应用微生物学课件.ppt
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- 应用 微生物学 课件
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1、 应用微生物学应用微生物学Applied Microbiology应用微生物学应用微生物学概论概论微生物的生长微生物的生长微生物的代谢微生物的代谢微生物的遗传与遗传育种微生物的遗传与遗传育种微生物基因工程微生物基因工程应用微生物的基因操作系统应用微生物的基因操作系统酶工程与生物转化酶工程与生物转化微生物发酵微生物发酵微生物代谢工程微生物代谢工程概 论基本概念基本概念应用微生物学的发展应用微生物学的发展微生物细胞的结构微生物细胞的结构重要的应用微生物重要的应用微生物定义应用微生物学应用微生物学:以一定的直接或间接应用目标研究微生物及以一定的直接或间接应用目标研究微生物及其相互作用和与环境的作用的
2、科学。其相互作用和与环境的作用的科学。(applied microbiology)微生物学与相关的生物技术相结合,以实现微生物学与相关的生物技术相结合,以实现一定的一定的直接或间接应用目标。直接或间接应用目标。(microbiology in application)微生物的特点资源量大(多样性丰富)资源量大(多样性丰富)生物量大(生长迅速)生物量大(生长迅速)可塑性大(便于操作)可塑性大(便于操作)个体小(便于运输、携带)个体小(便于运输、携带)完成自然界的物质循环完成自然界的物质循环造福人类造福人类引起灾难引起灾难当前人类面临的问题资源的压力资源的压力环境的挑战环境的挑战传染病的新生与复发
3、传染病的新生与复发微生物的应用部分细胞细胞基因基因基因产物(酶、蛋白质)基因产物(酶、蛋白质)代谢产物代谢产物应用微生物学需解决的问题微生物菌种的获得和优化微生物菌种的获得和优化微生物培养条件的建立和优化微生物培养条件的建立和优化微生物的应用微生物的应用应用微生物学研究的一般流程 提出问题(工业、农业、环境、健康、国防提出问题(工业、农业、环境、健康、国防)微生物?微生物?No Yes 菌种菌种 解决问题解决问题 发酵发酵 解决问题解决问题 应用应用 解决问题解决问题应用微生物学的发展应用微生物学的发展 微生物学的发展是与应用紧密联系的逐步建立方法认识微生物逐步建立方法认识微生物 Leenwe
4、nhock(1673)显微镜 Jenner(1798)牛痘 Basteur(1860s)发酵、低温灭菌、自然发生 Koch (1881)纯培养微生物形成产业微生物形成产业 Fleming(1929)青霉素 Waksman(1944)链霉素 现代生物技术现代生物技术 Cohen(1972)DNA 重组微生物细胞的结构细胞壁细胞壁形态保持、物质交换、信号识别形态保持、物质交换、信号识别细胞膜细胞膜转运转运细胞质细胞质酶、反应场所酶、反应场所细胞核细胞核遗传物质遗传物质核外遗传物质核外遗传物质线粒体、质粒线粒体、质粒重要的应用微生物重要的应用微生物病毒:病毒:?-噬菌体噬菌体细菌:大肠杆菌细菌:大肠
5、杆菌(E.coli)棒杆菌棒杆菌(Corynebacterium)放线菌:链霉菌放线菌:链霉菌(Streptomyces)酵母菌:酿酒酵母酵母菌:酿酒酵母(Saccharomyces cerevisia)真菌:曲霉真菌:曲霉(Aspergillus)第一章 微生物的生长微生物生长的条件微生物生长的条件培养基培养基生长动力学生长动力学 微生物细胞的化学组成细胞中几种主要元素的含量(干重的百分数)细胞干物质中主要组分和含量(%)元素细菌酵母菌霉菌C505345504063N1215 7.512.4710O203040H877细菌酵母菌霉菌蛋白质508032752040碳水化合物1228276371
6、0 脂类520215440核酸1020681灰分物质210710510 微生物生长的条件物质条件水水 aw=P/P0 微生物类群 最低aw值 细菌0.91 酵母菌0.88 霉菌0.80 耐干霉菌0.65 耐高渗酵母菌0.60微生物生长的条件物质条件碳源和氮源碳源和氮源O H P S K Ca Mg FeMn Cu Zn Mo Co Ni V B Cl Na Si 维生素、氨基酸等维生素、氨基酸等 微生物生长的条件环境条件pH 中性(弱酸、碱)、嗜酸、嗜碱中性(弱酸、碱)、嗜酸、嗜碱温度温度 最适、生长、耐受最适、生长、耐受氧气氧气 严格(专性)好氧、兼性、耐氧厌氧、严格厌氧严格(专性)好氧、兼
