第10章-蛋白质的生物合成课件.ppt
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- 关 键 词:
- 10 蛋白质 生物 合成 课件
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1、 中心法则蛋白质翻译翻译?转录转录逆转录逆转录复制复制复制复制DNADNARNARNA第十章第十章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成翻译(translation):以mRNA为模板合成蛋白质的过程。原料:氨基酸涉及到细胞内所有种类的RNA和几十种蛋白质因子能量:ATP和GTP提供。场所:在核糖体第十章第十章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成第一节第一节 蛋白质的合成体系蛋白质的合成体系第二节第二节 蛋白质的生物合成过程蛋白质的生物合成过程第三节第三节 肽链合成后的折叠与修饰肽链合成后的折叠与修饰第四节第四节 蛋白质合成后的定向转运蛋白质合成后的定向转运第一节 蛋白质的合成体系n蛋白质的合成要求
2、100多种大分子物质参与和相互协作,这些大分子物质包括mRNA、许多tRNA、核糖体、多种活化酶和各种蛋白质因子。mRNA与遗传密码tRNA 核糖体 辅助因子 一、mRNA与遗传密码(一)(一)mRNA(messenger RNA)l携带携带DNADNA的遗传信息,作为模板通过翻译将遗传信的遗传信息,作为模板通过翻译将遗传信息传递给蛋白质,直接息传递给蛋白质,直接决定多肽链中决定多肽链中AAAA的顺序的顺序。lmRNAmRNA分子中四种不同碱基构成特定顺序决定蛋白质分子中四种不同碱基构成特定顺序决定蛋白质分子中分子中2020种种AAAA所构成的序列。所构成的序列。原核生物的多顺反子原核生物的多
3、顺反子真核生物的单顺反子真核生物的单顺反子非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPP5 3 蛋白质蛋白质PPPmG-5 3 蛋白质蛋白质mRNA的碱基序列是如何翻译成蛋白质的氨基酸序列?遗传密码:DNA(或其转录的mRNA)中的碱基序列和蛋白质序列之间的对应关系。(二)遗传密码(genetic code)DNA:ATGCATGCATGCRNA:TUCGUACGUACG PROTEIN:aa1 aa2 aa3 aa4n 1954年物理学家G.Gamov首先对遗传密码进行探讨。4种核苷酸 构成序列(mRNA)20种基本aa构成
4、序列(蛋白质)?一对一的对应关系,42=16,43=64,足够n 1961年Francis Crick及其同事的遗传实验进一步肯定mRNA上相邻三个碱基编码一个氨基酸,此三联体碱基称为密码子(codon)。l遗传密码的发现遗传密码的发现19611961年,年,M.NirenbergM.Nirenberg等人提出。等人提出。4 43 3=64=64大肠杆菌中,以多聚大肠杆菌中,以多聚U U做为做为mRNAmRNA,即,即polyU+20polyU+20种放种放射性同位素标记的氨基酸,大肠杆菌合成体系射性同位素标记的氨基酸,大肠杆菌合成体系,在外,在外界环境合适下,合成了一条多聚苯丙氨酸(界环境合
5、适下,合成了一条多聚苯丙氨酸(phephe)肽)肽链。链。UUUUUU为为phephe的三联体密码。的三联体密码。确立了确立了polyApolyA为为LysLys,polyCpolyC为为ProPro等。等。发现具有密码子功能的最短链为三个核苷酸,并且发现具有密码子功能的最短链为三个核苷酸,并且含含3 3 -OH-OH和和5 5 -磷酸基的三核苷酸最有效。磷酸基的三核苷酸最有效。阅读方向为阅读方向为5 5-3-3 。至。至19661966年,年,2020中氨基酸对应的中氨基酸对应的6161个密码子和三个终止密码子全部破译。全部被查清。个密码子和三个终止密码子全部破译。全部被查清。遗遗 传传 密
6、密 码码阅读方向为阅读方向为5-35-32、遗传密码的特点密码子的方向性密码子的方向性 密码子密码子的阅读方向及它们在的阅读方向及它们在mRNAmRNA由起始信号由起始信号到终止信号的排列方向均为到终止信号的排列方向均为5 5-3-3,与,与mRNAmRNA链链合成时延伸方向相同。合成时延伸方向相同。n从正确起点开始至终止信号,密码子的排列从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间隔(无标点),也无是连续的。既不存在间隔(无标点),也无重叠。在重叠。在mRNAmRNA分子上插入或删去一个碱基,分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为会使该点以后的读码发生错误,
