原核细胞基因表达调控机制课件.ppt
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- 原核细胞 基因 表达 调控 机制 课件
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1、石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程Several steps in the gene expression process may be modulated,including the transcription step and translation step and the post-translational modification of a protein.Gene regulation gives the cell control over structure and function,and is the basis for cellular differentiat
2、ion,morphogenesis and the versatility and adaptability of any organism.Gene regulation may also serve as a substrate for evolutionary change,since control of the timing,location,and amount of gene expression can have a profound effect on the functions(actions)of the gene in the organism.石河子大学研究生生物化学
3、与分子生物学精品课程原核细胞基因表达调控原核细胞基因表达调控Regulation of Prokaryotic Gene Expression石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程一、基因表达调控概述一、基因表达调控概述Basic Conceptions and Principle石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程(一)基因表达的概念(一)基因表达的概念*基因基因*基因组基因组(genome)一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。整套基因。基因经过转录、翻译,产生具有特异生物学基因经过转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白质分子的过
4、程。功能的蛋白质分子的过程。*基因表达基因表达(gene expression)基因表达是受调控的基因表达是受调控的石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程(二)基因表达的时间性及空间性(二)基因表达的时间性及空间性1 1、时间特异性、时间特异性按功能需要,某一特定基因的表达严格按按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达的特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间时间特异性特异性(temporal specificity)。多细胞生物基因表达的时间特异性又称多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶阶段特异性段特异性(stage specificity)。石河子大学研
5、究生生物化学与分子生物学精品课程2、空间特异性、空间特异性基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的,布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的,所以空间特异性又称所以空间特异性又称细胞或组织特异性细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)。在个体生长全过程,某种基因产物在个体在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现,按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的称之为基因表达的空间特异性空间特异性(spatial specificity)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程
6、(三)基因表达的方式(三)基因表达的方式按对按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:刺激的反应性,基因表达的方式分为:1 1、组成性表达、组成性表达某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为续表达,通常被称为管家基因管家基因(housekeeping gene)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程无论表达水平高低,管家基因无论表达水平高低,管家基因较少受环境较少受环境因素影响因素影响,而是在个体各个生长阶段的大多数,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。区或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。区别于其他基因,
7、这类基因表达被视为别于其他基因,这类基因表达被视为组成性基组成性基因表达因表达(constitutive gene expression)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程2 2、诱导和阻遏表达、诱导和阻遏表达在特定环境信号刺激下,相应的基因被激在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,基因表达产物增加,这种基因称为活,基因表达产物增加,这种基因称为可诱导可诱导基因基因。可诱导基因在特定环境中表达增强的过程,可诱导基因在特定环境中表达增强的过程,称为称为诱导诱导(induction)。如果基因对环境信号应答是被抑制,这种如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基因是基因是可阻遏基因可阻遏
8、基因。可阻遏基因表达产物水平。可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为降低的过程称为阻遏阻遏(repression)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程基因基因表达增强表达增强表达减弱表达减弱诱导诱导阻遏阻遏环环境境因因素素石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程在一定机制控制下,功能上相关的一组基在一定机制控制下,功能上相关的一组基因,无论其为何种表达方式,均需协调一致、因,无论其为何种表达方式,均需协调一致
