第二章-目的基因连接及导入课件.ppt
- 【下载声明】
1. 本站全部试题类文档,若标题没写含答案,则无答案;标题注明含答案的文档,主观题也可能无答案。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
2. 本站全部PPT文档均不含视频和音频,PPT中出现的音频或视频标识(或文字)仅表示流程,实际无音频或视频文件。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
3. 本页资料《第二章-目的基因连接及导入课件.ppt》由用户(晟晟文业)主动上传,其收益全归该用户。163文库仅提供信息存储空间,仅对该用户上传内容的表现方式做保护处理,对上传内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(点击联系客服),我们立即给予删除!
4. 请根据预览情况,自愿下载本文。本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
5. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007及以上版本和PDF阅读器,压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 第二 目的 基因 连接 导入 课件
- 资源描述:
-
1、第五节 目的基因与载体连接基因工程之基因工程之二、二、目的基因与载体的连接(目的基因与载体的连接(接接)质粒质粒DNADNA分子分子一个一个切口切口两个两个黏性末端黏性末端两个两个切口切口获得目的基因获得目的基因DNA DNA 连接酶连接酶重组重组DNADNA分子(重组质粒)分子(重组质粒)同一种同一种 限制酶限制酶 (主要有以下(主要有以下4 4种连接方式)种连接方式)1)1)粘性末端连接粘性末端连接 2 2)平头末端连接平头末端连接 3 3)人工接头法人工接头法 4 4)同源多聚尾连接法同源多聚尾连接法工工具酶:具酶:基因工程中的工具酶主要包括基因工程中的工具酶主要包括用于用于DNADNA
2、和和RNARNA分分子子的切割的切割、连接连接、聚合聚合、逆、逆转录等转录等相关的各种酶类。相关的各种酶类。几种重要的工具酶几种重要的工具酶 活性活性 限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶 识别特异碱基序列,切割识别特异碱基序列,切割DNA DNA DNA DNA连接酶连接酶 催化催化DNA5DNA5-磷酸与磷酸与3 3-羟基羟基 形成磷酸二酯键形成磷酸二酯键 DNADNA聚合酶聚合酶 以以DNADNA为模板合成为模板合成DNA DNA 逆转录酶逆转录酶 以以RNARNA为模板合成为模板合成cDNA cDNA 碱性磷酸酶碱性磷酸酶 切除切除5 5 末端磷酸末端磷酸T4T4多聚核苷酸激酶多聚核苷酸激
3、酶 催化核酸催化核酸5-5-羟基磷酸化羟基磷酸化末端脱氧核苷酸转移酶末端脱氧核苷酸转移酶 催化催化3-3-端合成同聚尾端合成同聚尾 DNA连接酶 E.coli DNA 连接酶连接酶只能催化互补粘性只能催化互补粘性末端之间的连接末端之间的连接DNA 连接酶(DNA ligase)能催化双链DNA片段紧靠在一起的3-OH 末端与5-P末端之间形成磷酸二酯键,使末端连接。T4 DNA 连接酶连接酶催化互补粘性末端和催化互补粘性末端和平末端之间的连接,平末端之间的连接,但平末端之间连接的但平末端之间连接的效率比较低效率比较低。将目的基因和载体用同一种限制酶酶切,产生相同粘将目的基因和载体用同一种限制酶
4、酶切,产生相同粘性末端,再通过性末端,再通过DNADNA连接酶作用将两者连接起来,构成重组连接酶作用将两者连接起来,构成重组DNADNA分子。分子。用同一种或两种限制性内切酶酶切DNA连接酶重组质粒质粒目的基因本法适用于在质粒和目的基因上有相同单或双酶切位点(一)(一)粘性末端连接粘性末端连接有些限制酶只能将目的基因和载体有些限制酶只能将目的基因和载体DNADNA切割成平端,此切割成平端,此时在时在T T4 4DNADNA连接酶连接酶的作用下同样能连接起来。的作用下同样能连接起来。质粒产生平末端的内切酶DNA连接酶产生粘性末端的内切酶核酸酶S1目的基因重组质粒核酸酶S1 本法适用于在质粒和目的
