第八章DNA重组与转座课件.ppt
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- 第八 DNA 重组 课件
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1、2022-12-16第八章DNA重组与转座第八章第八章DNA重组与转座重组与转座第八章DNA重组与转座概述概述第一节第一节 同源重组同源重组第二节第二节 位点专一性重组位点专一性重组第三节第三节 转座作用转座作用第四节第四节 逆转录转座子逆转录转座子第八章DNA重组与转座概述:概述:只要有只要有DNA,就会发生重组,就会发生重组减数分裂减数分裂高等高等Euk.体细胞核基因、叶绿体和线粒体体细胞核基因、叶绿体和线粒体温和噬菌体温和噬菌体转座子转座转座子转座 生存生存变异变异突变,重组突变,重组 损伤修复、适应环境、加速进化损伤修复、适应环境、加速进化 广义遗传重组:任何造成基因型变化的基因交流过
2、程广义遗传重组:任何造成基因型变化的基因交流过程第八章DNA重组与转座 DNA重组 DNA分子内或分子间发生遗传信息的重新组合。(1)同源重组(2)位点特异性重组(3)转座重组(4)异常重组 DNA重组可分为四类(重组可分为四类(DNA序列、蛋白质因子)序列、蛋白质因子)第八章DNA重组与转座 重组重组DNA技术技术 第八章DNA重组与转座第一节第一节 同源重组同源重组第八章DNA重组与转座1、同源重组(同源重组(homologous recombination):发生在同源发生在同源DNA序列之间序列之间一、特征一、特征2、特征:特征:涉及同源序列间的联会配对,且交换的片段较大涉及同源序列间
3、的联会配对,且交换的片段较大 涉及涉及DNA分子在特定的交换位点发生分子在特定的交换位点发生断裂和错接断裂和错接的生化过程的生化过程 异源双链区的生成异源双链区的生成 存在重组热点存在重组热点 需要重组酶需要重组酶 单链单链DNA分子或单链分子或单链DNA末端是交换发生的重要信号末端是交换发生的重要信号第八章DNA重组与转座细线期细线期合线期合线期粗线期粗线期双线期双线期终变期终变期 e.g.e.g.Euk.Euk.减数分裂时减数分裂时 的染色单体之间的染色单体之间 的交换的交换 细菌的转化,细菌的转化,转转 导,接合,噬菌体导,接合,噬菌体 重组重组第八章DNA重组与转座双倍体染色体交换双倍
4、体染色体交换第八章DNA重组与转座二 同源重组的分子模型1.Holliday于1964年提出Holliday模型(1)两个同源染色体DNA排列整齐(2)两DNA分子同一部位两单链发生断裂引发重组(3)断裂的单链游离末端彼此交换形成Holliday中间体(4)通过分支迁移产生异源双链DNA分子。(5)中间体在内切酶和连接酶作用下,形成拼接重组体和片段重组体。第八章DNA重组与转座Synapsedchromatids第八章DNA重组与转座RecombinationjointHeteroduplex DNA第八章DNA重组与转座第八章DNA重组与转座第八章DNA重组与转座55(1)(2)片段重组体拼
5、接重组体Holliday中间体第八章DNA重组与转座3553Meselson-Radding模型模型单链入侵模型(链转移模型)单链入侵模型(链转移模型)置换置换侵入侵入Loop切除切除同化同化 异构化异构化 分支迁移分支迁移5切割切割第八章DNA重组与转座双链断裂修复模型双链断裂修复模型 第八章DNA重组与转座2、分枝迁移和分枝迁移和Holliday中间体中间体结构的拆分结构的拆分 分枝迁移(分枝迁移(branch migaration)双螺旋形成的交叉连接以拉链式效应扩散双螺旋形成的交叉连接以拉链式效应扩散第八章DNA重组与转座Holliday的异构化的异构化产生重组体的拆分产生重组体的拆分
6、Holliday结构一经生成即可结构一经生成即可不断地处于异构化不断地处于异构化异源双链异源双链 heteroduplex DNA重组结果取决于拆分时重组结果取决于拆分时配对链上的切口位置配对链上的切口位置第八章DNA重组与转座(1)(2)(1)(2)Holliday结构的拆分结构的拆分产生含异源双链产生含异源双链的的片段重组体片段重组体产生产生拼接重组体拼接重组体第八章DNA重组与转座“亲本链亲本链-片段重组体片段重组体”“拼接重组体拼接重组体”第八章DNA重组与转座三、原核同源重组(三、原核同源重组(E.coli)发生在双方发生在双方DNA的同源区域的同源区域 部分复制的染色体部分复制的染
