《生物化学酶》课件.ppt
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1、第六章 酶第一节第一节 概述概述第二节第二节 酶的命名与分类酶的命名与分类第三节第三节 酶分子的组成与结构酶分子的组成与结构第四节第四节 酶催化作用的机制酶催化作用的机制第五节第五节 酶促反应动力学酶促反应动力学第七节第七节 酶工程简介酶工程简介本本本 课课课 件件件 由由由 西西西 华华华 大大大 学学学 生生生 物物物 工工工 程程程 学学学 院院院 车车车 振振振 明明明 制制制 作作作 第一节第一节 概述概述1.1.概念:酶(概念:酶(EnzymeEnzyme):):是生物活细是生物活细胞产生的,以蛋白质为主要成分的生胞产生的,以蛋白质为主要成分的生物催化剂。物催化剂。2.2.生物催化
2、剂生物催化剂一、酶是生物催化剂一、酶是生物催化剂3.3.胞外酶与胞内酶胞外酶与胞内酶 酶虽是由细胞产生的酶虽是由细胞产生的,但并非必须在但并非必须在细胞内才能起作用细胞内才能起作用,有些酶被分泌到细有些酶被分泌到细胞外才发生作用。这类酶称胞外才发生作用。这类酶称“胞外胞外酶酶”。大部分酶在细胞内起催化作用。大部分酶在细胞内起催化作用称为称为“胞内酶胞内酶”。(一)酶的定义(一)酶的定义(二)酶的化学本质(二)酶的化学本质1.1.酶是蛋白质酶是蛋白质19261926年年SumnerSumner第一次从刀豆种子中提第一次从刀豆种子中提取了脲酶结晶,证明其具有蛋白质性取了脲酶结晶,证明其具有蛋白质性
3、质。质。3030年代,年代,NorthropNorthrop又分离出结晶又分离出结晶的胃蛋白酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白的胃蛋白酶、胰蛋白酶及胰凝乳蛋白酶,证明酶的化学本质是蛋白质。酶,证明酶的化学本质是蛋白质。v酶具有蛋白质的特性如:两性解离、酶具有蛋白质的特性如:两性解离、胶体性质、加热使酶变性、颜色反应胶体性质、加热使酶变性、颜色反应等;等;v酶可以被蛋白酶水解而丧失活性;酶可以被蛋白酶水解而丧失活性;v许多酶的氨基酸顺序已被测定;许多酶的氨基酸顺序已被测定;v19691969年人工合成了牛胰核糖核酸酶。年人工合成了牛胰核糖核酸酶。2 2、RibozymeRibozyme的化学本质是的化学本
4、质是RNARNA在已鉴定过的数千种酶中,绝大多数在已鉴定过的数千种酶中,绝大多数酶的化学本质是蛋白质。但在酶的化学本质是蛋白质。但在19821982年,年,美国科学家美国科学家T.T.CechCech发现原生动物四膜发现原生动物四膜虫的虫的2626SrRNASrRNA前体具有自我拼接的催前体具有自我拼接的催化活性。化活性。T.T.CechCech将这种将这种RNARNA命名为命名为“RibozymeRibozyme”。核酶(核酶(RibozymeRibozyme ):):指对指对RNARNA具有具有催化活性的催化活性的RNA RNA。二、酶的作用特点二、酶的作用特点(一)与无机催化剂相比,有如
5、下共(一)与无机催化剂相比,有如下共同点:同点:v反应前后都不发生数量和质量变化;反应前后都不发生数量和质量变化;v能加快反应速度能加快反应速度,但不改变反应的平但不改变反应的平衡点;衡点;v从热力学上看从热力学上看,只能催化热力学上允只能催化热力学上允许进行的反应;许进行的反应;v都能降低反应所需的都能降低反应所需的活化能活化能。活化能活化能:在一定温在一定温度下,度下,1 1molmol底物底物全部进入全部进入活化状态活化状态所需的自所需的自由能,单由能,单位位J/molJ/mol。E+SP+EES能能量量水水平平反应过程反应过程 G E1 E2S本本本课课课件件件由由由西西西华华华大大大
