遗传学数量性状遗传分析示范课件.ppt
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1、遗传学数量性状遗传分析优选遗传学数量性状遗传分析1.1.质量性状与数量性状质量性状与数量性状质量性状:表型之间截然不同,具有质的差别,用文字描质量性状:表型之间截然不同,具有质的差别,用文字描述的性状称为质量性状。如水稻的糯与粳,人的述的性状称为质量性状。如水稻的糯与粳,人的A、B、O血型等。血型等。数量性状:性状之间呈连续变异状态,界限不清楚,用数数量性状:性状之间呈连续变异状态,界限不清楚,用数字描述的性状。如人的身高、体重,作物的产量,棉花的字描述的性状。如人的身高、体重,作物的产量,棉花的纤维长度等纤维长度等质量性状和数量性状的区别质量性状和数量性状的区别 一一 是表型为是表型为严格的
2、连续变异的严格的连续变异的性状,如牛的泌乳性状,如牛的泌乳量,羊毛的长度等等;量,羊毛的长度等等;数量性状包括两大类:数量性状包括两大类:二二 是表型呈非连续变异,而遗传物质的数量呈是表型呈非连续变异,而遗传物质的数量呈潜在的连续变异的性状,即只有超越某一遗传阈值时潜在的连续变异的性状,即只有超越某一遗传阈值时才出现的性状,如抗病、死亡率以及单胎动物的产仔才出现的性状,如抗病、死亡率以及单胎动物的产仔数等性状,称为阈性状(数等性状,称为阈性状(threshold character或或threshold trait)。)。数量性状的连续性特点:数量性状的连续性特点:第一,一种基因型影响一组表型
3、的表现。其结果模糊第一,一种基因型影响一组表型的表现。其结果模糊了基因型所决定的不同表型之间的差异,因而不能将一个了基因型所决定的不同表型之间的差异,因而不能将一个特定的表型归属于一个特定的基因型。特定的表型归属于一个特定的基因型。第二,许多不同基因座的等位基因都能使某一种被观第二,许多不同基因座的等位基因都能使某一种被观察的表型发生改变。察的表型发生改变。1 1)数量性状是可以度量的;)数量性状是可以度量的;2 2)数量性状呈连续性的变异;)数量性状呈连续性的变异;3 3)数量性状的表现容易受到环境的影响;)数量性状的表现容易受到环境的影响;4 4)控制数量性状的遗传基础是多基因系统)控制数
4、量性状的遗传基础是多基因系统 2.数量性状的特点:数量性状的特点:数量性状的遗传在本质上与孟德尔式的遗传完数量性状的遗传在本质上与孟德尔式的遗传完全一样,只是需要用多基因理论来解释。全一样,只是需要用多基因理论来解释。1909年,瑞典遗传学家年,瑞典遗传学家Nilsson-Ehle对小麦和燕麦中对小麦和燕麦中籽粒颜色的遗传进行了研究,发现在若干个红粒与白粒的籽粒颜色的遗传进行了研究,发现在若干个红粒与白粒的杂交组合中有如下杂交组合中有如下A、B、C 3种情况:种情况:二二 数量性状遗传的多基因假说数量性状遗传的多基因假说在小麦和燕麦中,有在小麦和燕麦中,有3 3对基因与种皮颜色有关;对基因与种
5、皮颜色有关;1对基因:对基因:F2表型表型3:1分离;分离;2对基因:对基因:F2表表型型15:1分离;分离;3对基因:对基因:F2表型表型63:1分离分离F F2 2的红色籽粒中呈现各种程度的差异,按红色程度可分为:的红色籽粒中呈现各种程度的差异,按红色程度可分为:A A组:组:1/41/4红粒:红粒:2/42/4中等红:中等红:1/41/4白粒;白粒;B B组:组:1/161/16深红:深红:4/164/16红:红:6/166/16中等红:中等红:4/164/16淡红:淡红:1/161/16白色;白色;C C组:组:1/641/64极深红:极深红:6/646/64深红:深红:15/6415
6、/64次深红:次深红:20/6420/64中等红:中等红:15/6415/64中淡红:中淡红:6/646/64淡红:淡红:1/641/64白色白色 红色籽粒的颜色变异程度与决定红色籽粒的颜色变异程度与决定“红色红色”的基因数目有的基因数目有关,而与基因的种类无关。以关,而与基因的种类无关。以B B组为例:组为例:设:设:R1 r1及及R2 r2为两对决定种皮颜为两对决定种皮颜色的基因,大写字色的基因,大写字母表示增效基因母表示增效基因(“增加增加”红色),红色),小写字母表示减效小写字母表示减效基因(基因(“不增加不增加”红色),红色),R与与r不存不存在显隐性关系。在显隐性关系。主要论点:数
