真核基因与基因组课件.ppt
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- 基因 基因组 课件
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1、目录目录第三篇第三篇 基因信息的传递基因信息的传递FLOW OF GENETIC INFORMATION目录目录真核基因与基因组真核基因与基因组DNA的生物合成的生物合成DNA的损伤和修复的损伤和修复RNA的生物合成的生物合成蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成基因表达调控基因表达调控细胞信号转导细胞信号转导 本篇重点学习内容本篇重点学习内容目录目录1.本部分主要讨论生物遗传信息传递的。通过学习和讨论,掌握遗传信息的与()的矛盾统一。2.遗传信息的基本单位是。所谓基因,是指DNA(在极少的情况下,如某些病毒是RNA)上为生物活性产物编码的,它们编码的信息用于产生特定的功能产物()。目录目录 The
2、 central dogma of molecular biologyThe central dogma of molecular biology.It shows the general pathways of information flow via replication,transcription,and translation.The term“dogma”is a misnomer.Introduced by Francis Crick at a time when little evidence supported these ideas,the dogma has become
3、 a well-established principle.目录目录3.3.中心法则中心法则(The central dogma)(The central dogma)明确了遗传信息传递明确了遗传信息传递的基本规律,即的基本规律,即 DNA DNA RNA RNA 蛋白质。中心法则蛋白质。中心法则的三个基本过程为:的三个基本过程为:复制、转录、翻译复制、转录、翻译。复制复制 (replication)(replication):从母代:从母代DNADNA拷贝产生序列相同的拷贝产生序列相同的子代子代 DNA DNA。(dsDNA(dsDNA dsDNA dsDNA)转录转录 (transcrip
4、tion)(transcription):DNADNA的编码信息抄录至的编码信息抄录至RNA RNA 分分子上的过程。子上的过程。(dsDNA(dsDNAssRNAssRNA)翻译翻译 (translation)(translation):在核糖体上,以:在核糖体上,以mRNAmRNA上的编码上的编码信息为指导合成特定序列的多肽链信息为指导合成特定序列的多肽链(蛋白质蛋白质)。(mRNA(mRNA polypeptide polypeptide)目录目录生物体内的遗传信息传递遵循中心法则生物体内的遗传信息传递遵循中心法则uDNA以半保留复制的方式将亲代细胞的遗传以半保留复制的方式将亲代细胞的遗
5、传物质高度忠实地传递给子代。物质高度忠实地传递给子代。u以以DNA为模板转录生成的为模板转录生成的mRNA作为信使,作为信使,其核苷酸序列构成的密码子在合成蛋白质时其核苷酸序列构成的密码子在合成蛋白质时被翻译为肽链中氨基酸的排列顺序。被翻译为肽链中氨基酸的排列顺序。u细胞内所有蛋白质一级结构的信息全部来源细胞内所有蛋白质一级结构的信息全部来源于于DNA序列。序列。目录目录目录目录目录目录目录目录Contributions of David Baltimoren1982:The founding director of MITs Whitehead Instituten1986:The disc
6、overy of the key transcription factor NF-Bn1987:The creation of transgenic mice as a model for the study of disease.n1989:The recombination activating genes RAG-1 and RAG-2an1990:Bcr-abl is sufficient to stimulate cell growth and cause chronic myelogenous leukemia(CML).anti-cancer drug Imatinib(Glee
7、vec)目录目录中心法则中心法则 (The Central Dogma)转转 录录翻翻 译译逆转录逆转录复复 制制目录目录真核基因与基因组真核基因与基因组 第十三章第十三章Eukaryote Gene and Genome目录目录除了某些以除了某些以RNA为基因组的为基因组的RNA病毒外,基因病毒外,基因通常是指染色体或基因组的一段通常是指染色体或基因组的一段DNA序列。序列。基因包括基因包括编码序列编码序列(外显子)、(外显子)、调控序列调控序列和和间间隔序列隔序列(内含子)(内含子)。基因(基因(genegene):):编码蛋白质或编码蛋白质或RNA等具有特定等具有特定功能产物的、负载遗传
