医学精资料20111917-分子生物学复习题-2010研究生.doc
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- 医学 精品 课件 20111917 分子生物学 复习题 2010 研究生
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1、一、名词解释:1. 系统生物学以整体性研究为特征的一种大科学,是在细胞、组织、器官和生物体整体水平研究结构和功能各异的各种分子及其相互作用,并通过计算生物学来定量描述和预测生物功能、表型和行为。2. 表基因组学是研究在基因组序列不改变的情况下其表达谱改变的机制的分支领域,重点在基因组表达调控。3. Omics组学研究,包括病理基因组学、生殖基因组学、环境基因组学毒物基因组学、营养基因组学、比较基因组学表基因组学、干细胞基因组学、RNA组学、蛋白质组学转录组学、代谢物组学、临床基因组学、化学基因组学调节基因组学、计算机功能基因组学基因组动力学、功能基因组学4. 基因治疗 是指将外源正常基因导入靶
2、细胞,以纠正或补偿因基因缺陷和异常引起的疾病,以达到治疗目的。基因治疗的基本策略:取决于肿瘤的类型,概括起来有下列五种:基因置换:用正常的外源基因置换产生疾病的基因,使致病基因得到永久的更正。此为最理想的基因疗法。基因修正:单基因遗传病在多数情况下是由于基因内部单个碱基发生突变所致,而其他核苷酸序列均正常,因此只要将突变的单个碱基予以更正就能达到基因治疗的目的,而不必将整个基因进行置换。基因修饰:将目的基因导入病变细胞或其他细胞,目的基因的表达产物可以补偿病变基因的功能,而病变基因本身并未改变。由于已经发展了许多有效的方法可以将目的基因导入真核细胞,并获得表达,因而是目前较为成熟的方法。基因抑
3、制:导入外源基因去干扰、抑制有害基因的表达。基因封闭:以mRNA 为靶分子,用特定的可与靶分子互补的DNA或RNA分子与mRNA形成双链,从而改变RNA的剪接方式 ,阻断翻译甚至摧毁异常RNA,在剪接或翻译水平上调节基因的表达。5. 常染色体突变发生在常染色体上的基因突变。包括错义突变 ,无义突变,同义突变,移码突变6. M-CdkCdk指的是cyclin-dependent kinases,周期蛋白依赖性蛋白激酶,是一组丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,和周期蛋白cyclin协同作用,是细胞周期调控中的重要因子。CDK可以和cyclin结合形成异二聚体,其中CDK为催化亚基,cyclin为调节亚基,不
4、同的cyclinCDK复合物,通过CDK活性,到底不同底物磷酸化,而实现对细胞周期不同时相的推进和转化作用。M-Cdk作用于细胞分裂期。7. effector caspase caspase全称为天冬氨酸特异性的半胱氨酸蛋白水解酶。 caspase是一组存在于细胞质中具有类似结构的蛋白酶。它们的活性位点均包含半胱氨酸残基,能够特异性的切割靶蛋白蛋白天冬氨酸残基后的肽键。caspase负责选择性的切割某些蛋白质,从而造成细胞凋亡。8. 26S proteasome蛋白酶体是在细胞质基质中降解被泛素标记蛋白质的大分子蛋白复合体。9. 抑癌基因抗癌基因(antioncogene)是最初的叫法,大约可
5、以追溯到1985 年左右,现多称为抑癌基因(tumor suppressor gene),这是一类可抑制细胞生长并有潜在抑癌作用的基因,当它失活后,可能使癌基因充分发挥作用而导致癌的发生发展。 如果要确定某一特定组织或细胞恶性肿瘤的抑癌基因,需满足以下三个 条件: 在癌的相应正常组织中必须有正常的表达; 在恶性肿瘤中。相应基因应有所改变,包括点突变,片断缺失或 表达缺陷; 导入该基因缺陷的恶性肿瘤细胞中将部分或全部抑制恶性表型。10. 原癌基因c-onc也称为原癌基因(proto-oncgene)有两层含义: 1.原癌基因是不发挥致癌作用的c-onc,正常情况是与细胞增殖有关的基因。 2. v
6、-onc来源于原癌基因,目前所知v-onc,在哺乳动物都可以找到与之相对应的c-onc,具有相似的核苷酸序列,编码结构和功能相似的产物,反之则不然,目前发现几种c-onc没有相应的 v-onc。另一方面,细胞具有c-onc,但没有与之相关的癌基因成分。现在一般认为v-onc源于c-onc,是病毒基因组与细胞基因组发生重组而形成的。 未激活的细胞癌基因 在人体正常细胞中存在,基因序列高度保守 是一种正常基因,被激活后,形成癌性的细胞转化基因 作用通过产物蛋白来体现:调控细胞生长和分化 广泛存在于生物界中,从酵母到人的细胞中都存在11. 基因突变基因突变是指基因组中核酸分子碱基排列顺序的变异及其所
