原核基因表达及其调控-课件.ppt
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- 关 键 词:
- 基因 表达 及其 调控 课件
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1、2.1 2.1 原核微生物的基因表达及其调控原核微生物的基因表达及其调控2.2 2.2 原核微生物的基因表达产物的分离纯化原核微生物的基因表达产物的分离纯化 (1 1)转录因素;)转录因素;(2 2)翻译因素;)翻译因素;(3 3)蛋白质的稳定性;)蛋白质的稳定性;(4 4)胞外分泌的特性)胞外分泌的特性一、原核生物的基因表达一、原核生物的基因表达第一节第一节 原核生物的基因表达与调控因素原核生物的基因表达与调控因素(一)、转录对基因表达的影响(一)、转录对基因表达的影响要注意的关键名词术语:1)编码链(有义链,the coding strand);6)转录单位(A transcription
2、 unit);2)反义链(模板链,the template strand);7)上游(Upstream);3)RNA聚合酶(RNA polymerase);8)下游(Downstream);4)启动子(A promoter);9)转录起始位点(Startsite);5)终止子(A terminator);10)初始转录产物 A primary transcript 新生新生RNARNA序列与模板链序列与模板链互补;与编码链相同。互补;与编码链相同。大肠杆菌提取的大肠杆菌提取的RNARNA聚合酶:由聚合酶:由五个亚基组成五个亚基组成,分子量为,分子量为 500 500 kDakDa。核心酶(核心
3、酶(2):):转录功能单位转录功能单位 全酶(全酶(2 2 )(core enzymecore enzyme)(holoenzymeholoenzyme)因子因子:参与识别特异的启动子:参与识别特异的启动子 原核生物原核生物RNARNA聚合酶能被聚合酶能被利福平(利福平(rifampicinrifampicin)所抑制所抑制。利福平与利福平与亚基相结合,从而抑制酶的活性。亚基相结合,从而抑制酶的活性。RNARNA聚合酶可聚合酶可形成形成1 1个中间个中间管道管道(二二)、原核生物基因的翻译原核生物基因的翻译起始因子Initiation factors(IFs)可稳定自由状态的 30S 亚基;以
4、及结合起始 tRNA到 30S-mRNA复合物上二、二、可调控启动子驱动的基因表达可调控启动子驱动的基因表达 微生物表达系统:微生物表达系统:(1 1)功能基因;)功能基因;(2 2)载体;载体;(3 3)受体菌:受体菌:枯草芽胞杆菌枯草芽胞杆菌 其它细菌受体菌其它细菌受体菌 酵母菌酵母菌 昆虫细胞昆虫细胞 哺乳动物细胞等哺乳动物细胞等 E.coliE.coli用作受体菌的优势:用作受体菌的优势:(1 1)对其遗传学背景、分子生物学、生物化学和生)对其遗传学背景、分子生物学、生物化学和生 理学方面的了解较为深入;理学方面的了解较为深入;(2 2)很多目的基因能在)很多目的基因能在E.coliE
5、.coli中迅速而有效地表达;中迅速而有效地表达;(3 3)其培养条件易于掌控,培养费用相对较低。)其培养条件易于掌控,培养费用相对较低。启动子:DNA分子中与RNA pol I发生特定结合的序列,启动转录过程。启动子有强/弱之分。E.coli的启动子:(1)-10 region:TATA box(Pribnow box)T77A76T60A61A56T82 (2)-35 region:为RNA pol I初始结合区。T69T79G61A56C54A54 非调控启动子:对细胞产生伤害 (1)持续性地高水平表达某一目的基因会过分消耗宿 主细胞的营养和能源,最终造成致死效应;(2)由于使宿主细胞处
