生物催化物质课件.ppt
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- 生物 催化 物质 课件
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1、生 物 催 化 物 质第一节第一节 概概 述述酶酶是由活细胞产生的一类具有催化活性的蛋白质是由活细胞产生的一类具有催化活性的蛋白质特点:活细胞产生特点:活细胞产生 催化活性不依赖完整细胞的存在催化活性不依赖完整细胞的存在 不都是蛋白质不都是蛋白质目前将生物催化剂分为两类目前将生物催化剂分为两类酶、核酸催化剂(核酶、脱氧核酶)酶、核酸催化剂(核酶、脱氧核酶)一、酶的概念一、酶的概念与一般催化剂的异同与一般催化剂的异同 加快反应速度加快反应速度,本身在反应前本身在反应前后无变化后无变化 催化热力学上催化热力学上允许进行的化允许进行的化学反应学反应 来源来源 本质本质 催化特点催化特点 高度催化效率
2、高度催化效率 高度专一性高度专一性 高度不稳定性高度不稳定性 可代谢及可调节性可代谢及可调节性绝对特异性绝对特异性相对特异性相对特异性立体异构特异性立体异构特异性1.核酶核酶(ribozyme)具有催化活性的具有催化活性的RNA二、核酶的简介二、核酶的简介1982年,Cech等在研究四膜虫rRNA前体加工时,发现其rRNA前体具有自我剪接的能力。是对传统酶学的补充。核酶二级结构核酶二级结构槌头状结构槌头状结构底物部分底物部分同一分子上包括有催化同一分子上包括有催化部份和底物部份部份和底物部份 催化部份和底物部份组催化部份和底物部份组成锤头结构成锤头结构 第二节第二节 酶的分子结构与催化活性酶的
3、分子结构与催化活性一、一、酶的化学组成酶的化学组成蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)n 单纯酶单纯酶 (simple enzyme)n 结合酶结合酶(conjugated enzyme)q 酶蛋白决定反应的特异性酶蛋白决定反应的特异性q 辅助因子参与具体反应过程辅助因子参与具体反应过程 辅酶辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松,非共价键相连,可疏松,非共价键相连,可用用透析或超滤的方法除去。透析或超滤的方法除去。辅基辅基 (prosth
4、etic group):与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,共价键相连,不紧密,共价键相连,不能用能用透析或超滤的方法除去。透析或超滤的方法除去。金属离子的作用金属离子的作用组成酶的活性中心;组成酶的活性中心;稳定酶的构象;稳定酶的构象;参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;小分子有机化合物的作用小分子有机化合物的作用在反应中起运载体的作用,传递电子、在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其它基团。质子或其它基团。尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)维生素维生素B2(核黄素)(核黄
5、素)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸维生素维生素B12生物素生物素吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)叶酸叶酸NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸,辅酶I)NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶苷酸磷酸,辅酶II)FMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)辅酶辅酶A(CoA)硫辛酸硫辛酸钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类生物素生物素磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛四氢叶酸四氢叶酸氢原子(质子)氢原子(质子)醛基醛基
6、酰基酰基烷基烷基二氧化碳二氧化碳氨基氨基甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基甲炔基、甲酰基等一碳单位等一碳单位所含的维生素所含的维生素名名称称小分子有机化合物小分子有机化合物(辅辅 酶酶 或或 辅辅 基基)转移的基团转移的基团尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP之一)之一)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸维生素维生素B12生物素生物素吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)叶酸叶酸NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸
