分析处理、配套检测试剂盒及生物信息学为一体的筛选平台,成为药物筛选和作用机制研究领域中最先进的理论和技术之一。2、应用范围(1)细胞周期-可在活细胞条件下观察和定位药物对细胞周期的影响后细胞所处周期位置。(2)细胞黏附和扩散-细胞伸展过程受细胞表面的黏附分子和细胞外基质调节。可通过测定特异底物的吸附和伸展来判断细胞的应答能力。(3)细胞运动-可直接测定迁移细胞产生的运动轨迹可分析细胞的运动能力。(4)细胞毒性-可同时获得细胞毒性的4个特性变化的有关信息,即细胞核形态和大小、细胞膜通透性、溶酶体内容物及细胞密度。(5)凋
10、亡-同时测定与凋亡相关的3个基础参数,即细胞核形态、线粒体质量及膜电位和f-肌动蛋白含量改变的方法筛选抗癌药物。(6)神经生长-利用神经细胞特异性荧光标记抗体识别神经细胞,观察神经细胞密度、神经树突、轴突和突触密度及长度等指标。(7)分子转为-可通过测定信号分子的转移来判断传导通路上的信号激活。如细胞质向细胞膜转为以及多分子转位等质-膜转位。(8)G蛋白偶联受体信号(GPCRs)传导-HCS根据分子转位特征判别受体偶联信号的激活以及通过标记细胞核、膜及融合arrestin蛋白,精确定位GPCRs在细胞内各区域的分布情况并判断其激活状态(9)其他-还能对药物作用下受体内化、钙流检测功能指标;细胞
11、骨架变化、细胞器改变等形态指标以及微核反应等毒理学指标进行检测及分析。本章小结本章小结 药物发现药物发现筛选途径合理药物设计先导化合物先导化合物候选药物候选药物上市药物上市药物 筛选途径筛选途径u天然天然/合成化合物的随机筛选合成化合物的随机筛选/偶然发现(药化主导)偶然发现(药化主导)u药理活性研究的意外发现(药理主导)药理活性研究的意外发现(药理主导)u组合化学与高通量筛选,高内涵筛选(自动化技术)组合化学与高通量筛选,高内涵筛选(自动化技术)主要内容主要内容 药物体外过程药物体外过程:制剂溶解 药物体内过程药物体内过程:ADMEADME 吸收(Absorption);分布(Distrib
12、ution);代谢(Metabolism);排泄(Excretion)。1.2 药物的体内过程药物的体内过程药物有效的药物有效的决定性决定性因素:因素:在作用部位达到有效浓度在作用部位达到有效浓度影响较大的因素主要是:影响较大的因素主要是:溶解度、脂水分配系数、解离度。溶解度、脂水分配系数、解离度。2.2.与作用部位的受体发生作用与作用部位的受体发生作用 (基于结构的药物设计)(基于结构的药物设计)药物研发失败原因药物研发失败原因 药动学性质不佳药动学性质不佳 39%39%缺乏药效缺乏药效 30%30%动物毒性动物毒性 11%11%副作用副作用 10%10%商业商业 5%5%其他其他 5%5%
13、1.3 基于性质的药物设计(基于性质的药物设计(PBDD):指的是针对药物或候选药物结构进行药动学性质设计与优化,以实现药物或候选药物的良好口服吸收、定向分布、可控代谢、优化消除或降低毒副作用的目的。第二节 药物理化性质与其体内过程间的关系主要内容主要内容生物膜生物膜:细胞外表面的质膜与各种细胞器的亚细胞膜的统称。2.1.1 药物的膜转运和透膜性药物的膜转运和透膜性膜转运:物质通过生物膜的现象。在药物吸收、分布、排泄中的起重要作用。膜转运方式:膜转运方式:1.被动转运:药物的膜转运服从浓度梯度扩散原理,即从高浓度一侧向低浓度一侧的简单扩散过程,因而又称为被动扩散。2.载体媒介转运:促进扩散(易