6、于生长的逆境,容易发生载体 质粒的丢失;(3)非调控性地表达外源蛋白,容易受到蛋白酶的水 解作用,从而使最终的蛋白量并不高;(4)形成不溶性的包含体蛋白。(一)可调控启动子一)可调控启动子(Regulatable Promoters):大肠杆菌中已开发5种可调控启动子 (1)Plac 启动子:即 E.coli lac启动子;(2)Ptrp 启动子:即 E.coli trp启动子;(3)Ptac 启动子:由启动子:由lac和和trp组成的杂合启动子。组成的杂合启动子。即即 E.coli lac(-10 区)E.coli trp (-35 区)(4)PL 启动子:基于噬菌体 的启动子;(5)Pt7
7、 启动子:噬菌体T7 的基因10启动子 可调控启动子的特征:(1)通过与阻遏蛋白的相互作用,提供一个 开关系统,使启动子能在特定条件下发 生关闭或者开放;(2)容易被大肠杆菌的RNA聚合酶全酶所识 别。四种简单类型控制通路四种简单类型控制通路 诱导作用是指存在诱导物能使阻遏蛋白失活,或者可激活一个激活蛋白而解除阻遏蛋白对转录起始过程的阻遏;阻遏作用是指一个辅阻遏物激活一种阻遏蛋白,或者使一种激活蛋白失活而对转录过程发生阻遏作用。lac 启动子:(1)lac启动子来源于大肠杆菌的乳糖操纵子,包括启动子、活化蛋白(catabolite activator protein,CAP)结合位点、操纵基因
8、和lacZ组成。(2)lac启动子受到阻遏蛋白(repressor)的负调控,而受到CAP和cAMP的正调控。其中CAP的正调控是通过增加启动子与RNA聚合酶的亲和性而起作用。(3)lac 启动子由于与阻遏蛋白相结合而处于关闭状态,但当加入乳糖或者半乳糖苷结构类似物,如异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)、硫甲基半乳糖苷(TMG)和邻硝基苯基半乳糖苷(ONTG)后可发生脱阻遏作用。乳糖操纵子基因产物:1)lacI:阻遏蛋白;2)lacZ:-半乳糖苷酶;3)lacY:透性酶;4)lacA:硫代半乳糖苷转乙酰基酶 cAMP参与乳糖操纵子的调控:(1)cAMP通过与cAMP受体蛋白(CRP)结合,引起CR
9、P构 象变化,形成一种有活性的cAMP-CRP复合物;(2)乳糖操纵子启动基因(O)有2个位点:一个与RNA聚合 酶结合;另一个与cAMP-CRP结合,而且只有后者结合 后才能与启动基因结合,启动转录过程;(3)cAMP-CRP复合物不仅可以与一个启动基因结合,而且 还可以与几个操纵子上的启动基因结合,从而影响到许 多操纵子。Glucose reduces CRP activiyCRP复合物形成促进复合物形成促进RNA聚合酶与启动聚合酶与启动子的结合子的结合当当CAPCAP与与cAMPcAMP协同作用时,其对启动子的亲和性发生增强,而此时如果葡协同作用时,其对启动子的亲和性发生增强,而此时如果
10、葡萄糖的量达到最低时,其亲和性最高。这样,当诱导物存在时,高浓度萄糖的量达到最低时,其亲和性最高。这样,当诱导物存在时,高浓度的的cAMPcAMP水平能够导致乳糖操纵子的启动子发生高水平的转录作用。水平能够导致乳糖操纵子的启动子发生高水平的转录作用。trp promoter色氨酸启动子色氨酸启动子 由色氨酸阻遏蛋白进行调控:正调控作用。可形成启动子-阻遏蛋白复合物。trp 启动子的脱阻遏可通过:(1)移除色氨酸;(2)加入色氨酸结构类似物,如吲哚丙烯酸(3-indoleacrylic acid).3-吲哚丙烯酸 色氨酸操纵子(色氨酸操纵子(trp operon)由启动子、衰减子、操纵基因和色氨
