分子生物学-蛋白质(高中生物竞赛-细胞生物学)课件.ppt
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- 高中生物竞赛-细胞生物学 分子生物学 蛋白质 高中生物 竞赛 细胞生物学 课件
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1、 Please be quiet,Please be quiet,上课了上课了!同学们,早上好!同学们,早上好!分子生物学 张晓军 第四章第四章 蛋白质蛋白质(proteinprotein)第一节第一节 蛋白质概述蛋白质概述一、化学组成化学组成 C、H、O、N、S、P、Fe、Zn、Cu二、蛋白质分类蛋白质分类 1、从结构单位分、从结构单位分 简单蛋白质:氨基酸简单蛋白质:氨基酸 结合蛋白质:氨基酸结合蛋白质:氨基酸+辅基辅基 2、根据所带电荷、根据所带电荷 碱性蛋白:带正电荷(碱性蛋白:带正电荷(N+H 3)如:组蛋白如:组蛋白 酸性蛋白:带负电荷(酸性蛋白:带负电荷(COO-)如:非组蛋如:
2、非组蛋 白白二、蛋白质分类蛋白质分类 3、从空间结构、从空间结构 3.1 纤维状蛋白质纤维状蛋白质 在生物体内,作为结构成分而存在在生物体内,作为结构成分而存在 例如:胶原蛋白、角蛋白、丝蛋白例如:胶原蛋白、角蛋白、丝蛋白 3.2 球状蛋白质球状蛋白质 在细胞内承担动态的功能,即起酶学和在细胞内承担动态的功能,即起酶学和 调节的作用调节的作用 例如:酶例如:酶 第二节第二节 氨基酸氨基酸 除除甘氨酸甘氨酸和和脯氨酸脯氨酸外,其他均具有如下结构通式:外,其他均具有如下结构通式:各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。20种基本氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、极性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸。C
3、OOHCHH2NR-氨基酸可变部分不变部分 甘氨酸甘氨酸COOHCHH2NRH具有构象柔性由于其侧链的几何学特性,不能形成规则的-螺旋结构,而经常出现在-螺旋的终点部位,即形成环肽链或转角。脯氨酸脯氨酸(亚氨酸)(亚氨酸)H H2 2 C C H H2 2C CHC CH2 2 HNHNCHCHCOOHCOOH具有构象刚性顺反构象的转变需要异构酶的催化才能进行二、氨基酸的分类二、氨基酸的分类 脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸 甘氨酸 Glycine H2NCH CHOHO 脂肪族氨基酸H2NCH CCH3OHO 甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine 脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸 甘氨酸 Glyc
4、ine 丙氨酸 Alanine 缬氨酸 ValineH2NCH CCHOHOCH3CH3 脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 LeucineH2NCH CCH2OHOCH CH3CH3甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine 脂肪族氨基酸H2NCH CCHOHOCH3CH2CH3甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline 亚氨基酸HNCOHO甘氨酸 Glycine 丙
5、氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine 含硫氨基酸H2NCHCCH2OHOCH2SCH3甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine半胱氨酸 Cysteine 含硫氨基酸H2NCH CCH2OHOSH 芳香族氨基酸苯丙氨酸PhenylalanineH2NCHCCH2OHO 芳香族氨基酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸TyrosineH2NCHCCH2OHOOH 芳香