7、,辅酶I)NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶苷酸磷酸,辅酶II)FMN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)辅酶辅酶A(CoA)硫辛酸硫辛酸钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类生物素生物素磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛四氢叶酸四氢叶酸氢原子(质子)氢原子(质子)醛基醛基酰基酰基烷基烷基二氧化碳二氧化碳氨基氨基甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基甲炔基、甲酰基等一碳单位等一碳单位所含的维生素所含的维生素名名称称小分子有机化合物小分子有机化合物(辅辅 酶酶 或或 辅辅 基基)转移的基团转移的基团二、二、
8、维生素的种类及维生素的种类及B B族维生素的族维生素的辅酶(辅基)形式和主要作用辅酶(辅基)形式和主要作用三、酶的活性中心三、酶的活性中心必需基团必需基团(essential group)酶分子中氨基酸残酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关一些与酶活性密切相关的化学基团。的化学基团。或称活性部位或称活性部位(active site),指必需基团指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。化为产物。酶的活性中心酶的活性中心(act
9、ive center)活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团(binding group)与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。的空间构象所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团底底 物物 活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 活性中心活性中心 四、酶的分子结构与催化活性的关系四、酶的分子结构与催化活性的关系五、酶原与酶原的激活五、酶原与酶原的激活 酶原酶原 (zym
10、ogen):有些酶在特定细胞内合成或刚有些酶在特定细胞内合成或刚分泌时没有形成活性中心或活性中心被酶分子的分泌时没有形成活性中心或活性中心被酶分子的其它部位覆盖,因此无催化活性。其它部位覆盖,因此无催化活性。酶原的激活:酶原的激活:酶原在一定条件下经蛋白水解酶作酶原在一定条件下经蛋白水解酶作用,切去一段或几段肽段使其形成活性中心或已用,切去一段或几段肽段使其形成活性中心或已形成的活性中心暴露,使无催化活性的酶原转变形成的活性中心暴露,使无催化活性的酶原转变为有催化活性的酶的过程。为有催化活性的酶的过程。酶原激活的机理酶原激活的机理酶酶 原原分子构象发生改变分子构象发生改变形成或暴露出酶的活性中
11、心形成或暴露出酶的活性中心 一个或几个特定的肽键断裂,水解一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或几个短肽掉一个或几个短肽在特定条件下在特定条件下赖赖缬缬天天天天天天天天甘甘异异赖赖缬缬天天天天天天天天缬缬组组丝丝甘甘异异缬缬组组丝丝肠激酶肠激酶胰蛋白胰蛋白酶酶胰蛋白酶原的激活过程胰蛋白酶原的激活过程酶原激活的生理意义酶原激活的生理意义 避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化 酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证 体内代谢正常进行。体内代谢正常进行。六、六、同工酶同工酶同工酶同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化学是指催化相
12、同的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。免疫学性质不同的一组酶。乳酸脱氢酶的同工酶乳酸脱氢酶的同工酶举例:举例:乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶(LDH1 LDH5)四个亚基四聚体,四个亚基四聚体,M型、型、H型型 分子结构不同,电泳速度不同,电泳分离分子结构不同,电泳速度不同,电泳分离LDH1LDH2LDH3 LDH4 LDH5 不同组织中各酶的含量与分布比例不同不同组织中各酶的含量与分布比例不同 与组织利用乳酸的生理过程有关与组织利用乳酸的生理过程有关 LDH1、2 乳酸亲和力大,氧化成丙酮酸乳酸亲和力大,氧化成丙酮酸 心肌心肌 有氧
13、氧化有氧氧化 LDH4、5 丙酮酸亲和力大,还原成乳酸丙酮酸亲和力大,还原成乳酸 骨骼肌骨骼肌 无氧酵解无氧酵解代谢调节代谢调节心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝病病人血清LDHLDH同工酶谱的变化同工酶谱的变化1 1酶酶活活性性心肌梗死酶谱心肌梗死酶谱正常酶谱正常酶谱肝病酶谱肝病酶谱2 23 34 45 5六、别构酶六、别构酶别构调节别构调节 (allosteric regulation)别构酶别构酶(allosteric enzyme)别构效应剂别构效应剂(allosteric effector)别构激活剂与别构抑制剂别构激活剂与别构抑制剂别构剂与某些酶分子别构剂与某些酶分子活性中心外活性
