基因突变-DNA损伤与修复课件.ppt
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- 基因突变 DNA 损伤 修复 课件
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1、10.0.基因突变的定义基因突变的定义1.1.基因突变及其分子效应基因突变及其分子效应2.2.人工诱发的基因突变人工诱发的基因突变3.3.自发的基因突变自发的基因突变3.3.动态突变动态突变5.DNA5.DNA损伤生物体的修复机制损伤生物体的修复机制6.6.基因突变的检出基因突变的检出第八章第八章 基因突变与基因突变与DNA损伤修复损伤修复2v 突变(突变(mutation):):生物体遗传物质的核苷生物体遗传物质的核苷酸序列发生了稳定而可遗传的变化。酸序列发生了稳定而可遗传的变化。v 广义的突变包括广义的突变包括基因突变基因突变和和染色体畸变染色体畸变。v 狭义的突变就是指基因突变狭义的突变
2、就是指基因突变。v 基因突变是指基因内部由于一对或少数几对碱基的基因突变是指基因内部由于一对或少数几对碱基的置换、缺失或插入而引起的突变,其涉及的变化范围置换、缺失或插入而引起的突变,其涉及的变化范围很小,又称为点突变很小,又称为点突变。v 染色体畸变是指大段染色体的缺失、重复、易位和染色体畸变是指大段染色体的缺失、重复、易位和倒位,即较大范围内遗传物质的改变倒位,即较大范围内遗传物质的改变。Genetic mutation0 基因突变基因突变3镰状细胞贫血病(镰状细胞贫血病(sickle cell disease)4561.基因突变及其分子效应基因突变及其分子效应1.1 1.1 基因基因突变
3、的类型突变的类型1.2 1.2 基因基因突变的分子效应突变的分子效应1.3 1.3 可逆突变的遗传效应可逆突变的遗传效应7碱基替换(base substitution)移码(框)突变(base frame-shift mutation)转换转换(transition):嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶(AG,C T)。颠换颠换(transversion):嘌呤嘧啶,嘧啶嘌呤(A T,C G)。1.1 基因突变的类型基因突变的类型l 按突变的方式划分按突变的方式划分碱基的增加或删除(base addition/deletion)自发的基因突变人工诱发的基因突变 按来源划分按来源划分8由密码的简并性(code d
4、egeneracy)造成,一种密码子发生了突变,但编码的氨基酸不变。如 GAGAU U(天冬氨酸)GAGAC C (天冬氨酸),结果:编码的蛋白质结构和功能不发生改变 1.2 基因突变的分子效应基因突变的分子效应 编码区基因突变的分子效应编码区基因突变的分子效应同义突变 (same sense mutation)910有义密码子突变为终止密码子如 UUGUUG(亮氨酸)UAGUAG,UAA,UGAUAA,UGA 突变的结果:蛋白质合成提前终止 编码蛋白质的结构核功能发生改变无义突变(nonsense mutation)11 DNA 分子中插入或缺失一个或几个碱基,使密码组(读框)发生改变的现象
5、叫移码突变;突变的结果:编码蛋白质的结构和功能发生改变。移码突变移码突变(shift):12遗传密码编码氨基酸时发生差错,使原来编码的氨基酸变为另一种氨基酸,也叫密码错编(miscoding)。结果:编码蛋白质的结构核功能发生改变错义突变错义突变(missense mutation):13 启动子:多聚酶及相关因子结合位点;转录因子结合位点。内含子:内含子外显子交界区的 3与 5 端拼接位点;3与 5 端非转录区:蛋白质翻译调节和定位信号位点;核糖体结合位点。非编码区基因突变的分子效应非编码区基因突变的分子效应 以上属于调节位点。调节位点如果发生点突变,将会改变基因在特定时间,特定组织或特定环
6、境下的表达量.如RNA聚合酶,或剪接因子接合位点发生突变,将会完全阻遏正常基因的转录与翻译,或使基因产物失活.14151.3 可逆转突变及其分子效应可逆转突变及其分子效应可逆转突变也叫“回复突变”,即野生型变为突变型后,突变型再突变回到野生型.Aa,a A,或 A+A;a+a.一般把第一次突变个体失去的性状,通过第二次突变得到恢复的现象叫回复突变16回复到野生型原来的 DNA 序列,如 ATG ACG ATG.原位回复属于真正意义上的回复突变,但很少发生。原位回复突变最终只产生一种基因型和一种表型回复突变的类型及其分子机制回复突变的类型及其分子机制1)原位回复突变(in situ revers
