微生物生态上课讲义课件.ppt
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1、微生物生态 生态系统生态系统():在一定的在一定的空间内空间内,生物成分和,生物成分和非生物成分通过非生物成分通过物质循环物质循环和和能量能量流动流动互相作用、互相依存而构成互相作用、互相依存而构成的一个生态学功能单位。的一个生态学功能单位。微生物生态学微生物生态学 研究微生物与其所处环境条件之间的相互研究微生物与其所处环境条件之间的相互作用规律性的科学。作用规律性的科学。t 各种环境中的微生物的种类和分布;各种环境中的微生物的种类和分布;t 微生物和其它生物的关系;微生物和其它生物的关系;t 微生物与物质循环;微生物与物质循环;种群(种群(population):一种微生物细胞形成的群体。一
2、种微生物细胞形成的群体。共位群(共位群(guild):):在代谢关系上相关的种群。在代谢关系上相关的种群。微生物群落(微生物群落(community):):多组共位群相互作用多组共位群相互作用 而形成的群体。而形成的群体。土著(土著(indigenous)微生物:)微生物:已经占有特定的生境已经占有特定的生境(habit),能在该生境中进行代谢、生长和繁殖,并能),能在该生境中进行代谢、生长和繁殖,并能与同一生境中的微生物竞争的微生物。与同一生境中的微生物竞争的微生物。外来(外来(allochthonous)微生物:)微生物:在生境中不占有特在生境中不占有特定的生态位,而是从另一生境中传来的微
3、生物。定的生态位,而是从另一生境中传来的微生物。微生物区系微生物区系(microflora):在特定的生态环境条件下,由在特定的生态环境条件下,由特定的种类及一定数量微生物组成,并且是他们生命活特定的种类及一定数量微生物组成,并且是他们生命活动的综合体现。动的综合体现。一一.土壤中的微生物土壤中的微生物 土壤是微生物的大本营!土壤是微生物的大本营!l土壤中有养分、空气、水,土壤覆盖阻挡了紫外线对土壤中有养分、空气、水,土壤覆盖阻挡了紫外线对微生物的杀伤,土壤微生物的杀伤,土壤pHpH及渗透压都适合微生物生长。及渗透压都适合微生物生长。l土壤中的微生物有土壤中的微生物有 细菌、放线菌、真菌、藻类
4、、原生动物、病毒。细菌、放线菌、真菌、藻类、原生动物、病毒。耕作层耕作层(15cm)(15cm)土壤中的微生物数量和生物量土壤中的微生物数量和生物量微生物类群微生物类群菌数菌数(cfu/g)生物量生物量(g/m3)细细 菌菌108160真真 菌菌105200放放 线线 菌菌105-106160藻藻 类类104-10532原生动物原生动物10438Decrease with depth but still present in bed rockOrganicsnutrientsDecrease with depthNumbers ofmicroorganisms微生物在土壤中的垂直分布微生物在土
5、壤中的垂直分布微生物以微菌微生物以微菌落(落(microcolony)的形式存在于土壤的形式存在于土壤团粒结构中。团粒结构中。二、自然水域中的微生物二、自然水域中的微生物自然水域具有微生物的生活条件:自然水域具有微生物的生活条件:水中有营养物质、溶解氧、渗透压和温度适合水中有营养物质、溶解氧、渗透压和温度适合不同微生物生长。不同微生物生长。海水中的微生物:海水中的微生物:藻类、藻类、G-需氧细菌需氧细菌、兼性厌氧菌、兼性厌氧菌。特点:嗜盐、嗜冷、嗜压。特点:嗜盐、嗜冷、嗜压。algaeparamecium淡水水域中的微生物:淡水水域中的微生物:湖水中的微生物:湖水中的微生物:细菌细菌 、真菌、
