第二章菌种选育课件.ppt
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- 第二 菌种 选育 课件
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1、第二章第二章 菌种选育菌种选育主讲:李昌灵主讲:李昌灵放线菌(链霉素四放线菌(链霉素四环素;红霉素等)环素;红霉素等)真菌(青霉素、头孢等)真菌(青霉素、头孢等)一些产芽孢的细菌一些产芽孢的细菌植物或动物来源植物或动物来源一、抗生素生产有关的微生物一、抗生素生产有关的微生物抗生素是次级代谢产物,需要生物体进行复杂的代谢,目前发现的生物来源如下:第一节第一节 菌种的来源菌种的来源二、氨基酸生产有关的微生物二、氨基酸生产有关的微生物代谢控制发酵代谢控制发酵:用用人工诱变的方法人工诱变的方法,有意识地改,有意识地改变微生物的代谢途径,最大限度地积累产物,这变微生物的代谢途径,最大限度地积累产物,这种
2、发酵形象地称为代谢控制发酵,最早在氨基酸种发酵形象地称为代谢控制发酵,最早在氨基酸发酵中得到成功应用。发酵中得到成功应用。50,6050,60年代以氨基酸发酵为代表的代谢控制年代以氨基酸发酵为代表的代谢控制发酵,是发酵工业发展历史上的一个转折点:发酵,是发酵工业发展历史上的一个转折点:微生物(包括动、植物细胞)几乎可以生产微生物(包括动、植物细胞)几乎可以生产我们所需的一切产品,但是涉及到工业化生我们所需的一切产品,但是涉及到工业化生产对于某一种特定的产品,只有特定的微生产对于某一种特定的产品,只有特定的微生物才具有大量表达的潜力。物才具有大量表达的潜力。礼来礼来(Eli lilly(Eli
3、lilly),),花了花了1010年年的时间从的时间从4040万株万株微生微生物中,发现了物中,发现了三种三种有潜力的新抗生素有潜力的新抗生素。例:例:已工业化产品生产菌的介绍第二节第二节 自然界中有目的微生物分离的原则自然界中有目的微生物分离的原则一、菌种分离的一般过程土样的采取土样的采取 预处理预处理 培养培养 菌落的选择菌落的选择 产品的鉴定产品的鉴定如何使样品中所含微生物的可能性大如何使样品中所含微生物的可能性大如何在后续的操作中使这种可能性实现如何在后续的操作中使这种可能性实现目的目的:高效地获取一株高产目的产物的微生物高效地获取一株高产目的产物的微生物问题问题:自然界中有目的微生物
4、分离的原则自然界中有目的微生物分离的原则二、采样时要注意的问题l 气候、水分、空气气候、水分、空气l 来源要广来源要广l 结合产品的特点结合产品的特点l 标签:地点、时间、气候等标签:地点、时间、气候等富集的三种方案:富集的三种方案:l 定向培养定向培养:采用特定的有利于目的微生物富集的采用特定的有利于目的微生物富集的 条件,进行培养。条件,进行培养。三、目的微生物富集的一些基本方法三、目的微生物富集的一些基本方法富集的目的:富集的目的:让目的微生物在种群中占优势,使筛选变得可能。l 当不可能采用定向培养时,则可设计在一个分当不可能采用定向培养时,则可设计在一个分 类学中考虑,类学中考虑,l
5、不能提供任何有助于筛选产生菌的信息,这不能提供任何有助于筛选产生菌的信息,这 时只能通过随机分离的办法时只能通过随机分离的办法定向培养的富集方法定向培养的富集方法1 1、底物、底物2 2、pHpH条件条件3 3、培养时间、培养时间4 4、培养温度、培养温度等一切能提高目的微生物相对生等一切能提高目的微生物相对生长速度的手段,培养(固体、液长速度的手段,培养(固体、液体;分批连续)后使目的微生物体;分批连续)后使目的微生物在种群中占优势。在种群中占优势。四、菌落的选出四、菌落的选出q 从产物角度出发从产物角度出发在培养时以产物的形成有目的的设计培养基在培养时以产物的形成有目的的设计培养基利用简单
