基因工程酶学基础-课件.ppt
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1、西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第三章第三章 基因克隆的酶学基础基因克隆的酶学基础第一节第一节 限制性内切酶限制性内切酶第二节第二节 DNA、RNA连接酶连接酶第三节第三节 DNA聚合酶聚合酶第四节第四节 其它酶其它酶第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第一节第一节 限制性内切酶限制性内切酶返回第三章返回第三章3.1.1 寄主控制的限制与修饰现象(寄主控制的限制与修饰现象(50年代初)E.coli KE.coli CEOP=1EOP=1EOP=10-4 EOP=10-4 E
2、OP=1EOP=1EPO:efficiency of plate限制的实质是切割限制的实质是切割外源外源DNA,修饰的实修饰的实质是通过甲基化等质是通过甲基化等修饰自身修饰自身DNA而不而不被切割被切割起作用的是起作用的是核酸内核酸内切酶切酶和和甲基化酶甲基化酶第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程v型内切酶的发现型内切酶的发现3H标记标记未修饰未修饰的的 噬菌体噬菌体DNA+32P标记标记修饰修饰的的 噬菌体噬菌体DNA 不同菌株细胞温育一定时间蔗糖梯度离心分析蔗糖梯度离心分析DNA未修饰的未修饰的DNA降解降解
3、 修饰的修饰的DNA未降解未降解表明菌株细胞中存在核酸内切酶的活性表明菌株细胞中存在核酸内切酶的活性3.1.23.1.2 限制酶的发现限制酶的发现返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程特性特性型型型型型型限制修饰活性限制修饰活性单一功能单一功能分开的内切和甲基分开的内切和甲基活性活性双功能双功能蛋白质结构蛋白质结构三种亚基三种亚基单一成分单一成分2种亚基种亚基辅助因子辅助因子ATP,Mg+2、SAMMg+2ATP,Mg+2、SAM识别位点识别位点EcoB:TGA(N)8TGCT旋转对称旋转对称E
4、coP1:AGACC序列特异的切割序列特异的切割距识别位点至少距识别位点至少1000 bp 随机切割随机切割识别位点特异切割识别位点特异切割识别位点识别位点3端端24-26 bp处处基因克隆中的用处基因克隆中的用处无用无用十分有用十分有用用处不大用处不大3.1.3 3.1.3 限制性内切酶的一般特点限制性内切酶的一般特点返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.1.4 3.1.4 限制性内切酶的命名方式限制性内切酶的命名方式 第一个字母采用含有此酶的细菌属名的第一个字第一个字母采用含有此酶的细菌
5、属名的第一个字母,母,后两个字母为种名的前两个字母,小写,株系数后两个字母为种名的前两个字母,小写,株系数字通常都省略,字通常都省略,罗马数字用来表示从同一个细菌中分离出的不同罗马数字用来表示从同一个细菌中分离出的不同的限制性内切酶。的限制性内切酶。比如比如HpaI和和HpaII就是从同一种细菌中分离出来的就是从同一种细菌中分离出来的第一种和第二种类型第一种和第二种类型II的限制性内切酶。的限制性内切酶。返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程被被酶酶切开的双链切开的双链DNA在端口各形成在端口各
6、形成4个碱基暴露在外的单链,个碱基暴露在外的单链,即形成粘性末端,即形成粘性末端,内切部位为磷酸二酯键处内切部位为磷酸二酯键处返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程5GTTAAC 3 3CAATTG 55GTT AAC 3 3CAA TTG 5返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程
7、3.1.5 3.1.5 同尾酶和同裂酶同尾酶和同裂酶 AGATCT A GATCT TCTAGA TCTAG A CGATCG C GATCG GCTAGC GCTAG C返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.1.6 3.1.6 型酶的特点和型酶的特点和识别位点识别位点大多数大多数II型酶结合并且切割回文序列型酶结合并且切割回文序列,又称为又称为识别序列识别序列或或识别位点识
8、别位点酶切后产生酶切后产生5磷酸突出或磷酸突出或3羟基突出的末端,它们统称为羟基突出的末端,它们统称为粘性末端粘性末端酶酶有一些在切割两条链时会产生两端平整有一些在切割两条链时会产生两端平整(平末端平末端)的的DNA分子分子酶的识别位点的可以是酶的识别位点的可以是4个、个、5个、个、6个、个、8个甚至更多的碱基对个甚至更多的碱基对在分子克隆实验中使用最普遍的是识别在分子克隆实验中使用最普遍的是识别4个或个或6个碱基对的酶个碱基对的酶星号活性星号活性:非最佳条件下表现出的活性非最佳条件下表现出的活性返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课
9、程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.1.7 3.1.7 类型类型IIII限制性内切酶的主要用途限制性内切酶的主要用途1,绘制物理图谱(酶切位点图谱),绘制物理图谱(酶切位点图谱)返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程想看结果请单击第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程l两个不同的两个不同的DN