9、、共 同 表 达,即 为共 同 表 达,即 为 协 调 表 达协 调 表 达(c o o r d i n a t e e x p r e s s i o n),这 种 调 节 称 为这 种 调 节 称 为 协 调 调 节协 调 调 节(coordinate regulation)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程(四)基因表达调控的生物学意义(四)基因表达调控的生物学意义1 1、适应环境、维持生长和增殖、适应环境、维持生长和增殖2 2、维持个体发育与分化、维持个体发育与分化石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程二、基因表达调控的基本原理二、基因表达调控的基本原理Basic P
10、rinciple of Gene Expression Regulation a 石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程(一)基因表达的多级调控(一)基因表达的多级调控基因基因激活激活转录起始转录起始 转录后加工转录后加工mRNA降解降解蛋白质降解等蛋白质降解等蛋白质翻译蛋白质翻译翻译后加工修饰翻译后加工修饰转录起始转录起始石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程(二)(二)基因转录激活调节基本要素基因转录激活调节基本要素u特异特异DNA序列和调节蛋白质序列和调节蛋白质u调节蛋白调节蛋白uDNA-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用蛋白质相互作用uRNA聚合酶聚合酶石河子大学
11、研究生生物化学与分子生物学精品课程原核生物原核生物 蛋白质因子蛋白质因子 操纵子操纵子(operon)机制机制特异特异DNA序列序列编码序列编码序列 启动序列启动序列 操纵序列操纵序列 其他调节序列其他调节序列(promoter)(operator)1.特异特异DNA序列和调节蛋白质序列和调节蛋白质石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程是是RNA聚合酶结合并启动转录聚合酶结合并启动转录的特异的特异DNA序列。序列。1)启动序列启动序列RNA转录起始转录起始-35区区-10区区TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTAC
12、TGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrp tRNATyrlacrecAAra BAD TTGACA TATAAT共有序列共有序列石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程 Pribnow box石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程共有序列共有序列(consensus sequence)决定启动决定启动序列的转录活性大小。序列的转录活性大小。某些特异因子(蛋白质)某些特异因子(蛋白质)决定决定RNA聚合聚合酶酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。合能力。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程2 2 操纵序
13、列操纵序列 阻遏蛋白阻遏蛋白(repressor)的结合位点的结合位点当操纵序列结合有当操纵序列结合有阻遏蛋白阻遏蛋白时,会阻碍时,会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合,或是聚合酶与启动序列的结合,或是RNA聚聚合酶不能沿合酶不能沿DNA向前移动向前移动,阻碍转录。,阻碍转录。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列pol阻遏阻遏蛋白蛋白石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程3 3)其他调节序列、调节蛋白其他调节序列、调节蛋白例如例如激活蛋白激活蛋白(activator)可结合启动序列邻近可结合启动序列邻近的的DNA序列,促进序列,促进RNA聚合酶与启动序列的聚合酶与启动序列的结合
14、,增强结合,增强RNA聚合酶活性。聚合酶活性。有些基因在没有激活蛋白存在时有些基因在没有激活蛋白存在时,RNA聚合酶很少或完全不能结合启动序列。聚合酶很少或完全不能结合启动序列。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程真核生物真核生物顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表达活性的DNA序列序列BADNA编码序列编码序列转录起始点转录起始点不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列些共有序列,如,如TATA盒、盒、CAAT盒等,这些共盒等,这些共有序列是有序列是RNA聚合酶或特异转录
15、因子的结合位点。聚合酶或特异转录因子的结合位点。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程2、真核基因的调节蛋白、真核基因的调节蛋白还有蛋白质因子可特异识别、结合自还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列身基因的调节序列,调节自身基因的表达,调节自身基因的表达,称称顺式作用顺式作用。由某一基因表达产生的蛋白质因子,由某一基因表达产生的蛋白质因子,通过与另一基因的特异的顺式作用元件相通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用,调节其表达。互作用,调节其表达。反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)这种调节作用称为这种调节作用称为反式作用反式作用。石河子大学研究
16、生生物化学与分子生物学精品课程cDNAaDNA反式调节反式调节C顺式调节顺式调节 mRNA C蛋白质蛋白质CBA mRNA蛋白质蛋白质AA石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程指的是反式作用因子与顺式作用元件之指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的特异识别及结合。通常是非共价结合,间的特异识别及结合。通常是非共价结合,被识别的被识别的DNA结合位点通常呈对称、或不完结合位点通常呈对称、或不完全对称结构。全对称结构。绝大多数调节蛋白质结合绝大多数调节蛋白质结合DNA前,需通前,需通过蛋白质过蛋白质-蛋白质相互作用,形成蛋白质相互作用,形成二聚体二聚体(dimer)或或多聚体多聚体(poly
17、mer)。3.DNA-蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质-蛋白质蛋白质的相互作用的相互作用石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程4.RNA聚合酶聚合酶 原核启动序列原核启动序列/真核启动子与真核启动子与RNA聚合酶聚合酶活性活性 RNA聚合酶与其的亲和力聚合酶与其的亲和力,影响转录。影响转录。调节蛋白与调节蛋白与RNA聚合酶活性聚合酶活性一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下表一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下表达达,然后通
