第九章:原核生物基因表达调控课件.ppt
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1、第九章第九章 原核生物原核生物基因表达的调控基因表达的调控v基因表达调控就是对基因产物的合成进行控制的机制基因表达调控就是对基因产物的合成进行控制的机制.一个细胞可能仅含有一个细胞可能仅含有2020个拷贝乳糖操纵子阻遏蛋白,但个拷贝乳糖操纵子阻遏蛋白,但是它可能会需要超过是它可能会需要超过100 000100 000个拷贝的个拷贝的EF-EF-TuTu参与蛋白质的参与蛋白质的合成。合成。在另外一些情况下,单细胞有机体调控基因表达是为了在另外一些情况下,单细胞有机体调控基因表达是为了应答环境条件(例如,温度,渗透压或者是否存在某种应答环境条件(例如,温度,渗透压或者是否存在某种营养物质)的改变或
2、者细胞内部的生理状况(例如为细营养物质)的改变或者细胞内部的生理状况(例如为细胞分裂做准备)的变化。与细胞适应过程有关的酶或者胞分裂做准备)的变化。与细胞适应过程有关的酶或者蛋白质通常是不存在的,只有在需要的时候才被合成。蛋白质通常是不存在的,只有在需要的时候才被合成。v管家基因与奢侈基因管家基因与奢侈基因v基因表达基因表达表达是一个多步骤的过程,表达的产物是具有一定表达是一个多步骤的过程,表达的产物是具有一定功能的蛋白质。基因表达的每一环节以及表达产物的稳定性均功能的蛋白质。基因表达的每一环节以及表达产物的稳定性均可作为调控的位点,包括:可作为调控的位点,包括:基因被转录成初级转录产物基因被
3、转录成初级转录产物 初级转录产物被加工成成熟的初级转录产物被加工成成熟的mRNAmRNA的稳定性的稳定性mRNA的翻译的翻译多肽链的加工和组装多肽链的加工和组装酶或者蛋白质活性控制酶或者蛋白质活性控制蛋白质的降解蛋白质的降解9.1 9.1 转录水平的调控转录水平的调控正调控与负调控模式比较正调控与负调控模式比较 单顺反子与多顺反子单顺反子与多顺反子mRNA9.19.1.1.1 转录起始调控转录起始调控一、乳糖操纵子一、乳糖操纵子结构结构9.19.1.1.1.1.1 操纵子操纵子lacAlacA编码硫代半乳糖苷乙酰转移酶,该酶的作用是消除同编码硫代半乳糖苷乙酰转移酶,该酶的作用是消除同时被乳糖转
4、移酶转运到细胞内的硫代半乳糖苷对细胞造成时被乳糖转移酶转运到细胞内的硫代半乳糖苷对细胞造成的毒性。的毒性。乳糖操纵子的阻遏与诱导乳糖操纵子的阻遏与诱导 乳糖操纵子通常是关闭的。乳糖操纵子通常是关闭的。lacIlacI编码的阻遏蛋白以四聚体的形编码的阻遏蛋白以四聚体的形式与操纵基因结合,关闭三个结构基因的表达。式与操纵基因结合,关闭三个结构基因的表达。由于阻遏蛋白偶尔会脱离操纵子基因,所以操纵子的转录并非由于阻遏蛋白偶尔会脱离操纵子基因,所以操纵子的转录并非完全关闭,仍会有本底水平的表达,细胞内会有几个分子的完全关闭,仍会有本底水平的表达,细胞内会有几个分子的 半乳糖苷酶和透性酶。半乳糖苷酶和透
