最新基因工程基本原理简介课件.ppt
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1、基因工程基本原理简介基因工程基本原理简介第一节第一节 基因工程原理简介基因工程原理简介一、基因工程的定义一、基因工程的定义 本义:本义:根据人们的意愿,利用工程设计的方法,在体外根据人们的意愿,利用工程设计的方法,在体外将克隆获得的目的基因与适当的载体进行切割和连接,构建将克隆获得的目的基因与适当的载体进行切割和连接,构建成正确的重组表达载体,再应用物理的、化学的或生物学的成正确的重组表达载体,再应用物理的、化学的或生物学的方法将该表达载体导入到细菌、动植物细胞或受精卵中,使方法将该表达载体导入到细菌、动植物细胞或受精卵中,使目的基因在宿主体内以瞬时方式或稳定方式进行表达,借此目的基因在宿主体
2、内以瞬时方式或稳定方式进行表达,借此研究目的研究目的基因基因/DNA片段片段的结构与功能,或获得该基因的表达的结构与功能,或获得该基因的表达产物。这一过程就是基因工程。产物。这一过程就是基因工程。广义:广义:转基因动物;克隆;基因打靶;基因组计划等均转基因动物;克隆;基因打靶;基因组计划等均属于基因工程的范畴。属于基因工程的范畴。家蝇部分基因组文库构建、卵黄蛋白基因家蝇部分基因组文库构建、卵黄蛋白基因启动子克隆与初步应用研究启动子克隆与初步应用研究Cloning and initial application of functional promoter of Musca domestica
3、yolk protein gene启动子克隆一般思路启动子克隆一般思路启动子区启动子区杂交杂交增强子增强子调控启动子调控启动子核心启动子核心启动子基因基因3 5转录起始点转录起始点探针探针+50-40ATG-4000-500功能功能 分析分析 克隆启动子克隆启动子实验一、家蝇部分基因组文库的构建实验一、家蝇部分基因组文库的构建 1 材料与方法材料与方法 1.1 家蝇基因组家蝇基因组DNA的提取的提取 2.1 基因组基因组DNA的部分酶切的部分酶切 3.1 EMBL3载体臂的制备载体臂的制备 4.1 连接与包装连接与包装 5.1 基因组文库鉴定基因组文库鉴定 Bcl I随机酶切随机酶切 左臂左臂
4、 基因组基因组DNA 右臂右臂 left arm(20kb)central stuff 14kbright arm9kbEcoR IBamH ISal IBamHSal IEcoR I基因组基因组DNABamH I+CIPBcl IBcl IBamH IBamH I包包装装转化转化KW251噬菌斑噬菌斑 101023kb23kb包装蛋白包装蛋白实验一、技术路线图重组噬菌体重组噬菌体收集收集噬菌体液噬菌体液基因组文库基因组文库1.Genomic DNA2.Lamba DNA Fig.1 electrophoresis of genomic DNA图图1.1.基因组基因组DNADNA电泳电泳1 2
5、48.5kb 实验一结果实验一结果2.1 基因组基因组DNADNA的提取的提取提取的基因组提取的基因组 DNA 大于大于50kbFig.2 Digestion of genomic DNA by Bcl I1.5U/ugDNA Bcl I,2.2.5U/ugDNA Bcl I3.1.25 U/ugDNA Bcl I4.Lamba DNA/Hind Marker Marker图图2.基因组基因组DNA Bcl I 酶切电泳酶切电泳23kb 9.4kb1 2 3 4Fig.3 Electrophoresis of recover products of 1023kb DNA fragments 1
6、.Bcl I 酶切纯化片段 2.Lamba DNA/Hind Marker图图3.101023kb DNA23kb DNA片段回收产物电泳片段回收产物电泳23kb9.4kb 1 2 实验一结果实验一结果 2.2 家蝇基因组家蝇基因组DNA酶切和纯化酶切和纯化纯化了纯化了1023kb的的Bcl I酶切酶切DNA片段片段实验二、实验二、家蝇卵黄蛋白基因组基因的克隆家蝇卵黄蛋白基因组基因的克隆和序列分析和序列分析 特异性探针特异性探针噬菌斑原噬菌斑原位杂交位杂交鉴定鉴定可疑阳性克隆可疑阳性克隆亚克亚克 隆隆文库液文库液转化转化KW251噬菌斑噬菌斑三次纯化三次纯化噬菌斑原噬菌斑原位杂交位杂交-DNA
7、 提提 取取 阳性克隆阳性克隆单酶切和单酶切和双酶切双酶切Southern BlototHind IIIHind IIIXhoIXhoI目的目的DNA片段片段测序测序序列分析序列分析实验二、技术路线实验二、技术路线实验二结果实验二结果GCTCCCGGCCGCCATGGCCGCGGGATCGAA CAAGAAGTCA CCGTTTTCATCACCGGTCTG CCCCAGTCCTTGGAGGATGTGAAAAAGGCCAACACCAAATTGATCCAGTCCTACATTCAACGTTACAGCAAAAAACCCGAAGCACCCCAGGGTGAGGATCAATCGAAATGGGAAAATGAA