7、ion)17m+(野生型)正向突变m-(突变型)原位回复突变m+m-(野生型)(野生型)m+(全部野生型后代)(突变型),没有保留下来18 野生型 第一点突变 A T AA C G A G AA C G 突变型 2)抑制回复抑制回复突变突变(suppressor reverse mutation):第二点突变 抑制第一点突变,产生与原野生型相同或相近的表型。A G AA G G第一次突变发生后,其表型被另外一位点的突变所抑制,结果是野生型表型得以全部或部分恢复。第二点突变野生型19m+su+正向突变su+m-(突变型)第二点突变(抑制突变)m-su-(野生型)su+(野生型)m+m+su+m-
8、su-m+su-m-su+(野生型)(野生型)(野生型)(突变型)亲组型重组型杂交抑制回复突变最终产生四种基因型20基因间抑制回复抑制回复抑制回复突变突变可划为可划为:基因内抑制回复基因内错义抑制回复突变基因内移码抑制回复突变无义抑制突变错义抑制突变移码抑制突变21基因内基因内错义错义抑制回复突变抑制回复突变 CA CA U UC A GC A G(第第1818密码子密码子)(第第6464密码子密码子)mRNAmRNA蛋白质蛋白质第第1818氨基酸氨基酸第第6464氨基酸氨基酸18 18+64 64 野生型野生型(示空间结构示空间结构)正常情况下 CA G18 64 导致空间构型改变,活性丧失
9、22 基因间抑制回复突变基因间抑制回复突变抑制突变(第二点突变)发生在其它基因之中,而不是已发生突变的基因之内。包括:无义抑制突变(nonsense suppressor mutation)错义抑制突变(missense suppressor mutation)移码抑制突变(frameshift suppressor mutation)23无义抑制突变无义抑制突变(nonsense suppressor mutation)“无义抑制tRNA”抑制“无义突变”如噬菌体基因组编码某一个氨基酸的密码子突变为无义密码子的,结果使蛋白质合成(翻译)提前终止;宿主菌基因组编码 tRNA的基因(tDNA)发
10、生突变,导致反密码子碱基改变,发生突变的 tRNA与噬菌体基因中的无义密码子结合,使蛋白质合成继续进行。这种抑制突变回复发生在噬菌体基因与宿主菌基因之间.24mRNAmRNA 5 53 3U A GU A GA U CA U C氨基酸臂氨基酸臂携带某种携带某种氨基酸氨基酸5 53 3无义抑制无义抑制tRNAtRNA终止(无义)密码子25 Tyr-Tyr-tRNAtRNA 突变突变 tyr-tRNAtyr-tRNA G GUA UA C CU UU U UA UAU U UA UAG G (酪氨酸)(酪氨酸)琥珀无义密码子琥珀无义密码子mRNAU or C GA U蛋白质合成恢复蛋白质合成恢复宿
11、主菌宿主菌噬菌体噬菌体第一点突变第一点突变第二点突变第二点突变无义抑制 tRNA26UAGUAAUGAUXX有义密码子琥珀型突变amber(amb)赭石型突变ochre(och)乳白型突变opal(op)27因为有3 种无义密码子 产生 3 种无义突变所以有3种无义抑制突变无义抑制突变(基因)基因)琥珀无义抑制基因(su+amb)。赭石无义抑制基因(su+och)乳白无义抑制基因(su+op)283 种无义抑制突变无义抑制突变(基因)基因)3 3 种种无义抑制 tRNA琥珀无义抑制 tRNA 抑制琥珀无义突变赭石无义抑制 tRNA 抑制赭石无义突变乳白无义抑制 tRNA 抑制乳白无义突变293
12、0赭石抑制基因能抑制琥珀突变,但琥珀抑制基因不能抑制赭石突变之原因根据摆动假说,G-U可配对,所以赭石抑制基因可抑制琥珀突变.A-C不能配对,所以琥珀抑制基因不能抑制赭石突变(Oc)。OcOcAmAm31l通过无义抑制突变无义抑制突变插入的氨基酸,如果与无义突变前的氨基酸相同 合成的多肽完全与野生型的相同,有完全的功能;l插入的氨基酸为可接受氨基酸 合成的多肽有部分野生型活性;l插入的氨基酸为非可接受氨基酸合成的多肽则可能完全无活性。无义抑制的特征无义抑制的特征32l正常密码子无义密码子后,并不是所有无义密码子都可与无义抑制 tRNA 结合,使肽链延伸恢复.其中只有一部分结合.所以在细胞内,有
