分子生物学第二章DNA结构与复制课件.ppt
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- 分子生物学 第二 DNA 结构 复制 课件
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1、核酸的结构及其功能核酸的结构及其功能 DNA-DNA-遗传的物质基础,基因是具有特定生遗传的物质基础,基因是具有特定生物功能的核苷酸序列,基因通过转录和翻译物功能的核苷酸序列,基因通过转录和翻译能够使亲代的性状准确地在子代表现出来。能够使亲代的性状准确地在子代表现出来。DNADNA的此种功能与其分子结构是密切相关。的此种功能与其分子结构是密切相关。Erwin Chargaff用纸层析技术分析用纸层析技术分析DNA的核苷酸组分:的核苷酸组分:(1)腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等,即腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等,即 A=T;(2)鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数也相等,即鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数也相等,即 G=
2、C;(3)含氨基的腺嘌呤和胞嘧啶总数等于含酮基的鸟嘌呤和胸腺含氨基的腺嘌呤和胞嘧啶总数等于含酮基的鸟嘌呤和胸腺 嘧啶总数,即嘧啶总数,即 A+C=T+G;(4)嘌呤的总数等于嘧啶的总数,即嘌呤的总数等于嘧啶的总数,即 A+G=C+T;所有所有DNA中碱基组成必定是中碱基组成必定是A=T,G=C,这一规律暗示,这一规律暗示A与与T,C与与G相互配对的可能性,为相互配对的可能性,为Watson和和Crick提出提出DNA双螺旋结构提供了重要依据。双螺旋结构提供了重要依据。该模型揭示了该模型揭示了DNADNA作为遗传物质的稳定性特征,作为遗传物质的稳定性特征,最有价值的是最有价值的是确认了碱基配对原
3、则,这是确认了碱基配对原则,这是DNADNA复制、复制、转录和反转录的分子基础,转录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表亦是遗传信息传递和表达的分子基础。达的分子基础。2.3 DNA的复制的复制 研究证明生命的遗传实际上是染色体研究证明生命的遗传实际上是染色体DNA自我复制的结自我复制的结果。而果。而DNA自我复制主要是通过半保留复制来实现的,是一自我复制主要是通过半保留复制来实现的,是一个以亲代个以亲代DNA分子为模板合成子代分子为模板合成子代DNA链的过程。即细胞链的过程。即细胞分裂时,通过分裂时,通过DNA自我复制将亲代细胞所含有遗传信息传递自我复制将亲代细胞所含有遗传信息传递到子代
4、细胞。到子代细胞。双链双链DNA的复制包括的复制包括 复制的起始复制的起始、延伸延伸和和终止终止三个阶段,三个阶段,并需要拓扑异构酶、解链酶、单链结合蛋白、引物合成酶、并需要拓扑异构酶、解链酶、单链结合蛋白、引物合成酶、DNA聚合酶及聚合酶及DNA连接酶等酶和蛋白质的参与。连接酶等酶和蛋白质的参与。Watson和和Crick提出提出DNA双螺旋结构模型的同时对其复制双螺旋结构模型的同时对其复制过程进行了探讨。过程进行了探讨。DNA在复制过程中碱基间的氢键首先断开,每条链分别作在复制过程中碱基间的氢键首先断开,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。为模板合成新链,产生互补的两条链。新合成
5、新合成2条条DNA链的核苷酸序列和亲代链的核苷酸序列和亲代DNA链完全相同。链完全相同。因此,因此,每子代分子的一条链来自亲代每子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合,另一条链则是新合成的,成的,DNA这种复制方式叫做这种复制方式叫做DNA的半保留复制。的半保留复制。氯化铯密度梯度离心法:氯化铯密度梯度离心法:由于由于15N-DNA分子的密度比普通分子的密度比普通DNA的密度大,在氯化铯密的密度大,在氯化铯密度梯度离心时,这两种度梯度离心时,这两种DNA分子形成位置不同的区带。分子形成位置不同的区带。结果证实:结果证实:无论原核还是真核生物无论原核还是真核生物DNADNA都是以半保留