7、色体DNA之间或染色体之间或染色体DNA与外源与外源DNA之间之间 细菌的转化、结合和转导细菌的转化、结合和转导 1、RecBCD酶和酶和 Chi 位点位点 RecBCD酶具有酶具有ATP依赖的依赖的解旋酶活性、依赖于解旋酶活性、依赖于ATP的核酸的核酸外切酶活性、外切酶活性、序列特异性的单链内切酶活性序列特异性的单链内切酶活性.单链内切酶活性和解旋酶活性使单链内切酶活性和解旋酶活性使DNA产生具有游离末端的单链产生具有游离末端的单链 RecA的作用位点的作用位点 Chi位点含有位点含有GCTGGTGG序列序列,是基因是基因recBCD编码编码RecBCD酶作用酶作用的靶的靶位点位点第八章DN
8、A重组与转座3 RecBCD的识别和切割位点的识别和切割位点a、RecBCD结合在结合在DNA的平的平 头末端(产生机制不清楚)头末端(产生机制不清楚)b、外切、外切、解链、移动解链、移动 (ATP)c、兔耳状兔耳状 loop 结构产生结构产生(再旋酶活性低于解旋酶活性)(再旋酶活性低于解旋酶活性)d、RecBCD 在在 loop 单链区的单链区的 chi 位点位点3方方46NT处切处切 断单链(单链内切酶)断单链(单链内切酶)chi位点:位点:GCTGGTGG 目前发现的重组热点目前发现的重组热点 E.coli 含含 1000 个、个、Euk.第八章DNA重组与转座e、RecBCD 切割产生
9、切割产生3单链末端单链末端第八章DNA重组与转座 2、RecA 蛋白蛋白(1)活性活性a、RecA 有单、有单、双链双链 DNA 结合活性结合活性 b、RecA 有有 NTPase 活性(底物差异活性)活性(底物差异活性)与单链与单链 DNA 结合时活性最大结合时活性最大-依赖于依赖于 DNAc、RecA 有启动一个分子的单链侵入到另一双螺旋分子有启动一个分子的单链侵入到另一双螺旋分子 的能力,即联会同源的能力,即联会同源 DNA (但其靶(但其靶 DNA 必须有缺口结合必须有缺口结合DNA)第八章DNA重组与转座第八章DNA重组与转座RecA入侵单链入侵单链被置换连被置换连RecA引发链侵入
10、模型引发链侵入模型第八章DNA重组与转座RecA promotes the assimilation of invading single strands into duplex DNA so long as one of the reacting strands has a free end.RecA启动的单链入侵启动的单链入侵第八章DNA重组与转座RecA引起的链交换和引起的链交换和Holliday结构的生成结构的生成 第八章DNA重组与转座(2)RecA 蛋白催化双链和单链蛋白催化双链和单链 DNA 的反应阶段的反应阶段a、联会前阶段(缓慢)联会前阶段(缓慢)RecA 与单链结合与单链结
11、合b、单链与双螺旋的互补链迅速配对,形成双链连接分子单链与双螺旋的互补链迅速配对,形成双链连接分子 Holliday(5侵入)侵入)c、从双螺旋结构中缓慢置换一条链产生一段长的异源双链从双螺旋结构中缓慢置换一条链产生一段长的异源双链 DNA 反应结束时,反应结束时,RecA 结合到双链上结合到双链上 其中其中单链同化有固定的方向单链同化有固定的方向 入侵单链为入侵单链为53 双链双链 DNA 的互补链是的互补链是35第八章DNA重组与转座第八章DNA重组与转座 RecBCD 和和 RecA 的共同作用的共同作用第八章DNA重组与转座 3、原核同源重组的其它蛋白、原核同源重组的其它蛋白 需要需要
12、 E.coli 中三个基因中三个基因 ruvA,ruvB 和和 ruvC 的产物的产物 a、RuvA 识别识别 Holliday 结构的连接点结构的连接点b、RuvB 为分枝迁移提供动力(为分枝迁移提供动力(ATPase 1020bp/s)c、RuvC 核酸内切酶核酸内切酶-专一性识别专一性识别 Holliday 结构的连接点结构的连接点 体外切段连接点以拆分重组体体外切段连接点以拆分重组体第八章DNA重组与转座 E.coli 重组的各阶段重组的各阶段 (损伤修复)(损伤修复)损伤损伤DNADNA复复制产生缺口制产生缺口RecARecA链交换链交换第二次链交换第二次链交换DNApolDNApo