10、A样品用同一种酶酶切后,能产生相同的粘性末端样品用同一种酶酶切后,能产生相同的粘性末端l两个平末端两个平末端DNA片段也可以进行相互拼接片段也可以进行相互拼接 HindIII HindIII -CTCGAAGCTTGTTC-GGCAAGCTTACT-CAGCTTCGAACAAG-CCGTTCGAATGA -CTCGAOH pAGCTTGTTC-GCAOH pAGCTTACT-CAGCTTCGAp HOACAAG-CCGTTCGAp HOATGA 混合 退火 HO p -C T C G A A G C T T G T T C-C A G C T T C G A A C A A G P OH图 2
11、10 两段粘性末端 DNA 的互补配对2,产生克隆位点,产生克隆位点返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.1.8 影响核醚内切限制酶活性的因素影响核醚内切限制酶活性的因素(1)DNA的纯度的纯度(2)DNA的甲基化程度的甲基化程度(3)酶切消化反应的温度酶切消化反应的温度(4)DNA的分子结构的分子结构(5)核酸内切限制酶的缓冲液核酸内切限制酶的缓冲液返回
12、第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.1 3.2.1 连接酶连接酶待连接二端之一须有磷酸根待连接二端之一须有磷酸根第二节第二节 DNA、RNA连接酶连接酶返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.2 3.2.2 常见的常见的DNADNA连接酶连接酶n大肠杆菌大肠杆菌DNA连接酶连接酶,由细菌由细菌DNA编码,只连接编码,只连接 粘性末端。粘性末端。nT4 DNA连接酶连接酶,由由T4噬菌体
13、侵染的大肠杆菌产生。噬菌体噬菌体侵染的大肠杆菌产生。噬菌体DNA编码,对平末端的连接效率比编码,对平末端的连接效率比细菌细菌DNA连接酶连接酶高的多。高的多。n热稳定的热稳定的DNA连接酶:连接酶:嗜热高温放线菌中分离,嗜热高温放线菌中分离,85度有高活性,度有高活性,94仍有活性。仍有活性。返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.3 3.2.3 连接酶的连接作用连接酶的连接作用返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武
14、国凡武国凡基因工程基因工程返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.4 DNA的连接策略的连接策略二、平末端二、平末端DNA片段的连接片段的连接一、粘性末端一、粘性末端DNA片段的连接片段的连接(1)同聚物加尾法同聚物加尾法返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程(2)衔接物连接法衔接物连接法双衔接物法双衔接物法返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师
15、范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程(3)DNA接头连接法接头连接法第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.5热稳定的热稳定的DNA连接酶连接酶p从嗜热高温放线茵菌株中分离纯化从嗜热高温放线茵菌株中分离纯化p能够在高温下催化两条寡核苷酸探针发生连接作用的一种能够在高温下催化两条寡核苷酸探针发生连接作用的一种核酸酶核酸酶:在在85高温下都具有连接酶的活性,而
16、且在重复多次高温下都具有连接酶的活性,而且在重复多次升温到升温到940 之后也仍然保持活性。之后也仍然保持活性。p使用此种使用此种DNA连接酶进行体外连接,可明显降低形成非持连接酶进行体外连接,可明显降低形成非持异性连接产物的机率。异性连接产物的机率。p现已经能够从克隆的大肠杆菌中大量制备现已经能够从克隆的大肠杆菌中大量制备.返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程3.2.6 寡核苷酸连接测定寡核苷酸连接测定返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学
17、 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程也叫连接扩增反应,是也叫连接扩增反应,是应用寡核苷酸探针通过应用寡核苷酸探针通过DNA连接酶的作用扩增连接酶的作用扩增已知序列的靶已知序列的靶DNA3.2.7 连接酶链式反应连接酶链式反应返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程(1)裂口连接酶链裂口连接酶链式反应式反应(P151)(2)不对称裂口连不对称裂口连接酶链式反应接酶链式反应返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武
18、国凡基因工程基因工程3.2.8 连接策略连接策略1、匹配的粘性末端:、匹配的粘性末端:、平末端:、平末端:、不匹配的粘性末端:、不匹配的粘性末端:返回第三章返回第三章第三章第三章 基因工程酶学基础基因工程酶学基础西北师范大学西北师范大学 精品课程精品课程 武国凡武国凡基因工程基因工程第三节第三节 DNA聚合酶聚合酶返回第三章返回第三章DNA聚合酶:聚合酶:需要模板,有需要模板,有多种多种活性活性,催化催化1个个核苷酸在个个核苷酸在链的链的3接上去接上去Taq DNA聚合酶聚合酶:来自于嗜热的古细菌来自于嗜热的古细菌逆转录酶:逆转录酶:以以mRNA为模为模板,在逆转录酶的作用下,合成板,在逆转录
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