6、复制方式遗传的都是以半保留复制方式遗传的 DNA复制时,双链复制时,双链DNA要解开成两股链分别进行,所以,要解开成两股链分别进行,所以,这个复制起始点呈现叉子的形式,被称为复制叉。这个复制起始点呈现叉子的形式,被称为复制叉。DNA的复的复制是由固定的起始位点开始的。制是由固定的起始位点开始的。复复 制制 子子是生物体是生物体DNA复制的基本单位,一个复制子只含复制的基本单位,一个复制子只含一个复制起始位点。一个复制起始位点。复制叉复制叉从复制起点开始沿着从复制起点开始沿着DNA链连续移动,起始点可以链连续移动,起始点可以启动单向复制或者双向复制,这主要取决于在复制起点形成一启动单向复制或者双
7、向复制,这主要取决于在复制起点形成一个还是两个复制叉。个还是两个复制叉。1.富含富含AT:测定细菌、酵母、线粒体和叶绿体:测定细菌、酵母、线粒体和叶绿体DNA中的复中的复制起始点核苷酸序列,发现复制起始点富含制起始点核苷酸序列,发现复制起始点富含AT序列,它可序列,它可能有利于能有利于DNA复制启动时双链的解开。复制启动时双链的解开。2.细菌、病毒和线粒体细菌、病毒和线粒体DNA分子只有一个复制起始点,即分子只有一个复制起始点,即只有一个复制子。只有一个复制子。3.真生物基因组真生物基因组DNA有多个复制起点,可以同时在多个复有多个复制起点,可以同时在多个复制起点上进行双向复制,其大小为制起点
8、上进行双向复制,其大小为40-100kb/个。个。放射性自显影法:对于大基因组内的放射性自显影法:对于大基因组内的不确定区域,两次连续的放射脉冲可以不确定区域,两次连续的放射脉冲可以用来标记复制的移动。如果一个脉冲比用来标记复制的移动。如果一个脉冲比另一个脉冲强,我们可以用相对的标记另一个脉冲强,我们可以用相对的标记强度来区分,这些可用放射自显影观察。强度来区分,这些可用放射自显影观察。单向复制:单向复制:在复制眼的一端,一种类型在复制眼的一端,一种类型的标记后紧跟着另一种标记;的标记后紧跟着另一种标记;双向复制:双向复制:在复制眼的两端产生一种在复制眼的两端产生一种(对称的)模式。在真核生物
9、中普遍存(对称的)模式。在真核生物中普遍存在。在。生物体内生物体内DNA双链的复制大都是以半保留方式双链的复制大都是以半保留方式进行的;但是不同生物进行的;但是不同生物DNA分子存在形式各不相同,分子存在形式各不相同,如大小、线性分子、环状分子、功能差异,因而反如大小、线性分子、环状分子、功能差异,因而反映在复制方式上的差异。绝大多数映在复制方式上的差异。绝大多数DNA复制是以复复制是以复制叉的形式进行的。制叉的形式进行的。线性线性DNA双链的复制双链的复制 研究表明研究表明DNA聚合酶还是聚合酶还是RNA聚合聚合酶都只从聚合聚合酶都只从5端向端向3端移动;体内端移动;体内DNA复制时,由一段
10、复制时,由一段RNA引物起始引物起始DNA合合成,起始后成,起始后RNA引物被切除,使子链短于母链。切除后的引物被切除,使子链短于母链。切除后的5端缺口如何合成?这就提出了线性端缺口如何合成?这就提出了线性DNA末端复制的问题。末端复制的问题。寿命缩短?寿命缩短?线性线性DNA末端复制的特殊机制末端复制的特殊机制(1)线性复制子转变为环状或多聚分子:)线性复制子转变为环状或多聚分子:T4噬菌体噬菌体DNA通通过其末端的简并性使不同链的过其末端的简并性使不同链的3端因互补而结合。端因互补而结合。DNA聚合酶聚合酶作用填满其缺口,再经作用填满其缺口,再经DNA连接酶作用生成二联体。连接酶作用生成二
11、联体。(2)DNA末端形成发夹式结构,是该分子没有游离的末端。末端形成发夹式结构,是该分子没有游离的末端。如草履虫线粒体如草履虫线粒体DNA。(1)-复制复制(2)滚环复制滚环复制(3)D-环复制环复制2.2.环状环状DNADNA的复制的复制(1)-复制复制 E.coli基因组的复制原点位于天冬酰胺合酶和基因组的复制原点位于天冬酰胺合酶和ATP合酶操纵子之间,合酶操纵子之间,全长全长=45 bp,称为,称为oriC。OriC富含富含AT,并含有多个短的重复序列,能够,并含有多个短的重复序列,能够被复制起始点结合蛋白所识别。复制的起始:被复制起始点结合蛋白所识别。复制的起始:涉及涉及DNA双链的
