第八讲人类基因组计划与基因安全优质课件.ppt
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1、第八讲人类基因组计划与基因安全优选第八讲人类基因组计划与基因安全1 1 HGP(Human Genome Projects)简介简介人类基因组计划是由美国科学家于人类基因组计划是由美国科学家于1985年率先提出、于年率先提出、于1990年年正式启动的。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共正式启动的。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一价值达同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。这一计划旨亿美元的人类基因组计划。这一计划旨在为在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序,发现所有人多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序,发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置,破译
2、人类全部遗传信息类基因并搞清其在染色体上的位置,破译人类全部遗传信息。人类基因组计划可以与人类基因组计划可以与“曼哈顿原子弹计划曼哈顿原子弹计划”、“阿波罗阿波罗”登登月计划媲美,但意义上远远超出了以上两个计划,因为启动人月计划媲美,但意义上远远超出了以上两个计划,因为启动人类基因组计划的目的是致力于人类的和平、幸福和超过分享。类基因组计划的目的是致力于人类的和平、幸福和超过分享。科学家的胆略科学家的胆略诺贝尔奖获得者诺贝尔奖获得者Renato Dulbecco于于1986年发表短文年发表短文肿瘤研肿瘤研究的转折点:人类基因组测序究的转折点:人类基因组测序(Science,231:105510
3、56)。文中指出:如果我们想更多地了解肿瘤,我们从现在起必须文中指出:如果我们想更多地了解肿瘤,我们从现在起必须关注细胞的基因组。关注细胞的基因组。从哪个物种着手努力?如果我们想从哪个物种着手努力?如果我们想理解人类肿瘤,那就应从人类开始。理解人类肿瘤,那就应从人类开始。人类肿瘤研究将因人类肿瘤研究将因对对 DNA 的详细知识而得到巨大推动。的详细知识而得到巨大推动。”基因组就是一个物种中所有基因的整体组成基因组就是一个物种中所有基因的整体组成人类基因组有两层意义:人类基因组有两层意义:遗传信息遗传信息 遗传物质遗传物质从整体水平研究基因的存在、基因的结构与功能、基从整体水平研究基因的存在、基
4、因的结构与功能、基因之间的相互关系。因之间的相互关系。1 1.1 .1 什么是基因组什么是基因组(Genome)(Genome)1 1 HGP简介简介人类染色体人类染色体1 1.1 .1 什么是基因组什么是基因组(Genome)(Genome)1 1 HGP简介简介人类是在人类是在“进化进化”历程上最高级的生物历程上最高级的生物 认识自身认识自身 掌握生老病死规律掌握生老病死规律 疾病的诊断和治疗疾病的诊断和治疗 了解生命的起源了解生命的起源在人类基因组计划中,包括对五种生物基因组的研究:在人类基因组计划中,包括对五种生物基因组的研究:大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠,称之为人类的五大肠杆菌、
5、酵母、线虫、果蝇和小鼠,称之为人类的五种种“模式生物模式生物”。1 1.2 .2 为什么选择人类的基因组进行研究?为什么选择人类的基因组进行研究?1 1 HGP简介简介1984年年12月受美国能源部的委托,主持召开了一个小型会议,讨论月受美国能源部的委托,主持召开了一个小型会议,讨论DNA重组技术的发展及测定人类整个基因组的重组技术的发展及测定人类整个基因组的DNA序列的意义。序列的意义。1985年年6月,在美国加州举行了一次会议,美国能源部提出了月,在美国加州举行了一次会议,美国能源部提出了“人类基因人类基因组计划组计划”的初步草案。的初步草案。1986年年6月,在新墨西哥州讨论了这一计划的
6、可行性。随后美国能源部宣月,在新墨西哥州讨论了这一计划的可行性。随后美国能源部宣布实施这一草案。布实施这一草案。1 1.3 .3 HGPHGP的诞生的诞生1 1 HGP简介简介1987年初,美国能源部与国家医学研究院(年初,美国能源部与国家医学研究院(NIH)为)为“人类基因组计划人类基因组计划”下拨了启动经费约下拨了启动经费约550万美元,万美元,1987年总额近年总额近1.66亿美元。同时,美国开亿美元。同时,美国开始筹建人类基因组计划实验室。始筹建人类基因组计划实验室。1989年美国成立年美国成立“国家人类基因组研究中心国家人类基因组研究中心”。诺贝尔奖金获得者。诺贝尔奖金获得者J.Wa