6、学学学生生生物物物工工工程程程学学学院院院车车车振振振明明明制制制作作作 (二)酶的作用特点(二)酶的作用特点极高的催化效率极高的催化效率高度的专一性高度的专一性 易失活(蛋白质变性)易失活(蛋白质变性)活性可调控(激活、抑制)活性可调控(激活、抑制)常需辅助因子(辅酶、辅基等)常需辅助因子(辅酶、辅基等)继续继续 反应速度与不加催化剂相比可提反应速度与不加催化剂相比可提高高10108 810102020,与加普通催化剂相比可,与加普通催化剂相比可提高提高10107 710101313.1.1.极高的催化效率极高的催化效率NH2COH2ONH2CO2+2NH3脲酶脲酶FeFe粉粉脲酶的催化效率
7、比脲酶的催化效率比FeFe粉高粉高10101515倍。倍。返返 回回2.2.高度的专一性高度的专一性一种酶只能作用于某一类或某种特定一种酶只能作用于某一类或某种特定的物质,这种性质称为酶的专一性。的物质,这种性质称为酶的专一性。(1 1)结构专一性结构专一性 概念:酶对所催化的分子化学结构的特概念:酶对所催化的分子化学结构的特殊要求和选择。殊要求和选择。类别:类别:绝对专一性和绝对专一性和相对专一性相对专一性(2 2)立体异构专一性立体异构专一性 概念:酶除了对底物分子的化学结构有概念:酶除了对底物分子的化学结构有要求外,对其立体异构也有一定的要求要求外,对其立体异构也有一定的要求 类别:类别
8、:旋光异构专一性和几何异构专一旋光异构专一性和几何异构专一性性 绝对专一性绝对专一性:有些酶只作用于一:有些酶只作用于一种底物,催化一个反应,种底物,催化一个反应,而不作用于而不作用于任何其它物质。任何其它物质。如:过氧化氢酶底物:过氧化氢如:过氧化氢酶底物:过氧化氢 琥珀酸脱氢酶底物:琥珀酸琥珀酸脱氢酶底物:琥珀酸 相对专一性相对专一性:这类酶对结构相近:这类酶对结构相近的一类底物都有作用。包括键专一性的一类底物都有作用。包括键专一性和基团专一性。和基团专一性。基团专一性:基团专一性:化学键化学键 键一端的基团键一端的基团a-a-葡萄糖苷酶葡萄糖苷酶 a-a-糖苷键糖苷键 糖苷键的一端是葡萄
9、糖糖苷键的一端是葡萄糖底物:麦芽糖、蔗糖底物:麦芽糖、蔗糖键专一性:只要求作用于一定的化学键专一性:只要求作用于一定的化学键,而对键两端的基团无严格的要求。键,而对键两端的基团无严格的要求。返返 回回 旋光异构专一性旋光异构专一性:当底物具有旋:当底物具有旋光异构体时一酶只能作用于其中的一光异构体时一酶只能作用于其中的一种。种。如:如:L-AAL-AA氧化酶只能催化氧化酶只能催化L-AAL-AA氧化,氧化,而对而对D-AAD-AA无作用。无作用。顺反异构专一性顺反异构专一性:对具有顺式和:对具有顺式和反式异构的底物具严格的选择性。反式异构的底物具严格的选择性。本本本课课课件件件由由由西西西华华
10、华大大大学学学生生生物物物工工工程程程学学学院院院车车车振振振明明明制制制作作作 返返 回回消化道内几消化道内几种蛋白酶的种蛋白酶的专一性专一性第二节第二节 酶的分类和命名酶的分类和命名一、酶的分类一、酶的分类 国际国际E E学委员会制定的学委员会制定的“国际系统国际系统分类法分类法”将酶促反应分为六大类将酶促反应分为六大类:1.1.氧化还原酶氧化还原酶:催化氧化还原反应的酶催化氧化还原反应的酶。本本本课课课件件件由由由西西西华华华大大大学学学生生生物物物工工工程程程学学学院院院车车车振振振明明明制制制作作作 CH3CHCOOHOHNAD+H+CH3CCOOHONADH乳酸脱氢酶催化乳酸的脱氢