7、称为移码移码,由这种情况引起的突变称为由这种情况引起的突变称为移码突变移码突变。(RNARNA的编辑)的编辑)()()密码子的读码连续性密码子的读码连续性(无标点,不重叠)(无标点,不重叠)A B C D E F G H I J K Laa1 aa2 aa3 aa4密码子的简并性:指大多数氨基酸都是由几个不同的密码子编码的现象如UCU,UCC,UCA,UCG,AGU及AGC 6个密码子都编码丝氨酸。同义密码子(synonymous codon):编码相同氨基酸的密码子。只有Met(AUG)和Trp(UGG)仅有一个密码子。(3 3)密码子密码子简并性简并性(degeneracy)一是可以减少有
8、害的突变。假如每种氨基酸只有一个密码子,那么剩下的44个密码子都成了终止密码子,一旦某氨基酸的密码子发生单碱基的点突变,则很可能造成肽链合成的过早终止。二是既使DNA上碱基组成有变化,仍可保持由此DNA编码的多肽链上氨基酸序列不变。如GCN编码 A l a,由 于 简 并 性 的 存 在,不 论 第 三 位 的N(A/G/C/U)变成什么,都仍然编码Ala简并性的生物学意义?如丙氨酸:如丙氨酸:GCUGCU,GCCGCC,GCAGCA,GCGGCG,只第三位不同,只第三位不同 ,显,显然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基有较大灵活性。基
9、有较大灵活性。发现发现tRNAtRNA上的反密码子与上的反密码子与mRNAmRNA上的上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动性或变偶性密码的摆动性或变偶性(wobblewobble)。I IA A、U U、C C配对配对。(4 4)密码子的变偶性(摆动性)密码子的变偶性(摆动性)密码子阅读时的摆动性密码子阅读时的摆动性反密码子反密码子第一位碱基第一位碱基密码子密码子第三位碱基第三位碱基AUCGGUCUAGIUCA(5)(5)起始密码子和
10、终止密码子起始密码子和终止密码子 n64个密码子中,有1个密码子AUG既是甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子(initiation codon)。n另外3个密码子UAG,UAA,UGA不编码任何氨基酸,而是多肽合成的终止密码子(termination codon)。u密码子在高等、低等生物中基本是完全通用的。u但有例外情况,如哺乳动物的线粒体中,UGA不再是终止密码子,而编码色氨酸;AGA、AGG为终止密码,而不编码精氨酸。支原体中UGA不作终止密码,而是编码色氨酸。原生动物鞭毛虫把终止密码子UAA和UAG 读成谷氨酰胺(6 6)密码子的基本通用性)密码子的基本通用性 二、二、tRNA
11、tRNA (t transfer RNAransfer RNA)n在蛋白质合成中,氨基酸本身不能识别mRNA上的密码子,它需要由特异的tRNA分子携带到核糖体上并由tRNA上的反密码子去识别在mRNA上的密码子。n位于tRNA的反密码子环上,由3个特定的碱基组成,称为反密码子(anticodon)tRNA是多肽链和mRNA之间的接合器。tRNA的几个关键部位一个是氨基酸结合部位:33端端CCACCAOHOH另一个是与mRNA的结合部位:反密码子部位反密码子部位35ICCA-OH53CCA-AAG G CC C G密码子与反密码子的密码子与反密码子的阅读方向均为阅读方向均为55 3 3,两者反向
12、平行配对。两者反向平行配对。n识别识别氨酰氨酰tRNAtRNA合成酶合成酶的位点的位点n核糖体识别位点核糖体识别位点在蛋白质合成过程中在蛋白质合成过程中,根据功能将分成三类根据功能将分成三类:起始起始tRNAtRNA 延伸延伸tRNAtRNA 校正校正tRNAtRNAntRNAtRNA分子的突变与校正基因(分子的突变与校正基因(RNARNA再编辑再编辑)GAG(Gln)UAGH3NGlnCOO-有活力有活力H3NCOO-无活力无活力基因突变基因突变H3NTyrCOO-有活力有活力3AUGTyr U A CAUCtRNAtRNA突变突变n氨基酸羧基与tRNA3末端腺苷的核糖3-OH连接,形成氨酰
13、氨酰-tRNA-tRNA(由特异的氨酰-tRNA合成酶催化)。同功受体同功受体tRNAtRNA(isoaccepting tRNA):携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA(大多数氨基酸都有几种tRNA运载)在书写时,将所运氨基酸写在tRNA的右上角,如tRNAAla及tRNAcys分别表示转运Ala和cys的tRNA 一种氨酰-tRNA合成酶可以识别一组同功受体tRNA。3末端的氨基酸结合部位是蛋白质合成的场所。标记各种aa,注入大鼠体内,在不同时间取出肝脏,匀浆,离心分离各种亚细胞器,分析放射性蛋白的分布,证实蛋白质的合成是在核糖体上进行的。n真核生物:游离核糖体或与内质网结合真核生物
