第六章连锁遗传分析和染色体作图课件.ppt
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- 第六 连锁 遗传 分析 染色体 作图 课件
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1、引言:引言:孟德尔定律表明一对等位基因在遗传时相互分离,两孟德尔定律表明一对等位基因在遗传时相互分离,两对以上的等位基因则自由组合。遗传的染色体学说则对以上的等位基因则自由组合。遗传的染色体学说则说明基因在染色体上。基因有很多,成千上万,而染说明基因在染色体上。基因有很多,成千上万,而染色体只有几条到几十条,最多不过几百条。例如人类色体只有几条到几十条,最多不过几百条。例如人类有有23对染色体,而基因数目为对染色体,而基因数目为35000个。每条染色个。每条染色体上必然有很多基因。基因在染色体上是如何排列的体上必然有很多基因。基因在染色体上是如何排列的呢?同一条染色体上的基因之间在遗传时又是如
2、何相呢?同一条染色体上的基因之间在遗传时又是如何相互作用的呢?这就是本章要解决的问题互作用的呢?这就是本章要解决的问题内容包括:内容包括:I.连锁交换定律连锁交换定律II.基因定位与染色体作图基因定位与染色体作图III.人类基因组和染色体作图人类基因组和染色体作图遗传学重大发现往往由一个遗传学重大发现往往由一个“例外例外”现象而引起,现象而引起,Morgan由例外的白眼雄果蝇发现了伴性遗传,他的由例外的白眼雄果蝇发现了伴性遗传,他的学生学生Bridges由白眼雄果蝇中的初级例外和次级例外由白眼雄果蝇中的初级例外和次级例外发现了染色体不分离现象,并直接证明了遗传的染色发现了染色体不分离现象,并直
3、接证明了遗传的染色体学说。连锁现象的发现则是由两对基因杂交试验的体学说。连锁现象的发现则是由两对基因杂交试验的F2代性状分离比不符合孟德尔比率代性状分离比不符合孟德尔比率9:3:3:1的例外而引的例外而引起的,第一个发现非自由组合现象的是起的,第一个发现非自由组合现象的是W.Bateson 和和R.C.Punnet,他们于他们于1906年在研究香豌豆的花色及花年在研究香豌豆的花色及花粉粒的形状的遗传时,发现这两对性状在遗传时不能粉粒的形状的遗传时,发现这两对性状在遗传时不能自由组合。自由组合。P:红花长花粉红花长花粉白花圆花粉白花圆花粉F1:红花长花粉红花长花粉 表型表型观察数观察数(O)期望
4、比例期望比例 期望值期望值(E)F2:红长红长4831 9 3910.5红圆红圆390 3 1303.5白长白长393 3 1303.5白圆白圆1338 1 434.5 总计总计6952 2=(Oi-Ei)2/Ei=3371.58 df=4-1=3,2 2 0.05=7.82,2 2 0.01=11.35,统计差异极显统计差异极显著,著,说明实验结果不符合自由组合定律,说明实验结果不符合自由组合定律,F2代中性状的亲代中性状的亲本组合类型远远多于重组类型。本组合类型远远多于重组类型。香豌豆的花色及花粉粒的形状的遗传这两对性状在遗香豌豆的花色及花粉粒的形状的遗传这两对性状在遗传时不能自由组合,传
5、时不能自由组合,F2代中性状的亲本组合类型远远多代中性状的亲本组合类型远远多于重组类型。为什么?于重组类型。为什么?Batson等人并没能解释其原因,等人并没能解释其原因,只是提出了两个名词术语,用互引相只是提出了两个名词术语,用互引相(coupling phase)来来表示前一种亲本组合,用互斥相表示前一种亲本组合,用互斥相(repulsion phase)来表示来表示后一种亲本组合。这个谜团直到后一种亲本组合。这个谜团直到1912年摩尔根发现连锁年摩尔根发现连锁交换定律才被解开。交换定律才被解开。摩尔根摩尔根1910年发现果蝇白眼的伴性遗传后,又发现了年发现果蝇白眼的伴性遗传后,又发现了几