7、性、耐氧厌氧、严格厌氧压力压力渗透压渗透压极端环境微生物极端环境微生物(extremophile)不可培养微生物不可培养微生物(VBNC vive but non-cultured)极端微生物与不可培养微生物极端微生物与不可培养微生物极端环境微生物极端环境微生物(extremophile):依赖于一种或多种依赖于一种或多种极端物化因子生存的微生物极端物化因子生存的微生物嗜热菌:嗜热菌:50-80C (hyperthermophiles80C)嗜冷菌:嗜冷菌:16C嗜酸菌:嗜酸菌:9嗜盐菌:嗜盐菌:3M嗜压菌嗜压菌不可培养微生物不可培养微生物(VBNC vive but non-cultured
8、)培养基 提供微生物生长所需物质与环境条件提供微生物生长所需物质与环境条件的体系的体系培养基的组成要素碳源、氮源、提供各种元素的无机盐碳源、氮源、提供各种元素的无机盐生长因子或含生长因子的物质生长因子或含生长因子的物质水、固化基(固体培养基)水、固化基(固体培养基)pH、渗透压(糖、盐浓度)、灭菌条件、渗透压(糖、盐浓度)、灭菌条件培养基的种类按物理状态:固体、液体、半固体按物理状态:固体、液体、半固体按化学组成:合成、丰富、半合成按化学组成:合成、丰富、半合成按使用目的:种子、发酵、筛选、再按使用目的:种子、发酵、筛选、再 生、生、富集富集培养基的选择和设计原则培养基的选择和设计原则适用:利
9、于达到目的适用:利于达到目的 利于下游工艺利于下游工艺 重复性好重复性好经济:原料价格经济:原料价格 原料用量原料用量 全工艺综合平衡全工艺综合平衡安全:环境影响安全:环境影响 生物安全生物安全培养基的选择和设计是应用微生物学研究的重要内容培养基的选择和设计是应用微生物学研究的重要内容生长动力学增值曲线增值曲线(Multiplication curve):):细胞数细胞数-时间时间生长曲线生长曲线(growth curve):):细胞量细胞量-时间时间0 010102020303040405050606070700 04 48 8121216162020增值增值曲线曲线生长生长曲线曲线微生物生
10、长的实验计量显微计数显微计数菌落计数菌落计数浊度测定浊度测定细胞干重细胞干重微生物生长的数学描述 比生长速度比生长速度(specific growth rate)=dx/xdt 细菌 0.6-1.2 酵母菌 0.3-0.5 放线菌 0.1-0.3 真菌 0.1-0.3 生物量倍增时间生物量倍增时间(biomass doubling time)td=ln2/增值度增值度(multiplication degree)x/xo第二章 微生物的代谢微生物初级代谢微生物初级代谢微生物次级代谢微生物次级代谢代谢调节代谢调节 微生物的代谢 微生物细胞所进行的生化反应的总和微生物细胞所进行的生化反应的总和物质
11、代谢物质代谢 细胞内及细胞与环境间的物质转换的过程细胞内及细胞与环境间的物质转换的过程能量代谢能量代谢 载体载体信息代谢信息代谢微生物初级代谢微生物初级代谢微生物从环境摄取物质、获得能量、合成自身新物质微生物从环境摄取物质、获得能量、合成自身新物质的过程的过程 营养物 废弃物 能量(用于生长)能量 合成代谢合成代谢 (用于运动和物质转运)细胞组分 酶 分解代谢分解代谢 能量来源重要的初级代谢途径糖酵解途径糖酵解途径 糖代谢的共同分解途径糖代谢的共同分解途径三羧酸循环三羧酸循环 将糖最终氧化为二氧化碳和水,并产生大量能量将糖最终氧化为二氧化碳和水,并产生大量能量磷酸戊糖途径磷酸戊糖途径 产生四碳
12、糖、五碳糖和七碳糖等多种中间产物产生四碳糖、五碳糖和七碳糖等多种中间产物EDED途径途径 细菌代谢葡萄糖产生乙醇的途径细菌代谢葡萄糖产生乙醇的途径氨基酸合成途径氨基酸合成途径糖酵解途径糖酵解途径(Embden-Meyerhof pathway)GLC HXK ZWF SOL GND G6P G15L P6G RU5P PGI F6P PFKFBP F16P FBA GLYG3P DHAP GAP TPI TDH P13G PGK 3PG GPM 2PG ENO PEP PYK PDC ADH PYR ACA ETH三羧酸循环三羧酸循环(Krebs cycle)PYR ACoA MDH CIT