11、酸合成的5种酶组成。(1)由trpR产生的阻遏蛋白只有在与色氨酸结合后才能形成有活性的阻遏蛋白,它可以与操纵基因结合从而阻止转录的起始。当色氨酸缺乏时,该阻遏蛋白的前体不能与操纵基因结合,也就不能发挥阻遏作用;(2)当细胞中的色氨酸浓度较高时,在衰减子的作用下,操纵子DNA形成类似终止子的茎环结构茎环结构,从而只能翻译出14肽,称为前导肽。IAA是色氨酸的结构竞争类似物,它可以与阻遏蛋白结合而使其失去阻遏活性;不能再与操纵基因结合,从而不能阻遏转录过程。P Ptactac 启动子启动子:是来自于lac和trp的一组杂合启动子,但是比lac和trp都强得多,是一组强启动子。包括:(1)PtacI
12、:PlacUV5的-10区 Ptrp的-35区;(2)PtacII:Ptrp的-35区(一段合成的包括Pribnow框在 内的46bp的DNA)Plac的操纵基因;(3)Ptac12:Plac的-10区 Ptrp的-35区 所有所有Ptac都受都受IPTG的诱导,同时受到阻遏蛋白的阻遏调控。的诱导,同时受到阻遏蛋白的阻遏调控。PL 启动子:阻遏蛋白:cI,来源于噬菌体.cI857:为 cI温度敏感突变体.(1)将携带敏感的cI857 的细菌细胞首先在28 to 30 C条件下 培养,此时cI857 阻遏PL启动子的转录;(2)当细菌细胞被培养至特定浓度时(一般是到达平衡 期),将培养温度升高至
13、42 C,此时cI857 不再发生阻 遏作用,PL启动子开始启动转录过程。PL为为 噬菌体左向早期启动子,控制基因从噬菌体左向早期启动子,控制基因从N到到att的早期转录,受的早期转录,受到到cI所编码的阻遏蛋白的调控。所编码的阻遏蛋白的调控。噬菌体左向操纵子结构示意图噬菌体左向操纵子结构示意图P PL L 启动子启动子(二二)、常用原核表达载体、常用原核表达载体 大量产物的获得:(1)强的、可调控的启动子;(2)翻译效率;(3)新生肽稳定性等。mRNA与核糖体的结合能力:(1)RBS与翻译起始密码子(AUG)之间的距离要合适;(2)编码从结合位点到起始几个密码子之间的的DNA序 列不应含有可
14、能形成环状结构的序列,否则会妨碍 与核糖体的结合。优良表达载体的性能优良表达载体的性能 (1 1)强转录启动子和终止子;)强转录启动子和终止子;(2 2)核糖体结合位点()核糖体结合位点(RBSRBS)的强弱;的强弱;(3 3)质粒载体及其质粒的拷贝数;是否整合到)质粒载体及其质粒的拷贝数;是否整合到 染色体染色体DNADNA之上;之上;(4 4)合成的外源蛋白在细胞中的定位;)合成的外源蛋白在细胞中的定位;(5 5)宿主的翻译效率;)宿主的翻译效率;(6 6)克隆载体所表达的外源蛋白的稳定性。)克隆载体所表达的外源蛋白的稳定性。1、含、含lac 启动子的表达载体:启动子的表达载体:多种。其最
15、大的特点是带有编码lacZ(-半乳糖苷酶)的编码序列。当外源基因插入后,如果能够保持正确的ORF,就可以形成由外源基因编码的多肽和-半乳糖苷酶组成的融合蛋白。所有含lac启动子的表达载体都受到IPTG的诱导。pOP203-13特点(1)为pBR322衍生质粒,插入 了强启动子PlacUV5并在其下 游加入了-半乳糖苷酶的 编码序列(-gal)21 bp 片断和一个EcoRI位点;(2)其融合蛋白的N端为-半乳 糖苷酶的前7个氨基酸和 EcoRI接头编码的少数几个 氨基酸,其C端为完整的外 源蛋白。pOP203系列表达载体:A family of cloning vectors containi