6、个其他的伴性遗传性状,他同时研究了两对伴性性状几个其他的伴性遗传性状,他同时研究了两对伴性性状的遗传,通过大量的杂交试验,发现凡是伴性遗传的基的遗传,通过大量的杂交试验,发现凡是伴性遗传的基因,相互之间总是连锁的。因,相互之间总是连锁的。2.1 摩尔根的试验摩尔根的试验摩尔根用灰体长翅与摩尔根用灰体长翅与黑体残翅果蝇杂交:黑体残翅果蝇杂交:P:灰体长翅灰体长翅(BBVV)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)F1:灰体长翅灰体长翅(BbVv)测交测交:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):黑体残翅黑体残翅(bbvv)=(bbvv)=
7、1 :1按自由组合定律,按自由组合定律,应该产生:灰体长翅应该产生:灰体长翅(BbVv):黑体长黑体长翅翅(bbVv):灰体残翅灰体残翅(Bbvv):黑体残翅黑体残翅(bbvv)=1:1:1:1的四种的四种类型,可是试验结果并非如此,类型,可是试验结果并非如此,F2代没有重组类型,全部代没有重组类型,全部是亲本类型:是亲本类型:测交测交:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):0.42 0.42 黑体黑体长翅长翅(b bbVv):0.08 0.08 灰体灰体残翅残翅(Bbvv)bvv):0.08 0.08 黑体残翅黑体残翅(bbvv)(
8、bbvv):0.42 0.42 F2 F2虽然出现了四种类型,但是重组类型显著少于亲虽然出现了四种类型,但是重组类型显著少于亲本类型。本类型。2.2 摩尔根的解释:基因摩尔根的解释:基因B、V处于同一条染色体上,而其等位基因处于同一条染色体上,而其等位基因b、v位于同源染色体的另一条上。这样在形成配子的减数分裂时,位于同源染色体的另一条上。这样在形成配子的减数分裂时,B和和V,b和和v结随同它们所在的染色体一起分离,而不能独立分配和自结随同它们所在的染色体一起分离,而不能独立分配和自由组合。由组合。(1).连锁连锁(linkage):处于同一条染色体上的基因遗传时较多地联系在一起处于同一条染色
9、体上的基因遗传时较多地联系在一起的现象称为连锁的现象称为连锁.(2).完全连锁完全连锁(Complete linkage):如上述第一种情况,基因完全连锁,如上述第一种情况,基因完全连锁,不能发生重组。不能发生重组。P:灰体长翅灰体长翅(BBVV)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)F1:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):黑体残翅黑体残翅(bbvv)=(bbvv)=1 :1B VB Vb vb vB Vb vb vb vB Vb vb vb v(3).不完全连锁不完全连锁(Incomplete linkage):如上述第二种情
10、况,:如上述第二种情况,基因可以发生部分重组,但亲本类型多于重组类型。基因可以发生部分重组,但亲本类型多于重组类型。灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)(bbvv)灰体长翅灰体长翅:黑体黑体长翅长翅:灰体灰体残翅残翅:黑体残翅黑体残翅(BbVv)(b bbVv)(Bbvv)(bbvv)bvv)(bbvv)B Vb vB vb VB Vb vb vb vb vb vb vb v42%8%8%42%玉米实验玉米实验 1931年美国著名的遗传学家麦克林托克(年美国著名的遗传学家麦克林托克(McClintock)指导了她的女博士生克莱顿(指导了她的女博士生克莱顿(Creighton
11、,B)以玉米为材)以玉米为材料进行了一项有趣的实验,为染色体交换导致遗传重组提供料进行了一项有趣的实验,为染色体交换导致遗传重组提供了一个有力的证据。了一个有力的证据。玉米的优点:玉米的优点:1、很多性状可以在种子上看到、很多性状可以在种子上看到2、同一、同一穗上有几百粒种子,便于计数分析穗上有几百粒种子,便于计数分析3、去雄容易,、去雄容易,4、经济作物,可以直接用在生产上。经济作物,可以直接用在生产上。玉米籽粒的两对性状遗传玉米籽粒的两对性状遗传:糊粉层有色糊粉层有色C对无色对无色c是显性是显性饱满种子饱满种子Sh对凹陷种子对凹陷种子sh是显性是显性P CCShSh ccshshF1 Cc
