[基础医学]第四章 DNA的生物合成课件.ppt
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- 基础医学 基础医学第四章 DNA的生物合成课件 第四 DNA 生物 合成 课件
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1、第四章第四章DNA BiosynthesisDNA的生物合成的生物合成本章主要内容本章主要内容 DNA复制的基本特性复制的基本特性 DNA复制的反应体系复制的反应体系 DNA复制过程复制过程 DNA损伤、突变和修复损伤、突变和修复逆转录现象和逆转录酶逆转录现象和逆转录酶DNARNAprotein复制复制转录转录翻译翻译逆转录逆转录RNA复制复制3DNA是大多数生物的遗传物质的载体是大多数生物的遗传物质的载体遗传分子生物学中心法则遗传分子生物学中心法则第一节第一节 DNA复制的基本特性复制的基本特性 Basic Characters of DNA Replication复制复制(replicat
2、ion)指在生物体内以亲代指在生物体内以亲代 DNA分子两条链为模板,合成两个子代分子两条链为模板,合成两个子代DNA分子的过程分子的过程 DNA复制的基本特性复制的基本特性 半保留复制半保留复制 半不连续复制半不连续复制双向复制双向复制特定的复制起点特定的复制起点需要引物需要引物一、半保留复制一、半保留复制(semiconservative replication)nDNA复制时,亲代复制时,亲代DNA双螺旋解开成为两条单链,双螺旋解开成为两条单链,各自作为模板,按照碱基配对规律合成一条与模各自作为模板,按照碱基配对规律合成一条与模板相互补的新链,形成两个子代板相互补的新链,形成两个子代DN
3、A分子。每一分子。每一个子代个子代DNA分子中都保留有一条来自亲代的链。分子中都保留有一条来自亲代的链。这种这种DNA复制的方式称为半保留复制。复制的方式称为半保留复制。含含15N-DNA的细菌的细菌第一代细菌第一代细菌第二代细菌第二代细菌培养于普通培养基继续培养于普通培养基轻DNA沉降的位置重DNA沉降的位置中等密度DNA沉降的位置DNA半保留复制的实验证明半保留复制的实验证明TGCACGTDNA的半保留复制的半保留复制ACGTAGCTGCACGTACGTAGCTGCACGTACGTAGCTGCACGTACGTAGC二、二、DNA复制的方向和方式复制的方向和方式模板模板DNA的阅读方向是的阅
4、读方向是3 5 新链的延伸方向是新链的延伸方向是5 3 PC35The direction of new strandPPPPPP35GCTATTtemplatePGPAPTPAPAOH12Mechanism of DNA replicationDNA复制时碱基的配对规律:复制时碱基的配对规律:A=TGCDNA的复制泡及复制叉的复制泡及复制叉origin原核生物的原核生物的DNA为环为环状,复制时要在特定状,复制时要在特定的复制起始点上开始的复制起始点上开始解链,形成解链,形成“复制复制泡泡”,并向两个方向,并向两个方向解链,形成两个复制解链,形成两个复制叉。叉。复制叉复制叉AGGTACTGC
5、CACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGAGGTACTGTCCATGACGGTGACCTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+555333333355555353亲代的DNA复制叉的形成两个子代的DNA分子三、半不连续复制三、半不连续复制n领头链领头链(leading strand)n随从链随从链(lagging strand)n冈崎片段冈崎片段(Okazaki fragment)33555复制叉的解链方向3533555复制叉的解链方向35领头链领头链随从链随从链冈
6、崎片段冈崎片段复制的保真性复制的保真性n新链的延伸过程严格遵守碱基配对的规律,新链的延伸过程严格遵守碱基配对的规律,即即AT,G C nDNA聚合酶对碱基的选择能力,能选择与亲聚合酶对碱基的选择能力,能选择与亲代模板链正确配对的碱基进入子链相应的位置代模板链正确配对的碱基进入子链相应的位置 n校读修正错配碱基,通过校读修正错配碱基,通过DNA聚合酶的聚合酶的35外切外切酶活性,在碱基发生错配时,及时切除并酶活性,在碱基发生错配时,及时切除并更换上正确碱基更换上正确碱基 第二节第二节 DNA复制的反应体系复制的反应体系Reaction System for DNA ReplicationDNA复