7、量性状是由大量的、数量微小而类似的、主要论点:数量性状是由大量的、数量微小而类似的、并且可以相加的基因控制,这些基因在世代相传中服从并且可以相加的基因控制,这些基因在世代相传中服从经典遗传学规律,这些基因一般没有显隐性区别。经典遗传学规律,这些基因一般没有显隐性区别。Nilsson-EhleNilsson-Ehle 根据小麦籽粒颜色遗传研究提出假说:根据小麦籽粒颜色遗传研究提出假说:JohannsenJohannsen提出数量性状同时受到基因型和环境的作用,提出数量性状同时受到基因型和环境的作用,而且数量性状的表现对环境相当敏感。而且数量性状的表现对环境相当敏感。多基因学说的要点:多基因学说的
8、要点:1)数量性状由多对微效基因或多基因控制;)数量性状由多对微效基因或多基因控制;2)多基因中的每一对基因对性状的效应是微小的;)多基因中的每一对基因对性状的效应是微小的;3)微效基因的效应相等,而且相互累加;)微效基因的效应相等,而且相互累加;4)微效基因之间一般不存在显隐性关系;)微效基因之间一般不存在显隐性关系;5)微效基因对环境敏感;)微效基因对环境敏感;6)多基因往往有多效性;)多基因往往有多效性;7)多基因及主效基因都位于染色体上,具有分离、重组、)多基因及主效基因都位于染色体上,具有分离、重组、连锁的性质。连锁的性质。数量性状在研究方法的特点:数量性状在研究方法的特点:1)在杂
9、交后代中,个别或少数后裔所能提供的信息量很少。)在杂交后代中,个别或少数后裔所能提供的信息量很少。研究的单位必须扩大到群体和许多世系才可能获得对其研究的单位必须扩大到群体和许多世系才可能获得对其 遗传规律和动态变化的认识;遗传规律和动态变化的认识;2)对个体的性状进行测量;)对个体的性状进行测量;3)利用生物统计学的方法,计算性状的表型参数:平均数、)利用生物统计学的方法,计算性状的表型参数:平均数、方差(或标准差)、变异系数,以及遗传参数:遗传率、方差(或标准差)、变异系数,以及遗传参数:遗传率、遗传相关系数等。遗传相关系数等。以假定的玉米穗长的遗传模式来直观地说明这一假说:以假定的玉米穗长
10、的遗传模式来直观地说明这一假说:(1)1)如果两亲本相差一对基因:如果两亲本相差一对基因:P aaP aa(6cm6cm)AA AA(18cm18cm)F1 F1 AaAa(12cm12cm)自交自交 F2 F2 1aa 2Aa 1AA1aa 2Aa 1AA 频率频率 1/4 2/4 1/41/4 2/4 1/4增加一个增加一个A,就相当于在短穗亲本的基础上增加,就相当于在短穗亲本的基础上增加 6 cm(2)2)假设该性状由三对等位基因(假设该性状由三对等位基因(A A1 1a a1 1,A A2 2a a2 2和和A A3 3a a3 3)控制,依)控制,依据多基因假说,等位基因间无显性效应
11、,非等位基因间无上位据多基因假说,等位基因间无显性效应,非等位基因间无上位效应,基因的效应应相同且可加效应,基因的效应应相同且可加 如果如果A A1 1A A1 1A A2 2A A2 2A A3 3A A3 3=18cm=18cm,a a1 1a a1 1a a2 2a a2 2a a3 3a a3 3=12cm,=12cm,可知一个基因的效应值(可知一个基因的效应值(A A1 1=A=A2 2=A=A3 3)为)为3cm3cm,(,(6A=186A=18)一个一个a a基因的效应值(基因的效应值(a a1 1=a=a2 2=a=a3 3)为)为2cm2cm。(。(6a=126a=12)因此
12、,每用一个因此,每用一个a基因替换一个基因替换一个A基因,穗长将减少基因,穗长将减少1cm上位效应(I):不同基因座非等位基因间互作产生的方差,与杂种优势有关。(一)表型值及其方差分量理想群体假设群体中的交配是随机的,但很多群体对于某些性状而言交配并不是随机的。如人的身高、体重,作物的产量,棉花的纤维长度等方差(V):表示一组资料的分散程度,是全部观察数偏离平均数的重要参数.因此,每用一个a基因替换一个A基因,穗长将减少1cm遗传规律和动态变化的认识;V越大,表示变异程度越大。VP=VG +Ve2)多基因中的每一对基因对性状的效应是微小的;方差(或标准差)、变异系数,以及遗传参数:遗传率、杂交