14、化扩散)、主动转运 药物透过生物膜的过程借助生物膜上的转运载体转运载体。3.膜动转运:泡饮作用、吞噬作用 通过生物膜的主动变形将药物转运过生物膜的过程。被动转运特点:1.顺浓度梯度转运;2.不消耗能量;3.不需要转运体参与;4.不存在转运饱和现象;5.不存在同类物竞争抑制现象。条件:1.分子量不能太大。2.具有适宜水溶性与适宜脂溶性促进扩散(易化扩散)特点:1.顺浓度梯度转运;2.不消耗能量;3.需要转运体参与;4.存在转运饱和现象;5.存在同类物竞争抑制现象。条件:1.结构匹配。主动转运特点:1.逆浓度梯度转运;2.消耗能量;3.需要转运体参与;4.存在转运饱和现象;5.存在竞争抑制现象。条
15、件:1.结构匹配。胞饮和吞噬作用摄取的物质为溶解物或液体称为胞饮作用(pinocytosis)。摄取的物质为大分子或颗粒状物称为吞噬作用(phagocytosis)。2.1.2 药物吸收药物吸收 药物吸收:是指药药物吸收:是指药物从给药部位进入物从给药部位进入体循环的过程。体循环的过程。吸收是药效产生的吸收是药效产生的重要条件重要条件 药物吸收机制:药物吸收机制:主动转运主动转运 载体媒介转运载体媒介转运 膜动转运膜动转运 细胞旁路转运:细胞旁路转运:细胞间充满水的小孔(直细胞间充满水的小孔(直径径310)影响药物吸收的因素影响药物吸收的因素药物的理化性质对吸收的影响药物的理化性质对吸收的影响
16、1.1.溶解度溶解度2.2.脂溶性脂溶性3.3.解离度解离度4.4.极性表面积极性表面积 解离度解离度 药物多是药物多是弱的有机酸弱的有机酸或或弱的有机碱弱的有机碱。体液中体液中 非解离非解离 解离解离 有机酸或有机碱类药物的吸收并不取决于他有机酸或有机碱类药物的吸收并不取决于他们的总浓度,而和他们的们的总浓度,而和他们的解离度解离度有关。有关。解离度和解离度和药物药物pKapKa值值及及吸收部位的吸收部位的pH值值有关。有关。酸性药物:酸性药物:环境pH值减小,吸收较强。碱性药物碱性药物:环境pH值增大,吸收较强。例例1:磺胺药的解离常数与抑菌强度有关磺胺药的解离常数与抑菌强度有关(1)解离
17、常数在)解离常数在6.57.2之间,抗菌活性最强。之间,抗菌活性最强。(2)抗菌活性最强具有适宜的分子、离子比。)抗菌活性最强具有适宜的分子、离子比。磺胺药物的制菌作用是离子和分子的总效应。磺胺药物的制菌作用是离子和分子的总效应。磺胺甲恶唑磺胺甲恶唑 磺胺甲恶唑磺胺甲恶唑 例例2 2:巴比妥类药物巴比妥类药物 名称名称 结构结构 离子型离子型 分子型分子型 巴比妥酸巴比妥酸 99.9%(无效)(无效)三乙基苯三乙基苯 基巴比妥基巴比妥 100%(无效)(无效)NNOHOHOHNNOOOCH3CH3CH3 苯巴比妥苯巴比妥 50%50%(离子型)(离子型)(分子型)(分子型)有效有效NHNOOC
18、H3OH 巴比妥类药物巴比妥类药物 药药 名名 解离常数解离常数 分子型分子型%药效药效 无取代类无取代类 巴比妥酸巴比妥酸 4.12 0.052 无效无效单取代类单取代类 5-苯基巴比妥苯基巴比妥 3.75 0.022 无效无效 乙基巴比妥乙基巴比妥 7.0 50.00 +苯巴比妥苯巴比妥 7.4 50+丙烯巴比妥丙烯巴比妥 7.7 66.6 1 +异戊巴比妥异戊巴比妥 7.9 75.97 +戊巴比妥戊巴比妥 8.0 79.92 +己琐巴比妥己琐巴比妥 8.4 90.00 +1,3,5-三乙基三乙基 -5-苯基巴比妥苯基巴比妥 0.0 100.00 无效无效5,5-双双取代类取代类四取代类四
19、取代类 极性表面积极性表面积(Polar Surface Area,PSA),系指分子中极性原,系指分子中极性原子表面的总和;子表面的总和;通过计算极性原子通过计算极性原子O,N,OH和和NH的范德华表面积得到的;的范德华表面积得到的;PSA越大,极性越大,难于过膜;越大,极性越大,难于过膜;对上千个口服非对上千个口服非CNS药物的药物的PSA最高阈值为最高阈值为1202,超过,超过该值难以吸收;该值难以吸收;透血脑屏障,透血脑屏障,PSA60-702极性表面积极性表面积药物的理化性质对吸收的影响(小结)药物的理化性质对吸收的影响(小结)1.1.溶解度溶解度 溶解度 吸收2.2.脂溶性脂溶性