5、基因上没有相没有相同同的酶切位点!(二)平头末端连接(二)平头末端连接(三)(三)人工接头法人工接头法 合成合成连接子连接子与与DNADNA平头末端连接平头末端连接限制酶切割限制酶切割,产生粘性末端产生粘性末端连接,构建重组连接,构建重组DNADNA。用接头连接 用同一种限制性内切酶酶切DNA连接酶重组质粒质粒目的基因+DNA连接酶接头(linker)本法适用于在质粒和目的基因上没有相没有相同同的酶切位点!(四)同源多聚尾连接法(四)同源多聚尾连接法尾接法 DNA连接酶重组质粒质粒目的基因内切酶末端转移酶+dGTP末端转移酶 +dCTP 本法适用于在质粒和目的基因上没有相没有相同同的酶切位点基
6、因与载体的平末端连接方法有哪些?基因与载体的平末端连接方法有哪些?(1)T4DNA连接酶法连接酶法 连接平末端连接平末端DNADNA分子的方法有分子的方法有2 2种,种,一种一种是直接用是直接用T T4 4DNADNA连接酶连接酶连接,连接,另一种另一种是先用末端核苷酸转移酶给是先用末端核苷酸转移酶给平末端平末端DNADNA分子加上同聚物尾巴之后再用分子加上同聚物尾巴之后再用DNADNA连接酶连接酶进行连接。进行连接。T T4 4DNADNA连接酶连接酶同一般的大肠杆菌同一般的大肠杆菌DNADNA连接连接酶不同。酶不同。T T4 4DNADNA连接酶连接酶除了能够封闭具有除了能够封闭具有3-O
7、H3-OH和和55-P-P末端的双链末端的双链DNADNA的缺口之外的缺口之外,在存在在存在ATPATP和加入高浓和加入高浓度酶的条件下度酶的条件下,它还能够连接具有完全配对碱基的平它还能够连接具有完全配对碱基的平末端末端DNADNA分子分子,但其连接效率比粘性端要低的多。但其连接效率比粘性端要低的多。(2)同聚物加尾法同聚物加尾法 55特意的核酸外切酶处理目的基因及质粒的平特意的核酸外切酶处理目的基因及质粒的平末端,移去几个末端核苷酸。末端,移去几个末端核苷酸。运用运用末端核苷酰转末端核苷酰转移酶移酶,能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前,能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到体)加到DN
8、ADNA分子单链延伸末端的分子单链延伸末端的3-OH3-OH基因基因上上,它并不需要模板链的存在它并不需要模板链的存在,它一个一个加上它一个一个加上核苷酸核苷酸,构成由核苷酸组成的尾巴构成由核苷酸组成的尾巴,长度可达长度可达10100 0个核苷酸。个核苷酸。在载体中加入在载体中加入dTTPdTTP和末端核苷酸转移和末端核苷酸转移酶,在载体酶,在载体33OHOH末端延伸形成单链末端延伸形成单链PolyTPolyT尾巴。尾巴。将两者混合发生互补连接,缺口用将两者混合发生互补连接,缺口用DNADNA连接酶封闭。连接酶封闭。3)用化学合成的衔接物连接)用化学合成的衔接物连接 DNA DNA分子用化学合
9、成法合成一段分子用化学合成法合成一段10101212个核苷个核苷酸,具有限制酶识别位点的寡核苷酸片段,磷酸酸,具有限制酶识别位点的寡核苷酸片段,磷酸化后,通过化后,通过T4DNAT4DNA连接酶,将片段分别于载体连接酶,将片段分别于载体55端和目的基因片段端和目的基因片段55连接起来。用相应的限制连接起来。用相应的限制性内切酶处理,产生互补的粘性末端。性内切酶处理,产生互补的粘性末端。4)T-A克隆法:克隆法:TagDNATagDNA聚合酶在扩增目的基因聚合酶在扩增目的基因DNADNA的同时,还能的同时,还能不依赖模版在产物不依赖模版在产物33末端加上两个游离的末端加上两个游离的A A。只。只
10、要载体切口除人工加上的游离要载体切口除人工加上的游离T T,PCRPCR产物即可于产物即可于载体连接。载体连接。T-A克隆克隆T-vector两条链的两条链的5端含有一个游离的端含有一个游离的TPCR过程中,普通的过程中,普通的Taq酶可在产物的酶可在产物的3端多加一个端多加一个A1.1.用一定的用一定的_切割切割 质粒,使其出现一个切质粒,使其出现一个切 口,露出口,露出_。2.2.用用_切断目切断目 的基因,使其产生的基因,使其产生_ _ _。3.3.将切下的目的基因片段插入质粒的将切下的目的基因片段插入质粒的_处,处,再加入适量再加入适量_,形成了一个重组,形成了一个重组 DNADNA分
11、子(重组质粒)分子(重组质粒)限制酶限制酶黏性末端黏性末端同一种限制酶同一种限制酶的黏性末端的黏性末端切口切口DNADNA连接酶连接酶相同相同质粒单酶切点的基因连接如何降低本底和质粒单酶切点的基因连接如何降低本底和防止自我环化和提高连接效率?防止自我环化和提高连接效率?目的基因片断与载体目的基因片断与载体由相同的单一限制性核酸内切酶由相同的单一限制性核酸内切酶(如(如EcoRI)消化酶切后)消化酶切后,两者的两端均具有相同的粘性末两者的两端均具有相同的粘性末端端,称为单酶切点的粘性末端称为单酶切点的粘性末端,又称全同源性粘性末端又称全同源性粘性末端 高背景高背景 载体经单一限制性核酸内切酶切割