8、AAACCTGTGGGCGGTCATTTGGTTGTCATCGATTTGGGCCATGCCATCACCAATGTGGAACGTTATGCCACTTTGAATGTCAAGGAGACCGGTAAAATGATTGGCAAGACCTTGGCCGAGTTGGAGAGGGAAAGCAATGTCGATTTGGAAGATCTCCATGTCATTGGTCAGGGTATTGGTGCCAATGTTGCCGGTGCTGCTGGTAAGGCTTTCAAGGACATTACCACCCACAAATTGGATCGCATTACTGCCTTGGACCCTGCCAGCCAAATGGCCAAGGATCCCAAAGTTTTGACCGGT
9、TTGTCTCGTGGCAGTGCCAAATTCGTTGATGCCATCCACACCTCCGCCTTGGGTATGGGCACCACCCGTCGTGTTGGTGATGTTGATTTCTTCCCCAATGGACCATGCCAAGGTGTTCCCGGTAGCCGCAATGCCATCGATGCCCAAGCTCGTGCCACACGTCTCTTTGCCGAAACAGTTCGTCCCGGTAACAGCCGCAATTTCCCTGCCGTTGAGGCCAGCTCTTTGAAACAGTACCGCAACAATGATGGCTATGGCAAACGCACCTACATGGGCATTGCCACCCATCGTGACATCTCC
10、GGTGACTACATGTTGGAGGTTAAATCACTAGTGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGC卵黄蛋白基因部分卵黄蛋白基因部分DNA片段特异性探针序列片段特异性探针序列2.1 特异性探针制备特异性探针制备 制备了大小为制备了大小为768bp的地高辛标记的的地高辛标记的DNA片段特异性探片段特异性探针,工作浓度为针,工作浓度为1:2000。实验二结果实验二结果 2.2 阳性克隆的筛选和纯化阳性克隆的筛选和纯化1#positive clone(about 2000 plaques/plate)Fig.3 Screen
11、ing result of 1st round situ hybridization图图3 第一次噬菌斑原位杂交第一次噬菌斑原位杂交筛选结果筛选结果YP1 2#positive clone(about 200 plaques/plate)Fig.4 Screening result of 2nd round situ hybridization图图4 第二次噬菌斑原位杂交筛第二次噬菌斑原位杂交筛选结果选结果Numbers:11 positive clone(11 plaques/plate)Fig.5 Screening result of 3rd round situ hybridizati
12、on图图5 第三次噬菌斑原位杂交筛选第三次噬菌斑原位杂交筛选结果结果获得了含家蝇卵黄蛋白基因的阳性克隆获得了含家蝇卵黄蛋白基因的阳性克隆2.0 2.3 4.4 6.6 9.423 1.4 1.6 2.0 3.5 4.3 5.0 21 1 2 3 4 5 6 kb kb Fig.6 Digestion analysis of recombinant-DNA of positive plaque图图6 阳性克隆阳性克隆-DNA的酶切分析的酶切分析实验二结果2.3 mdYP基因组基因的克隆基因组基因的克隆1:Lambda DNA/Hind Marker 2:Xho,3:Xho/Hind,4:Hind
13、,5:Sal6:DNA/EcoR+Hind Marker3.5 kb 1 2 4 1:Xho I,2:Hind 3:Xho/Hind Fig.7 Southern blot of recombinant -DNA of positive plaque with mdYP1 DNA probe DIG-labeled 图图7 阳性克隆阳性克隆-DNA的的 Southern blot实验二结果2.3 mdYP基因组基因的克隆基因组基因的克隆 1 ACAGAATTTGCTATTTAGGTCTTATATTTCTCAGAGCAAAGAGCTGGGCTGCAGAGAGATTTATGACAACGCCGTTG
14、TGTGGTGTATGTATATAGAAAGA 100 101 ATAGAAGAATTACTTTNCTTAGTTGTTTTTTAAATAATCCTGTCCAACAAATGTGTCCAATCCAATTCTTGTTTTATTGGTTTTATCCCTCCTTAATATT 200 201 AATCTTTTTGGTCTTATTGAATAATTATTGATTGTGGTGATTGCTGTCTCTACTTCGTTTGGTTTGGTTTGGTTGTCAGTTGCGAACGTTGGAAACAAAA 300 301 ATGAAAAACGTCCCAACGAAACGAATATGAAGGCCACAAAGGAATACCCG