6、真菌 、藻类、藻类 、原生动物。、原生动物。river ostracod河水中的微生物:河水中的微生物:富营养化(富营养化(eutrophication):指水体中因指水体中因N、P等元素含量过高而引起水等元素含量过高而引起水体表层的蓝细菌和藻类过度生长繁殖的现象。体表层的蓝细菌和藻类过度生长繁殖的现象。这时,下层水体不但因缺光而少氧,而且大量这时,下层水体不但因缺光而少氧,而且大量死藻因细菌的分解而进一步而造成了厌氧和有死藻因细菌的分解而进一步而造成了厌氧和有毒的环境。毒的环境。滇滇 池池太太 湖湖“水花水花”或或“水华水华”(water bloom)藻类(主要是微藻)的大量藻类(主要是微藻
7、)的大量繁殖使水体出现颜色,并变繁殖使水体出现颜色,并变得浑浊,许多藻类团块漂浮得浑浊,许多藻类团块漂浮在水面上形成。在水面上形成。赤潮或红潮(赤潮或红潮(red tides):):在海洋中,某些甲藻类在海洋中,某些甲藻类生物大量繁殖从而使海水出生物大量繁殖从而使海水出现红色或褐色。现红色或褐色。空气中的微生物主要是:空气中的微生物主要是:芽孢细菌的芽孢和一些芽孢细菌的芽孢和一些G菌;菌;真菌的孢子。真菌的孢子。空气中的微生物密度空气中的微生物密度 农村农村 城市城市 高空高空 低空低空 海洋上空海洋上空 陆地上空陆地上空 畜厩、街道、医院、宿舍区微生物密度大畜厩、街道、医院、宿舍区微生物密度
8、大 高山、海洋、森林、旷原微生物少高山、海洋、森林、旷原微生物少空气不具有微生物生活的条件空气不具有微生物生活的条件 !三、三、空气中的微生物空气中的微生物四、食品中的微生物四、食品中的微生物微生物可以从土壤、作物收割、食微生物可以从土壤、作物收割、食品加工、储藏等各个环节进入食品品加工、储藏等各个环节进入食品食品中有益的微生物食品中有益的微生物乳酸菌乳酸菌双歧杆菌双歧杆菌酵母菌酵母菌霉霉 菌菌食品中有害的微生物食品中有害的微生物 导致食品腐败、变质,产生导致食品腐败、变质,产生有害物质,危害人类健康!有害物质,危害人类健康!可采用多种方法防止微生物对食品等的破坏可采用多种方法防止微生物对食品
9、等的破坏 食品微生物检验的指标就是根据食品卫生食品微生物检验的指标就是根据食品卫生的要求,从微生物学的角度,对不同食品所提的要求,从微生物学的角度,对不同食品所提出的与食品有关的具体指标要求。出的与食品有关的具体指标要求。食品微生物检验的指标食品微生物检验的指标1 1、菌落总数、菌落总数2 2、大肠菌群、大肠菌群3 3、致病菌、致病菌高温环境高温环境 极端嗜热菌极端嗜热菌 Pyrodictium broii 最适生长温度为最适生长温度为 105,最高可达,最高可达110。低温环境低温环境 嗜冷菌中的某些固嗜冷菌中的某些固 N 微生物在微生物在 1 下还可以固下还可以固 N。强酸环境强酸环境 嗜
10、酸菌;氧化硫硫杆菌能在嗜酸菌;氧化硫硫杆菌能在 pH 0.9-4 范围生长,最适范围生长,最适 pH 为为 2.5左右。左右。强碱环境强碱环境 嗜碱菌嗜碱菌 Bacillus rotans 能在能在 pH 11下生长。下生长。高盐环境高盐环境 极端嗜盐菌,最适生长盐浓度为极端嗜盐菌,最适生长盐浓度为2.5-5.0摩尔摩尔/L.高压环境高压环境 深海中的极端嗜压菌深海中的极端嗜压菌 Pseudomonas bathycete 能在能在 1.01108 Pa,3 下生长。下生长。五、五、极端环境中的微生物极端环境中的微生物 研究意义:研究意义:(1)开发利用新的微生物资源,包括特异性的基开发利用新