16、ng the lacUV5PromoterpOP203-1,2,3、pOP203-13、pOP203-24、pOP203-27、pOP203-28、pOP203-29表达载体表达载体pOP203pOP203质粒结构示意图质粒结构示意图 2 2、含、含trptrp 启动子的表达载体:启动子的表达载体:(1)产生的表达蛋白的量高于lac启动子;(2)所有含trp启动子的表达载体都受到3-吲哚丙烯 酸(IAA)的诱导。如:pDR720pDR720 质粒质粒pDR720是一个含是一个含trp启动子的表达载体,它启动子的表达载体,它来源于来源于p51,trp启动子在启动子在Sma I位点插入,在启动子位
17、点插入,在启动子的下游有的下游有3个位点,个位点,Sal I、BamH I和和Sma I,可以插,可以插入外源基因。入外源基因。质粒载体pDR720结构示意图 3、含tac 启动子的表达载体:高表达效率启动子;受IPTG的诱导。多种商业化的载体。如:pKK223-3;pBADHis-A,B,C;pTrcHis-A,B,C;pSE420 特点:特点:1)Ampr;2)tac启动子;3)lacZ核糖体结合部位;4)ATG起始密码子,位于 RBS下游8bp处;5)来源于-噬菌体的终止 子T1和T2,以避免其它 基因的过度转录。4、含PL 启动子的表达载体:是一种极强的启动子,所以被广泛用于各种载体的
18、 构建;如:pPL-;(1)来源于pBR322,pBR322的EcoRI/BamHI位点 被PL 和N基因取代;(2)外源基因可以插入到N基因中的HpaI位点;(3)当培养温度为29-31C时,PL启动子处于阻遏 状态;但当温度升到42C,发生脱阻遏。质粒载体质粒载体pPL-结构示意图结构示意图(三)提高蛋白质的表达量三)提高蛋白质的表达量 某些表达载体被构建用于增加蛋白质的表达量,例如,pPLc2833:(1)强启动子;(2)选择性标记;(3)多克隆位点(MCS)其衍生质粒pCP3的构建:将pPLc2833的复制起始位点替换为另一个质粒pKN402。质粒pKN402的复制起始位点是耐温型的,
19、在42C时仍然有很强的复制起始的功能。电泳后回收片段c电泳后回收片段1和3连接 由于pKN402和pCP3的复制子在42C时仍然具有很强的起始复制能力,因此当培养温度升高到42C时,细胞中的pKN402和pCP3的拷贝数要比pPLc2833高510倍。温度对3种表达载体质粒拷贝数的影响(四)大规模培养系统四)大规模培养系统 小规模培养(15L)含表达载体的重组菌株时,其调控可以直接向培养基中添加诱导物,或者升高温度,但是在半工业化(20200L)或者工业化大规模(大于200L)生产时,不能采用小规模的方法:(1)直接向培养基中添加诱导物如IPTG,由于需要量较大,成本 高,不经济;(2)即使是
20、使用温度敏感的表达载体,升高温度既需要较长的时 间,又需要很大的能源消耗,成本也很高。一种解决的途径:使用“双质粒系统双质粒系统”:用trp启动子带动编码cI阻遏蛋白的基因,然后将它们置于一个弱启动子的载体上;将要表达的外源基因置于强启动子PL之下,使其受PL启动子的控制。“双载体系统”特点:1)当培养基中Trp含量较低时,trp启动子启动,cI阻遏蛋白合成,此时PL启动子受阻遏,目的基因不表达;2)添加Trp(可添加蛋白胨)以后,trp启动子受阻遏,而PL启动子启动,此时可表达外源蛋白。A 培养基中不存在色氨酸B 培养基中不存在色氨酸cI蛋白合成(脱阻遏)无克隆基因蛋白合成(阻遏)克隆基因蛋
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