7、引起的生物表型变化。12. 表型表型(Phenotype),也叫表现型,是指生物体个别或少数性状以至全部性状的表现。对于一个生物而言,表示它某一特定的物理外观或成分。如植物的高度、人的血型、蛾的颜色,都是表型的例子。 13. 错义突变错义突变(missense mutation) 在基因的编码序列中,由于碱基的替换,使编码某一氨基酸的密码子变为编码另一氨基酸的密码子,这种突变称为错义突变。14. 无义突变无义突变(nonsense mutation) 在基因的编码序列中,由于碱基的替换,使某个氨基酸密码转变为终止密码,致使肽链合成提前终止,肽链缩短,这种突变称为无义突变。15. 移码突变移码突
8、变(frame-shifting mutation): 在基因的编码序列中,插入或缺失一个或数个(非3的整倍数)碱基,均可造成突变位点后的遗传密码阅读框架发生改变,不能编码出原来多肽链的氨基酸排列顺序。这种突变称为移码突变。16. 肿瘤基因诊断检测致病基因或疾病相关基因的改变,或患者体内病原体所特有的核苷酸序列,以此作为肿瘤诊断的指标。17. 蛋白质组一种细胞、组织或生物体完整基因组所对应的全套蛋白质18. Real time PCR(实时定量PCR)实时定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,使每一个循环变得“可见”,最后通过Ct值和标准曲
9、线对样品中的DNA (or cDNA) 的起始浓度进行定量的方法。 19. Threshold Cycle (Ct)PCR扩增过程中,扩增产物荧光信号超过基线值(进入指数增长期)时的循环数 20. 同尾酶即能切割产生相同末端的限制性内切酶,一般是指能产生相同粘性末端的限制酶。所有钝末端酶产生的末端均是相同的,但一般不把它作为同尾酶来研究。故名思义,同尾酶是不同的酶,它们只是切割DNA产生的末端相同,同尾酶之间的识别序列可以相同也可以不同,但基因工程中识别序列不同的同尾酶的应用性最大。21. DDRPRNA聚合酶(RNA pol)也称转录酶(transcriptase) ,全称依赖DNA的RNA
10、聚合酶(DDRP)。原核生物(E . Coli)RNA pol 由 2 共5 个亚基组成(465KD)。22. 原核生物转录终止子原核生物的转录终止:终止信号存在于RNA聚合酶已转录过的序列中。这种提供终止信号的序列称为终止子(terminator)。1.不依赖因子的转录终止2.依赖因子的转录终止两类终止子有共同的序列特征:转录终止点之前有一段回文序列,回文序列的两个重复部分由几个碱基对的不重复节段隔开。回文结构的对称轴一般距离转录终止点16-24bp)23. 调节基因调节基因是参与其他基因表达调控的RNA或蛋白质的编码基因。调节基因编码的调节物质通过与DNA上的特定位点结合控制转录是调控的关
11、键。 调节物与DNA特定位点的相互作用能以正调控的方式调节靶基因,也能以负调控的方式调节靶基因。24. 结构基因结构基因是编码蛋白质或RNA的任何基因。25. 组成型表达速率不受环境变化或代谢状态影响的基因表达方式称组成型表达;26. 互补现在使用的许多载体都带有一个大肠秆菌DNA的短区段,其中含有了半乳糖苷酶基因(lac Z)的调控序列和头146个氨基酸的编码信息(-肽区段)。这个编码区中插入了一个多克隆位点,不破坏读框,但可使少数几个氨基酸插入到半乳糖苷酶的氨基端,而不影响功能。这种载体适用于缺失掉半乳糖苷酶-肽区段的宿主细胞。虽然宿主和质粒编码的片段各自都没有酶活性,但可以融为一体,形成
12、具有酶活性的蛋白质。这样,lacZ基因上缺失近操作基因区段的突变体与带有完整的近操作基因区段的半乳糖苷酶阴性的突变体之间实现互补,这种互补现象叫互补。27. 遗传密码摆动性tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,并不严格遵循配对原则,这种现象称为密码的摆动性。28. chromatin remodeling染色体重建:指发生在基因活化转录时核小体能量-依赖型的排列或重排。29. transcriptional co-activators and co-repressors转录共激活子(Co-activator):不与DN
13、A调控序列结合 但与转录激活因子结合并激活基因转录的因子。转录共抑制子(Co-repressor):不与DNA调控序列结合 但与转录因子结合并抑制基因转录的因子。30. Kozak sequence存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用。 核糖体能够识别mRNA上的这段序列,并把它作为翻译起始位点。真核生物基因中起始密码子上下游的最佳序列为,-3位为嘌呤碱基;+4位为G,起始密码子AUG中的A处于+1位。A/GCCAUGG被称为kozak序列或扫描序列。二、问答题:1. 简述人类个体基因组分析的意义。人类个体基因组测序对实现个体化的诊断、预防、治疗具有重要意义。目前正在研