11、反应乳酸脱氢酶催化乳酸的脱氢反应 2.2.转移酶转移酶:催化基团转移反应,:催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。到另一个底物的分子上。例如,例如,谷丙转氨酶催化的氨基转谷丙转氨酶催化的氨基转移反应:移反应:CH3CHCOOHNH2HOOCCH2CH2CCOOHOHOOCCH2CH2CHCOOHNH2CH3CCOOHO 3.3.水解酶水解酶:催化:催化催化底物的加水催化底物的加水分解反应。分解反应。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。酶及脂酶等。例如,脂肪酶催化的脂的水解反例如,脂肪酶催化的脂的水
12、解反应:应:H2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OH 4.4.裂合酶裂合酶:催化从底物上移去某:催化从底物上移去某些基团而形成双键的非水解性反应及些基团而形成双键的非水解性反应及其逆反应的酶。其逆反应的酶。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。酶等。例如,例如,延胡索酸水合酶催化的延胡索酸水合酶催化的反应。反应。HOOCCH=CHCOOHH2OHOOCCH2CHCOOHOH 5.5.异构酶异构酶:催化同分异构体的相:催化同分异构体的相互转变,互转变,即底物分子内基团或原子的即底物分子内基团或原子的重排过程重排过程的酶。的酶。例如,例如,6-6-磷酸葡萄糖异构
13、酶催化磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。的反应。OCH2OHOHOHOHOHOCH2OHCH2OHOHOHOH6-6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖6-6-磷酸果糖磷酸果糖 6.6.合成酶合成酶:又称为连接酶,能够又称为连接酶,能够催化催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形键的形成反应。这类反应必须与成反应。这类反应必须与ATPATP分解反分解反应相互偶联。应相互偶联。如:如:GlnGln合成酶合成酶,丙酮酸羧化酶。丙酮酸羧化酶。A+B+ATP AB+ADP+PiA+B+ATP AB+ADP+Pi酶的编号:酶的编号:ECEC、类、亚类、亚亚类、顺序号类、亚类、亚亚类、顺
14、序号类:表示反应性质,前面所述的六大类:表示反应性质,前面所述的六大 类;类;亚类:表示反应性质:如第一类中的亚类:表示反应性质:如第一类中的 氧化、脱氢;氧化、脱氢;亚亚类:表示作用键的类型或受体;亚亚类:表示作用键的类型或受体;顺序号:表示底物。顺序号:表示底物。国际酶学委员会标志国际酶学委员会标志如:如:1 1大类大类1 1亚类中的亚亚类表示受体的类亚类中的亚亚类表示受体的类型:型:1.11.11 1表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于=CHOHCHOH基基 团,受体是团,受体是NAD+NAD+,NADP+NADP+,1.11.12 2表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于
15、=CHOHCHOH基基 团,受体是细胞色素团,受体是细胞色素 ,1.11.13 3表示氧化还原酶,作用于表示氧化还原酶,作用于=CHOHCHOH基基 团,受体是分子氧团,受体是分子氧 。当酶的编号仅有前三个数字时,就已当酶的编号仅有前三个数字时,就已清楚地表明了这个酶的特性:反应性质、清楚地表明了这个酶的特性:反应性质、反应物反应物(或底物或底物)性质、键的类型。性质、键的类型。关于编号第四个则没有什么特殊规定,关于编号第四个则没有什么特殊规定,只表示底物不同。例如:只表示底物不同。例如:EC1.1EC1.11.27 1.27 为乳酸为乳酸:NADNAD+氧化还原酶。氧化还原酶。EC1.1EC