15、ATAAAAAATAAACAGAAAGCAAAGACTCCGGGTACTCTGTTGTTTACGAA 400 401 TGAGACATGAGAGAATTGAACATCTTCACTAAAGAGCTCGGAATTAGTTACAAATTAAATTGAATTCGACGGTGCGGTGGCGACATGACAGACGGACGGGT 500 501 TGATGGATAGATAACGGCGTTGAGAGTGAATGTGTTGGCGTCTTGTCTCTATTGCAGGGTGATTCATATATTAGAAAATTTACAATGGAAAAGTGGTTAT 600 601 TTTAAATAAGAAATAATATATA
16、TATGATATATATGATGTTTGGGGAAAAAATATGAAAAGATTACACTCTTACCTCATTATCTTTACTAAAAAAGGTATT 700 701 TTATGTATAAAAGGCTTGCAAAGTCGAAGTCTATTCACAAAAGATTCGAAAACGGTAATAAATGATCCTTCAGCAAAATATTATTGGACAGTATTGGACA 800 801 ATTCAACGATAAAAAAGTCACATTAAAAAGTGCTTTAAAAATAATGGCGGTTGACTTTTTTGCAGTTTTTTTTTTATCTTACCCTTTATGTCTAAAACGG 900
17、 901 ACATTTTCAAAGGAACCTTATTCTAAAAATCTCAAAATATATGGAAGAGGGGGTAACTTTCCTCCTCTATTTAGGTTACTTTCCGATGTAAATTTTCAAA 10001001 ACGCCATTACATTTGTCTTCTATTTTTAGCCCTACTTTCATAATCTACTAGATTATTTCAGTATTTTTTTGCACAGTGCAGGTGATGATATTGGATAATT 11001101 CTTATTGAGGAAAAAATTCCCCAGTAAGAATGGAGAATCGGGTTATGAAACAAGATTTTTTAATAATTTCATTAA
18、TTATTTATTTTTTGNTTCTATGATT 12001201 TTGTGTTTTTTTTTTTTTTTGAATATTATTTTGAAATAAAGTGAAATCGAAATCTTCTCCTTTTTAGGTTATTGATCTAAAATACAAGGCTATTGCCAAA 13001301 ATCATGTAATACAATATTTGCTGAAATAGGCCAAATCACTTCTCGCCCTCCGTTCTATTTTTGATGACAGTGAAGCATTATGCAAGCTTGTTTCAATCAATTCT 14001401 CCCGCTTATCGTCACAACCTCTACAGATTTTGCAATTTACG
19、TAAAGAAAAAGAAAAACGGCAAAATATTGAAAATGAAAATCAGCAAAAATCAAAAAAAT 15001501 TATCAGCAGTTCTCGCTTAACTATTTTGCTGTGAAATGTTAAATTTATTTGATATAAATATATAAATACCCCCAGTGGAAGCCAGTG 16001601 GAGGGTACATTTCACAAGTTAGAACATTCGGCTTAAGAAGTGCCCGTACGACTTTGGGAATTTTTGAAACTGACCGACAGAAGGAATCCATTGGGAG 17001701 TTTTGTGCTTTGTAGCCTTTGTGGCTG
20、CCGGCGCCTTGGCCTCACAATCGCAGGACTACAGTCCAAAGCCAGCACATTGGCTGAAACCCACCGAATTGGA 18001801 GGAGCTCACCTTTGAGCAGCTGGAGAATATGCCATTGGAAAAGGGAGCCAAATTGATGCGTAAACTCTGTAAGTAGCCAGTC 19001901 AAGAATTTGGAAAAGACCTCCAATAATACAATTTCTCTCTTCTCTAGACCACCTGTCCCAAATCGACTACTCTGTGTCGCCCAACTTTGTGCCCAGTCCC 20002001 AGCAATGTCCCCGTC
21、TACATTTTCAACAGCAAGGGTGAAAAAGAAACCTGCAACTTGAACAACTACGTCGACATTGCCAAGGAAAAGCCGAAATTTGGCG 2100 获得了全长获得了全长3991bp的基因组序列,包含的基因组序列,包含1.7kb卵黄蛋白卵黄蛋白基因组基因及其基因组基因及其5-调控区序列。调控区序列。2101 AACAAGAAGTCACCGTTTTCATCACCGGTCTGCCCCAGTCCTTGGAGGATGTGAAAAAGGCCAACACCAAATTGATCCAGTCCTACATTCAACGTTACAG 22002201 CAAAAAACCCGAAGCACCC
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