分子生物学染色体与DNA课件.ppt
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- 分子生物学 染色体 DNA 课件
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1、第二章 染色体与DNAn 染色体n DNA的结构n DNA的复制n DNA的修复n DNA的转座1ppt课件.分子生物学研究已经证实分子生物学研究已经证实DNA控制了生物的性状遗传。无论控制了生物的性状遗传。无论DNA或或RNA,都是由许许多多个,都是由许许多多个核苷酸核苷酸连接而成的生物大分子,而每个核连接而成的生物大分子,而每个核苷酸又由苷酸又由磷酸磷酸、核糖核糖和和碱基碱基3部分组部分组成。成。2ppt课件.图图2-1 核苷酸核苷酸的组成与结构。核苷的的组成与结构。核苷的5位和位和3位都可能与磷酸基团相连。位都可能与磷酸基团相连。3ppt课件.2.1 染色体(Chromosome)内容提
2、要:染色体概述染色体与染色质染色体的结构和组成(原核生物、真核生物)核小体原核生物和真核生物基因组结构特点比较 4ppt课件.2.1 染色体2.1.1染色体染色体遗传物质的主要载体染色遗传物质的主要载体染色体在遗传上起着主要作用体在遗传上起着主要作用,因为亲代能因为亲代能够将自己的遗传物质以够将自己的遗传物质以染色染色体体(chromosome)的形式传给子代,保持的形式传给子代,保持了物种的稳定性和连续性。了物种的稳定性和连续性。5ppt课件.In the first phase of mitosis the chromatin fibers condense into chromosome
3、s.6ppt课件.Chromosomesconsisting of twoIdentical chromatids7ppt课件.染色体染色体包括包括DNA和和蛋白蛋白两两大部分。同一物种内每条染色大部分。同一物种内每条染色体所带体所带DNA的量是一定的,但的量是一定的,但不同染色体或不同物种之间变不同染色体或不同物种之间变化很大,人化很大,人X染色体有染色体有1.28亿亿个核苷酸对,而个核苷酸对,而Y染色体只有染色体只有0.19亿个核苷酸对。亿个核苷酸对。8ppt课件.人类人类22对对染色体及染色体及性染色体性染色体显微结构显微结构图图9ppt课件.2.1.1染色体概述染色体概述10ppt课件
4、.襻平均含襻平均含40kb DNA40kb DNA,襻在基部被,襻在基部被固定,襻的双链固定,襻的双链DNADNA被未知的各种被未知的各种碱性蛋白质压缩碱性蛋白质压缩(1)原核生物(prokaryote)E.coli 2.4109 Da,42000 Kb(1300微米),闭合环状,约编码2000个基因。E.coli的类核由支架(scafford)和向四周伸出的100个DNA环组成,支架的形状因染色体而异,长度为3-5m,支架是含RNA和蛋白质的复合结构,四周的每个环就是一个独立的功能区,长40Kb,13m。11ppt课件.Bacterial DNA is compacted in a stru
5、cture called the nucleoid,which occupies a large fraction of the bacterial cells volume 12ppt课件.拟核拟核(nucleoid)是原核细胞含基因组的区域。是原核细胞含基因组的区域。DNA同蛋同蛋白质结合并没有被膜包住。白质结合并没有被膜包住。染色体染色体(chromosome)是细胞在有丝分裂时遗传物质是细胞在有丝分裂时遗传物质存在的特定形式,是间期细胞染色质结构紧密包装的结存在的特定形式,是间期细胞染色质结构紧密包装的结果。是基因组的一个分立单元并携带很多基因。果。是基因组的一个分立单元并携带很多基因
6、。真核生物的染色体在细胞生活周期的大部分时间里都是真核生物的染色体在细胞生活周期的大部分时间里都是以染色质的形式存在的。以染色质的形式存在的。染色质染色质(chromatin)是一种纤维状结构,叫做染色质丝,是一种纤维状结构,叫做染色质丝,它是由最基本的单位它是由最基本的单位核小体核小体(nucleosome)成串排列而成串排列而成的。它是间期期间,细胞核成的。它是间期期间,细胞核DNA及与其连接的蛋白质及与其连接的蛋白质的状态。的状态。13ppt课件.(2)染色体形态14ppt课件.2.1.2 真核细胞染色体的组成真核细胞染色体的组成作为遗传物质,染色体具有如下征:分子结构相对稳定分子结构相