16、1.11.37 1.37 为苹果酸为苹果酸:NADNAD+氧化还原酶。氧化还原酶。EC1.1EC1.11.1 1.1 为乙醇为乙醇 :NADNAD+氧化还原酶氧化还原酶。EC6.1EC6.11.1 1.1 为为L-L-酪氨酸酪氨酸:tRNAtRNA-连接酶连接酶(AMP)AMP)第三个第三个1 1表示作用在表示作用在-CHOHCHOH基团上,受基团上,受体体NADNAD+,第第4 4个数字表示底物不同。个数字表示底物不同。二、酶的命名酶的命名 1.1.习惯命名法习惯命名法底物名称底物名称 脲酶、淀粉酶、蛋白酶脲酶、淀粉酶、蛋白酶反应性质反应性质 脱氢酶、加氧酶、转氨酶脱氢酶、加氧酶、转氨酶两者
17、结合两者结合 琥珀酸脱氢酶、谷丙转氨酶琥珀酸脱氢酶、谷丙转氨酶酶的来源酶的来源 胃蛋白酶、木瓜蛋白酶胃蛋白酶、木瓜蛋白酶 2.2.国际系统命名法国际系统命名法 底物底物1 1:底物:底物2 2 反应类型反应类型 如:琥珀酸:如:琥珀酸:FADFAD氧化还原酶氧化还原酶返返 回回第三节第三节 酶的组成与结构酶的组成与结构一、酶的组成一、酶的组成按化学成分酶分为:单纯酶和结合酶按化学成分酶分为:单纯酶和结合酶1.1.单纯酶单纯酶:只由蛋白质组成,如脲酶、:只由蛋白质组成,如脲酶、淀粉酶、蛋白酶。淀粉酶、蛋白酶。2.2.结合酶结合酶:除蛋白质外,还有对热稳:除蛋白质外,还有对热稳定的非蛋白小分子物质
18、,称定的非蛋白小分子物质,称辅因子辅因子。辅因子:辅酶、辅基、金属离子辅因子:辅酶、辅基、金属离子 辅酶:辅酶:与酶蛋白结合疏松,与酶蛋白结合疏松,用透析法可以除去用透析法可以除去 辅基:辅基:与酶蛋白结合紧密,与酶蛋白结合紧密,不能用透析法除去不能用透析法除去 小分子有机化合物小分子有机化合物本本本课课课件件件由由由西西西华华华大大大学学学生生生物物物工工工程程程学学学院院院车车车振振振明明明制制制作作作 往往是由维生素参与形成的小分子有机物。往往是由维生素参与形成的小分子有机物。金属离子:与酶蛋白结合,有的紧,有的松金属离子:与酶蛋白结合,有的紧,有的松二、酶的结构二、酶的结构(一)酶的结
19、构与蛋白质的结构相同,(一)酶的结构与蛋白质的结构相同,是具有一定空间结构的蛋白质。是具有一定空间结构的蛋白质。(二)根据酶蛋白的结构特点,酶可(二)根据酶蛋白的结构特点,酶可分为:分为:1.1.单体酶单体酶:只有一条多肽链只有一条多肽链,分子量分子量在在13,000-35,00013,000-35,000之间,一般是水解之间,一般是水解酶酶,如蛋白酶、羧肽酶。如蛋白酶、羧肽酶。2.2.寡聚酶:由两个或两个以上的亚基寡聚酶:由两个或两个以上的亚基组成组成,亚基之间由非共价键相连,亚亚基之间由非共价键相连,亚基可以是相同的基可以是相同的,也可以是不同的,也可以是不同的,分子量在分子量在35,00
20、0-35,000-几百万,如丙酮酸几百万,如丙酮酸激酶、乳酸脱氢酶。激酶、乳酸脱氢酶。3.3.多酶复合体:由几个酶有组织的聚多酶复合体:由几个酶有组织的聚集在一起集在一起,功能上相互配合,第一个酶功能上相互配合,第一个酶的产物是第二个酶的底物,如丙酮酸的产物是第二个酶的底物,如丙酮酸脱氢酶、脂肪酸合成酶。脱氢酶、脂肪酸合成酶。三、酶的活性中心三、酶的活性中心(一)与催化作用相关的结构特点(一)与催化作用相关的结构特点酶的活性中心酶的活性中心:指酶分子中直接和底:指酶分子中直接和底物结合,并和酶催化作用直接有关的物结合,并和酶催化作用直接有关的部位。部位。必需基团与调控部位必需基团与调控部位:参