14、:游离核糖体或与内质网结合n原核生物:游离核糖体或与原核生物:游离核糖体或与mRNAmRNA结合成串状的结合成串状的多核多核糖体糖体(提高翻译效率提高翻译效率)。三、核糖体 核糖体是由核糖核酸(核糖体是由核糖核酸(rRNArRNA)和几十种蛋白质分子)和几十种蛋白质分子(核糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。(核糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。每个核糖体是由大小两个亚基组成,每个亚基都有每个核糖体是由大小两个亚基组成,每个亚基都有自己不同的自己不同的rRNArRNA和蛋白质分子和蛋白质分子1、核糖体的组成来源来源 核糖体核糖体亚基亚基rRNA蛋白质分子蛋白质分子数目数目原核细胞原核细胞70S5
15、0S5S,23S3430S16S21真核细胞真核细胞80S60S5S,28S5040S18S30 大肠杆菌中大肠杆菌中30S30S的亚基能单独与的亚基能单独与mRNAmRNA结合成结合成30S30S核糖体核糖体-mRNA-mRNA复复合体,后者与合体,后者与tRNAtRNA可以专一性可以专一性结合结合(起始起始AAAA进入进入)。50S50S亚基不亚基不能单独与能单独与 mRNAmRNA结合,但可以非结合,但可以非专一地与专一地与tRNAtRNA结合。结合。核糖体核糖体上上有两个有两个tRNAtRNA结合位点(主要占结合位点(主要占据大亚基):据大亚基):氨酰基位点氨酰基位点-A-A;肽酰基位
16、点肽酰基位点-P-P。还有一个还有一个GTPGTP结结合位点。合位点。PA2.E.Coli2.E.Coli核糖体存在两个重要的核糖体存在两个重要的tRNAtRNA的结合部位的结合部位P P位和位和A A位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离。位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离。P P:结合起始的氨酰:结合起始的氨酰-tRNAtRNA和肽基和肽基-tRNAtRNA,A A:结合新掺入的氨酰:结合新掺入的氨酰-tRNAtRNA。PA53四、辅助因子 n蛋白质的合成除了需要mRNA、tRNA、核糖体外,在起始、延伸和终止阶段还需要一系列蛋白辅助因子即起始因子起始因子(initiation fac
17、tor)、延伸因子延伸因子(elongation factor)释放因子释放因子(release factor)等的参与。蛋白质生物合成所需的辅助因子生物 种类辅助因子功 能原原核核生生物物起始因子起始因子IF-1IF-2IF-3延伸因子延伸因子EF-TuEF-TsEF-G释放因子释放因子RF-1RF-2RF-3促进促进IF-2和和IF-3的活性的活性促使起始促使起始tRNA与与30S小亚基结合,需小亚基结合,需GTP促进核糖体解离成亚基;促使促进核糖体解离成亚基;促使30S小亚基与小亚基与mRNA起始部位结合起始部位结合促使氨酰促使氨酰-tRNA进入进入A位与位与mRNA结合结合促进促进EF
18、-TuGDP再生为再生为EF-TuGTP水解水解GTP,使核糖体按,使核糖体按5 3 方向沿方向沿mRNA移动一个密码子的距离移动一个密码子的距离识别终止密码子识别终止密码子UAA,UAG识别终止密码子识别终止密码子UAA,UGA促进促进RF-1,RF-2的活性的活性真真核核生生物物起始因子起始因子包括eIF-1,eIF-2,eIF-3,eIF-4等至少9种延伸因子延伸因子EF-1EF-2释放因子释放因子RF参与真核细胞蛋白质合成起始复合物的组装参与真核细胞蛋白质合成起始复合物的组装相当于相当于EF-Tu和和EF-Ts的功能的功能相当于相当于EF-G的功能的功能识别终止密码子识别终止密码子UA
19、A,UAG,UGA第第二二节节 蛋白质的生物蛋白质的生物 合成过程合成过程 u原核生物蛋白质的生物合成过程原核生物蛋白质的生物合成过程u真核生物蛋白质的生物合成特点真核生物蛋白质的生物合成特点u蛋白质合成的抑制剂蛋白质合成的抑制剂u氨基酸的活化氨基酸的活化u多肽链合成的起始多肽链合成的起始u多肽链的延伸多肽链的延伸 u多肽链合成的终止与释放多肽链合成的终止与释放 一、原核生物蛋白质的一、原核生物蛋白质的 生物合成过程生物合成过程(大肠杆菌)(大肠杆菌)游离氨基酸掺入多肽链以前必须活化即氨基酸与特异tRNA形成氨酰-tRNA,在在胞液中胞液中进行进行。氨基酸的活化由氨酰tRNA合成酶催化。每一种