20、药物脂溶性适宜,吸收油油/水分配系数水分配系数(P P):):在生物相中物质的量浓度与在水相中物质的量浓度之比.通常用PO/W表示(Octanol/Water)P值越大,则药物的脂溶性越高。3.3.解离度解离度 非离子型药物易通过生物膜4.4.极性表面积极性表面积 极性越大,难于过膜2.1.3 药物分布 药物分布是指药物在血液、组织及器官间的可逆转运过程。特点:药物分布不均匀,药物分布直接影响药物活性和毒副作用。影响药物分布的因素影响药物分布的因素1.1.药物分子因素药物分子因素 溶解度、脂水配系数、酸碱性、电离度、分子溶解度、脂水配系数、酸碱性、电离度、分子间力、氧化还原电位、电子等排、官能
21、团之间的距间力、氧化还原电位、电子等排、官能团之间的距离和立体化学。离和立体化学。2.2.生物学因素生物学因素 组织的血液循环速度、毛细血管的通透性、组织的血液循环速度、毛细血管的通透性、药物分子与细胞间及细胞内药物分子与细胞间及细胞内体液体液及及生物聚合物生物聚合物等等相相互作互作用,这种相互作用决定了药物的吸收、分布和用,这种相互作用决定了药物的吸收、分布和消除的特征,决定了药物的生物利用度。消除的特征,决定了药物的生物利用度。药药 物物脂水分配系数脂水分配系数溶解性溶解性生物膜生物膜扩散转运扩散转运进入进入细胞细胞内内血液血液或体液或体液药物因素药物因素溶解度和脂水分配系数溶解度和脂水分
22、配系数 例如例如:抗疟药抗疟药 血液循环血液循环 需脂溶性需脂溶性 红细胞膜、红细胞膜、疟原虫膜疟原虫膜 疟原虫疟原虫DNA 生长、繁殖生长、繁殖 抗疟药效抗疟药效进入进入穿过穿过作用作用干扰干扰产生产生需水溶性需水溶性化合物结构与脂水化合物结构与脂水分配系数分配系数芳香取代基、饱和或不饱和脂肪取代芳香取代基、饱和或不饱和脂肪取代基、卤素基、卤素是非极性基团,使化合物具有是非极性基团,使化合物具有疏水性疏水性;氨基、羧基、硝基和氰基氨基、羧基、硝基和氰基等极性基团,等极性基团,使化合物具有使化合物具有亲水性亲水性。分子的取代基分子的取代基对对脂水分配系数脂水分配系数P 影响影响:基基 团团 P
23、 值值 引入引入:羟基羟基 5150倍倍 脂氨基脂氨基 2100倍倍 卤素原子卤素原子 420倍倍 甲基甲基 24倍倍 羧基成甲酯羧基成甲酯 24倍倍 分子的取代基分子的取代基对对脂水分配系数脂水分配系数P 影响影响:基基 团团 P 值值 引入引入:羟基羟基 5150倍倍 脂氨基脂氨基 2100倍倍 卤素原子卤素原子 420倍倍 甲基甲基 24倍倍 羧基成甲酯羧基成甲酯 24倍倍 例:例:抗精神失常药抗精神失常药 药药 名名 R 脂溶性脂溶性 药药 效效 异丙嗪异丙嗪 H 镇镇 静静 氯丙嗪氯丙嗪 C l 抗精神失常抗精神失常 三氟丙嗪三氟丙嗪 CF3 强效抗精神失常强效抗精神失常 改变其改变
24、其脂溶性(易透过血脑屏障达有效浓度)脂溶性(易透过血脑屏障达有效浓度),从而从而改变了药物的作用改变了药物的作用或或 影响了药效的强弱影响了药效的强弱。NSHHRR(副作用)(副作用)药物因素药物因素酸碱性酸碱性 通常碱性更强的化合物组织分布更为广泛,这通常碱性更强的化合物组织分布更为广泛,这是因为在生理是因为在生理pH 下,碱性化合物可以与细胞膜磷下,碱性化合物可以与细胞膜磷脂表面的酸性基团形成离子对而结合,从而增加其脂表面的酸性基团形成离子对而结合,从而增加其与组织细胞的亲和力。与组织细胞的亲和力。引入了碱性基团表观分布容积(引入了碱性基团表观分布容积(Vd)显著增加,)显著增加,并且消除
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