6、、快速的鉴定方法,如抗生素(利用简单、快速的鉴定方法,如抗生素(P35P35)q 从形态的角度从形态的角度 菌落的外观形态,是微生物的一个重要表征。菌落的外观形态,是微生物的一个重要表征。如多糖产生菌在适当的培养基上生长,从具有粘如多糖产生菌在适当的培养基上生长,从具有粘液性的菌落外观上就可以初步识别。液性的菌落外观上就可以初步识别。实例:碱性纤维素酶产生菌的筛选(国家七五攻关项目)实例:碱性纤维素酶产生菌的筛选(国家七五攻关项目)采样(造纸厂)采样(造纸厂)80度度30分钟处理分钟处理文献文献:产生菌为中性牙孢杆菌,产生菌为中性牙孢杆菌,嗜碱牙孢杆菌嗜碱牙孢杆菌、放线菌及霉菌、放线菌及霉菌0
7、.0075%曲利本蓝曲利本蓝1%CMC(羧甲基纤维素),(羧甲基纤维素),pH10.5培养培养34天,选择有凹陷圈的菌落天,选择有凹陷圈的菌落从从285个土样中获得个土样中获得62株株26株为组成型株为组成型36株为诱导型株为诱导型例:例:醛肟水解酶的筛选醛肟水解酶的筛选 -Journal of biotechnology 94(2002),65-72培养基中含培养基中含0.05%of Z-PAOx 每隔每隔2-3天移去一半培养物,补充新鲜培养基天移去一半培养物,补充新鲜培养基不断分析样品,不断分析样品,2-3个月后个月后Z-PAOx降低后,稀释分离条菌落降低后,稀释分离条菌落抗抗生生素素产产
8、生生菌菌的的筛筛选选过过程程(一)样品的采集(一)样品的采集 土壤的营养:土壤的营养:有机氮多有机氮多-放线菌、细菌放线菌、细菌 有机氮少、酸性有机氮少、酸性-真菌真菌 土壤深度:土壤深度:放线菌和细菌放线菌和细菌-0-1m-0-1m(80%80%在在0-10cm 0-10cm)真菌真菌-0-0.3m-0-0.3m 未开垦过的土壤最佳未开垦过的土壤最佳 南方地区土壤中的放线菌种类比北方多南方地区土壤中的放线菌种类比北方多 采样季节一春秋天为宜采样季节一春秋天为宜三、微生物的分离三、微生物的分离、放线菌、放线菌2.1 概念概念在形态上具有分枝状菌丝、菌落形态与霉菌相似,以孢子进行繁殖。在形态上具
9、有分枝状菌丝、菌落形态与霉菌相似,以孢子进行繁殖。“介于细菌与丝状真菌之间介于细菌与丝状真菌之间又接近细菌的一类丝状原核又接近细菌的一类丝状原核生物生物”近代生物学技术近代生物学技术放线菌实际上是属于细菌放线菌实际上是属于细菌范畴内的原核微生物,只范畴内的原核微生物,只不过其细胞形态为分枝状不过其细胞形态为分枝状菌丝。菌丝。放线菌是具有菌丝、以孢子进行繁殖、革兰氏染色阳性的一类原核微生物,属于真细菌范畴。2.2 2.2 形态与结构形态与结构t单细胞,大多由分枝发达的菌丝组成;单细胞,大多由分枝发达的菌丝组成;t菌丝直径与杆菌类似,约菌丝直径与杆菌类似,约1 1m mm m;t细胞壁组成与细菌类
10、似,革兰氏染色阳性(少数阴性);细胞壁组成与细菌类似,革兰氏染色阳性(少数阴性);t细胞的结构与细菌基本相同,细胞的结构与细菌基本相同,按形态和功能可分为营养、气生和孢子丝三种。按形态和功能可分为营养、气生和孢子丝三种。(1)营养菌丝匍匐生长于培养基内,吸收营匍匐生长于培养基内,吸收营养,也称基内菌丝。一般无隔养,也称基内菌丝。一般无隔膜,直径膜,直径0.2-0.80.2-0.8 m m,长度差别,长度差别很大,有的可产生色素。很大,有的可产生色素。(2 2)气生菌丝)气生菌丝营养菌丝发育到一定阶段,伸向空间形成气生菌丝,叠生于营养营养菌丝发育到一定阶段,伸向空间形成气生菌丝,叠生于营养菌丝上