7、制的反应体系组成有:复制的反应体系组成有:模板模板(template),DNA的两条单链均作为模板的两条单链均作为模板主要的复制酶,主要的复制酶,DNA dependent DNA polymerase or DDDP,DNA pol引物引物(primer),是一段短的特殊,是一段短的特殊RNA底物底物(substrate),dNTP 其他的酶和蛋白质因子,包括拓朴异构酶、解螺旋其他的酶和蛋白质因子,包括拓朴异构酶、解螺旋酶、酶、DNA单链结合蛋白、引物酶、单链结合蛋白、引物酶、DNA连接酶等连接酶等 一、一、DNA聚合酶聚合酶nDNA dependent DNA polymerase,DDD
8、P,或,或DNA pol 功能:功能:53聚合活性聚合活性外切活性外切活性53外切活性外切活性35外切活性外切活性355353外切活性外切活性3553355335外切活性外切活性355335533553(一一)原核生物原核生物DNA聚合酶聚合酶nE coli中的中的DNA聚合酶,已知有三种,聚合酶,已知有三种,分别为分别为DNA pol I,DNA pol II,DNA pol III53聚合活性聚合活性外切活性外切活性53外切活性外切活性35外切活性外切活性切除引物切除引物校读作用校读作用 DNA聚合酶聚合酶I的校读作用的校读作用3535DNA pol I的的355外切活性外切活性错配碱基错
9、配碱基AG AG CTT A A G C G T G C GG T AT GTC TC G A A TTC G C A C G CC A C种类种类DNA polDNA polDNA pol 分子组成分子组成单一多肽链单一多肽链不清不清10种亚基的不对称种亚基的不对称二聚体二聚体生物学活性生物学活性(1)53聚聚合活性合活性聚合活性低聚合活性低有有聚合活性高聚合活性高(2)35外外切切酶活性酶活性有有有有有有(3)53外外切切酶活性酶活性有有无无无无功能功能校读作用校读作用无其他酶时发无其他酶时发挥作用挥作用主要的复制酶主要的复制酶修复填补修复填补校读作用校读作用 Ecoli 中三种中三种DN
10、A聚合酶的比较聚合酶的比较 DNA pol 的不对称异源二聚体结构的不对称异源二聚体结构复合物复合物核心酶核心酶222()22核心酶核心酶DNA 聚合酶种类聚合酶种类生物学功能生物学功能DNA 聚合酶聚合酶有引物酶活性,参与复制的引发过程有引物酶活性,参与复制的引发过程DNA 聚合酶聚合酶主要参与主要参与DNA的修复过程的修复过程DNA 聚合酶聚合酶参与线粒体中参与线粒体中DNA的复制的复制DNA 聚合酶聚合酶是最主要的复制酶,参与链的延伸是最主要的复制酶,参与链的延伸DNA 聚合酶聚合酶参与修复过程参与修复过程(二二)真核生物真核生物DNA聚合酶聚合酶二、二、DNA解螺旋酶、解螺旋酶、DNA
11、拓扑异构酶、拓扑异构酶、单链单链DNA结合蛋白结合蛋白(一一)DNA解螺旋酶解螺旋酶(helicase)每解开一对碱基,需消耗每解开一对碱基,需消耗2分子分子ATP 功能:功能:使使DNA双链解开成为单链双链解开成为单链 现知为现知为Dna B蛋白蛋白(二二)DNA拓扑异构酶拓扑异构酶(topoisomerase)功能:功能:使使DNA超螺旋旋松,理顺超螺旋,便于超螺旋旋松,理顺超螺旋,便于DNA解链解链 既能水解既能水解、又能连接磷酸二酯键、又能连接磷酸二酯键特点:特点:3233Topoisomerase ICut only one strand of DNA,no ATP needed拓扑
12、异构酶拓扑异构酶 ITopoisomerase II34Cut two strands of DNA,ATP needed拓扑异构酶拓扑异构酶 II E.coli 的拓扑异构酶的拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶亚型亚型topoDNA gyrase(topo)topo topo 功能功能切断切断DNA双链中的一双链中的一股,松弛后再封闭股,松弛后再封闭切断切断DNA的双股链,的双股链,松弛后再封闭松弛后再封闭是否需是否需要要ATP不需要不需要需要需要(三三)DNA单链结合蛋白单链结合蛋白(DNA single strand binding protein,DBP or SSB)
13、功能:功能:与解开的与解开的DNA单链结合,稳定并保护单链结合,稳定并保护DNA单链单链 *防止单链重新形成双螺旋,保持模板的单链状态以防止单链重新形成双螺旋,保持模板的单链状态以便于复制便于复制*防止单链模板被核酸酶水解防止单链模板被核酸酶水解 意义:意义:三、引物酶和引发体三、引物酶和引发体(primase,primosome)n引物酶,即引物酶,即Dna G蛋白,催化引物的生成蛋白,催化引物的生成n引发体,由引发体,由ori C,Dna A、Dna B、Dna C及及Dna G组成组成 引物引物为一段短的为一段短的RNA片段片段为什么需要引物?为什么需要引物?DNA 聚合酶不能催化游离的