12、Shsh ccshsh(测交测交)F2 CcShsh Ccshsh ccShsh ccshsh有色饱满有色饱满 有色凹陷有色凹陷 无色饱满无色饱满 无色凹陷无色凹陷 1:1:1:1实际结果实际结果 4032 149 152 4035亲组合亲组合 8067占占 96.4%;重组合重组合 301 占占3.6%无色饱满无色饱满ccShSh 有色凹陷有色凹陷CCshshF1 CcShsh ccshsh(测交)(测交)F2 CcShsh Ccshsh ccShsh ccshsh有色饱满有色饱满 有色凹陷有色凹陷 无色饱满无色饱满 无色凹陷无色凹陷1:1:1:1实际结果:实际结果:638 21379 21
13、906 672亲组合占亲组合占 97.06%;重组合占;重组合占2.94%(1).重组:同一对同源染色体上不同对等位基因之间的重新重组:同一对同源染色体上不同对等位基因之间的重新组合的现象叫做重组组合的现象叫做重组(Recombination),以与自由组合相区,以与自由组合相区别。重组产生的重组类型个体称为重组子别。重组产生的重组类型个体称为重组子(recombinants)。(2).重组率:两个基因之间是否连锁,可以对重组率:两个基因之间是否连锁,可以对F1代进行测交代进行测交来检测。如果测交后代的比率为来检测。如果测交后代的比率为1:1:1:1,则是自由组合的,则是自由组合的,如果亲组型
14、高于预期比率而重组型低于预期比率,则说明它如果亲组型高于预期比率而重组型低于预期比率,则说明它们是互相连锁的。遗传学中以测交子代中出现的重组子所占们是互相连锁的。遗传学中以测交子代中出现的重组子所占的比例来测定基因连锁的程度,称为重组率的比例来测定基因连锁的程度,称为重组率(recombination frequency,RF)。由此可知,不论用哪种基因组合的交配由此可知,不论用哪种基因组合的交配方式,测交的结果都是亲组型的频率很高,方式,测交的结果都是亲组型的频率很高,占占97%左右,而重组型的频率很低,仅占左右,而重组型的频率很低,仅占3%左右。显然,测得的两个特定基因座的左右。显然,测得
15、的两个特定基因座的RF值值越大,例如接近越大,例如接近50%时,基因间的连锁关系时,基因间的连锁关系越难以判断,因为与基因的自由组合测交比越难以判断,因为与基因的自由组合测交比1:1:1:1很接近,在这种情况下,必须用大量很接近,在这种情况下,必须用大量的测交后代的数据方可鉴别。如的测交后代的数据方可鉴别。如RF值越小,值越小,基因间的连锁关系越易察觉,因为测交比例基因间的连锁关系越易察觉,因为测交比例与与1:1:1:1相差甚远。相差甚远。我们知道,不同染色体上的基因遗传时可以自由组合,因我们知道,不同染色体上的基因遗传时可以自由组合,因而可以产生亲代所没有的新组合;位于同一条染色体上的而可以
16、产生亲代所没有的新组合;位于同一条染色体上的基因相互连锁,形成亲代所没有的新组合的机制是什么?基因相互连锁,形成亲代所没有的新组合的机制是什么?在两对基因连锁遗传时,为什么又会出现一定频率的重组?在两对基因连锁遗传时,为什么又会出现一定频率的重组?1.交换的机制:交换的机制:Janssens,1909年根据两栖类和直翅目昆年根据两栖类和直翅目昆虫的减数分裂的观察,提出了交叉型假设(虫的减数分裂的观察,提出了交叉型假设(chiasmatype hypothesis),解释了遗传重组的机制,其要点是:,解释了遗传重组的机制,其要点是:(1).减数分裂前期,尤其是双线期,配对中的同源染减数分裂前期,