5、性酶。可诱导型操纵子使细菌能很好地适应环境的变化,有效地利用可诱导型操纵子使细菌能很好地适应环境的变化,有效地利用环境提供的底物。例如,当培养基中加有乳糖时,操纵子被诱环境提供的底物。例如,当培养基中加有乳糖时,操纵子被诱导开放,合成分解乳糖所需要的酶。当乳糖被消耗完后,细胞导开放,合成分解乳糖所需要的酶。当乳糖被消耗完后,细胞不再需要分解乳糖的酶,操纵子重新关闭。不再需要分解乳糖的酶,操纵子重新关闭。在研究工作中很少使用乳糖作为诱导剂,因为培养基中的乳糖在研究工作中很少使用乳糖作为诱导剂,因为培养基中的乳糖会被诱导合成的会被诱导合成的 半乳糖苷酶催化降解,其浓度不断发生变半乳糖苷酶催化降解,
6、其浓度不断发生变化。实验室里常使用人工合成的诱导物异丙基化。实验室里常使用人工合成的诱导物异丙基-D-D-硫代半硫代半乳糖苷(乳糖苷(IPTGIPTG),由于),由于IPTGIPTG不是不是 半乳糖苷酶的底物,不半乳糖苷酶的底物,不被降解,所以又称作安慰诱导物。被降解,所以又称作安慰诱导物。葡萄糖对葡萄糖对laclac操纵子表达的影响操纵子表达的影响葡萄糖是细菌优先利用的糖类。当葡萄糖和其他糖类(比如乳葡萄糖是细菌优先利用的糖类。当葡萄糖和其他糖类(比如乳糖)同时存在时,细菌只利用葡萄糖而不代谢别的糖类,这种糖)同时存在时,细菌只利用葡萄糖而不代谢别的糖类,这种现象称为分解代谢物阻遏(现象称为
7、分解代谢物阻遏(catabolitecatabolite repression repression)。因此,)。因此,乳糖操纵子只有在乳糖存在,同时葡萄糖缺乏时才会高水平表乳糖操纵子只有在乳糖存在,同时葡萄糖缺乏时才会高水平表达。原因是乳糖操纵子除了受阻遏蛋白的调节,还要受到分解达。原因是乳糖操纵子除了受阻遏蛋白的调节,还要受到分解代谢活化子蛋白(代谢活化子蛋白(catabolic activator proteincatabolic activator protein,CAPCAP)的调)的调节。节。CAPCAP能够与能够与cAMPcAMP结合形成一个二聚体,所以结合形成一个二聚体,所以C
8、APCAP又称为又称为cAMPcAMP受体受体蛋白(蛋白(cAMPcAMP receptor protein receptor protein,CRPCRP)。)。cAMPcAMP-CRP-CRP二聚体能够二聚体能够结合到启动子的上游识别位点上,通过募集结合到启动子的上游识别位点上,通过募集RNARNA聚合酶激活乳糖聚合酶激活乳糖操纵子的转录。操纵子的转录。P Placlac不是强启动子,它没有典型的不是强启动子,它没有典型的3535序列。为序列。为了实现高水平的转录,了实现高水平的转录,laclac操纵子需要操纵子需要cAMPcAMP-CRP-CRP复合物的激活作复合物的激活作用。激活蛋白通
9、常结合在启动子的上游协助用。激活蛋白通常结合在启动子的上游协助RNARNA聚合酶与启动子聚合酶与启动子结合。与之相反,阻遏蛋白结合在启动子的下游,阻止结合。与之相反,阻遏蛋白结合在启动子的下游,阻止RNARNA聚合聚合酶与启动子结合,或者阻止酶与启动子结合,或者阻止RNARNA聚合酶向前移动,转录基因。聚合酶向前移动,转录基因。乳糖操纵子的四种调控形式乳糖操纵子的四种调控形式 二、阿拉伯糖操纵子二、阿拉伯糖操纵子 大肠杆菌阿拉伯糖操纵子大肠杆菌阿拉伯糖操纵子的编码产物与阿拉伯糖的利用有关。的编码产物与阿拉伯糖的利用有关。与乳糖操纵子一样,阿拉伯糖操纵子也属于可诱导型,操纵子与乳糖操纵子一样,阿