18、过然后通过DNA-蛋白质、蛋白质蛋白质、蛋白质-蛋白质相互蛋白质相互作用影响作用影响RNA聚合酶活性。聚合酶活性。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程三、原核基因表达调控三、原核基因表达调控Regulation of Prokaryotic Gene Expression石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程调节的主要环节在调节的主要环节在转录起始转录起始(一)原核基因转录调节特点(一)原核基因转录调节特点1、因子决定因子决定RNA聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性2、操纵子模型的普遍性、操纵子模型的普遍性3、阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性、阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性石河子大学研究生生
19、物化学与分子生物学精品课程(二)乳糖操纵子调节机制(二)乳糖操纵子调节机制1、乳糖操纵子乳糖操纵子(lac operon)的结构的结构 调控区调控区CAP结合位点结合位点启动序列启动序列操纵序列操纵序列 结构基因结构基因Z:-半乳糖苷酶半乳糖苷酶Y:透酶透酶A:乙酰基转移酶乙酰基转移酶ZYAOPDNA石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程 Lac operon石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时没有乳糖存在时2 2、阻遏蛋白的负性调节阻遏蛋白的负性调节阻遏基因阻遏基因石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程mRNA
20、阻遏蛋白阻遏蛋白有乳糖存在时有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录启动转录mRNA乳糖乳糖半乳糖半乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程 Lac operon石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程+转录转录无葡萄糖,无葡萄糖,cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖,有葡萄糖,cAMP浓度低时浓度低时3、CAP的的正性调节正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程4 4、协调调节协调调节当阻遏蛋白封闭转录时,当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能对该系
21、统不能发挥作用;发挥作用;如无如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合,操纵子仍无转录活性。列结合,操纵子仍无转录活性。单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源;单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时,细乳糖共同存在时,细菌首先利用葡萄糖。菌首先利用葡萄糖。葡萄糖对葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称操纵子的阻遏作用称分解代分解代谢阻遏谢阻遏(catabolic repression)。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程mRNA低半乳糖时低半乳糖时高半乳糖时高半乳糖时 葡萄糖低葡萄糖低 cAMP浓度高浓度
22、高 葡萄糖高葡萄糖高cAMP浓度低浓度低RNA-polOOOO石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程 The regulation of lac operon by CAP,repressor,CAMP and inducer石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程Trp Trp 高时高时 Trp 低时低时 mRNA OPtrpR调节区调节区 结构基因结构基因 RNARNA聚合酶聚合酶 RNARNA聚合酶聚合酶 (三)色氨酸操纵子调节机制(三)色氨酸操纵子调节机制转录衰减转录衰减色氨酸操纵子色氨酸操纵子石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程 石河子大学研究生生物化学与分子生物学
23、精品课程 Trp operon石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程衰减子(衰减子(A A)是)是TrpTrp operonoperon的第二控制系统。的第二控制系统。第二控制系统实验证据提示:第二控制系统实验证据提示:TrpTrp operonoperon酶本底只有酶本底只有1/701/70,Lac Lac operonoperon为为1/10001/1000,说明,说明TrpTrp operonoperon的阻遏要比的阻遏要比Lac Lac operonoperon低得低得多,但多,但仍可以满足细菌适应生存的需要,说明仍可以满足细菌适应生存的需要,说明TrpTrp存存在第二控制系统。
24、在第二控制系统。石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程衰减子前导肽(aL)及其空间结构特点aL离离E基因上游约基因上游约3060bp有有4个个GC特征的片段,其后是特征的片段,其后是8个个U,是不依赖是不依赖因子的终止子,因子的终止子,终止作用有赖于前面片段发夹结终止作用有赖于前面片段发夹结构形成情况。构形成情况。当当Trp,片段片段3,4形形成发夹结构,转录终止。成发夹结构,转录终止。有有2个串联个串联UGG(Trp密码子)密码子)全长多顺反子全长多顺反子6700bp。空 间 结 构特特 点点DNARPO aL EBCDA aLmRNAL肽UGGUGG1234位于第60位核苷酸-Trp
25、-Trp-石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程UUUUUUUU调节区调节区 结构基因结构基因 trpROP前导序列前导序列 衰减子区域衰减子区域 UUUU前导前导mRNA1234衰减子结构衰减子结构 第第1010、1111密码子为密码子为trptrp密码子密码子 终止密码子终止密码子 14aa14aa前导肽编码区前导肽编码区:包含序列包含序列1 1 形成发夹结构能力强弱:形成发夹结构能力强弱:序列序列1/21/2 序列序列2/32/3序列序列3/4 3/4 trp 密码子密码子 UUUU石河子大学研究生生物化学与分子生物学精品课程UUUU34UUUU 334核糖体核糖体 前导肽前导肽
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