20、氨酰tRNA合成酶既能识别自己的配体氨基酸,又能识别对应的tRNA。1、氨基酸的活化第一步反应第一步反应氨基酸氨基酸 ATP-E 氨基酰氨基酰-AMP-E AMP PPi第二步反应第二步反应氨基酰氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰氨基酰-tRNA AMP E攻击位点攻击位点2 2-OH-OH连接连接AAAA,影响下一步影响下一步肽键形成肽键形成v氨基酸活化的总反应式是:氨基酸活化的总反应式是:氨基酸氨基酸+ATP+tRNA+ATP+tRNA+H+H2 2O O 氨酰氨酰-tRNA+AMP+PPi-tRNA+AMP+PPiv2020种氨基酸中每一种都有各自特异的氨酰种氨基酸中每一种都有各自特异
21、的氨酰-tRNA-tRNA合成合成酶。酶。氨酰氨酰-tRNA-tRNA合成酶合成酶具有高度的专一性具有高度的专一性,它既能识它既能识别相应的氨基酸(别相应的氨基酸(L-L-构型),又能识别与此氨基酸构型),又能识别与此氨基酸相对应的一个或多个相对应的一个或多个tRNAtRNA 分子;即使分子;即使AAAA识别出现错识别出现错误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。这种高这种高度的专一性保证了氨基酸与其特定的度的专一性保证了氨基酸与其特定的tRNA准确匹配,准确匹配,从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。氨酰氨酰-tRNA-t
22、RNA 合成酶合成酶氨酰氨酰-tRNA-tRNA合成酶和之相对应的合成酶和之相对应的tRNAtRNA分子被称为遗传密码第二分子被称为遗传密码第二tRNAtRNA与多肽合成的有关位点与多肽合成的有关位点n3 3 端端-CCACCA上上AAAA接受位点接受位点n识别氨酰识别氨酰-tRNA-tRNA合成酶位点合成酶位点n核糖体识别位点核糖体识别位点n反密码子位点(识别反密码子位点(识别mRNAmRNA上的密码子)上的密码子)2 2、肽链合成的起始、肽链合成的起始n起始密码子的识别:起始密码子的识别:(30S30S复合物形成)复合物形成)起始起始AUGAUG一般位于距一般位于距5 5 端端2525个核
23、苷酸以后,并在其上个核苷酸以后,并在其上游(游(5 5 端)约端)约1010个核苷酸处有一段富含嘌呤的序列个核苷酸处有一段富含嘌呤的序列(SDSD序列序列),原核生物核糖体),原核生物核糖体30S30S小亚基上的小亚基上的16SrRNA316SrRNA3端富含嘧啶的序列能与之互补配对,这样端富含嘧啶的序列能与之互补配对,这样30S30S亚基能与亚基能与mRNAmRNA结合结合(IF3(IF3参加,识别起始密码子参加,识别起始密码子AUG,AUG,使上次循环中使上次循环中的大小亚基分离),的大小亚基分离),在在IF1IF1IFIF参与下,参与下,30S-mRNA-30S-mRNA-IF3IF3进
24、一步与进一步与fMet-tRNAfMet-tRNAi i、GTPGTP结合,形成结合,形成30S30S复合物:复合物:30S-mRNA-fMet-tRNA30S-mRNA-fMet-tRNAi i(tRNA(tRNAi ifMetfMet)53 AUGAUGAUGl 现在已经知道作为多肽合成起始信号的密码子现在已经知道作为多肽合成起始信号的密码子有两个,即甲硫氨酸的密码子有两个,即甲硫氨酸的密码子(AUG)(AUG)和缬氨酸和缬氨酸的密码子的密码子(GUG)(GUG)(极少出现极少出现)。在大肠杆菌中在大肠杆菌中,起始密码子起始密码子AUG AUG 所编码的氨基酸并不是甲硫氨所编码的氨基酸并不
25、是甲硫氨酸本身酸本身,而是甲酰甲硫氨酸。而是甲酰甲硫氨酸。fMet-tRNAfMet-tRNAi i的形成的形成Met-tRNAi+N10-甲酰FH4 fMet-tRNAi+FH4甲酰化酶真核生物:Met-tRNAMet。真核生物无甲基化过程,起始真核生物无甲基化过程,起始氨基酸是氨基酸是Met,Met,起始起始tRNAtRNA为为Met-tRNAMet-tRNAi i(tRNA(tRNAi i MetMet)肽链中间的肽链中间的MetMet携带者是携带者是tRNAmtRNAm tRNA tRNAMetMet 延长因子识别延长因子识别起始因子识别起始因子识别n原核生物核糖体30S小亚基上的16
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