14、中心外的某部分的某部分可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催化活性,此种调节方式称化活性,此种调节方式称别构调节。别构调节。别构酶别构酶结构特点:多亚基寡聚酶结构特点:多亚基寡聚酶 催化位点与别构位点催化位点与别构位点 别构剂别构剂:生理小分子物质:生理小分子物质 (底物、产物、中间代谢物底物、产物、中间代谢物)别构激活剂与别构抑制剂别构激活剂与别构抑制剂 调节代谢调节代谢,常位于代谢途径的开端常位于代谢途径的开端别构酶常为多个亚基构成的寡聚体,具别构酶常为多个亚基构成的寡聚体,具有协同效应。有协同效应。别构激活别构激活别构抑制别构抑制别构酶的形曲线别
15、构酶的形曲线无别构效应剂无别构效应剂七、多酶复合体、多酶体系与多功能酶七、多酶复合体、多酶体系与多功能酶 多酶复合体:多酶复合体:几种酶分子聚集在一起组成一物理几种酶分子聚集在一起组成一物理复合体,若把物理复合体解体,各酶活性消失复合体,若把物理复合体解体,各酶活性消失 丙酮酸脱氢酶复合体:丙酮酸脱氢酶复合体:丙酮酸脱氢酶、二氢硫辛丙酮酸脱氢酶、二氢硫辛酸乙酰转移酶、二氢硫辛酸脱氢酶酸乙酰转移酶、二氢硫辛酸脱氢酶 多酶体系:多酶体系:代谢途径中许多酶参与,依次完成反代谢途径中许多酶参与,依次完成反应过程,但彼此结构无关联应过程,但彼此结构无关联 糖酵解糖酵解过程中的过程中的1111个酶均位于细
16、胞液中,组成一个酶均位于细胞液中,组成一个多酶体系个多酶体系 多功能酶多功能酶(multifunctional enzyme):有的有的酶分子中存在多种催化活性部位酶分子中存在多种催化活性部位 大肠杆菌大肠杆菌DNA聚合酶聚合酶I、哺乳动物的脂肪酸、哺乳动物的脂肪酸合成酶合成酶 意义:提高催化效率意义:提高催化效率第三节第三节 酶促反应的特点及作用机制酶促反应的特点及作用机制(一)酶促反应具有高度的催化速率(一)酶促反应具有高度的催化速率 一、一、酶促反应的特点酶促反应的特点酶的催化效率通常比非催化反应高酶的催化效率通常比非催化反应高1081020倍,倍,比一般催化剂高比一般催化剂高10710
17、13倍。倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不需要较高的反应温度。酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的酶和一般催化剂加速反应的机理都是降低反应的活化能活化能(activation energy)。酶比一般催化剂更有。酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能。效地降低反应的活化能。反应总能量改变反应总能量改变 非催化反应活化能非催化反应活化能 酶促反应酶促反应 活化能活化能 一般催化剂催一般催化剂催化反应的活化能化反应的活化能 能能量量 反反 应应 过过 程程 底物底物 产物产物 酶促反应活化能的改变酶促反应活化能的改变 活化能活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量底物分子从初态
18、转变到活化态所需的能量。一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶的这种特性称为酶的特异性一定的产物。酶的这种特性称为酶的特异性或专一性。或专一性。*酶的特异性酶的特异性(specificity)(二)酶促反应具有高度的特异性(二)酶促反应具有高度的特异性 绝对特异性绝对特异性(absolute specificity):只能作用只能作用于一种底物进行反应于一种底物进行反应 相对特异性相对特异性(relative specificity):作用于一作用于一类化合物或一类化学键进行
19、反应类化合物或一类化学键进行反应。立体结构特异性立体结构特异性(stereo specificity):对底物对底物的立体构型有严格要求。的立体构型有严格要求。(三)酶活性的可调节性(三)酶活性的可调节性 别构调节别构调节 酶原与酶原的激活酶原与酶原的激活 共价修饰的调节共价修饰的调节 酶含量的调节酶含量的调节二、酶促反应的作用机制二、酶促反应的作用机制1、酶与底物形成酶、酶与底物形成酶-底物复合物底物复合物2、酶与底物的过渡状态互补、酶与底物的过渡状态互补酶底物复合物酶底物复合物 E+S E+P ES 酶降低反应的活化能:酶降低反应的活化能:释放出的结合能抵消部分活化能释放出的结合能抵消部分
20、活化能酶与底物相互接近时酶与底物相互接近时,其结构相其结构相互诱导、相互变形和相互适应,互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。进而相互结合。二、酶促反应作用机制二、酶促反应作用机制1.邻近效应邻近效应(proximity effect)与与 定向排列定向排列(orientation arrange)2.多元催化多元催化 两性电解质,含有两性电解质,含有多种功能基团,同多种功能基团,同一种功能基团在不一种功能基团在不同的蛋白质分子中同的蛋白质分子中处于不同的微环境处于不同的微环境下,解离度也有差下,解离度也有差异。异。3.表面效应表面效应 第四节第四节酶促反应的动力学酶促反应的动力学q概念概
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