13、的肽链得以延伸,有的肽链提前终止,其结果是蛋白质的总浓度低于野生型。33l某无义抑制tRNA与某无义密码子的结合,并不影响它与应该结合的有义密码子结合.原因:1)密码子有简并现象;2)细胞内每种tRNA有许多拷贝.34l无义抑制tRNA 存在时,蛋白质合成释放因子(RF)与无义抑制tRNA 可竞争性地与终止密码子结合,如果RF处于优势,RF与终止密码子结合,使蛋白质合成正常终止.释放因子有 RF1、RF2、RF3.l RF1 识别 终止密码 UAA 和 UAG;l RF2 识别 终止密码 UGA 和 UAA;l RF3 激活 RF1和 RF2 的活性35l mRNA内有时存在双重终止密码子,如
14、UAG(琥珀)UAA(赭石),如果两终止密码子相距不远,蛋白质合成即使不在UAG处终止,必然在UAA处终止。l 各抑制tRNA抑制效率不同。琥珀抑制tRNA的抑制效率约为50%;赭石抑制tRNA的抑制效率很低,只有1-5%;二者双重抑制效率为 0.5-2.5%(1%50%5%50%).36第一突变第二突变删除或添加1-2个碱基添加或删除1-2个碱基 基因内移码突变抑制突变回复基因内移码突变抑制突变回复基因内一个位点删除(或添加)1-2个碱基,在另一个位点添加(或删除)同样数目碱基),结果是整个读框保持不变,同时也是突变体的性状恢复到野生型.37l功能获得型突变(gain of function
15、 mutation)l 突变使生物获得某种新功能.获得的功能有可能是显性突变(因为在杂合体中表达).1.4 1.4 突变对多细胞生物的影响突变对多细胞生物的影响新产物新产物显性突变38 基因的关键功能区被删除或改变,结果使某一功能丧失。按功能丧失程度大小分为:无效突变(nullmutation):突变使某一基因的功能完全丧失.渗漏突变(leaky mutation):突变使某一基因的功能部分丧失,l 功能丧失型突变(loss of function mutation):3940 (Morphological mutation)菌落形态、噬菌斑形态、孢子颜色、残翅、白眼、矮茎、侏儒等。表型突变也
16、叫可见突变(visible mutation)致死突变(lethal mutation)如致死突变型(lethal mutant),导致个体死亡.如小鼠的 AyAy 胚胎致死、植物的白化、人的镰刀型贫血等,致死突变型包括全致死、半致死、条件致死突变。41422.人工人工诱发的基因突变诱发的基因突变使用物理或化学方法诱导产生的突变叫诱发诱发突变(induced mutation).可诱发基因突变的物质叫诱变剂(mutagen),诱变剂通常有致癌作用,所以也叫致癌剂(carcinogen)。431 1)碱基类似物)碱基类似物-诱发碱基转换诱发碱基转换5 5 -溴尿嘧啶溴尿嘧啶(5-BU)(5-BU
17、)BU 代替胸腺嘧啶(T)掺入DNA,产生 ATGC 转换。BU 代替胞嘧啶(C)掺入DNA,产生 GCAT 转换2-AP 和 T 配对后,又和 C 配对,产生 ATGC 转换;2-AP 和 C 配对后,又和 T 配对,产生 GCAT转换。二氨基嘌呤二氨基嘌呤(2-AP(2-AP)l 诱变剂的类型及其诱变机制诱变剂的类型及其诱变机制4444碱基配对碱基配对Base pairing45455BU 碱基碱基T的类似物的类似物碱基类似物碱基类似物Base analog462)烷化剂烷化剂-诱发特异性错配诱发特异性错配烷化剂的种类烷化剂的种类甲基磺酸乙酯(EMS)亚硝基胍(NG)芥子气等471 1)烷
18、化剂诱发嘌呤碱基脱落,产生缺口)烷化剂诱发嘌呤碱基脱落,产生缺口 烷化剂化剂在鸟嘌呤的 N 位活化-糖甙键,引起-糖甙键断裂,使嘌呤碱基从 DNA 链上脱落下来,产生缺口,复制时任何碱基配对到缺口位置,这样可引起转化或颠换烷化剂的作用机制烷化剂的作用机制48如甲基磺酸乙酯(EMS)可使鸟嘌呤(G)的 N 位乙基化,使鸟嘌呤成为 7-乙基鸟嘌呤(m G),使之不能和胞嘧啶(C)配对,而和胸腺嘧啶(T)配对,产生GC TA 转换.GCmGCGCmGTTAmGT2)烷化剂使碱基烷基化烷化剂使碱基烷基化,引起特异性错配引起特异性错配修复后不修复G:C C:G49嵌合剂种类:嵌合剂种类:吖啶橙(acri
19、dine organge),荧光染色剂,可使DNA特异染色。原黄素(proflavine)黄素(acrilavine)等3)嵌合剂的诱变作用嵌合剂的诱变作用50嵌合剂分子含吖啶环,分子大小与碱基大小相近,吖啶环可嵌入到 DNA 双链中心,堆积在碱基对之间,在嵌入点引起单个碱基对插入 或 缺失,最终引起移码突变。嵌合剂作用机理嵌合剂作用机理51524)辐射辐射源紫外线(ultraviolet light,UV):电离辐射-射线(同位素)太空射线(卫星搭载)x-射线(同位素)重离子(重离子加速器重离子)53 紫外线紫外线(ultraviolet light,UV):诱发相邻的两个嘧啶碱基形成二聚体