11、的微生物资源,包括特异性的基因资源;因资源;(2)为微生物生理、遗传和分类乃至生命科学及为微生物生理、遗传和分类乃至生命科学及相关学科许多领域,如:功能基因组学、生物电相关学科许多领域,如:功能基因组学、生物电子器材等的研究提供新的课题和材料;子器材等的研究提供新的课题和材料;(3)为生物进化、生命起源的研究提供新的材料。为生物进化、生命起源的研究提供新的材料。六、未培养的微生物六、未培养的微生物 (unculturable microorganisms)自然界中,只有自然界中,只有的微生物获得的微生物获得培养,而培养,而的微生物都是未培的微生物都是未培养的微生物养的微生物.未培养的微生物未培
12、养的微生物研究意义:研究意义:生物多样性和系统发生的多样性生物多样性和系统发生的多样性(Biodiversity and Phylogenetic diversity)微生物生态学的研究提出新的要求微生物生态学的研究提出新的要求寻找新的致病微生物寻找新的致病微生物从不可培养微生物中寻找新的基因、新的蛋白从不可培养微生物中寻找新的基因、新的蛋白据报道,美国据报道,美国recombianant biocatalysis Inc公司目前已从不可培养公司目前已从不可培养微生物中获得了约微生物中获得了约300个与工业生产相关的新蛋白个与工业生产相关的新蛋白微生物种群之间存在下面八种相互关系:微生物种群之
13、间存在下面八种相互关系:l中性关系中性关系 neutralism l偏利关系偏利关系 commensalisml协同关系协同关系 synergisml互惠关系互惠关系 mutualisml竞争关系竞争关系 competition l拮抗关系拮抗关系 antagonism l寄生关系寄生关系 parasitism l捕食关系捕食关系 predation 1、中性关系:、中性关系:两个微生物种群之间两个微生物种群之间没影响没影响或仅存在无关紧要的相互作用称为或仅存在无关紧要的相互作用称为中性关系。例如空气中的微生物、海洋和低营养湖中的微生物休眠中性关系。例如空气中的微生物、海洋和低营养湖中的微生物
14、休眠的芽胞,厚垣孢子等。的芽胞,厚垣孢子等。3、协同关系:、协同关系:两个微生物种群之间相互受益并保持它们各自独立性的松散关两个微生物种群之间相互受益并保持它们各自独立性的松散关系。例如土壤中的纤维素分解菌分解纤维素为葡萄糖,为固系。例如土壤中的纤维素分解菌分解纤维素为葡萄糖,为固N菌提菌提供供C源;而固源;而固N菌固定大气菌固定大气N,又能改善纤维分解菌的又能改善纤维分解菌的N素营养。素营养。2、偏利关系:、偏利关系:一个微生物种群因另一种群的存在或生命活动而单方面获利的一个微生物种群因另一种群的存在或生命活动而单方面获利的现象。例如土壤中兼性厌氧现象。例如土壤中兼性厌氧M.的生长消耗环境中
15、的氧,为厌氧微生的生长消耗环境中的氧,为厌氧微生物的生长创造了条件。物的生长创造了条件。4 4、互、互 惠惠 关关 系(共生关系)系(共生关系)两种微生物形成了两种微生物形成了特殊的结构,特殊的结构,紧密地生活在一起,彼此紧密地生活在一起,彼此依赖依赖,相互为对方创造有利的生存条件。,相互为对方创造有利的生存条件。特点:特点:在生理上相互分工,互换代谢活动的产物;在生理上相互分工,互换代谢活动的产物;在组织上形成了特殊的结构,单独不能存活。在组织上形成了特殊的结构,单独不能存活。例如:例如:地衣是真菌和蓝细菌的共生体地衣是真菌和蓝细菌的共生体 地衣地衣-藻类和真菌的共生体藻类和真菌的共生体形成