8、信息的基本单位。功能产物的、负载遗传信息的基本单位。The fundamental unit of information in living systems is the gene目录目录基因组(基因组(genome):):一个生物体内所有遗传信息一个生物体内所有遗传信息的总和。的总和。(1920年,年,H.Winkles提出)提出)人类基因组包含了细胞人类基因组包含了细胞核染色体核染色体DNA(常染色(常染色体和性染色体)及体和性染色体)及线粒体线粒体DNA所携带的所有遗传物所携带的所有遗传物质。质。目录目录真核基因的结构与功能真核基因的结构与功能 第一节第一节The Structure
9、and Function of Eukaryote Gene目录目录 利用碱基的不同排列荷载遗传信息。利用碱基的不同排列荷载遗传信息。通过复制将遗传信息稳定、忠实地遗传给子代通过复制将遗传信息稳定、忠实地遗传给子代细胞,在这一过程中为适应环境变化,可能会细胞,在这一过程中为适应环境变化,可能会发生基因突变。发生基因突变。作为基因表达(作为基因表达(gene expression)的模板,使)的模板,使其所携带的遗传信息通过各种其所携带的遗传信息通过各种RNA和蛋白质在和蛋白质在细胞内有序合成而表现出来。细胞内有序合成而表现出来。n 基因的功能基因的功能目录目录单个基因的组成结构及一个完整的生物
10、体内基因的组织单个基因的组成结构及一个完整的生物体内基因的组织排列方式统称为排列方式统称为基因组构基因组构(gene organization)。)。n 与基因功能相关的结构与基因功能相关的结构编码区序列(编码区序列(coding region sequence)非编码序列(非编码序列(non-coding sequence)基因表达需要的调控区(基因表达需要的调控区(regulatory region)序列,)序列,包括启动子(包括启动子(promoter)、增强子()、增强子(enhancer)等。)等。在细胞内表达为蛋白质或功能在细胞内表达为蛋白质或功能RNA的的DNA序列序列目录目录一
11、、真核基因的基本结构一、真核基因的基本结构编码蛋白质或编码蛋白质或RNA的的编码序列编码序列。非编码序列非编码序列,包括编码区两侧的调控序列和,包括编码区两侧的调控序列和编码序列间的间隔序列。编码序列间的间隔序列。目录目录真核基因结构不连续,为断裂基因(真核基因结构不连续,为断裂基因(split gene)。)。真核基因结构真核基因结构外显子外显子(exon);在基因序列中,出现在成熟);在基因序列中,出现在成熟mRNA分子上分子上的序列。的序列。内含子内含子(intron):外显子之间、与):外显子之间、与mRNA剪接过程中被删除剪接过程中被删除部分相对应的间隔序列。部分相对应的间隔序列。目
12、录目录真核生物结构基因,由若干个编码区和非真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。断裂基因断裂基因(split gene)CABD编码区编码区 A、B、C、D非编码区非编码区目录目录周芷(Louise T.Chow)1977年细胞杂志第11卷第4期 目录目录真核生物绝大部分编码蛋白质的基因都有内含子。编码真核生物绝大部分编码蛋白质的基因都有内含子。编码rRNA和一些和一
13、些tRNA的基因也都有内含子。的基因也都有内含子。内含子的数量和大小决定了真核基因的大小。不同种属内含子的数量和大小决定了真核基因的大小。不同种属中,外显子序列通常比较保守,而内含子序列则变异较中,外显子序列通常比较保守,而内含子序列则变异较大。大。外显子与内含子接头处有一段高度保守的序列(外显子与内含子接头处有一段高度保守的序列(大多数大多数内含子以内含子以GTGT为为55端开始,末端为端开始,末端为AG-OH-3AG-OH-3),这一),这一共有序列是真核基因中共有序列是真核基因中RNA剪接的识别信号。剪接的识别信号。目录目录基因的基因的5 端称之为上游,端称之为上游,3 端称为下游端称为
14、下游基因序列中开始基因序列中开始RNA链合成的第一个核苷酸所链合成的第一个核苷酸所对应的碱基记为对应的碱基记为+1,此碱基上游的序列记为负,此碱基上游的序列记为负数,下游的序列记为正数。数,下游的序列记为正数。目录目录二、基因编码区编码多肽链和特定的二、基因编码区编码多肽链和特定的RNA分子分子 基因的编码序列决定其编码产物的序列和功能。基因的编码序列决定其编码产物的序列和功能。编码序列中一个碱基的改变或突变,可能使基因功能编码序列中一个碱基的改变或突变,可能使基因功能发生重要的变化。发生重要的变化。相同的相同的DNA序列因起始位点的变化或不同的剪接方式序列因起始位点的变化或不同的剪接方式而编
15、码不同的蛋白质多肽链。而编码不同的蛋白质多肽链。基因编码区中的基因编码区中的DNA碱基序列碱基序列决定特定的成熟决定特定的成熟RNA分分子的序列,即子的序列,即DNA的一级结构决定着其转录产物的一级结构决定着其转录产物RNA分分子的一级结构。子的一级结构。目录目录三、调控序列参与真核基因表达调控三、调控序列参与真核基因表达调控 位于基因转录区前后,对基因表达起调控作用的区位于基因转录区前后,对基因表达起调控作用的区域,因其是紧邻的域,因其是紧邻的DNA序列,又称旁侧序列序列,又称旁侧序列(flanking sequence)。基因的调控区(顺式作用元件)基因的调控区(顺式作用元件)目录目录转录