6、族氨基酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸Tyrosine色氨酸 TrytophanH2NCHCCH2OHOHN 碱性氨基酸 精氨酸 ArginineH2NCHCCH2OHOCH2CH2NHCNH2NH 碱性氨基酸精氨酸 Arginine赖氨酸 LysineH2NCH CCH2OHOCH2CH2CH2NH2 碱性氨基酸精氨酸 Arginine赖氨酸 Lysine组氨酸 HistidineH2NCH CCH2OHONNH天冬氨酸 Aspartate 酸性氨基酸H2NCH CCH2OHOCOHO天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate 酸性氨基酸H2NCH CCH2OHOCH
7、2COHO丝氨酸 Serine 含羟基氨基酸H2NCH CCH2OHOOH丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine 含羟基氨基酸H2NCH CCHOHOOHCH3天冬酰胺 Asparagine 含酰胺氨基酸H2NCH CCH2OHOCNH2O天冬酰胺 Asparagine谷酰胺 Glutamine 含酰胺氨基酸H2NCHCCH2OHOCH2CNH2O第三节第三节 蛋白质结构的层次体系蛋白质结构的层次体系蛋白质分子是由氨基酸首尾相连而成的共价多肽链,但是天然的蛋白质分子并不是走向随机的松散肽链。每一种蛋白质都有自己特有的空间结构或三维结构,被称谓蛋白质的构象蛋白质的构象。一个给定的蛋白质
8、理论上可采取多种构象,但在生理条件下,只有一种或很少几种在能量上有利的。指导蛋白质多肽链折叠成能量上有利的构象能量上有利的构象的规律至今仍不完全清楚,寻找这些规律是当前奋力研究的课题之一。蛋白质的结构就像一座精美的建筑,层次丰富,构造多彩一级结构:一级结构:多肽链中氨基酸顺序多肽链中氨基酸顺序 共价键共价键 含有复杂机构的全部信息含有复杂机构的全部信息二级结构:二级结构:螺旋、螺旋、B-折叠折叠 非共价力(氢键)非共价力(氢键)三级结构:三级结构:球状构象球状构象 非共价力(氢键、二硫键、疏水力)非共价力(氢键、二硫键、疏水力)四级结构:四级结构:各亚基之间在空间上各亚基之间在空间上 的相互关
9、系和结合方式的相互关系和结合方式 非共价力(氢键、二硫键、疏水力)非共价力(氢键、二硫键、疏水力)一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构 从多肽链的从多肽链的N N端到端到C C端的共价主链端的共价主链及氨基酸的排列顺序。它是蛋白及氨基酸的排列顺序。它是蛋白质结构层次体系的基础,是决定质结构层次体系的基础,是决定更高层次结构的主要因素。更高层次结构的主要因素。主要因素主要因素 (一级结构(一级结构)高级结构高级结构 辅助因素辅助因素 (分子伴侣)(分子伴侣)一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构(多肽多肽)一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失水形成的酰一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的
10、羧基之间失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。H2NCHCOOHR1+H2NCHCOOHR2NCHCOOHR2HH2NCHCR1O肽键二肽l由两个氨基酸组成的肽称为二肽,由多个氨基酸组成的肽则称为多肽。组成多肽的氨基酸单元称为氨基酸残基。CCNCCNCCNCCNCCH2CHCH2CH2CH2COO-OHCO2HCH2CONH2OHCH3H3N+OOOOHHHHHHHHHSerValTyrAspGlnCH3N-端C-端肽键在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序排列顺序称为氨基酸顺
11、序通常在多肽链的一端含有一个游离的通常在多肽链的一端含有一个游离的-氨基,称为氨基,称为氨基端或氨基端或N-N-端;在另一端含有一个游离的端;在另一端含有一个游离的-羧基,羧基,称为羧基端或称为羧基端或C-C-端。端。氨基酸的顺序是从氨基酸的顺序是从N-N-端的氨基酸残基开始,以端的氨基酸残基开始,以C-C-端端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为:为:Ser-Val-Tyr-Asp-GlnSer-Val-Tyr-Asp-Gln(二)肽键(二)肽键肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面。组成肽键的
12、原子处于同一平面。肽键中的肽键中的C-NC-N键具有部分双键性质,不能自由旋键具有部分双键性质,不能自由旋转。转。CONCN+O-CNCOHC(三)二硫键(三)二硫键在蛋白质的三维结构中,靠近的两个半胱氨酸(Cys)的巯基(-SH)之间可被氧化形成二硫键。作为一个合成的结构单位成为胱氨酸(胱氨酸(Cystine)。二硫键按以下反应式由空气氧化产生:2CH2SH+12 O2=-CH2-S-S-CH2-+H2O二硫键的形成需要一个氧化环境氧化环境,因此二硫键一般不出现在细胞质内蛋白质中,因为细胞质内主要是一个还原环境。二硫键常常出现在由细胞分泌出来的胞外蛋白质胞外蛋白质中。(三)二硫键(三)二硫键