16、有固定形态的叶状结构:形成有固定形态的叶状结构:真菌无规则地缠绕藻类细胞,或二者组成一定的层次排列。真菌无规则地缠绕藻类细胞,或二者组成一定的层次排列。结构上的共生:结构上的共生:生理上的共生:生理上的共生:共生真菌从基质中吸收水分和无机养料;共生真菌从基质中吸收水分和无机养料;共生蓝细菌进行光合作用,合成有机物;共生蓝细菌进行光合作用,合成有机物;使地衣能在十分贫瘠的环境中生存。使地衣能在十分贫瘠的环境中生存。6、拮抗关系、拮抗关系 当一种微生物的群体产生某种物质使另一个当一种微生物的群体产生某种物质使另一个M.群体生长受到抑群体生长受到抑制而本身不受影响时,称为拮抗现象。制而本身不受影响时
17、,称为拮抗现象。例如:例如:乳酸菌产酸抑制其它乳酸菌产酸抑制其它M.生长(非特异性拮抗作用)。生长(非特异性拮抗作用)。产黄青霉产生的青霉素可以抑制产黄青霉产生的青霉素可以抑制G+菌(特异性拮抗作用)。菌(特异性拮抗作用)。5、竞争关系、竞争关系 竞争是两个或多个竞争是两个或多个M群体共同依赖于同一生长基质或者环境因群体共同依赖于同一生长基质或者环境因素,结果一方或两方的群体大小或生长率受到限制的现象。素,结果一方或两方的群体大小或生长率受到限制的现象。竞争结竞争结果强者生存,弱者淘汰。果强者生存,弱者淘汰。例如例如在同一生长环境中如果限制在同一生长环境中如果限制P的数量,两种藻类星杆藻和小环
18、的数量,两种藻类星杆藻和小环藻在此环境中生活时,则小环藻被星杆藻取代。藻在此环境中生活时,则小环藻被星杆藻取代。lLeft Bacteriophage p22 virus lRight Bacteriophage T4 attacking a bacterial cell7 7、寄生关系、寄生关系 一种微生物侵入另一种微生物体内吸取自己所需要的营养物质一种微生物侵入另一种微生物体内吸取自己所需要的营养物质进行生长繁殖,在一定的条件下对后者造成损害或死亡的现象。进行生长繁殖,在一定的条件下对后者造成损害或死亡的现象。8 8、捕食关系、捕食关系定义:定义:一种大型的(微)生物直接捕捉、吞食其他小型
19、微一种大型的(微)生物直接捕捉、吞食其他小型微生物来满足生存需要的现象。生物来满足生存需要的现象。例如:原生动物以细菌为食。例如:原生动物以细菌为食。1.互生关系互生关系 metabiosis l两种可以独立生活的生物生活在一起时,都从对方获两种可以独立生活的生物生活在一起时,都从对方获得利益,相互提供营养或生态位。得利益,相互提供营养或生态位。l人体肠道正常菌群与宿主的关系主要是互生关系,肠人体肠道正常菌群与宿主的关系主要是互生关系,肠道为微生物提供生存环境,肠道微生物进行多种代谢,道为微生物提供生存环境,肠道微生物进行多种代谢,为人体提供有益物质如维生素。为人体提供有益物质如维生素。l人体
20、内正常菌群对宿主新陈代谢、营养物质转化和消人体内正常菌群对宿主新陈代谢、营养物质转化和消化吸收都具有重要作用,是保持人体生态平衡和内环化吸收都具有重要作用,是保持人体生态平衡和内环境的稳定的重要因素。境的稳定的重要因素。二、二、微生物与动物的关系微生物与动物的关系 人体各部位常见的正常菌群人体各部位常见的正常菌群皮肤:皮肤:表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、绿脓杆菌、耻垢杆菌等表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、绿脓杆菌、耻垢杆菌等口腔:口腔:链球菌(甲型或乙型)、乳酸杆菌、螺旋体、梭形杆菌、白链球菌(甲型或乙型)、乳酸杆菌、螺旋体、梭形杆菌、白色念球菌、(真菌)表皮葡萄球菌、肺炎球菌、奈瑟氏球菌、类白色念球菌