7、对稳定;能够能够自我复制自我复制,使亲子代之间保,使亲子代之间保持连续性;持连续性;能够能够指导蛋白质的合成指导蛋白质的合成,从而控,从而控制整个生命过程;制整个生命过程;能够能够产生可遗传的变异产生可遗传的变异。15ppt课件.16ppt课件.17ppt课件.18ppt课件.Mitotic chromosome(有丝分裂期的染色体)19ppt课件.20ppt课件.2.1.2.1 蛋白质 染色体蛋白主要分为染色体蛋白主要分为组蛋白组蛋白和和非组蛋白非组蛋白两两类。类。真核细胞真核细胞的染色体中,的染色体中,DNA与组蛋白的质与组蛋白的质量比约为量比约为1:1。DNA、组蛋白和非组蛋白及、组蛋白
8、和非组蛋白及部分部分RNA(尚未完成转录而仍与模板(尚未完成转录而仍与模板DNA相相连接的那些连接的那些RNA,其含量不到,其含量不到DNA的的10%)组成了染色体。组成了染色体。21ppt课件.组蛋白:H1 H2A H2B H3 H4非组蛋白核小体DNA蛋白质染色体真核生物染色体的组成22ppt课件.组蛋白是染色体的结构蛋白,分H1、H2A、H2B、H3及H4五种,为与DNA共同组成核小体。组蛋白含有大量的赖氨酸和精氨酸,其中H3、H4富含精氨酸,H1富含赖氨酸。H2A、H2B介于两者之间。23ppt课件.组蛋白的一般特性:进化上的极端保守性,牛与豌豆的H4相差2个氨基酸无组织特异性:鸟/鱼
9、例外,H5取代H1肽链氨基酸分布的不对称性:氨基端(N)多的碱性氨基酸易于DNA的负电区结合,羧基端(C)与其他组蛋白、非组蛋白结合。H5组蛋白的特殊性:富含赖氨酸(24%)可能与染色质失活有关。组蛋白的可修饰性:甲基化、乙基化、磷酸化等,H3,H4修饰作用普遍24ppt课件.保守程度:H1 H2A、H2B H3、H4组蛋白组蛋白 上海生化所分子遗传学试题:在真核生物核内。五种组蛋白(H1 H2A H2B H3 和H4)在进化过程中,H4极为保守,H2A最不保守(-)25ppt课件.在细胞周期特定时间可发生甲基化、乙酰化、磷酸化和ADP核糖基化等。H3、H4修饰作用较普遍,H2B有乙酰化作用、
10、H1有磷酸化作用。所有这些修饰作用都有一个共同的特点,即降低组蛋白所有这些修饰作用都有一个共同的特点,即降低组蛋白所携带的正电荷。所携带的正电荷。这些组蛋白修饰的意义:一是改变染色体的结构,直接影响转录活性;二是核小体表面发生改变,使其他调控蛋白易于和染色质相互接触,从而间接影响转录活性。组蛋白的可修饰性组蛋白的可修饰性26ppt课件.简述真核生物染色体上组蛋白的种类,组蛋白修饰的种类及其生物学意义中国科学院2003年硕士研究生入学生物化学与分子生物学试题27ppt课件.(5)非组蛋白非组蛋白n非组蛋白约占组蛋白总量的非组蛋白约占组蛋白总量的60%-70%60%-70%n包括酶类如包括酶类如R
11、NARNA聚合酶、核孔复合蛋白及肌动蛋白等。聚合酶、核孔复合蛋白及肌动蛋白等。可能是染色体的结构成分可能是染色体的结构成分n高速泳动蛋白高速泳动蛋白HMGHMG:与:与DNADNA结合不牢固,可能与结合不牢固,可能与DNADNA的超的超螺旋结构有关。螺旋结构有关。nDNADNA结合蛋白:与结合蛋白:与DNADNA结合紧密,可能是一些与结合紧密,可能是一些与DNADNA复制复制或转录有关的酶或调解物或转录有关的酶或调解物nA24A24非组蛋白,呈酸性,含有较多的谷氨酸和天冬氨酸。非组蛋白,呈酸性,含有较多的谷氨酸和天冬氨酸。28ppt课件.(1)C值反常现象(C-value paradox)/C
12、值矛盾 真核细胞基因组的最大特点是它含有大量的重复序列,而且功能DNA序列大多被不编码蛋白质的非功能DNA所隔开。C值是一种生物的单倍体基因组DNA的总量。C值往往与种系的进化复杂程度不一致,即基因组大小与遗传复杂性之间没有必然的联系,某些较低等的生物C值却很大,如一些两栖动物的C值甚至比哺乳动物还大。这就是著名的“C值反常现象”。2.1.2、真核生物基因组DNA简述DNA的C值以及C值矛盾(C Value paradox).中科院上海生化所;上海第二军医大:C值矛盾29ppt课件.两栖类同类生物不同种属之间同类生物不同种属之间DNA总量变化很总量变化很大。从编码每类生物所需的大。从编码每类生
13、物所需的DNA量的最量的最低值看,生物细胞中的低值看,生物细胞中的C值具有从低等值具有从低等生物到高等生物逐渐增加的趋势。生物到高等生物逐渐增加的趋势。30ppt课件.1.不重复序列不重复序列/单一序列单一序列:在基因组中有一个或几个拷贝。真核生物的大多数基因在单倍体中都是单拷贝的。不重复序列长约7502 000bp,如:蛋清蛋白、血红蛋白等。占40%-80%。功能:主要是编码蛋白质。2.2.中度重复序列中度重复序列:在基因组中的拷贝数为101-104。如:rRNA、tRNA。总DNA的10%40%,如小鼠中占20%,果蝇中占15%,各种rRNA、tRNA以及某些结构基因如组蛋白基因等都属于这