11、,可覆盖整个菌落表面。在光学显微镜下观察,颜色较深菌丝上,可覆盖整个菌落表面。在光学显微镜下观察,颜色较深,直径较粗(,直径较粗(1-1.41-1.4m m),有的产色素。),有的产色素。(3 3)孢子丝)孢子丝气生菌丝发育到一定阶段,其上可分化出形成孢子的菌丝,即孢气生菌丝发育到一定阶段,其上可分化出形成孢子的菌丝,即孢子丝,又称产孢丝或繁殖菌丝。其形状和排列方式因种而异,常子丝,又称产孢丝或繁殖菌丝。其形状和排列方式因种而异,常被作为对放线菌进行分类的依据。被作为对放线菌进行分类的依据。(二)放线菌的分离(二)放线菌的分离1 1 样品分离前的处理样品分离前的处理除去或减少不需要微生物,增加
12、所需要放线菌的数量。除去或减少不需要微生物,增加所需要放线菌的数量。(1 1)化学方法)化学方法 SDS-SDS-酵母浸膏处理样品,可以使细菌数量明显减少,酵母浸膏处理样品,可以使细菌数量明显减少,HVHV平板上平板上55%95%55%95%都是放线菌。都是放线菌。风干的土壤与风干的土壤与CaCOCaCO3 3混合后培养,放线菌的数量可以增混合后培养,放线菌的数量可以增加加100100倍。风干的土壤减少了细菌的数量;倍。风干的土壤减少了细菌的数量;CaCOCaCO3 3有利有利于放线菌的生长,抑制了大多数真菌的生长。于放线菌的生长,抑制了大多数真菌的生长。0.01M NaOH0.01M NaO
13、H处理土壤,分离小单孢菌,处理土壤,分离小单孢菌,1M NaOH1M NaOH处理处理土壤可以分离到诺卡氏菌和小单孢菌。土壤可以分离到诺卡氏菌和小单孢菌。其他试剂:其他试剂:1.4%1.4%酚、乙酸乙酯可以使细菌和真菌数量酚、乙酸乙酯可以使细菌和真菌数量明显减少,有利于分离放线菌。明显减少,有利于分离放线菌。(2 2)物理方法)物理方法 温度:温度:根据各种微生物耐热程度的不同,用根据各种微生物耐热程度的不同,用高温处理样品,可以分离到不同种类的放线高温处理样品,可以分离到不同种类的放线菌。菌。离心:离心:根据微生物大小对样品进行离心分离。根据微生物大小对样品进行离心分离。如如1600g160
14、0g离心离心20min20min,上清液中主要是放线菌,上清液中主要是放线菌孢子,沉淀中含有细菌和真菌孢子。孢子,沉淀中含有细菌和真菌孢子。膜过滤:膜过滤:用孔径为用孔径为0.45m0.45m的滤膜可以浓缩的滤膜可以浓缩水中的微生物,过滤后把滤膜贴在平板培养水中的微生物,过滤后把滤膜贴在平板培养基上培养。这种方法用来分离水中的小单孢基上培养。这种方法用来分离水中的小单孢菌和高温放线菌。菌和高温放线菌。2 2 分离方法分离方法(1)培养基 分离放线菌多采用合成培养基(精分离放线菌多采用合成培养基(精氨酸培养基、高氏一号培养基、察氏培氨酸培养基、高氏一号培养基、察氏培养基)和有机培养基(如养基)和
15、有机培养基(如WaksmanWaksman培养基培养基和和BennettBennett培养基培养基)(2)抗生素的加入 培养基中加入抗真菌抗生素和抗细培养基中加入抗真菌抗生素和抗细菌抗生素,可以抑制真菌和细菌的生长,菌抗生素,可以抑制真菌和细菌的生长,对放线菌进行浓缩。对放线菌进行浓缩。(3 3)分离放线菌的方法)分离放线菌的方法 稀释法:稀释法:无菌水稀释样品,然后涂布平板。无菌水稀释样品,然后涂布平板。喷土法:喷土法:用喷土机或其他方法把风干碾细的土用喷土机或其他方法把风干碾细的土样直接喷在分离平板上。样直接喷在分离平板上。滤膜法:滤膜法:将将0.22-0.45 m0.22-0.45 m的