10、拉伯糖操纵子也属于可诱导型,操纵子通常情况下是关闭的,只有当环境中存在阿拉伯糖时,操纵子通常情况下是关闭的,只有当环境中存在阿拉伯糖时,操纵子才开放,合成相应的酶参与阿拉伯糖分解代谢。才开放,合成相应的酶参与阿拉伯糖分解代谢。v当没有阿拉伯糖存在时,不需要当没有阿拉伯糖存在时,不需要araBAD表达,表达,AraC作为作为负调控蛋白,以二聚体的形式同时与负调控蛋白,以二聚体的形式同时与araO2和和araI1结合,导结合,导致致DNA环化,阻止环化,阻止araBAD的表达。的表达。v当有阿拉伯糖存在时,阿拉伯糖与当有阿拉伯糖存在时,阿拉伯糖与AraC结合,导致其构象结合,导致其构象发生变化,二
11、聚体优先与发生变化,二聚体优先与araI1和和araI2结合,这个时候如果没结合,这个时候如果没有葡萄糖存在,有葡萄糖存在,AraC和和cAMP-CRP共同促进共同促进RNA聚合酶与聚合酶与PBAD结合,起始转录。结合,起始转录。v由于由于AraC对转录有激活作用,所以删除对转录有激活作用,所以删除araC后,阿拉伯糖后,阿拉伯糖操纵子一直处于关闭状态,即便有阿拉伯糖的存在,也是如操纵子一直处于关闭状态,即便有阿拉伯糖的存在,也是如此。此。vAraC也可以进行自然调控,当细胞内也可以进行自然调控,当细胞内AraC的水平升高时,的水平升高时,AraC与与araO1结合,抑制自结合,抑制自araP
12、c开始的转录。开始的转录。三、半乳糖操纵子三、半乳糖操纵子 gal操纵子有三个结构基因操纵子有三个结构基因-galE,galT和和galK,它们编码的酶,它们编码的酶参与半乳糖代谢,这三个基因被转录成一条多顺反子参与半乳糖代谢,这三个基因被转录成一条多顺反子mRNAmRNA。这三个结构基因分别编码半乳糖表异构酶、半乳糖转移酶和这三个结构基因分别编码半乳糖表异构酶、半乳糖转移酶和半乳糖激酶半乳糖激酶 。半乳糖半乳糖 +ATP +ATP 半乳糖半乳糖1-1-磷酸磷酸 +ADP+H+ADP+H+半乳糖半乳糖1-1-磷酸磷酸 +UDPGluUDPGlu UDPGalUDPGal+葡萄糖葡萄糖1-1-磷
13、酸磷酸UDPGalUDPGal UDPGluUDPGlu以上三个反应式的总反应是:以上三个反应式的总反应是:半乳糖半乳糖 +ATP +ATP 葡萄糖葡萄糖1-1-磷酸磷酸 +ADP+H+ADP+H+半乳糖激酶半乳糖激酶半乳糖转移酶半乳糖转移酶半乳糖表异构酶半乳糖表异构酶v无葡萄糖,有半乳糖时,促进从无葡萄糖,有半乳糖时,促进从P1起始的转录,合成代谢起始的转录,合成代谢半乳糖的酶,为细胞的生长提供碳源和能源。但是,抑制从半乳糖的酶,为细胞的生长提供碳源和能源。但是,抑制从P2起始的转录起始的转录。v有葡萄糖时,从有葡萄糖时,从P2起始转录低水平转录,合成的半乳糖表起始转录低水平转录,合成的半乳
14、糖表异构酶将异构酶将UDPGlu 转换成转换成UDPGal,为细胞壁的合成提供材,为细胞壁的合成提供材料料。v两个阻遏蛋白分子分别结合于两个阻遏蛋白分子分别结合于OE和和OI,它们之间的相互作,它们之间的相互作用导致它们之间的用导致它们之间的DNA弯曲成环,启动子就位于该弯曲成环,启动子就位于该DNA环上。环上。DNA的环化阻止了的环化阻止了RNA聚合酶起始转录。聚合酶起始转录。v如果阻遏蛋白只与如果阻遏蛋白只与OE结合,则会促进由结合,则会促进由P2的转录。的转录。四、色氨酸操纵子四、色氨酸操纵子 在一些操纵子中,阻遏蛋白自身并不能与操纵基因结合,它们在一些操纵子中,阻遏蛋白自身并不能与操纵