14、一类。一般是不编码蛋白质的序列,在调控基因表达中起重要作用。根据 DNA复性动力学研究,DNA序列可以分成哪几种类型?并加以举例说明。(上海生化所)真核细胞真核细胞DNA序列可被分为序列可被分为3类类:31ppt课件.图2-6 非洲爪蟾的rRNA基因结构示意图在动物卵细胞形成过程中,在动物卵细胞形成过程中,rDNA可进行几千可进行几千次不同比例的复制,产生次不同比例的复制,产生2106个拷贝,使个拷贝,使rDNA占卵细胞占卵细胞DNA的的75%,从而使该细胞能积累,从而使该细胞能积累1012个个核糖体,以合成大量蛋白质供细胞分裂之需。核糖体,以合成大量蛋白质供细胞分裂之需。32ppt课件.3.
15、高度重复序列:高度重复序列:拷贝数达到几百个到几百万个。只存在于真核生物中,占基因组的10%60%,由6100个碱基组成,在DNA链上串联重复高达数百万次。因为卫星DNA不转录,其功能不详。它们是异染色质的成份,可能与染色体的稳定性有关。33ppt课件.(三)核小体(nucleosome)nucleosome)Nucleosome、chromosome、genome 中科院2002年硕士学位研究生入学分子遗传学试题 1、定义:用于包装染色质的结构单位,是由DNA链缠绕一个组蛋白核构成的。34ppt课件.6.8:140:11000:18000:1DNA double helixNucleosom
16、e(10 nm fiber)30 nm FiberLoops ILoops IIchromosome2、染色体的包装超螺旋结构35ppt课件.基因组很小,大多只有一条染色体 结构简炼 存在转录单元(trnascriptional operon)多顺反子(polycistron)X174 D-E-J-F-G-H mRNA 蛋白J、F、G H D EE.coli 色氨酸操纵子色氨酸操纵子 9个顺反子个顺反子 9个酶个酶1、原核生物基因组结构特点(四)原核生物和真核生物基因组结构特点比较36ppt课件.有重叠基因(有重叠基因(SangerSanger发现)发现)基因内基因 部分重叠基因 一个碱基重叠
17、上海第二军医大硕士研究生入学考试试题:基因组的特点(真核、原核比较)37ppt课件.4、真核生物基因组结构特点38ppt课件.2.2 DNA的结构1 1)概念概念 指4种脱氧核苷酸的连接及其排列顺序,DNA序列是这一概念的简称。碱基序列1、DNA的一级结构39ppt课件.2)特征:双链反向平行配对而成脱氧核糖和磷酸交替连接,构成DNA骨架,碱基排在内侧内侧碱基通过氢键互补形成碱基对(A:T,C:G)。40ppt课件.3)DNA结构的表示法41ppt课件.42ppt课件.2 2、DNA DNA 的二级结构的二级结构1)定义:指两条多核苷酸链反向平行盘绕所产生的双螺旋结构。43ppt课件.绕DNA
18、双螺旋表面上出现的螺旋槽(沟),宽的沟称为大沟,窄沟称为小沟。大沟,小沟都、是由于碱基对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。44ppt课件.ABZ大沟宽小沟窄小沟窄大沟变深小沟宽深大沟不存在小沟窄而深2)DNA二级机构分类:右手螺旋:右手螺旋:A-DNA,B-DNA左手螺旋:左手螺旋:Z-DNA45ppt课件.ABZ46ppt课件.DNADNA双链的变性和复性双链的变性和复性1)DNA的变性和复性 变性(Denaturation)DNA双链的氢键断裂,最后完全变成单链的过程称为变性。增色效应(Hyperchromatic effect)在变性过程中,260nm紫外线吸收值先缓慢上升,当达到某一温度时
19、骤然上升,称为增色效应。47ppt课件.融解温度(Melting temperature Tm)变性过程紫外线吸收值增加的中点称为融解温度。生理条件下为85-95影响因素:G+C含量,pH值,离子强度,尿素,甲酰胺等48ppt课件.49ppt课件.复性(Renaturation)热变性的DNA缓慢冷却,单链恢复成双链。减色效应(Hypochromatic effect)随着DNA的复性,260nm紫外线吸收值降低的现象。50ppt课件.2.2.3 DNA的高级结构1)定义:指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。是一种比双螺旋更高层次的空间构象。2)超螺旋结构是DNA高级结构的主要形