17、尤其是双线期,配对中的同源染色体不是简单地平行靠拢,而是在非姊妹染色单体色体不是简单地平行靠拢,而是在非姊妹染色单体之间的出现交叉之间的出现交叉(chiasma),这是同源染色体对应片,这是同源染色体对应片段之间发生过交换段之间发生过交换(crossing over)的地方的地方.(2).处于同源染色体的不同座位的相互连锁的两个基因之间如果发处于同源染色体的不同座位的相互连锁的两个基因之间如果发生了交换,就会导致这两个基因发生重组。生了交换,就会导致这两个基因发生重组。A Ba bA ba B交换交换发生在染色体复制之后,因此发生过交换的性母细胞交换发生在染色体复制之后,因此发生过交换的性母细
18、胞产生的配子,只有一半是重组子,另一半是亲组型。产生的配子,只有一半是重组子,另一半是亲组型。A BA ba Ba bA Ba bA Ba bA Ba b复制 交换重组率最大值不可能超过重组率最大值不可能超过50%,无论染色体,无论染色体上两点距离如何大,一次交换只可能发生在非上两点距离如何大,一次交换只可能发生在非同源染色体的两条染色单体之间,另外两条单同源染色体的两条染色单体之间,另外两条单体并未发生交换,即使是每个初级性母细胞都体并未发生交换,即使是每个初级性母细胞都如此,重组率也只有如此,重组率也只有50%,其实当重组率达,其实当重组率达到到50%时已是染色体间的自由组合了。时已是染色
19、体间的自由组合了。摩尔根通过深入研究发现了同一条染色体上的基因之间具有连锁遗传和交换的特性,这就是被誉为遗传学第三大定律的连锁交换定律。其内容是:处在同一染色体上的两个或多个基因联合在处在同一染色体上的两个或多个基因联合在一起传入子代的频率大于重新组合的频率一起传入子代的频率大于重新组合的频率.重组重组类型的产生是由于配子形成时,同源染色体的非类型的产生是由于配子形成时,同源染色体的非姊妹染色单体间发生了局部交换的结果。姊妹染色单体间发生了局部交换的结果。1.分离定律是自由组合定律和连锁交换定律的基础;分离定律是自由组合定律和连锁交换定律的基础;2.自由组合定律和连锁交换定律是生物体遗传性状发
20、生自由组合定律和连锁交换定律是生物体遗传性状发生变异的主要机制;变异的主要机制;3.自由组合于连锁交换的区别在于:自由组合是染色体自由组合于连锁交换的区别在于:自由组合是染色体间重组间重组(interchromosomal recombination),而交换则,而交换则是染色体内重组是染色体内重组(intrachromosomal recombiation)。4.另外,自由组合受到生物染色体对数的限制,而连锁另外,自由组合受到生物染色体对数的限制,而连锁交换则受到其染色体本身长度的限制。只要我们在染交换则受到其染色体本身长度的限制。只要我们在染色体上发现的突变愈多,由交换而产生的重组类型的色
21、体上发现的突变愈多,由交换而产生的重组类型的数量也愈大。从这个意义上说,自由组合是有限的,数量也愈大。从这个意义上说,自由组合是有限的,连锁交换相对地说限度较小。连锁交换相对地说限度较小。有许多因素影响交换,包括温度、性别、射线、化学物质等等。1)温度:在果蝇中早已发现22C饲养的雌蝇的交换频率最低。2)射线和化学物质:某些化学物质如放线菌D、丝裂霉素C可以引起交换值的增加。3)着丝粒使附近基因的交换值明显降低。4)性别:人类和许多哺乳动物例如小鼠,雌性交换值大于雄性。性别对于交换的影响最典型的情况是在果蝇果蝇中由Morgan所发现的雄蝇无交换(完全连锁)。在家蚕中则恰恰相反,交换只发生在雄蚕
22、而不发生在雌蚕雌蚕中。实际上,凡是性染色体决定性别的生物,异配性别的个体中一般总是较少发生交换。双交换(双交换(double crossingover):A、B两个基因座之间同时发两个基因座之间同时发生两次交换。其特点是:生两次交换。其特点是:(1).双交换的概率显著低于单交换的概率,如果不存在干涉,双交换的概率显著低于单交换的概率,如果不存在干涉,双交换的概率是两个单交换概率的乘积。双交换的概率是两个单交换概率的乘积。(2).AB两个基因座之间发生双交换,基因不会发生重组,如果两个基因座之间发生双交换,基因不会发生重组,如果没有没有C基因座作为参照,则看不出发生过交换。基因座作为参照,则看不
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