16、起始点转录起始点TATA盒盒CAAT盒盒GC盒盒增强子增强子AATAAA剪接加尾剪接加尾转录终止点转录终止点修饰点修饰点外显子外显子翻译起始点翻译起始点内内含含子子 OCT-1 OCT-1:ATTTGCAT八聚体八聚体+1结构基因结构基因启动子启动子上游启动子元件上游启动子元件目录目录启动子启动子上游调控元件上游调控元件增强子增强子加尾信号加尾信号细胞信号反应元件细胞信号反应元件顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting elements)目录目录1.1.启动子提供转录起始信号启动子提供转录起始信号 启动子启动子是是DNA分子上能够介导分子上能够介导RNA聚合酶聚合酶结合并形成转录起始复合
17、体的序列。结合并形成转录起始复合体的序列。多数启动子位于真核细胞基因转录起点的上游,多数启动子位于真核细胞基因转录起点的上游,启动子本身通常不被转录。启动子本身通常不被转录。少数启动子(如编码少数启动子(如编码tRNA基因的启动子)位于基因的启动子)位于转录起始点的下游,这些转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。序列可以被转录。目录目录真核生物有真核生物有3类启动子,分别对应于细胞内存类启动子,分别对应于细胞内存在的三种不同的在的三种不同的RNA聚合酶和相关蛋白质。聚合酶和相关蛋白质。rRNAmRNA5S rRNA,tRNA目录目录能够在相对于启动子的任何方向和位置(上游或者下游)能够在
18、相对于启动子的任何方向和位置(上游或者下游)上发挥这种增强作用,大部分位于上游。上发挥这种增强作用,大部分位于上游。增强子序列距离所调控基因距离近者几十个碱基对,远增强子序列距离所调控基因距离近者几十个碱基对,远的可达几千个碱基对。的可达几千个碱基对。通常数个增强子序列形成一簇。通常数个增强子序列形成一簇。有时增强子序列也可位于内含子之中。有时增强子序列也可位于内含子之中。不同的增强子序列结合不同的调节蛋白。不同的增强子序列结合不同的调节蛋白。2.增强子增强邻近基因的转录增强子增强邻近基因的转录增强子增强子是增强真核基因启动子工作效率的顺是增强真核基因启动子工作效率的顺式作用元件,是真核基因中
19、最重要的调控序列,式作用元件,是真核基因中最重要的调控序列,决定着每一个基因在细胞内的表达水平。决定着每一个基因在细胞内的表达水平。目录目录沉默子沉默子(silencer)是抑制基因转录的特定)是抑制基因转录的特定D N A 序 列,当 其 结 合 一 些 反 式 作 用 因 子序 列,当 其 结 合 一 些 反 式 作 用 因 子(repressors)时对基因的转录起阻遏作用,使基因时对基因的转录起阻遏作用,使基因沉默。沉默。REST/NSRF-RE-1/NRSE:silencing of neuronal genes 3.沉默子是负调节元件沉默子是负调节元件目录目录4.绝缘子是异染色质扩
20、散的屏障绝缘子是异染色质扩散的屏障绝缘子(绝缘子(insulator)是具有独立调节作用的染色)是具有独立调节作用的染色质结构,可位于增强子或沉默子与启动子之间,阻止质结构,可位于增强子或沉默子与启动子之间,阻止其对启动子的增强或抑制作用(其对启动子的增强或抑制作用(enhancer-blocking insulators);位于活化基因与异染色质之间,阻止异染色质扩位于活化基因与异染色质之间,阻止异染色质扩展对活化基因造成的抑制作用(展对活化基因造成的抑制作用(barrier insulators)目录目录Enhancer-blocking insulatorsBarrier insulat
21、ors目录目录The chicken-globin locus目录目录真核基因组的结构与功能真核基因组的结构与功能 第二节第二节The Structure and Function of Eukaryote Genome目录目录基因组基因组:细胞或生物体的一套完整单倍体:细胞或生物体的一套完整单倍体遗传物质的总和。遗传物质的总和。目录目录一、真核基因组具有独特的结构一、真核基因组具有独特的结构 基因的编码序列所占比例远小于非编码序列。基因的编码序列所占比例远小于非编码序列。高等真核生物基因组含有大量的重复序列,高等真核生物基因组含有大量的重复序列,真核基因组中存在多基因家族和假基因。真核基因组
22、中存在多基因家族和假基因。大多基因具有可变剪接,大多基因具有可变剪接,80%的可变剪接会的可变剪接会使蛋白质的序列发生改变。使蛋白质的序列发生改变。基因组基因组DNA与蛋白质结合形成染色体,储存与蛋白质结合形成染色体,储存于细胞核内,除配子细胞外,体细胞的基因于细胞核内,除配子细胞外,体细胞的基因组为二倍体。组为二倍体。结构特点:结构特点:目录目录二、真核基因组中存在大量重复序列二、真核基因组中存在大量重复序列 高度重复序列高度重复序列(highly repetitive sequence)中度重复序列中度重复序列(moderately repetitive sequence)单拷贝序列单拷贝
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