13、MAL OAA CTT FUM ACO FUM ICI SDH OSM IDP SUC SUCC AKG LSC KGD磷酸戊糖途径磷酸戊糖途径氧化(氧化(产生产生NADPH)RU5P P6G G15L G6P RKI RPE非氧化非氧化 R5P X5P (分子重排分子重排)TKL TKL GAP S7P E4P TKL F6PED途径 存在于某些缺乏完整EMP途径的微生物中,是微生物特有的,将2-酮-3脱氧-6-磷酸葡糖酸(KDPG)裂解为丙酮酸和3-磷酸甘油醛。氨基酸合成途径氨基酸合成途径 GLC 3PG Ser,Gly,Met(3磷酸甘油酸衍生型)磷酸甘油酸衍生型)PPP R5P PEP
14、 Phe,Try,Trp (芳香族芳香族氨基酸)氨基酸)His PRY Ala,Val,Leu(丙酮酸衍生型)丙酮酸衍生型)OAA Asp ASA Lys(草酰乙酸衍生型)草酰乙酸衍生型)TCA Asn HS Thr AKG Met Ile Arg Glu Gln(酮戊二酸衍生型)酮戊二酸衍生型)Pro微生物次级代谢微生物次级代谢 次级代谢是相对于初级代谢的概念,指微次级代谢是相对于初级代谢的概念,指微生物在一定的生长时期(一般为稳定期)以初生物在一定的生长时期(一般为稳定期)以初级代谢物为前体、合成对微生物生命活动没有级代谢物为前体、合成对微生物生命活动没有明确功能的物质的过程。明确功能的物
15、质的过程。次级代谢(前体聚合、次级代谢(前体聚合、初级代谢初级代谢 结构修饰、装配)结构修饰、装配)营养物营养物 前体前体 次级代谢物次级代谢物 (初级代谢物)(初级代谢物)次级代谢的生物学意义次级代谢的生物学意义 次级代谢的生理意义目前尚无定论,但它肯定对微生物是有意次级代谢的生理意义目前尚无定论,但它肯定对微生物是有意义的,否则这种需要多种酶类协同参与、并在精细的调节机制控义的,否则这种需要多种酶类协同参与、并在精细的调节机制控制之下的代谢过程是不会在生物体内保存下来的。制之下的代谢过程是不会在生物体内保存下来的。维持初级代谢的平衡维持初级代谢的平衡次级代谢产物作为储藏物质的一种形式次级代
16、谢产物作为储藏物质的一种形式使菌体在生存竞争中占优势使菌体在生存竞争中占优势与细胞分化有关与细胞分化有关青霉素 S CH3R-CO-NH-HCCH C B A CH3 OC-N-CH COOH侧链:R-CO-母核:噻唑环 A,-内酰胺环 B青霉素的生物合成代谢调节代谢调节 细胞为维持正常的生理功能,细胞为维持正常的生理功能,它的组分、代谢物、能量和电子载它的组分、代谢物、能量和电子载体的合成大体上应保持恒定。当环体的合成大体上应保持恒定。当环境或细胞自身发生某种变化时,可境或细胞自身发生某种变化时,可以通过一定的反馈作用来达到平衡以通过一定的反馈作用来达到平衡生长,这种反馈作用即代谢调节。生长
17、,这种反馈作用即代谢调节。代谢调节的位点 DNA RNA 酶 底物 底物 产物 (营养物)(或中间物)底物进入,酶的活性,酶的合成代谢调节的本质:酶的调节酶合成的调节:诱导与阻遏酶合成的调节:诱导与阻遏基因水平基因水平酶活性的调节:反馈抑制酶活性的调节:反馈抑制蛋白质水平蛋白质水平适应现象例例1,大肠杆菌乳糖代谢:大肠杆菌乳糖代谢:半乳糖苷酶 乳糖-半乳糖+葡萄糖 E.coli生长于无乳糖培养基,半乳糖苷酶:3 分子/细胞 E.coli生长于含乳糖培养基,半乳糖苷酶:3000-5000 分子/细胞例例2,大肠杆菌色氨酸代谢:大肠杆菌色氨酸代谢:E.coli生长于无色氨酸培养基,合成色氨酸合成酶
18、,当色氨酸浓度增加时,色氨酸合成酶浓度下降。细胞需要某种酶时才合成,反映出细胞的自我调节机理。这种诱细胞需要某种酶时才合成,反映出细胞的自我调节机理。这种诱导物诱导可诱导酶的产生与辅抑物抑制可阻遏酶的产生的现象称适应导物诱导可诱导酶的产生与辅抑物抑制可阻遏酶的产生的现象称适应现象。现象。乳糖:诱导物诱导物(inducer)色氨酸:辅抑物辅抑物(corepressor)底物与诱导物底物不等于诱导物底物不等于诱导物对 半乳糖苷酶乳糖IPTG(异丙基硫代半乳糖苷)苯基半乳糖苷苯基硫代半乳糖苷作底物+-+-作诱导物+-乳糖操纵子 i P O Z Y A 调节基因 i:编码阻遏蛋白启动子 P:有CAP(
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