7、ston出任第一任主任。出任第一任主任。1990年,历经年,历经5年辩论之后,美国国会批准美国的年辩论之后,美国国会批准美国的“人类基因组计划人类基因组计划”于于10月月1日正式启动。美国的人类基因组计划总体规划是:拟在日正式启动。美国的人类基因组计划总体规划是:拟在15年内至少年内至少投入投入30亿美元,进行对人类全基因组的分析。亿美元,进行对人类全基因组的分析。1 1.3 .3 HGPHGP的诞生的诞生1 1 HGP简介简介HGP诞生过程中的质疑诞生过程中的质疑计划的必要性问题计划的必要性问题计划的现实性问题计划的现实性问题科学研究领域的选择问题科学研究领域的选择问题为什么不选择基因组小的
8、或有经济意义的生物为什么不选择基因组小的或有经济意义的生物 认为认为“制图制图”是在沙漠里建公路,是在沙漠里建公路,“测序测序”是把是把“垃圾垃圾”分类,选分类,选择择“模式动物模式动物”是拼凑是拼凑“诺亚方舟诺亚方舟”。1 1.3 .3 HGPHGP的诞生的诞生1 1 HGP简介简介解码生命解码生命了解生命的起源了解生命的起源了解生命体生长发育的规律了解生命体生长发育的规律认识种属之间和个体之间存在差异的起因认识种属之间和个体之间存在差异的起因认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象为疾病的诊治提供科学依据。为疾病的诊治提供科学依据。1 1.4 .
9、4 HGPHGP的目的的目的1 1 HGP简介简介2 HGP的主要任务的主要任务 遗传图谱遗传图谱 物理图谱物理图谱 序列图谱序列图谱 转录图谱转录图谱遗传图谱遗传图谱-孟德尔的孟德尔的“新生新生”遗传图谱(遗传图谱(genetic map)又称连锁图)又称连锁图谱谱(linkage map),它是以具有遗传多态,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在群体中的出现频率皆高于等位基因,在群体中的出现频率皆高于1%)的遗传标记为)的遗传标记为“路标路标”,以遗传,以遗传学距离(在减数分裂事件中两个位点之学距离(在减数分裂事件中两个位点之间
10、进行交换、重组的百分率,间进行交换、重组的百分率,1%的重的重组率称为组率称为1cM)为图距的基因组图。遗)为图距的基因组图。遗传图谱的建立为基因识别和完成基因定传图谱的建立为基因识别和完成基因定位创造了条件。位创造了条件。间间 期期前前 期期 I同同 源源 染染 色色 体体形形 成成 配配 对对中中 期期 I晚晚 期期 I发发 生生 交交 换换前前 期期 II中中 期期 II晚晚 期期 II末末 期期 II配配 子子物理图谱物理图谱-路标与路轨路标与路轨物理图谱(物理图谱(physical map)是指有关构成基因组的全部基因的排列和)是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过
11、对构成基因组的间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。上的相对位置线性而系统地排列出来。基因转录图谱基因转录图谱-生命的乐谱生命的乐谱转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。序列图谱序列图谱-重中之重重中之重随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序
12、就成为重中之重的工作。随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱 大规模基因组测序大规模基因组测序 Megabace 测序仪测序仪3700 测序仪测序仪2 HGP的主要任务3 HGP对人类的重要意义是否必须进行基因检查?而基因删除的结果将会人类基因库狭小,势必减少人类未来的进化选择空间。2003年春天席卷全球的“非典”病毒在人类面前不那么人人平等,针对的是新加坡、中国大陆、
13、香港、台湾等地的中国人,还有加拿大的华人。3 HGP与制药业人类第一次“走出非洲”200万年的古猿;人类千万不能打开基因武器这只“潘多拉匣子”,基因武器一旦问世,人类将面临巨大的灾难基因工程药物:分泌蛋白(多肽激素,生长因子,趋化因子,凝血和抗凝血因子等)及其受体;通过测序得到基因组的序列图谱健康相关研究是人类基因组计划的重要组成部分,并于1997年相继提出了:“肿瘤基因组解剖计划”、“环境基因组学计划认为“制图”是在沙漠里建公路,“测序”是把“垃圾”分类,选择“模式动物”是拼凑“诺亚方舟”。6 HGP对生物信息学提出挑战设计婴儿一生下来就被置于先天预制的价值期待中,遭受与众不同的生活境遇,这