14、究下一代DNA测序技术,以期2013年实现1000美元测定人体基因组序列的目标。那时将能对每个患者的基因组DNA测序作为日常诊疗的一部分,使针对每个患者的个体化医疗中的预防、诊断、治疗成为可能。 100000 USD基因组 大幅提升 Sanger法和PCR的性能 提高使用毛细管系统效率的方法(Network Biosystems Co. USA);珠粒基聚合酶簇(Colony)测序技术(美国Agercourt Personal Genomics Co. USA)。 1000 USD基因组 该项目将在微珠上克隆的 DNA放入液滴中,反复进行DNA链伸展和清洗的方法(Duke University
15、,USA);利用“零模式导波管(ZMW)”技术,实时检测在聚合酶作用下每个连接到延伸的DNA分子中的核苷酸(Nanofluidics Co. USA) 作为读取DNA碱基的分子传感器,开发利用聚合酶和核苷酸的系统(VisiGen Biotechnologies Co. USA)等。2. 简述第二代测序技术的原理和应用。第2 代测序技术工作流程3. 2010年诺贝尔生理或医学奖授予了哪项成果?你对此有何评价?2010年,英国生理学家罗伯特爱德华兹因为在试管婴儿方面的研究获得2010年诺贝尔生理学或医学奖。体外受精技术俗称“试管婴儿”技术,是指采用人工方法让卵子和精子在体外受精,进行早期胚胎发育后
16、,移植到母体子宫内妊娠的技术。1968年,爱德华兹与发明腹腔镜技术的帕特里克斯特普托医生正式合作,开始了人的体外受精研究。尽管张民觉完成的哺乳动物体外受精技术已经非常成熟,但应用于人体还有诸多困难。1969年,爱德华兹和斯特普托经过努力,成功地从不育妇女卵巢中获得有活性的卵子,并首次实现了体外受精。经过不断的失败,1977年11月10日,斯特普托成功获得一枚布朗太太的卵子并人工授精成功,两天后将其植入布朗太太的体内,布朗太太顺利怀孕,并且胎儿发育正常。1978年7月25日,世界上第一个“试管婴儿”路易丝乔伊布朗出生。“试管婴儿”技术宣告成功。4. 请用文字加示意图阐述SCF类泛素连接酶复合体的
17、组织模式及作用机制。Ubiquitination of CDK inhibitor SIC1 by SCFCDC4-ROC ligase具体过程原理请参见张令强老师课件【2010-12-20 张令强研究生课 泛素化介导的蛋白质降解 含Smurf1 NCB文章】p435. 请简述线粒体在细胞凋亡发生中的地位及信号机制。细胞凋亡的一个重要途径通过线粒体完成,称为线粒体途径a) The mitochondrial pathway is activated by most cellular stresses. A resulting signal or intracellular change cau
18、ses the release of cytochrome c into the cytosol. Cytochrome c binds to Apaf-1 and procaspase-9 to form the apoptosome and catalyzes the activation of caspase-9. (线粒体途径)Role of mitochondriab) important in necrosisc) important role in activating apoptosisd) some downstream events ATP dependente) cert
19、ain caspases and Bcl-2 family members present in mitochondriaf) permeability transition releases cytochrome cg) cytochrome c binds to apaf-1 and caspase-9 (apoptosome)具体机制可参见张令强老师课件【2010-12-16 张令强研究生课 细胞凋亡的主要信号转导途径】p32或细胞生物学课本相关章节。6. 请简述抑癌蛋白p53的结构组成、作用机制及调控层次。答案见张令强老师课件【2010-12-16 张令强研究生课 细胞周期调控与癌症】
20、P55-p66,相关机理过程可从中总结。7. 简述病毒使细胞恶性转化的途径有哪些。病毒使正常细胞转化为恶性主要通过病毒癌基因编码产物癌蛋白对细胞各部分发生作用。 1) 作用细胞膜 有的病毒癌基因产物为生长因子或其受体类似物,可不断刺激细胞进行增殖。 2 )跨膜信号传导 有的病毒癌基因产物具有类似G蛋白的作用,但不能有效地调节信号输入,而处于持续信号传入状态。 3) 作用细胞质 有的病毒癌基因产物本身为蛋白激酶,通过胞质蛋白激酶的磷酸化而影响细胞第二信使的产生。 4 )作用细胞核 正常细胞核内存在核蛋白和核受体,一些病毒癌基因本身为核蛋白,核受体或转录因子,参与转录及DNA合成的改变。 8. 简
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