14、聚合酶不能催化游离的dNTP聚合聚合四、四、DNA连接酶连接酶(DNA ligase)n功能功能催化催化DNA分子中两段相邻单链片段的连接,但分子中两段相邻单链片段的连接,但不能连接单独存在的不能连接单独存在的DNA单链单链 DNA连接酶催化的反应是耗能的,在真核生物连接酶催化的反应是耗能的,在真核生物中利用中利用ATP供能,而在原核生物中则消供能,而在原核生物中则消NAD+5 3 5 3 POHD N A 连 接 酶ATP(NAD+)ADP+Pi(NMN+AMP)5 3 3 5 DNA连接酶的作用连接酶的作用真核生物真核生物原核生物原核生物 第三节第三节DNA复制过程复制过程DNA Repl
15、ication Process 生物体在细胞分裂之前要完成生物体在细胞分裂之前要完成DNA复制。复制。DNA复复制是一个连续酶促反应的复杂过程,大致分为制是一个连续酶促反应的复杂过程,大致分为复制的起始复制的起始复制的延伸复制的延伸复制的终止复制的终止 一、原核生物一、原核生物DNA复制的基本过程复制的基本过程(一一)复制的起始复制的起始 原核生物原核生物DNA复制起始以形成复制起始以形成引发体引发体(primosome),催化,催化引物引物(primer)的生成为的生成为标志。标志。1.DNA拓扑异构酶松解超螺旋,解螺旋酶拓扑异构酶松解超螺旋,解螺旋酶使使DNA双链解开双链解开SSB3 5
16、3 5 Dna BDNA拓扑异构酶拓扑异构酶Dna ADna C 复制是在一个特定的起始点上开始,复制是在一个特定的起始点上开始,E coli的复制起始的复制起始点点ori C有特殊的碱基组成,四个有特殊的碱基组成,四个9核苷酸组成的一致性序列核苷酸组成的一致性序列TTATCCACA能被能被Dna A所识别及结合,在所识别及结合,在Dan C的帮助下,的帮助下,解螺旋酶解螺旋酶Dna B结合到该区,使结合到该区,使DNA局部解链。局部解链。GGATCCTGgnTATTAAAAAGAAGATCTnTTTATTTAGAGATCTGTTnTATT101150200nTTtAAGATCAAnnnnnT
17、ggnAAGGATCncTAnCTGTGAATGATCGGTGA201250TtnAnCAgAGTTATCCACAntnGAnnGcnn-GATGTGATCTCTTATTAGGATCGnnntnnnnTGTGGATAAgnngGATCCnnTCCTGGnCCGTATAAGCTGGGATCAnAATGngGGnTTATACACAgCtCAAAAncgnACaaCGGTTaTTCTTTGGATAACTACCGGTTGATCCAAGCTT50151100151E.coli的的ori C结构。剪头所示为四个结构。剪头所示为四个9核苷酸序列,黑括弧内所示为核苷酸序列,黑括弧内所示为245个个碱基组成的最
18、小复制起始区。碱基组成的最小复制起始区。GATC为为Bgl II内切酶识别位点。内切酶识别位点。SSB3 5 3 5 Dna BDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶Dna CDna A含有解螺旋酶含有解螺旋酶(Dna B)、Dna A、DnaC、引物、引物酶和酶和DNA复制起始区域的复合结构称为引发体。复制起始区域的复合结构称为引发体。2.引发体的组装及引物的形成引发体的组装及引物的形成3 5 3 5 引物引物酶酶在引发体引物酶的作用下,催化合成一段短的在引发体引物酶的作用下,催化合成一段短的RNA作为引物作为引物(二二)复制的延伸复制的延伸 n当引物合成后,当引物合成后,DNA聚合酶可在引
19、物的聚合酶可在引物的3-OH基础上逐步催化脱氧核苷酸的聚合,基础上逐步催化脱氧核苷酸的聚合,以以3-5磷酸二酯键相连,使新链不断向磷酸二酯键相连,使新链不断向前延伸。前延伸。3 5 3 5 DNA pol III本质:本质:3-5磷酸二酯键的不断生成磷酸二酯键的不断生成DNA复制的延伸过程复制的延伸过程领头链的合成领头链的合成(DNA pol III)DNA拓扑异构酶拓扑异构酶II(DNA gyrase)随从链的合成随从链的合成RNA 引物引物RNA 引物引物引物酶引物酶随从链的合成随从链的合成(DNA pol III)解螺旋酶解螺旋酶复制叉的前进方向复制叉的前进方向(三三)复制的终止复制的终
20、止 n从一个亲代从一个亲代DNA分子到两个子代分子到两个子代DNA分分子的合成结束子的合成结束 n细菌的环状细菌的环状DNA从两个复制叉向前复制从两个复制叉向前复制延伸,在同一个终止点上结束延伸,在同一个终止点上结束n两个复制叉上的延伸速度可以是不同的两个复制叉上的延伸速度可以是不同的nE.coli的复制起始点在的复制起始点在82位点,终止点在位点,终止点在32位点位点E.Coli 基因组结构基因组结构复制起始点复制起始点复制终止点复制终止点82位点位点32位点位点 在复制的终止阶段,要切除引物,并填补引在复制的终止阶段,要切除引物,并填补引物切除后留下的空隙。对于物切除后留下的空隙。对于E.
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