16、滤膜放在分离培的滤膜放在分离培养基的平板上,接种培养,放线菌菌丝可以穿养基的平板上,接种培养,放线菌菌丝可以穿过滤膜长到培养基中,而细菌在滤膜表面生长,过滤膜长到培养基中,而细菌在滤膜表面生长,去掉滤膜,培养基中的放线菌菌丝继续培养长去掉滤膜,培养基中的放线菌菌丝继续培养长出菌落。出菌落。(4 4)培养温度:)培养温度:一般一般25-3025-30度,或者度,或者32-3732-37度,度,培养培养7-147-14天;高温放线菌需要天;高温放线菌需要45-5045-50度培养度培养1-21-2天,海水中分离放线菌用天,海水中分离放线菌用2020度培养度培养6 6周左右。周左右。产纤维素酶放线菌
17、的分离与筛选产纤维素酶放线菌的分离与筛选 纤维素酶纤维素酶是一种复合酶,主要由外切是一种复合酶,主要由外切-葡聚糖酶、内葡聚糖酶、内切切-葡聚糖酶(又称葡聚糖酶(又称CMCase)和)和-葡萄糖苷酶等组葡萄糖苷酶等组成,还有很高活力的木聚糖酶活力。成,还有很高活力的木聚糖酶活力。采集土样采集土样 朽木、烂稻草、烂稻草表层朽木、烂稻草、烂稻草表层土、锯木、锯木表层土、落叶表土、锯木、锯木表层土、落叶表层土。层土。选择性培养基(改良查氏培养选择性培养基(改良查氏培养基):基):CMC-Na 15 g、NaNO3 2 g、NaCl 2 g、MgSO4 0.5 g、FeSO4 0.1 g、刚果红、刚果
18、红 0.2 g、琼、琼脂脂20 g、蒸馏水、蒸馏水 1000 mL、pH自然;自然;(三)其他微生物的分离(三)其他微生物的分离1 真菌的分离 用PDA培养基、Martin培养基、察氏培养基等,pH5.5-6.5,24-28度培养5-14天,在培养基中加入抗细菌类抗生素抑制细菌的生长。2 细菌的分离 采用牛肉膏蛋白胨培养基等,pH7.2-7.6,温度28-37度培养1-7天,培养基中加入一定量的抗真菌抗生素抑制真菌的生长。3 海洋微生物的分离 根据微生物在海洋中的生存环境设计分离方法、分离培养基和培养条件。一般海深100米内分离出链霉菌,1000米左右分离的大多数是小单孢菌,3000-5000
19、米范围内没有分离出放线菌。4 极端微生物的分离 根据极端微生物的生长繁殖条件,如高温、低温、高盐、高碱、高压,来设计分离和培养条件。产青蒿素内生菌的分离与筛选目前使用青篙素进行治疗每个疗程的费用是目前使用青篙素进行治疗每个疗程的费用是8美元到美元到10美元,对这些地区的贫困患者来说过美元,对这些地区的贫困患者来说过于昂贵,主要瓶颈在于青篙的收获量不足。于昂贵,主要瓶颈在于青篙的收获量不足。采集青蒿植株,分别取根、茎和叶的小块,约采集青蒿植株,分别取根、茎和叶的小块,约0.15cm0.15cm大小,大小,75%酒精漂洗酒精漂洗(2030s)无菌水冲洗无菌水冲洗0.2%升汞漂洗升汞漂洗(1020s
20、)无菌水冲洗数次或直接取内层无污样,分置于无菌水冲洗数次或直接取内层无污样,分置于PDA、牛肉膏蛋白胨和高氏一号脂培养基平板,牛肉膏蛋白胨和高氏一号脂培养基平板,2530下避光培养。下避光培养。培养培养520d,分别待平板上长出菌落,用划线、稀释以及直接用,分别待平板上长出菌落,用划线、稀释以及直接用无菌小剪刀取尖端菌丝等分离方法,经过分离、筛选、纯化的无菌小剪刀取尖端菌丝等分离方法,经过分离、筛选、纯化的反复过程,直至得到纯化的具有产抗疟疾药物青蒿素或其结构反复过程,直至得到纯化的具有产抗疟疾药物青蒿素或其结构类似物的内生菌菌株。类似物的内生菌菌株。四、抗生素的初筛发酵和抗菌活性的测定四、抗