14、对他公平吗?这构不构成对他的生活权利的侵犯?一个人的生活究竟应该由他自己作出选择,还是别人包办代替?一个人为满足别人的而出生,他的主体地位和人的尊严在哪里?人的出生是一个神秘随机的偶然事件,所以人对自己的出生往往是没有什么可抱怨的。人对自身的改造是否也会重蹈覆辙?科学家认为基因删除将象从计算机硬盘上删除的文件一样无法恢复,以不可逆的方式改变人类的基因库将十分危险。传统人群和民族的划分;1999年7月在国际人类基因组注册,得到完成人类3号染色体短臂上一个约30Mb区域的测序任务,该区域约占人类整个基因组的1。序列图谱-重中之重基因转录图谱-生命的乐谱优生是人类永远无法割舍的情结。大规模测序基本策
15、略大规模测序基本策略逐个克隆法:对连续克隆系中排逐个克隆法:对连续克隆系中排定的定的BAC克隆逐个进行亚克隆测克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装。序并进行组装。全基因组鸟枪法:在一定作图信全基因组鸟枪法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。机进行组装。运用计算机软件进行序列拼接运用计算机软件进行序列拼接模式生物体的研究模式生物体的研究通过对进化不同阶段的生物体基因组序列的比较,发现基因组结构通过对进化不同阶段的生物体基因组序列的比较,发现基因
16、组结构组成和功能调节的规律。组成和功能调节的规律。利用酵母、线虫、果蝇、大肠杆菌斑马鱼、小鼠等模式生物体进行利用酵母、线虫、果蝇、大肠杆菌斑马鱼、小鼠等模式生物体进行基因的剔除或转基因的研究,从而在整体水平认识基因的功能。基因的剔除或转基因的研究,从而在整体水平认识基因的功能。大肠杆菌大肠杆菌果蝇果蝇小鼠小鼠线虫线虫酵母酵母3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3.1 对医学的影响对医学的影响发现新的致病基因发现新的致病基因发展一些复杂疾病的早期基因诊断发展一些复杂疾病的早期基因诊断方法,如方法,如“肿瘤基因组解剖计划肿瘤基因组解剖计划”通过基因治疗解决传统方法无法解通过基因治疗解决传统方
17、法无法解决的疑难杂症决的疑难杂症疾病易感基因的识别及对风险人群疾病易感基因的识别及对风险人群进行生活方式、环境因子的干预进行生活方式、环境因子的干预人类基因组多样性与个体化医学人类基因组多样性与个体化医学3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义所有的疾病,都可以说是基因病所有的疾病,都可以说是基因病“基因病基因病”概念:概念:基因相关论:所有疾病都与人类基因有关;基因相关论:所有疾病都与人类基因有关;基因修饰论:所有药物都是通过修饰基因本身结构、改变基因的表达调控基因修饰论:所有药物都是通过修饰基因本身结构、改变基因的表达调控、影响基因产物的功能而起作用的;、影响基因产物的功能而起作用的;人
18、类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。单基因病:单基因病:定位克隆定位克隆和和定位候选克隆定位候选克隆的全新思路,导致了亨廷顿舞蹈病的全新思路,导致了亨廷顿舞蹈病、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义单基因病:单基因病:“定位克隆定位克隆”和和“定位候选克隆定位候选克隆”的全新思路,导致了亨的全新思路,导致
19、了亨廷顿舞蹈病、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因廷顿舞蹈病、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。多基因疾病:心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性多基因疾病:心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性痴呆、精神分裂症)、自身免疫性疾病,是目前疾病基因研究的重点痴呆、精神分裂症)、自身免疫性疾病,是目前疾病基因研究的重点。健康相关研究是人类基因组计划的重要组成部分,并于健康相关研究是人类基因组计划的重要组成部分,并于1997年相继提年相继提出了:出了:“