15、基因结合,它们需要首先与称作辅阻遏物需要首先与称作辅阻遏物(corepressorcorepressor)的小分子物质结合后才的小分子物质结合后才能与操纵基因结合,关闭结构基因的转录。这种类型的操纵子能与操纵基因结合,关闭结构基因的转录。这种类型的操纵子为可阻遏型,它们平时处于开启状态,由于合成产物的积累而为可阻遏型,它们平时处于开启状态,由于合成产物的积累而将其关闭。在大肠杆菌中,参与很多将其关闭。在大肠杆菌中,参与很多氨基酸和维生素氨基酸和维生素合成的酶合成的酶的表达就是以这种方式受到调控的。色氨酸操纵子属于可阻遏的表达就是以这种方式受到调控的。色氨酸操纵子属于可阻遏型,作为辅阻遏物的是色
16、氨酸型,作为辅阻遏物的是色氨酸。五、全局调控五、全局调控受一种调节蛋白调控的一组基因或操纵子称为调节子(受一种调节蛋白调控的一组基因或操纵子称为调节子(regulonregulon),),这些基因或操纵子可以位于一条染色体的不同位置上。这些基因或操纵子可以位于一条染色体的不同位置上。乳糖操纵子乳糖操纵子阿拉伯糖操纵子阿拉伯糖操纵子半乳糖操纵子半乳糖操纵子9.19.1.1.2 .1.2 不同不同 因子对转录的调控因子对转录的调控一、热激蛋白的表达一、热激蛋白的表达v大肠杆菌的最适生长温度是大肠杆菌的最适生长温度是37。当温度上升至。当温度上升至46时,时,大肠杆菌几乎停止生长。在大肠杆菌几乎停止
17、生长。在46下细胞合成的蛋白质大约下细胞合成的蛋白质大约30为一组相当保守的热激蛋白(为一组相当保守的热激蛋白(heat shock protein,HSP)。)。很多热激蛋白是分子伴侣(很多热激蛋白是分子伴侣(molecular chaperones)和蛋白酶。)和蛋白酶。分子伴侣的作用是介导蛋白质正确折叠;蛋白酶的作用则是分子伴侣的作用是介导蛋白质正确折叠;蛋白酶的作用则是降解受到热损伤而又不能修复的蛋白质。降解受到热损伤而又不能修复的蛋白质。v热激蛋白的表达调控主要发生在转录水平上。热激蛋白基热激蛋白的表达调控主要发生在转录水平上。热激蛋白基因的启动子被因的启动子被32而不是通常的而不是
18、通常的70识别。识别。32也不能识别也不能识别70启启动子,因为这两种动子,因为这两种因子识别的启动子序列不一样因子识别的启动子序列不一样vHSP的诱导合成是由于细胞内的的诱导合成是由于细胞内的32水平瞬间升高引起的。水平瞬间升高引起的。在热激条件下,在热激条件下,32的合成会增加,热激诱导的合成会增加,热激诱导32合成发合成发生在翻译水平。生在翻译水平。另一方面,在热激条件下另一方面,在热激条件下32的稳定性也增加了。的稳定性也增加了。二、枯草杆菌的孢子形成过程中的级联调控二、枯草杆菌的孢子形成过程中的级联调控芽孢的形成与释放芽孢的形成与释放 芽孢形成过程中的芽孢形成过程中的因子激活级联因子
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