20、光生成物 如胸腺嘧啶二聚体(T T),胸腺嘧啶二聚体可在同一单链,或两条单链上相邻的两个嘧啶碱之间形成。紫外线还可引起缺失,重复和移码突变.5455突变频率与X-射线剂量的关系56 电离辐射电离辐射X-射线,-射线等,因能量高,能引起被照射物质中原子的电离(形成离子),故称电离辐射.电离辐射可造成染色体“断裂”和“重新连接”,引起染色体结构畸变.通常用于农作物诱变育种的诱变源575)黄曲霉黄曲霉 B B1 1黄曲霉素B1(aflatoxin B1,AFB1)可以在鸟嘌呤 N-7位置诱导脱嘌呤作用,继而以腺嘌呤代之,产生GCAT的转换,是很强的致癌剂。586)6)定点诱变定点诱变定点诱变也称为离
21、体定点突变或诱变(site-specific in vitro mutation)。是利用人工合成寡聚核苷酸技术,在离体条件下使 DNA分子任何位点的碱基发生转换或颠换的技术.定点突变在蛋白质工程,基因表达和表达调控机制的研究方面就有重要的意义。59定点诱变的基本步骤定点诱变的基本步骤1 采用化学合成法,首先人工合成一条包括靶(目标)碱基及其附近序列的寡聚核苷酸(引物),该引物除了目标碱基被替换外,其余序列与野生型DNA分子的相应序列应完全相同。5 AAT TCC 5 AAT TCC GGCGGC CTT AAG GAT.ATT CCG GGC GCG.GGC 3 CTT AAG GAT.AT
22、T CCG GGC GCG.GGC 355-AAT TCC AAT TCC G GT TC C CTT AAG-3 CTT AAG-3602.将合成好的引物与携带目标基因全序列的单链噬菌体 M13 的 DNA分子混合,使引物与 M13 DNA分子上的目标基因配对,并在在 DNA 聚合酶作用下合成完整的互补链。3.将合成好的双链环状 DNA分子导入大肠杆菌,在大肠杆菌内复制,即可得到稳定遗传的突变的 DNA分子克隆,最终使大肠杆菌某些位表型发生变化(突变体)。613.通过等位基因替换(或其他)方法,将突变基因送回细胞内原来的基因组中,在生理条件下检测和研究突变效应,即可了解该点突变的动能。62如
23、诱发如诱发IFN-IFN-基因第基因第1717位碱基突变位碱基突变半胱氨酸Cys 丝氨酸Ser63643.自发的基因突变自然环境中的物理、化学、生物因素偶然诱导基因产生的突变叫自发的基因突变。65l多方向性多方向性 (multidirection):即一个基因可以突变为两个以上数目的等位基因(复等位基因),即 A a1,a2,a3 等,复等位基因的存在,也说明了突变的多方向性.3.1 基因自发突变的基本特征基因自发突变的基本特征66l 独立性(independency)一个基因突变与另一个基因突变无关,互不影响。如 Strs strr;pens penr 的频率都是107,strs pens
24、strr penr 双突变的频率是 107107=1014。67l可逆性(reversibility):Aa,aA,或 A+A;a+a.回复突变(back or reverse mutation).l有害/利性(detrimental and beneficial):如残翅果蝇对生存不利(飞行困难),但在多风的海岛上,则对残翅有利(风助其飞行)。68l随机性随机性(randomness)l 即不定向性,基因突变的方向与生物体所处的环境没有对应关系,突变可发生在任何时期、任何个体、任何基因位点上。l重演性重演性(reappearance)l 1791年在美国一个牧场发现一只 安康羊(腿短,跳不出
25、羊圈),20 世纪40年代在挪威又发现一只。后来证实是生殖细胞中一个显性基因的一个碱基对的变化所致。69l 稀有性稀有性(rarity)高等生物自发突变率=1 10-5 1 10-10细菌自发突变率=1 10-4 1 10-10突变率指在一个世代或其他规定的条件和时间内,发生某一突变的细胞占细胞总数的比率。.有性生殖中,突变率=发生某一突变的配子数 占所观察配子总数的百分数。细菌中,突变率用一定数目的细菌,在一次分裂过程中发生突变的次数表示.70体细胞突变体细胞突变生物个体营养组织细胞(如植物的跟、茎、叶)发生的基因突变叫体细胞突变.发生突变的体细胞如果继续保持分裂,便生成一个具相同表型的细胞
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