20、肿瘤基因组解剖计划肿瘤基因组解剖计划”、“环境基因组学计划环境基因组学计划3 3.2 .2 HGPHGP与生物技术与生物技术基因工程药物:分泌蛋白(多肽激素,生长因子,趋化因子,凝血和基因工程药物:分泌蛋白(多肽激素,生长因子,趋化因子,凝血和抗凝血因子等)及其受体;抗凝血因子等)及其受体;诊断和研究试剂产业:基因和抗体试剂盒、诊断和研究用生物芯片、诊断和研究试剂产业:基因和抗体试剂盒、诊断和研究用生物芯片、疾病和筛药模型;疾病和筛药模型;对细胞、胚胎、组织工程的推动:胚胎和成年期干细胞、克隆技术、对细胞、胚胎、组织工程的推动:胚胎和成年期干细胞、克隆技术、器官再造。器官再造。3 3.3 .3
21、 HGPHGP与制药业与制药业筛选新药和药物的靶点,分析药理过程;筛选新药和药物的靶点,分析药理过程;进行药物设计,对基因蛋白产物的高级结构分析、预测、模拟药物作进行药物设计,对基因蛋白产物的高级结构分析、预测、模拟药物作用用“口袋口袋”个体化的药物治疗:药物基因组学个体化的药物治疗:药物基因组学3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3.4 基因组学、生物信息学与新药研制基因组学、生物信息学与新药研制未来的药物研究过程将是基于生物未来的药物研究过程将是基于生物信息知识挖掘的过程信息知识挖掘的过程数据处理和关联分析发现药物作用对象确定靶目标分子针对靶目标进行合理的药物设计3 HGP对人类的重
22、要意义对人类的重要意义3 3.5 .5 HGPHGP与社会经济发展与社会经济发展生物产业与信息产业是一个国家的两大经济支柱;生物产业与信息产业是一个国家的两大经济支柱;发现新功能基因的发现新功能基因的社会和经济效益;转基因食品;转基因药物(如减肥药,增高药)社会和经济效益;转基因食品;转基因药物(如减肥药,增高药)3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3 3.6 .6 HGPHGP与生物进化研究与生物进化研究生物的进化史,都刻写在各基因组的生物的进化史,都刻写在各基因组的“天书天书”上上草履虫是人的亲戚草履虫是人的亲戚13亿年;人是由亿年;人是由300400万年前的一种猴子进万年前的一种猴
23、子进化来的;人类第一次化来的;人类第一次“走出非洲走出非洲”200万年的古猿;人类的万年的古猿;人类的“夏娃夏娃”来自于非洲,距今来自于非洲,距今20万年万年第二次第二次“走出非洲走出非洲”?3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3 3.5 .5 HGPHGP带来的负面作用带来的负面作用侏罗纪公园不只是科幻故事侏罗纪公园不只是科幻故事恐龙化石3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3 3.5 .5 HGPHGP带来的负面作用带来的负面作用种族选择灭绝性生物武器种族选择灭绝性生物武器各种病毒不断袭击了人类。各种病毒不断袭击了人类。2003年春天席卷全年春天席卷全球的球的“非典非典”病毒在人
24、类面前不那么人人平等病毒在人类面前不那么人人平等,针对的是新加坡、中国大陆、香港、台湾等,针对的是新加坡、中国大陆、香港、台湾等地的中国人,还有加拿大的华人。地的中国人,还有加拿大的华人。“非典非典”病病毒似乎对其他民族特别关照,美国人、日本人毒似乎对其他民族特别关照,美国人、日本人、德国人及世界其他民族基本上相安无事,死、德国人及世界其他民族基本上相安无事,死亡率很低甚至出现零死亡率。亡率很低甚至出现零死亡率。“非典非典”可能来自于基因武器?可能来自于基因武器?3 HGP对人类的重要意义对人类的重要意义3 3.5 .5 HGPHGP带来的负面作用带来的负面作用种族选择灭绝性生物武器种族选择灭
25、绝性生物武器只需只需20克超级基因武器,就足以使克超级基因武器,就足以使60亿地球人死于非命。英国生物学家亿地球人死于非命。英国生物学家断言,基因武器的问世不会晚于断言,基因武器的问世不会晚于2010年。为此,他们向全球发出强烈呼年。为此,他们向全球发出强烈呼吁,各国政府有必要采取紧急措施,以制止基因武器的研制与扩散。人吁,各国政府有必要采取紧急措施,以制止基因武器的研制与扩散。人类千万不能打开基因武器这只类千万不能打开基因武器这只“潘多拉匣子潘多拉匣子”,基因武器一旦问世,人,基因武器一旦问世,人类将面临巨大的灾难类将面临巨大的灾难新浪网新浪网2002年年9月月26日日了解生命体生长发育的规
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