21、、(真菌)表皮葡萄球菌、肺炎球菌、奈瑟氏球菌、类白喉杆菌等喉杆菌等胃:胃:正常一般无菌正常一般无菌肠道:肠道:类杆菌、双歧杆菌、大肠杆菌、厌氧性链球菌、粪链球菌、类杆菌、双歧杆菌、大肠杆菌、厌氧性链球菌、粪链球菌、葡萄球菌、白色念球菌、乳酸杆菌、变形杆菌、破伤风杆菌、产气葡萄球菌、白色念球菌、乳酸杆菌、变形杆菌、破伤风杆菌、产气荚膜杆菌等荚膜杆菌等鼻咽腔:鼻咽腔:甲型链球菌、奈氏球菌、肺炎球菌、流感杆菌、乙型链球甲型链球菌、奈氏球菌、肺炎球菌、流感杆菌、乙型链球菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、变形杆菌等菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、变形杆菌等眼结膜:眼结膜:皮表葡萄球菌、结膜干燥杆菌、类
22、白喉杆菌等皮表葡萄球菌、结膜干燥杆菌、类白喉杆菌等阴道:阴道:乳酸杆菌、白色念球菌、类白喉杆菌、大肠杆菌等乳酸杆菌、白色念球菌、类白喉杆菌、大肠杆菌等尿道:尿道:表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、耻垢杆菌等表皮葡萄球菌、类白喉杆菌、耻垢杆菌等2.共生关系共生关系 symbiosis 两种生物生活在一起,相互依赖,形成特殊两种生物生活在一起,相互依赖,形成特殊的共生结构。的共生结构。A、反刍动物与瘤胃微生物的共生关系、反刍动物与瘤胃微生物的共生关系 牛、羊、骆驼等反刍动物以草为食,可是它们本身缺牛、羊、骆驼等反刍动物以草为食,可是它们本身缺乏消化纤维素和木质素的酶。主要靠瘤胃中定居的特乏消化纤维素和木质
23、素的酶。主要靠瘤胃中定居的特定微生物群落来分解纤维素、木质素为纤维二糖和葡定微生物群落来分解纤维素、木质素为纤维二糖和葡萄糖,为动物提供能量来源。同时反刍动物吃进的草萄糖,为动物提供能量来源。同时反刍动物吃进的草料又为这些微生物提供了营养。料又为这些微生物提供了营养。B.Termites白蚁白蚁&发癣菌发癣菌 TrichonymphaC.C.发光细菌在鱿鱼体内发光,发光细菌在鱿鱼体内发光,躲避捕食者。躲避捕食者。白蚁、蟑螂等昆虫白蚁、蟑螂等昆虫的肠道内含有大量的肠道内含有大量的细菌和原生动物的细菌和原生动物与其共生。与其共生。3.寄生关系寄生关系 parasitism 能寄生在人和动物的体内,
24、并引起疾病的微生物称为寄生菌。能寄生在人和动物的体内,并引起疾病的微生物称为寄生菌。专性寄生:专性寄生:只能在适宜的寄主动物或介体生物细胞的体内生活。只能在适宜的寄主动物或介体生物细胞的体内生活。兼性寄生:兼性寄生:在一般情况下,在土壤和水体等自然生境中生活,在一般情况下,在土壤和水体等自然生境中生活,遇到特定的条件和时机才侵入寄主体内引起疾病。遇到特定的条件和时机才侵入寄主体内引起疾病。利用寄生关系开展生物防治是生态农业发展方向:利用寄生关系开展生物防治是生态农业发展方向:苏云金杆菌寄生于鳞翅目昆虫引起病害导致昆虫死亡。苏云金杆菌寄生于鳞翅目昆虫引起病害导致昆虫死亡。核多角体病毒寄生于棉铃虫
25、引起病毒病导致昆虫死亡。核多角体病毒寄生于棉铃虫引起病毒病导致昆虫死亡。(一)互生关系(一)互生关系 植物根际植物根际(Rhizosphere)微生物与植物的关系微生物与植物的关系是典型的互生关系:是典型的互生关系:植物为根际微生物提供分泌物和根冠脱落物植物为根际微生物提供分泌物和根冠脱落物作为营养。微生物产生的代谢产物如生长刺激作为营养。微生物产生的代谢产物如生长刺激素或抗生素,对植物生长有利。素或抗生素,对植物生长有利。l根圈效应根圈效应:生活在根圈中的微生物,在数量、种类和活性:生活在根圈中的微生物,在数量、种类和活性上都有明显不同,表现出一定的特异性(即植物根圈对微上都有明显不同,表现
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