免疫炎症相关基因多态性与课件.ppt

1、 免疫炎症相关基因多态性与免疫炎症相关基因多态性与非小细胞肺癌预后的关联研究非小细胞肺癌预后的关联研究 胡志斌胡志斌南京医科大学公共卫生学院南京医科大学公共卫生学院Tel(fax):(025)86862756E-mail:zhibin_免疫炎症与肿瘤发生发展的机制免疫炎症与肿瘤发生发展的机制Schetter et al.Carcinogenesis.2010;31:37-49IL4IL4 C-5 C-589T89T和和C-33TC-33T基因多态性基因多态性共同影响肾细胞癌预后共同影响肾细胞癌预后Kleinrath et al.J Clin Oncol.2007;25:845-51.变量变量H

2、R95%CIP年龄年龄1.01.0-1.00.953性别性别1.30.7-2.30.386分级分级I-II1.0III2.01.0-3.70.05IV5.42.4-11.90.001IL4基因型基因型3.11.4-6.9 6028349.815625.0性别男43476.424124.70.805女13423.67027.8病理类型腺癌35362.219226.20.519鳞癌18432.49924.0其它315.52017.9肿瘤分期I14425.44660.40.001II7112.52947.6III22138.913319.6IV13223.210313.4手术否20035.21551

3、5.30.001是36864.815636.8化疗或放疗 无10618.74733.00.102有46281.326423.5研究对象一般情况研究对象一般情况基因多态性选择和检测基因多态性选择和检测n 候选基因策略选择潜在功能性候选基因策略选择潜在功能性SNPsp宿主免疫炎症通路：宿主免疫炎症通路：52个基因个基因p5侧翼区，侧翼区，5UTR，3UTR，外显子区氨基，外显子区氨基酸改变的酸改变的SNP：187个位点个位点n Illumina Golden Gate芯片进行基因分型芯片进行基因分型p设计失败：设计失败：15个位点个位点p分型成功率低分型成功率低(90%)或明显不符合或明显不符合H

4、WE：18个位点个位点GeneSNPsLocationAllelesLog-rank PAdditive modelDominant modelRecessive modelCOX2rs204175 flanking regionC:G0.0710.9990.022IFNA1rs13321905 flanking regionA:G0.0200.0060.774IFNAR2rs4986956Phe8SerG:A0.0100.0020.273IFNGR2rs9808753Gln64ArgA:G0.0760.2400.027IL1Ars18005875-UTRG:A0.0380.0810.138I

5、L1Ars18007945 flanking regionG:A0.0300.0640.138IL1Ars17561Ala114SerC:A0.0290.0880.104IL1Ars13040373-UTRA:G0.0350.1080.104IL5Rrs117134195 UTRA:G0.0120.4980.005IL-8rs40735 flanking regionA:T0.1060.4020.035IL8RBrs11265793-UTRA:G0.0670.0200.513IL10RArs96103-UTRA:G0.0720.0420.111.TLR10rs11096957His241Asn

6、C:A0.0730.0270.212单因素分析单因素分析NSCLCNSCLC预后相关预后相关SNPSNP位于位于18个免疫炎症基因的个免疫炎症基因的27 SNP与与NSCLC预后显著预后显著相关（相关（Log-rank P 0.05）VariablesSEHR95%CIPStage(Dummy variable)0.490.08 1.63 1.39-1.920.001Surgical Operation(Ever vs.never)-0.610.14 0.55 0.41-0.720.001TLR3 rs3775291(Additive model)0.230.09 1.26 1.06-1.49

7、0.010IL-5R rs11713419(Recessive model)1.760.52 5.79 2.11-15.90 0.001IL23R rs6682925(Dominant model)0.300.12 1.35 1.05-1.720.017TLR1 rs5743551(Additive model)-0.200.09 0.82 0.69-0.970.020多因素分析筛选多因素分析筛选NSCLCNSCLC预后独立预测因子预后独立预测因子Unfavorable lociPatientsDeaths MST(Months)Adjusted HR a(95%CI)0531751.901.

8、0011849827.402.23(1.33-3.75)224613922.102.60(1.57-4.31)3825617.703.13(1.82-5.40)4115.5016.22(2.10-125.22)免疫炎症基因联合基因型与免疫炎症基因联合基因型与NSCLCNSCLC死亡风险死亡风险a Adjusted for smoking status,histology,stage,surgical operation and chemotherapy or radiotherapy status 0.000.250.500.751.00020406080Survival time(Month

9、s)0 unfavorable genotype1 unfavorable genotype2 unfavorable genotypes3 unfavorable genotypes4 unfavorable genotypesCumulative Survival免疫炎症基因联合基因型与免疫炎症基因联合基因型与NSCLCNSCLC预后预后0.50.60.70.80.910.511.522.533.544.55Time(year)AUCSurgery+Stage in 568 patients4 SNPs in 568 patientsSurgery+Stage+4 SNPs in 568

10、patients免疫炎症基因型联合临床信息共同免疫炎症基因型联合临床信息共同预测预测NSCLCNSCLC死亡风险死亡风险结结 论论免疫炎症基因多态性可能是非小细胞免疫炎症基因多态性可能是非小细胞肺癌潜在的预后预测因子。肺癌潜在的预后预测因子。国家自然科学基金重点项目国家自然科学基金重点项目(30730080)国家自然科学基金杰出青年基因国家自然科学基金杰出青年基因(30425001)国家重点基础研究规划项目（国家重点基础研究规划项目（973）(2002CB512902)沈洪兵沈洪兵 教授教授 南京医科大学公共卫生学院南京医科大学公共卫生学院许许林林 教授教授 南京医科大学附属江苏省肿瘤医院南京医科大学附属江苏省肿瘤医院陈亦江陈亦江 教授教授 南京医科大学附属江苏省人民医院南京医科大学附属江苏省人民医院致致 谢谢谢谢 谢谢