21、与构成酶的:参与构成酶的活性中心和维持酶的特定构象所必需活性中心和维持酶的特定构象所必需的基团,包括活性中心基团及维持活的基团,包括活性中心基团及维持活性中心的基团。性中心的基团。活性中心活性中心结合部位结合部位催化部位催化部位与底物结合,决与底物结合,决定酶的专一性定酶的专一性底物的敏感键在此处断裂而形成新键,底物的敏感键在此处断裂而形成新键,决定酶的高效性决定酶的高效性返返 回回酶分子酶分子必需基团必需基团其它部分(非必需基团)其它部分(非必需基团)活性中心活性中心维持活性中心的必需基团维持活性中心的必需基团结合部位结合部位催化部位催化部位调控部位调控部位酶分子中存在着一些可以酶分子中存在
22、着一些可以与其他分子发生某种程度与其他分子发生某种程度的结合的部位,从而引起的结合的部位,从而引起酶分子空间构象的变化,酶分子空间构象的变化,对酶起激活或抑制作用对酶起激活或抑制作用(二)酶活性中心的形成(二)酶活性中心的形成酶蛋白多肽链经过盘绕折叠形成特定酶蛋白多肽链经过盘绕折叠形成特定的空间结构,使相关的的空间结构,使相关的AAAA形成微区。形成微区。AspHisSer活性中心重要基团活性中心重要基团:His57,Asp102,Ser195胰凝乳蛋白酶的活性中心胰凝乳蛋白酶的活性中心为为Tyr 248为为Arg 145为为Glu 270为底物为底物羧羧肽肽酶酶活活性性中中心心示意图示意图(
23、三)酶活性中心的结构特征(三)酶活性中心的结构特征1.1.活性中心是活性中心是酶酶分子表面的一个凹穴,分子表面的一个凹穴,一定的大小和特殊的构象,在与底物一定的大小和特殊的构象,在与底物接触时表现一定的柔性。接触时表现一定的柔性。X-Y2.2.构成活性中心的大多数构成活性中心的大多数AAAA残基为疏残基为疏水性的,使此小区形成一个非极性的水性的,使此小区形成一个非极性的微环境,有利于与底物作用。在活性微环境,有利于与底物作用。在活性中心内仅有少数极性中心内仅有少数极性AAAA残基以其功能残基以其功能基团直接与底物作用。基团直接与底物作用。活性中心的活性中心的AAAA在一级结构上相距很远,在一级
24、结构上相距很远,甚至不在一条肽链上,但在三级结构甚至不在一条肽链上,但在三级结构上比较靠近。上比较靠近。X-Y胰凝乳蛋白酶的活性中心胰凝乳蛋白酶的活性中心3.3.在活性中心,底物以弱键与酶结在活性中心,底物以弱键与酶结合(有利于产物形成)。合(有利于产物形成)。(四)酶原(四)酶原1.1.酶原酶原:某些酶在细胞内合成或初分:某些酶在细胞内合成或初分泌时没有催化活性,这种无活性状态泌时没有催化活性,这种无活性状态的酶前身物称为酶原。的酶前身物称为酶原。2.2.酶原激活酶原激活:酶原变成酶的过程(切:酶原变成酶的过程(切去几个去几个AAAA的肽段)。的肽段)。实质:酶活性中心的形成或暴露过程。实质
25、:酶活性中心的形成或暴露过程。本本本课课课件件件由由由西西西华华华大大大学学学生生生物物物工工工程程程学学学院院院车车车振振振明明明制制制作作作 返返 回回第四节第四节 酶的作用机制酶的作用机制一一.酶催化作用的本质:酶催化作用的本质:降低反应活化能降低反应活化能。E+SP+EES能能量量水水平平反应过程反应过程 G E1 E2S本本本 课课课 件件件 由由由 西西西 华华华 大大大 学学学 生生生 物物物 工工工 程程程 学学学 院院院 车车车 振振振 明明明 制制制 作作作 (二)中间产物学说(二)中间产物学说酶降低活化酶降低活化能的原因能的原因EPESSEkk21 1k 酶(酶(E E)
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