12、解旋和松双链的解旋和松开,形成两个方向相反的复制叉。前导链还是复制前,复制原点的核酸开,形成两个方向相反的复制叉。前导链还是复制前,复制原点的核酸序列被转录生成短的序列被转录生成短的RNA链,作为起始链,作为起始DNA复制的引物。复制的引物。(2)滚环复制()滚环复制(replication by rolling cycles structure)这是单向复制的一种特殊形式。这是单向复制的一种特殊形式。X174噬菌体由一个单链环噬菌体由一个单链环状状DNA组成,这条链称为正(组成,这条链称为正(+)链;合成的互补链称为负()链;合成的互补链称为负(-)链。双链体的复制以滚环复制方式进行。链。双
13、链体的复制以滚环复制方式进行。(3)D-环型(环型(D-loop):):这也是一种单向复制的特殊方式。这种方式首先在动物线粒体这也是一种单向复制的特殊方式。这种方式首先在动物线粒体DNA的复制中被发现。双链环在固定点解开进行复制。但两条链的合成是高的复制中被发现。双链环在固定点解开进行复制。但两条链的合成是高度不对称的,一条链上迅速合成出互补链,另一条链则成为游离的单链度不对称的,一条链上迅速合成出互补链,另一条链则成为游离的单链环(即环(即D-环)。环)。基因组基因组DNA是双链环状;复制起始区位于其遗传图的是双链环状;复制起始区位于其遗传图的84min附近;附近;OriC含有含有3个个13
14、bp和和4个个9bp的两个保守序列。复制起始后形成的两个复制叉沿着的两个保守序列。复制起始后形成的两个复制叉沿着整个基因组双向等速移动,整个基因组双向等速移动,DNA复制中间产物呈一个复制中间产物呈一个。研究证实多种蛋白质及酶参与研究证实多种蛋白质及酶参与DNA双链的解开过程。如拓双链的解开过程。如拓扑异构酶扑异构酶I、DNA解链酶及解链酶及SSB蛋白等。蛋白等。DNA helicase是经水解是经水解ATP获得能量来解开双链获得能量来解开双链DNA,大部分大部分DNA helicase沿着随后链模板沿着随后链模板5 3方向及沿着复制叉方向及沿着复制叉的前进而移动。的前进而移动。研究证明:研究
15、证明:Rep蛋白和特定的蛋白和特定的DNA解链酶分别在解链酶分别在DNA两条链两条链上协调作用,以解开双链上协调作用,以解开双链DNA。发现噬菌体发现噬菌体T4的的基因基因32蛋白蛋白可以在远低于解链温度时使可以在远低于解链温度时使双链双链DNA分开,并牢牢地结合在单链分开,并牢牢地结合在单链DNA上,后来发现许多上,后来发现许多生物中都有这类蛋白。生物中都有这类蛋白。原核生物:原核生物:SSB蛋白与蛋白与DNA结合时还表现协同效应,如第结合时还表现协同效应,如第1个个SSB蛋白结合蛋白结合DNA的能力为的能力为1,第,第2个个SSB蛋白的结合力可蛋白的结合力可达达103。真核生物。真核生物S
16、SB蛋白与单链蛋白与单链DNA结合时,不表现协同效结合时,不表现协同效应。应。SSB蛋白蛋白:保证被解链酶解开的保证被解链酶解开的ssDNA在复制完成之前能在复制完成之前能保持单链结构,保持单链结构,SSB蛋白以四聚体形式存在于复制叉处,他蛋白以四聚体形式存在于复制叉处,他没有解链作用。没有解链作用。DNA复制过程中,随着复制过程中,随着DNA解旋,双螺旋的盘绕数解旋,双螺旋的盘绕数T减减少,而超螺旋数少,而超螺旋数W增加,使正超螺旋增加,未解链部分的缠增加,使正超螺旋增加,未解链部分的缠绕更加紧密,形成的压力使解链不能继续进行。绕更加紧密,形成的压力使解链不能继续进行。DNA拓扑异构酶作用拓
17、扑异构酶作用 它能够消除解链造成的正超螺旋堆积,消除阻碍解链继它能够消除解链造成的正超螺旋堆积,消除阻碍解链继续进行的此种压力,使续进行的此种压力,使DNA复制得以延伸。复制得以延伸。研究发现:研究发现:所有所有DNA复制是由一个固定的起始位点开始;复制是由一个固定的起始位点开始;DNA聚合酶都只能延长已存在的聚合酶都只能延长已存在的DNA链,而不能从头链,而不能从头合成合成DNA链。链。问题:一个新链问题:一个新链DNA的复制怎样开始的呢?的复制怎样开始的呢?所有所有DNA聚合酶都从脱氧核苷酸聚合酶都从脱氧核苷酸3-OH端起始端起始DNA合合成,所以,成,所以,DNA复制时,由引发酶复制时,
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