13、分析亲本、F1、F2或回交世代的表现型方差 AaAa一个a基因的效应值(a1=a2=a3)为2cm。第一,一种基因型影响一组表型的表现。易患性的变异是呈连续变异的,它表示人体内由基因决定的某种抗体物质的浓度差异。只含有一个阈值的阈性状又称为二者居一性状,或称全或无性状。(一)表型值及其方差分量AaAa075 Ve=2.忽略环境效应的影响,下列杂交试验的结果将是:忽略环境效应的影响,下列杂交试验的结果将是:A A1 1A A1 1A A2 2A A2 2A A3 3A A3 3 a a1 1a a1 1a a2 2a a2 2a a3 3a a3 3 A1a1A2a2A3a3 F F2 2:6A
14、:5A1a:4A2a:3A3a:2A4a:1A5a:6a频率:频率:1/64:6/64:15/64:20/64:15/64:6/64:1/64穗长:穗长:18 17 16 15 14 13 12(cm)将将F2的各基因频率作一曲线图:的各基因频率作一曲线图:在以上例子中:小写字母仅仅保持一个基数,叫做无效等位在以上例子中:小写字母仅仅保持一个基数,叫做无效等位 基因(基因(null alleles),大写字母基因具有使),大写字母基因具有使 数数 量增加的效应,每增加一个,效应加量增加的效应,每增加一个,效应加1份,份,基因数目越多,每份的效应越小。大写字母基因数目越多,每份的效应越小。大写字
15、母 基因叫做有效等位基因(基因叫做有效等位基因(active alleles)无效等位基因:无效等位基因:不能产生野生型表不能产生野生型表型,完全失去活性型,完全失去活性的突变基因。的突变基因。F2表型类别数表型类别数 基因数基因数+1一对等位基因一对等位基因 2+1=3三对等位基因三对等位基因 6+1=7 基本物质处于某一特定范围内,基本物质处于某一特定范围内,表现为正常,如果超出某一阈表现为正常,如果超出某一阈值,表型就不正常。值,表型就不正常。基本物质受多基因控制,但性基本物质受多基因控制,但性状的改变仅发生在基本物质达状的改变仅发生在基本物质达到或者超过某一阈值时才发生。到或者超过某一
16、阈值时才发生。表示发生率为表示发生率为20%的一的一个阈性状的两种分布个阈性状的两种分布阈性状:遗传基础是微效多基因、表型是非连续变异的一类性状。阈性状:遗传基础是微效多基因、表型是非连续变异的一类性状。三三 阈性状及其特性阈性状及其特性 人类多基因遗传病如唇腭裂、脊柱裂、先天性心脏病、原发性高人类多基因遗传病如唇腭裂、脊柱裂、先天性心脏病、原发性高血压等,一般认为是由遗传因素与环境效应共同决定个体是否容血压等,一般认为是由遗传因素与环境效应共同决定个体是否容易患病,称为易患(感)性。易患性的变异是呈连续变异的,它易患病,称为易患(感)性。易患性的变异是呈连续变异的,它表示人体内由基因决定的某
17、种抗体物质的浓度差异。易患性高的表示人体内由基因决定的某种抗体物质的浓度差异。易患性高的个体,抗病力低,当一个个体的易患性超过一定限度个体,抗病力低,当一个个体的易患性超过一定限度-阈值时,阈值时,该个体即表现为该个体即表现为“患病患病”。连续分布的易患性。连续分布的易患性(X)就被阈值区分就被阈值区分出不连续的出不连续的“发病发病”与与“正常正常”两类。两类。只含有一个阈值的阈性状又称为二者居一性状,或称全或无性状。只含有一个阈值的阈性状又称为二者居一性状,或称全或无性状。阈性状与非阈性状的数量遗传学分析的原理和方法基本相同。阈性状与非阈性状的数量遗传学分析的原理和方法基本相同。第二节第二节
18、 数量性状遗传分析的基本方法数量性状遗传分析的基本方法一一.数量性状的遗传率数量性状的遗传率 (一一)表型值及其方差分量表型值及其方差分量 表型值及其剖分表型值及其剖分表型由遗传因素和环境因素共同决定表型由遗传因素和环境因素共同决定 即:即:P=G+E基因型值由基因型值由3部分组成:部分组成:G=A+D+I基因的累加效应(基因的累加效应(A A):多基因的累加效应;许多微):多基因的累加效应;许多微效基因的总和,可遗传效基因的总和,可遗传,且固定且固定,育种值。育种值。显性离差(显性离差(D D):基因座内等位基因之间的互作效应):基因座内等位基因之间的互作效应;基因在杂合状态时,显性效应所产
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