13、l通过通过DNADNA合成填满缺口合成填满缺口RuvA,BRuvA,B分枝迁移分枝迁移RuvCRuvC切割切割HollidayHolliday连接点连接点第八章DNA重组与转座第二节第二节 位点专一性重组位点专一性重组第八章DNA重组与转座一、位点专一性重组(一、位点专一性重组(site-specific recombination)1、概念:发生在专一序列的、概念:发生在专一序列的DNA分子间的重组分子间的重组,有特异的有特异的 重组酶和辅助因子对其识别和作用。重组酶和辅助因子对其识别和作用。噬菌体基因组整合到细菌染色体基因组中属此种重组噬菌体基因组整合到细菌染色体基因组中属此种重组2、位点
14、特异性重组的结果依赖于重组位点的位置和方向位点特异性重组的结果依赖于重组位点的位置和方向第八章DNA重组与转座二、二、phagephage的整合与切除的整合与切除1、实现机制:、实现机制:均是通过均是通过-细菌细菌DNADNA和和DNADNA上特定位点之间的重组上特定位点之间的重组2、特定位点、特定位点-附着位点(附着位点(attachment site att)E.coli attB 含含BOB序列序列 23bp phage attP 含含 POP序列序列 240bp 核心序列核心序列“O区区”完全一致完全一致 (同源部分(同源部分15bp15bp)-位点特异性重组发生的地方位点特异性重组发
15、生的地方第八章DNA重组与转座3、整合过程、整合过程 整合后的附着位点为整合后的附着位点为 attL(BOP)attR(POB)整合位点整合位点-attB、attP 切除位点切除位点-attL、attR 整合过程需要整合过程需要整合酶整合酶 (integrase Int)()(编码编码)和和寄主的整合宿主因子寄主的整合宿主因子IHF (integration host factor)共同作用共同作用第八章DNA重组与转座溶源性细菌溶源性细菌(lysogen)溶菌周期溶菌周期(lysis)原噬菌体原噬菌体第八章DNA重组与转座第八章DNA重组与转座4、整合分子机制、整合分子机制 核心序列核心序列
16、O全长全长15bp,富含,富含A-T 发生在发生在O内的重组交换位点相距内的重组交换位点相距 7bp 整合酶的结合位点:整合酶的结合位点:attP 240bp、attB 23bp(两者的作用不同两者的作用不同)attP位点的负超螺旋为重组所必须位点的负超螺旋为重组所必须-加强了加强了Int和和IHF的亲和的亲和力力 -高剂量的蛋白维持单链重组所必需的结构高剂量的蛋白维持单链重组所必需的结构 Int结合结合 -核心序列的反向位点(切割位置)核心序列的反向位点(切割位置)-结合在结合在att臂上(臂与核心区靠近)臂上(臂与核心区靠近)第八章DNA重组与转座intIHFXis第八章DNA重组与转座
17、整合体及其作用整合体及其作用 整合体(整合体(intasome)-Int和和IHF结合到结合到attP时的复合物时的复合物 整合体捕获整合体捕获attB 说明说明-a、attB和和attP的的最初识别靠最初识别靠Int 识别两序列的能力识别两序列的能力 b、两序列的同源性两序列的同源性在链交换时为在链交换时为 重要因素重要因素第八章DNA重组与转座 Int蛋白能蛋白能切断切断DNA,并使它重新,并使它重新连接连接,近而使,近而使holliday结构结构拆分拆分 重组时重组时attP和和attB部位交叉断裂,互补单链末端进行交叉杂交部位交叉断裂,互补单链末端进行交叉杂交第八章DNA重组与转座5、
18、整合与切除的控制、整合与切除的控制(1)整合整合 C-促使阻遏蛋白促使阻遏蛋白C的产生的产生 -与与int gene 的的PI结合,转录产生结合,转录产生Int蛋白蛋白 -且且PI位于位于xis基因内,基因内,C与与PI结合导致结合导致xis gene失活失活(2)切除切除 寄主寄主SOS反应时反应时-RecA大量产生,促使阻遏蛋白大量产生,促使阻遏蛋白C的水解的水解 -把把OL和和OR从阻遏状态释放出来从阻遏状态释放出来 -从从PL转录使转录使int和和xis表达表达第八章DNA重组与转座细菌的特异位点重组鼠伤寒沙门氏杆菌鞭毛蛋白H1和H2转换第八章DNA重组与转座四、四、依赖于同源重组的位
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