21、生素的初筛发酵和抗菌活性的测定(一)抗生素的初筛发酵(一)抗生素的初筛发酵1 1培养基培养基2 2 培养条件培养条件固体平板发酵:固体平板发酵:便于大量筛选抗生素产生菌便于大量筛选抗生素产生菌液体振荡培养:液体振荡培养:溶氧较好,有利于放线菌的生溶氧较好,有利于放线菌的生长和抗生素合成。长和抗生素合成。(二)抗菌活性的测定(二)抗菌活性的测定 初筛发酵液样品有全发酵液、上清液和菌丝提取初筛发酵液样品有全发酵液、上清液和菌丝提取液液3 3种用于测定抗菌活性。种用于测定抗菌活性。抗菌活性的测定方法有以下三种:抗菌活性的测定方法有以下三种:杯碟法或者纸片法:杯碟法或者纸片法:将发酵液样品加到鉴定平板
22、上将发酵液样品加到鉴定平板上的小杯中,或将纸片浸入发酵液样品中,取出后放的小杯中,或将纸片浸入发酵液样品中,取出后放在鉴定平板上,在鉴定平板上,3737度培养度培养1 1天,测量抑菌圈直径的天,测量抑菌圈直径的大小。大小。琼脂块法:琼脂块法:将固体发酵平板上用打孔器打成的圆块将固体发酵平板上用打孔器打成的圆块转移到长好的试验菌的平板上,在转移到长好的试验菌的平板上,在3737度培养度培养1 1天,天,测量抑菌圈直径的大小。测量抑菌圈直径的大小。平板划线法:平板划线法:先将放线菌在先将放线菌在平板上划线培养,培养平板上划线培养,培养5 5天后天后再把试验菌在放线菌的两侧垂再把试验菌在放线菌的两侧
23、垂直划线,直划线,3737度培养度培养1 1天,观察天,观察放线菌两侧试验菌被抑制的长放线菌两侧试验菌被抑制的长度。度。五、抗生素的早期鉴别五、抗生素的早期鉴别 1 1 纸层析和纸电泳:纸层析和纸电泳:根据抗生素样品在纸上的迁移率,鉴别根据抗生素样品在纸上的迁移率,鉴别已知抗生素和发现新的抗生素。已知抗生素和发现新的抗生素。2 2 颜色反应:颜色反应:有的抗生素层析之后与显色剂反应,表现出特有的抗生素层析之后与显色剂反应,表现出特有的颜色反应。有的颜色反应。3 3 紫外吸收光谱:紫外吸收光谱:4 4 抗菌谱抗菌谱抗 生 素 茚 三 酮 坂 口 反 应 紫 霉 素 卡 那 霉 素、新 霉 素、巴
24、 龙 霉 素 链 霉 素 类 六、抗细菌药物的筛选模型和方法六、抗细菌药物的筛选模型和方法(一)以试验菌为对象的筛选方法(常规方法)(一)以试验菌为对象的筛选方法(常规方法)利用很多种微生物作为鉴定菌的琼脂扩散法是一种利用很多种微生物作为鉴定菌的琼脂扩散法是一种经典的筛选方法。目前主要筛选耐药细菌和厌氧菌。经典的筛选方法。目前主要筛选耐药细菌和厌氧菌。1 1 抗生素耐药突变株的使用抗生素耐药突变株的使用2 2 超敏菌株的使用:超敏菌株的使用:用传统的琼脂扩散法直接检测发酵液用传统的琼脂扩散法直接检测发酵液中所存在的少量抗生素,获得新的抗生素的可能性较大中所存在的少量抗生素,获得新的抗生素的可能
25、性较大3 3 利用厌氧菌作为试验株利用厌氧菌作为试验株 双层琼脂平板法,拟杆菌属、双层琼脂平板法,拟杆菌属、梭杆菌属等厌氧菌,治疗厌氧致病菌。梭杆菌属等厌氧菌,治疗厌氧致病菌。(二)以作用机理为依据的筛选方法(定靶筛选)(二)以作用机理为依据的筛选方法(定靶筛选)1 1 细菌细胞壁合成抑制剂的筛选细菌细胞壁合成抑制剂的筛选 作用于细胞壁的抗生素对人体细胞没有毒害作用,作用于细胞壁的抗生素对人体细胞没有毒害作用,有较好的选择性毒性。有较好的选择性毒性。(1 1)观察细胞形态变异)观察细胞形态变异 细菌尤其是细菌尤其是G+G+发生各种形态变化,例如细菌变长、发生各种形态变化,例如细菌变长、部分突起
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