20、式,可分为正超螺旋与负超螺旋两大类,它们在特殊情况下可以相互转变。51ppt课件.使每圈的核苷酸数不等于使每圈的核苷酸数不等于1010,出现双螺旋空间结构的改变,产生额,出现双螺旋空间结构的改变,产生额外的张力。如果额外的张力不能释放,则导致外的张力。如果额外的张力不能释放,则导致DNADNA分子内部原子空分子内部原子空间位置的重排,造成扭曲,即出现超螺旋结构。间位置的重排,造成扭曲,即出现超螺旋结构。在电场作用下,相同分子质量的超螺旋在电场作用下,相同分子质量的超螺旋DNADNA比线性比线性DNADNA迁移率大,线迁移率大,线性性DNADNA又比开环的又比开环的DNADNA迁移率大。迁移率大
21、。52ppt课件.拓扑异构酶or溴化乙锭拓扑异构酶or溴化乙锭DNA扭曲与双螺旋相同(拧紧)DNA扭曲与双螺旋相反(松开)负超螺旋松弛DNA正超螺旋53ppt课件.2.3 DNA的复制DNARNA蛋白质复制转录翻译逆转录RNA复制内容提要:DNA的半保留复制与DNA复制有关的物质 DNA的复制过程(大肠杆菌为例)DNA复制的其它方式真核生物中DNA的复制特点54ppt课件.2.3 DNA的复制的复制 生命的遗传实际上是染色体生命的遗传实际上是染色体DNA自我复制的自我复制的结果,而染色体结果,而染色体DNA的自我复制主要是通过的自我复制主要是通过半保半保留复制留复制(Semi-conserva
22、tive)来实现的,是一个以来实现的,是一个以亲代亲代DNA分子为模板合成子代分子为模板合成子代DNA链的过程。链的过程。由于由于DNA是遗传信息的载体,因此亲代是遗传信息的载体,因此亲代DNA必须以自身分子为模板来合成新的分子必须以自身分子为模板来合成新的分子准确准确地复制成两个拷贝,并分配到两个子代细胞中去,地复制成两个拷贝,并分配到两个子代细胞中去,才能真正完成其遗传信息载体的使命。才能真正完成其遗传信息载体的使命。55ppt课件.由于由于DNA分子分子由两条多核苷酸链组成由两条多核苷酸链组成,两,两条链上的碱基条链上的碱基G只能与只能与C相配对,相配对,A只能只能与与T相配对,所以,两
23、条链是相配对,所以,两条链是互补互补的,一条的,一条链上的核苷酸排列顺序决定了另一条链上的链上的核苷酸排列顺序决定了另一条链上的核苷酸排列顺序。核苷酸排列顺序。56ppt课件.DNA的半保留复制的半保留复制(semi-conservative replication)DNA在复制过程中,每条链分别作为模在复制过程中,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。这样新板合成新链,产生互补的两条链。这样新形成的两个形成的两个DNA分子与原来分子与原来DNA分子的碱分子的碱基顺序完全一样。因此,每个子代分子的基顺序完全一样。因此,每个子代分子的一条链来自亲代一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合,
24、另一条链则是新合成的,这种复制方式被称为成的,这种复制方式被称为DNA的半保留的半保留复制。复制。57ppt课件.1、定义:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式称半保留复制。DNA的半保留复制(semi-conservative replication)半保留 保守型 分散型58ppt课件.DNA的半保留复制的半保留复制Semi-conservative mechanism15N labeling experiment1958年,Meselson 和Stahl研究了经15N标记3个世代的大肠杆菌DNA,首次证明了DN
25、A的半保留复制。DNA的半保留复制保证了DNA在代谢上的稳定性,与DNA的遗传功能相符合。59ppt课件.DNA的半不连续复制的半不连续复制(semidiscontinuous replication)由于由于DNA双螺旋的两条链是反向平行的,因此在复制双螺旋的两条链是反向平行的,因此在复制叉附近解开的叉附近解开的DNA链一条是链一条是53方向,另一条是方向,另一条是35方向,两个模板极性不同。而所有已知方向,两个模板极性不同。而所有已知DNA聚合酶的合成聚合酶的合成方向都是方向都是53,两条链无法同时进行复制。为了解释,两条链无法同时进行复制。为了解释DNA的等速复制现象,日本学者冈崎(的等
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