13、 mRNA中没有胱氨酸的密码子,因此必须通过蛋白质合成后由两个半胱氨酸的氧化作用来合成。真核生物中,二硫键在内质网腔中形成:内质网内为非还原性环境 内质网蛋白二硫键异构酶 二硫键可以稳定蛋白质的三维结构二硫键可以稳定蛋白质的三维结构(三)二硫键(三)二硫键 二硫键存在部位二硫键存在部位 链间二硫键链间二硫键:将两条不同的多肽链共价 交 联在 一起。链内二硫键链内二硫键:使单肽链折叠形成环状结构域。使蛋白质不易降解。例如:胰岛素分子例如:胰岛素分子二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构多肽链借助氢键规则折叠所形成的周期性的规则构象。称为secondary struture.二级结构是多肽链主链
14、局部区域的规则结构。主要被其内部形成的主链氢键所稳定,因此氢氢键的排布键的排布也是二级结构的重要特征。二级结构的模型二级结构的模型很多,在天然蛋白质结构中主要的二级结构包括:-螺旋螺旋-折叠片层折叠片层-转角转角二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构 在所有已知的天然蛋白质结构中都有广泛的二级结构存在:在所有已知的天然蛋白质结构中都有广泛的二级结构存在:在纤维蛋白纤维蛋白中,二级结构就是分子的基本结构,并在基本方面决定了分子性能。如,角蛋白主要由-螺旋螺旋 构成 丝主要由-折叠片层折叠片层构成 胶原蛋白三股螺旋三股螺旋 在球蛋白球蛋白中,二级结构主要形成分子骨架,而三维特征更多地依赖于侧链的
15、相互作用和 比主链氢键更为复杂的作用力。三、三、结构模体结构模体和和结构域结构域(一)超二级结构(一)超二级结构 在蛋白质中由若干相邻的二级结构元件组合在在蛋白质中由若干相邻的二级结构元件组合在一起彼此相互作用,形成有规律的二级结构组一起彼此相互作用,形成有规律的二级结构组合,充当三级结构的建筑模块。合,充当三级结构的建筑模块。3种组合类型:种组合类型:1 这是一种这是一种螺旋束,由两股平行的或反向平行的右手螺旋段螺旋束,由两股平行的或反向平行的右手螺旋段相互缠绕而成的左手卷曲螺旋(超螺旋,相互缠绕而成的左手卷曲螺旋(超螺旋,coiled-coil)coiled-coil)卷曲螺旋是卷曲螺旋是
16、纤维蛋白纤维蛋白如角蛋白、肌球如角蛋白、肌球蛋白的主要结构元件。蛋白的主要结构元件。螺旋束也存在于螺旋束也存在于球状蛋白球状蛋白中,如、中,如、蚯蚓血红蛋白中。蚯蚓血红蛋白中。与纤维蛋白中不同的是在球状蛋白中与纤维蛋白中不同的是在球状蛋白中螺旋束是由同一条链的一级序列上螺旋束是由同一条链的一级序列上的邻近的的邻近的螺旋组成螺旋组成2 2 由两段平行的由两段平行的-折叠股折叠股和一段作为连接的和一段作为连接的-螺旋螺旋(或(或无规则线团无规则线团)组成,)组成,-折叠股之间还折叠股之间还有有氢键氢键相连。相连。3 3 反向平行反向平行-折叠片折叠片,在球形蛋白质多是由一条,在球形蛋白质多是由一条
17、多肽链的若干多肽链的若干片段片段反向平行组合而成,两个反向平行组合而成,两个片段片段之间由一个之间由一个短环短环(发夹发夹)连接。)连接。发夹发夹:两段反平行的两段反平行的链链由一环肽链连接而成由一环肽链连接而成 曲折:两段反平行的曲折:两段反平行的链链 希腊钥匙拓扑结构:希腊钥匙拓扑结构:4 4段反平行的段反平行的链链小结!看来蛋白质构象是由超二级结构看来蛋白质构象是由超二级结构装配在一起形成的,因此目前致装配在一起形成的,因此目前致力于了解力于了解螺旋螺旋之间、之间、折叠片折叠片之间以及之间以及螺旋螺旋和和折叠片折叠片之间相互之间相互作用的基础。在多数情况下,只作用的基础。在多数情况下,只
18、有非极性残基侧链参与这些相互有非极性残基侧链参与这些相互作用,而亲水侧链多分布在分子作用,而亲水侧链多分布在分子的外表面。的外表面。(二)结构域(二)结构域 多肽链中的多肽链中的二级结构二级结构和和超二级结构超二级结构以特定的方式组织连接起来,以特定的方式组织连接起来,形成三级结构的形成三级结构的局部折叠区局部折叠区,它是相对独立的球状实体。,它是相对独立的球状实体。结构域是蛋白质三级结构的基本单位结构域是蛋白质三级结构的基本单位 单域蛋白质:单域蛋白质:较小的球状蛋白由一个结构域构成,较小的球状蛋白由一个结构域构成,即一条即一条 多肽链只多肽链只 形成一个结构域。结构域就是三级结形成一个结构
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