12、后载体经单一限制性核酸内切酶切割后,载体分子易于自载体分子易于自我环化我环化,既不利于目的基因的重组连接既不利于目的基因的重组连接,大大降低阳性克大大降低阳性克隆效率隆效率,又可使非重组性载体造成高背景。又可使非重组性载体造成高背景。为了防止载体为了防止载体的自我环化,通常用碱性磷酸酶去除载体粘性末端的的自我环化,通常用碱性磷酸酶去除载体粘性末端的 5-P 5-P以抑制以抑制DNADNA的自我环化。的自我环化。在连接反应中在连接反应中,具有具有5-P5-P的的目的基因目的基因DNADNA片断可有效地与去磷酸化质粒片断可有效地与去磷酸化质粒DNADNA载体通过粘载体通过粘性末端发生互补连接性末端
13、发生互补连接,尽管产生的重组尽管产生的重组DNADNA分子于连接点含分子于连接点含有两个缺口的开环分子有两个缺口的开环分子,尽管在转化时其转化效率高于线性尽管在转化时其转化效率高于线性低于闭和环低于闭和环,但转化大肠杆菌后但转化大肠杆菌后,在菌体内其缺口可获得修在菌体内其缺口可获得修复。复。双向插入双向插入 经单一限制核酸内切酶(如经单一限制核酸内切酶(如EcoRIEcoRI)切割的目的基)切割的目的基因和载体因和载体,因二者的粘性末端是相同的因二者的粘性末端是相同的,因此在连接因此在连接反应中反应中,目的基因可发生双向插入目的基因可发生双向插入,载体对目的基因载体对目的基因表达是有方向的表达
14、是有方向的,而目的基因可双向与之相连而目的基因可双向与之相连,这种这种连接若以克隆目的基因片段为目的没有影响连接若以克隆目的基因片段为目的没有影响,若以表若以表达为目的达为目的,我们就要对插入的片段进行方向鉴定我们就要对插入的片段进行方向鉴定,因因目的基因由起始密码子向终止密码子方向表达是定向目的基因由起始密码子向终止密码子方向表达是定向转录的转录的,一旦启动子与目的基因编码顺序方向相反就一旦启动子与目的基因编码顺序方向相反就不能正确转录目的基因的不能正确转录目的基因的mRNAmRNA。若构建表达若构建表达DNADNA重组体重组体选用选用双酶切切割目的基因和载体双酶切切割目的基因和载体,可使目
15、的基因与载,可使目的基因与载体的连接发生定向连接重组体的连接发生定向连接重组,以便定向克隆。以便定向克隆。(YL)(YL)第六节 重组DNA导入受体细胞基因工程之基因工程之 在目的基因与载体连接成重组在目的基因与载体连接成重组DNADNA分子以分子以后,后,下面的重要工作主要是下面的重要工作主要是将其导入受体细将其导入受体细胞进行扩增和筛选,获得大量的重组胞进行扩增和筛选,获得大量的重组DNADNA分子,分子,这就是外源基因的无性繁殖,即克隆这就是外源基因的无性繁殖,即克隆(cloning)(cloning)。由于外源基因与载体构成的重组由于外源基因与载体构成的重组DNADNA分子性分子性质不
16、同、宿主细胞不同,将重组质不同、宿主细胞不同,将重组DNADNA导入宿主导入宿主细胞的具体方法也不相同。细胞的具体方法也不相同。转转重组重组DNADNA导入宿主细胞导入宿主细胞 受体细胞:受体细胞:也叫宿主细胞,是指在转化、转也叫宿主细胞,是指在转化、转导、杂交中接受外源基因的细胞。导、杂交中接受外源基因的细胞。分为分为原核受体细胞原核受体细胞(最主要是大肠杆菌最主要是大肠杆菌)、真真核受体细胞核受体细胞 (最主要是酵母菌最主要是酵母菌)、动物细胞和动物细胞和昆虫细胞昆虫细胞(其实也是真核受体细胞其实也是真核受体细胞)。具有接受外源具有接受外源DNADNA的能力;为限制性内切酶的能力;为限制性
17、内切酶缺陷型菌珠或为缺陷型菌珠或为DNADNA重组型菌珠重组型菌珠 ;在标记上和;在标记上和载体对应;有利于表达;不适宜在人体或非培载体对应;有利于表达;不适宜在人体或非培养条件下生存,有利于安全。养条件下生存,有利于安全。受体细胞条件受体细胞条件原核生物细胞是较为理想的受体细胞原核生物细胞是较为理想的受体细胞:没有细胞壁,便于外源没有细胞壁,便于外源DNA 的进入;的进入;没有核膜,染色体没有核膜,染色体DNA 没有固定结合的蛋没有固定结合的蛋白质,便于外源白质,便于外源DNA与染色体与染色体DNA 重组;重组;基因组小,遗传背景简单,便于外源基因基因组小,遗传背景简单,便于外源基因的遗传分
展开阅读全文